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Contamination virale de l'environnement littoral ArchiMer
Miossec, Laurence; Besseau, Laetitia; Haugarreau, Larissa; Le Guyader, Francoise; Menard, Dominique; Pommepuy, Monique; Abadie, Eric; Comps, Marie-annick; Guillou, Jean-louis; Le Bec, Claude; Sauvagnargues, Jean-claude; Bon, Fabienne; Jamot, B.; Kohli E, Evelyne; Potier, P.; Daurat, G.; Guyonnet, J.p..
Les microorganismes, bactéries et virus d'origine entérique, sont abondants dans les rejets urbains. Si la charge bactériologique contenue dans les eaux usées est notablement réduite lors des traitements appliqués dans les stations d'épurations, de nombreux microorganismes persistent et sont rejetés avec les eaux épurées dans le milieu récepteur, en rivière ou directement en mer. Le développement de méthodes analytiques basées sur la biologie moléculaire a permis récemment la détection de virus entériques non cultivables dans les échantillons de l'environnement, tels que les entérovirus, le virus de l'hépatite A, les calicivirus, les astrovirus et les rotavirus. En France, les données publiées sur la présence de ces virus entériques, détectés par RTPCR,...
Tipo: Text
Ano: 1999 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15552/12941.pdf
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Contamination virale et indicateurs du risque (Programme Liteau) ArchiMer
Pommepuy, Monique; Caprais, Marie-paule; Le Mennec, Cecile; Parnaudeau, Sylvain; Le Guyader, Francoise; Camus, Patrick; Dimeet, Joel; Treguier, Cathy; Bon, Fabienne; Pothier, Pierre; Kohli E, Evelyne; Brachet, R.; Flahault, A.; Sarrette, B.; Vilagines, P..
Le développement des activités humaines dans les régions littorales entraîne le rejet de germes pathogènes d'origine fécale dans l'environnement estuarien et marin. L'amélioration des traitements d'épuration, mais aussi la mise en place de normes bactériologiques pour surveiller les zones de production conchylicole, ont entraîné une diminution des épidémies liées à la consommation de coquillages. Ainsi, à l'heure actuelle, même si l'origine de ces gastro-entérites n'est pas élucidée dans sa globalité (rôle probable des vibrios ou d'autres bactéries), les virus semblent jouer un rôle important et leur implication té clairement établie dans les phénomènes épidémiques (Miossec et Vaillant, 2001) Les principaux virus humains susceptibles d'être détectés dans...
Tipo: Text
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15549/12936.pdf
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Detection of multiple noroviruses associated with an international gastroenteritis outbreak linked to oyster consumption ArchiMer
Le Guyader, Soizick; Bon, Fabienne; Demedici, Dario; Parnaudeau, Sylvain; Bertone, Alessandra; Crudeli, Silvia; Doyle, Aoife; Zidane, Mohamed; Suffredini, Elisabetta; Kohli E, Evelyne; Maddalo, Francesco; Monini, Marina; Gallay, Anne; Pommepuy, Monique; Pothier, Pierre; Ruggeri, Franco M..
An international outbreak linked to oyster consumption involving a group of over 200 people in Italy and 127 total subjects in 13 smaller clusters in France was analyzed using epidemiological and clinical data and shellfish samples. Environmental information from the oyster-producing area, located in a lagoon in southern France, was collected to investigate the possible events leading to the contamination. Virologic analyses were conducted by reverse transcription-PCR (RT-PCR) using the same primer sets for both clinical and environmental samples. After sequencing, the data were analyzed through the database operated by the scientific network FoodBorne Viruses in Europe. The existence of an international collaboration between laboratories was critical to...
Tipo: Text Palavras-chave: Seafood; Contamination; Norovirus; Epidemiology; Virology; Oyster.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/publication-2096.pdf
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Molecular epidemiology of caliciviruses detected in sporadic and outbreak cases of gastroenteritis in France from December 1998 to February 2004 ArchiMer
Bon, Fabienne; Ambert Balay, K; Giraudon, H; Kaplon, J; Le Guyader, Soizick; Pommepuy, Monique; Gallay, A; Vaillant, V; De Valk, H; Chikhi Brachet, R; Flahaut, A; Pothier, P; Kohli, E.
We compiled sequence and epidemiological data from 172 caliciviruses detected in France from December 1998 to February 2004 in sporadic and outbreak cases. The results showed a cocirculation of strains with a majority of genogroup II (GII) noroviruses. Three groups of noroviruses, not detected before in our laboratory, emerged and spread during the period: the recombinant GGIIb and Norwalk-related strains not amplified in the polymerase gene in 2000 and a new Lordsdale variant in 2002. We observed that (I) GII4 noroviruses were predominant in nursing home and hospital outbreaks but rare in oyster- and water-related outbreaks despite continuous circulation in the population; (ii) at the opposite, genogroup I strains were detected in the majority of...
Tipo: Text Palavras-chave: Genogroup; Cocirculation; Gastroenteritis; Caliciviruses; Epidemiological.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/publication-723.pdf
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