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A Bayesian framework to objectively combine metrics when developing stressor specific multimetric indicator ArchiMer
Drouineau, Hilaire; Lobry, Jeremy; Delpech, C.; Bouchoucha, Marc; Mahevas, Stephanie; Courrat, A.; Pasquaud, S.; Lepage, M..
In the context of the European Water Framework Directive (WFD), monitoring programs and related indicators have been developed to assess anthropogenic impacts on various components of aquatic ecosystems. While great precautions are usually taken when selecting and calculating relevant core metrics, little attention is generally paid to the generation of the multimetric indicator, i.e. the combination of the different core metrics. Indeed, most multimetric indicators are generated by simply averaging or summing metrics, without taking into account their sensitivity and their variability. Moreover, few indicators provide a rigorous estimate of the uncertainty of the assessments, while this estimation is essential for managers. In this context, we developed a...
Tipo: Text Palavras-chave: Multimetric fish-based indicator; Bayesian method; Pressure-impact models; Water Framework Directive; Anthropogenic pressure; Monitoring program; Transitional waters.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00049/16037/13572.pdf
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A global perspective on the trophic geography of sharks ArchiMer
Bird, Christopher S.; Verissimo, Ana; Magozzi, Sarah; Abrantes, Katya G.; Aguilar, Alex; Al-reasi, Hassan; Barnett, Adam; Bethea, Dana M.; Biais, Gerard; Borrell, Asuncion; Bouchoucha, Marc; Boyle, Mariah; Brooks, Edward J.; Brunnschweiler, Juerg; Bustamante, Paco; Carlisle, Aaron; Catarino, Diana; Caut, Stephane; Cherel, Yves; Chouvelon, Tiphaine; Churchill, Diana; Ciancio, Javier; Claes, Julien; Colaco, Ana; Courtney, Dean L.; Cresson, Pierre; Daly, Ryan; De Necker, Leigh; Endo, Tetsuya; Figueiredo, Ivone; Frisch, Ashley J.; Hansen, Joan Holst; Heithaus, Michael; Hussey, Nigel E.; Iitembu, Johannes; Juanes, Francis; Kinney, Michael J.; Kiszka, Jeremy J.; Klarian, Sebastian A.; Kopp, Dorothee; Leaf, Robert; Li, Yunkai; Lorrain, Anne; Madigan, Daniel J.; Maljkovic, Aleksandra; Malpica-cruz, Luis; Matich, Philip; Meekan, Mark G.; Menard, Frederic; Menezes, Gui M.; Munroe, Samantha E. M.; Newman, Michael C.; Papastamatiou, Yannis P.; Pethybridge, Heidi; Plumlee, Jeffrey D.; Polo-silva, Carlos; Quaeck-davies, Katie; Raoult, Vincent; Reum, Jonathan; Torres-rojas, Yassir Eden; Shiffman, David S.; Shipley, Oliver N.; Speed, Conrad W.; Staudinger, Michelle D.; Teffer, Amy K.; Tilley, Alexander; Valls, Maria; Vaudo, Jeremy J.; Wai, Tak-cheung; Wells, R. J. David; Wyatt, Alex S. J.; Yool, Andrew; Trueman, Clive N..
Sharks are a diverse group of mobile predators that forage across varied spatial scales and have the potential to influence food web dynamics. The ecological consequences of recent declines in shark biomass may extend across broader geographic ranges if shark taxa display common behavioural traits. By tracking the original site of photosynthetic fixation of carbon atoms that were ultimately assimilated into muscle tissues of 5,394 sharks from 114 species, we identify globally consistent biogeographic traits in trophic interactions between sharks found in different habitats. We show that populations of shelf-dwelling sharks derive a substantial proportion of their carbon from regional pelagic sources, but contain individuals that forage within additional...
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00420/53141/54249.pdf
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A MSFD complementary approach for the assessment of pressures, knowledge and data gaps in Southern European Seas: The PERSEUS experience ArchiMer
Crise, A.; Kaberi, H.; Ruiz, J.; Zatsepin, A.; Arashkevich, E.; Giani, M.; Karageorgis, Aristomenis; Prieto, L.; Pantazi, M.; Gonzalez-fernandez, D.; D'Alcala, M. Ribera; Tornero, V.; Vassilopoulou, V.; Durrieu De Madron, Xavier; Guieu, C.; Puig, P.; Zenetos, A.; Andral, Bruno; Angel, D.; Altukhov, D.; Ayata, S. D.; Aktan, Y.; Balcioglu, E.; Benedetti, F.; Bouchoucha, Marc; Buia, M. -c.; Cadiou, Jean-francois; Canals, M.; Chakroun, M.; Christou, E.; Christidis, M. G.; Civitarese, Giuseppe; Coatu, V.; Corsini-foka, M.; Cozzi, S.; Deidun, A.; Dell'Aquila, A.; Dogrammatzi, A.; Dumitrache, C.; Edelist, D.; Ettahiri, Omar; Fonda-umani, S.; Gana, S.; Galgani, Francois; Gasparini, S.; Giannakourou, A.; Gomoiu, M. -t.; Gubanova, A.; Gucu, Ali-cemal; Gurses, Ozgur; Hanke, G.; Hatzianestis, I.; Herutx, B.; Hone, R.; Huertas, E.; Irisson, J. -o.; Isinibilir, M.; Jimenez, J. A.; Kalogirou, S.; Kapiris, K.; Karamfilov, Ventzi; Kavadas, S.; Keskin, G.; Kideys, Ahmet; Kocak, M.; Kondylatos, G.; Kontogiannis, C.; Kosyan, R.; Koubbi, Philippe; Kuspilic, G.; La Ferla, R.; Langone, L.; Laroche, Sophie; Lazar, Luminita; Lefkaditou, E.; Lemeshko, I. E.; Machias, A.; Malej, A.; Mazzocchi, M. -g.; Medinets, Volodymyr; Mihalopoulos, N.; Miserocchi, S.; Moncheva, Snejana; Mukhanov, V.; Oaie, Gheorghe; Oros, A.; Ozturk, A. A.; Ozturk, B.; Panayotova, M.; Prospathopoulos, A.; Radu, G.; Raykov, V.; Regiero, P.; Reygondeau, G.; Rougeron, Natacha; Salihoglu, B.; Sanchez-vidal, A.; Sannino, G.; Santinelli, C.; Secrieru, D.; Shapiro, G.; Simboura, N.; Shiganova, Tamara; Sprovieri, M.; Stefanova, Kremena; Streftaris, N.; Tirelli, V.; Tom, Moshe; Topaloglu, B.; Topcu, N. E.; Tsagarakis, K.; Tsangaris, C.; Tserpes, G.; Tugrul, S.; Uysal, Z.; Vasile, Daniela; Violaki, K.; Xu, J.; Yuksek, Ahsen; Papathanassiouh, E..
PERSEUS project aims to identify the most relevant pressures exerted on the ecosystems of the Southern European Seas (SES), highlighting knowledge and data gaps that endanger the achievement of SES Good Environmental Status (GES) as mandated by the Marine Strategy Framework Directive (MSFD). A complementary approach has been adopted, by a meta-analysis of existing literature on pressure/impact/knowledge gaps summarized in tables related to the MSFD descriptors, discriminating open waters from coastal areas. A comparative assessment of the Initial Assessments (IAs) for five SES countries has been also independently performed. The comparison between meta-analysis results and IAs shows similarities for coastal areas only. Major knowledge gaps have been...
Tipo: Text Palavras-chave: Marine Strategy Framework Directive; Southern European Seas; Good Environmental Status; Initial Assessment; PERSEUS project.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00273/38422/36743.pdf
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A multitracer approach to assess the spatial contamination pattern of hake (Merluccius merluccius) in the French Mediterranean ArchiMer
Cresson, Pierre; Bouchoucha, Marc; Morat, Fabien; Miralles, Francoise; Chavanon, Fabienne; Loizeau, Veronique; Cossa, Daniel.
Chemical contamination levels and stable isotope ratios provide integrated information about contaminant exposure, trophic position and also biological and environmental influences on marine organisms. By combining these approaches with otolith shape analyses, the aim of the present study was to document the spatial variability of Hg and PCB contamination of the European hake (Merluccius merluccius) in the French Mediterranean, hypothesizing that local contaminant sources, environmental conditions and biological specificities lead to site-specific contamination patterns. High Hg concentrations discriminated Corsica (average: 1.36 ± 0.80 μg g− 1 dm) from the Gulf of Lions (average values < 0.5 μg g− 1 dm), where Rhône River input caused high PCB burdens....
Tipo: Text Palavras-chave: Hg; Mediterranean; Merluccius merluccius; Multiple ecotracers; PCB.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00270/38155/36309.pdf
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Analyse statistique des données du réseau RINBIO : détermination d’une réponse universelle de capteur ArchiMer
Bouchoucha, Marc; Andral, Bruno.
La mesure des contaminants chimiques directement dans la colonne d’eau est coûteuse, difficilement interprétable et peu applicable à de nombreux échantillons prélevés le long d’un important linéaire côtier. Pour surmonter ces difficultés, les contaminants peuvent être mesurés dans la chair de bioaccumulateurs naturels tels les moules. Depuis 1996, le réseau RINBIO évalue les niveaux de contamination chimique à l’échelle de la façade méditerranéenne en utilisant une technique de caging de moules. Or, les caractéristiques du capteur représenté par les moules varient en fonction du milieu et notamment de ses capacités trophiques. L’objectif de l’étude était de déterminer statistiquement la réponse de ce capteur à partir de jeux de données disponibles depuis...
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00028/13920/11090.pdf
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Approche statistique des données MYTILOS - MYTIMED - MYTIAD - MYTIOR - MYTITURK. Contamination chimique en Méditerranée. Application du modèle de capteur "moule" ArchiMer
Sargian, Peggy; Laroche, Sophie; Bouchoucha, Marc; Andral, Bruno.
Sur la base de l'expérience acquise dans le cadre du programme Rinbio, développé en partenariat avec l'Agence de l'Eau Rhône Méditerranée Corse depuis 1996, sept campagnes ont été réalisées sur l'ensemble de la Méditerranée : Mytilos en 2004, 2005 et 2006, Mytimed en 2007, Mytiad en 2008, Mytior en 2009 et Mytiturk en 2011. La reproductibilité de la technique du caging de moules au cours de ces différentes campagnes permet de disposer d'une première cartographie de la contamination chimique à l'échelle de l'ensemble du littoral méditerranéen. Les caractéristiques du capteur représenté par les moules varient cependant en fonction du milieu et en particulier de ses capacités trophiques, des périodes de stabulation et des lots initiaux d'échantillons, ce qui...
Tipo: Text Palavras-chave: Rinbio; Méditerranée; Mytilos; Mytimed; Contaminant chimique; Modèle; Moules; Traitement statistique..
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00233/34387/32781.pdf
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Are red mullet efficient as bio-indicators of mercury contamination? A case study from the French Mediterranean ArchiMer
Cresson, Pierre; Bouchoucha, Marc; Miralles, F.; Elleboode, Romain; Mahe, Kelig; Marusczak, Nicolas; Thebault, Herve; Cossa, Daniel.
Mercury (Hg) is one of the main chemicals currently altering Mediterranean ecosystems. Red mullet (Mullus barbatus and M. surmuletus) have been widely used as quantitative bio-indicators of chemical contamination. In this study, we reassess the ability of these species to be used as efficient bio-indicators of Hg contamination by monitoring during 18 months Hg concentrations in muscle tissue of mullet sampled from 5 French Mediterranean coastal areas. Mean concentrations ranged between 0.23 and 0.78 μg g−1 dry mass for both species. Values were consistent with expected contamination patterns of all sites except Corsica. Results confirmed that red mullets are efficient bio-indicators of Hg contamination. Nevertheless, the observed variability in Hg...
Tipo: Text Palavras-chave: Mercury; Bio-indicator; Fish; Mullus spp.; Mediterranean.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00244/35514/34083.pdf
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Base de données "pressions sur les lagunes méditérranéennes" - Analyse des liens état - pression ArchiMer
Meinesz, Coralie; Derolez, Valerie; Bouchoucha, Marc.
Les objectifs de résultats, en termes de préservation ou de restauration des milieux aquatiques, que fixent la Directive Cadre sur l’Eau (2000/60/CE), nécessitent de connaître les liens entre l’état des masses d’eau et les pressions auxquelles elles sont soumises. L’évaluation de l’état des lagunes méditerranéennes est notamment basée sur différents éléments de qualité biologique (phytoplancton, macrophytes, macrofaune benthique de substrat meuble). La présente étude s’applique à recenser les pressions anthropiques sur les lagunes méditerranéennes, les bancariser et analyser les liens entre les indicateurs de qualité biologique de la DCE et des indicateurs de pressions pertinentes issus de ce recensement. Le travail d’identification des pressions et de...
Tipo: Text Palavras-chave: Pressions; Lagunes méditerranéennes; Lien état-pression; DCE.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00154/26496/24607.pdf
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Bilan 2007 du réseau REPAMO - Réseau national de surveillace de la santé des mollusques marins ArchiMer
Francois, Cyrille; Garcia, Celine; Arzul, Isabelle; Chollet, Bruno; Ferrand, Sylvie; Joly, Jean-pierre; Miossec, Laurence; Robert, Maeva; Cuvelier, Nicolas; Le Gagneur, Eric; Ropert, Michel; Mouillard, Gilbert; Gerla, Daniel; Annezo, Jean-pierre; Le Gal, Dominique; Langlade, Aime; Bedier, Edouard; Nourry, Max; Martin, Jean-louis; Chabirand, Jean-michel; Fillon, Alain; Robert, Stephane; Courtois, Olivier; D'Amico, Florence; Rumebe, Myriam; Pichot, Yves; Le Gall, Patrik; Bouchoucha, Marc; Baldi, Yoann; Ravel, Christophe.
Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s'inscrit dans le cadre de deux Directives Européennes, les Directives 91 /67/CEE et 95/70/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l'introduction et la propagation d'organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l'évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l'IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Bonamia ostreae et la Marteiliose à Marteilia refringens chez l'huître...
Tipo: Text Palavras-chave: Réseau; Surveillance; Mollusques; Coquillages; Santé.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00086/19708/17349.pdf
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Bilan 2012 du réseau REPAMO - Réseau national de surveillance de la santé des mollusques marins ArchiMer
Francois, Cyrille; Joly, Jean-pierre; Garcia, Celine; Lupo, Coralie; Travers, Marie-agnes; Pepin, Jean-francois; Hatt, Philippe-jacques; Arzul, Isabelle; Omnes, Emmanuelle; Tourbiez, Delphine; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Huchet, Eve; Dubreuil, Christine; Chollet, Bruno; Renault, Tristan; Cordier, Remy; Hebert, Pascale; Le Gagneur, Eric; Parrad, Sophie; Gerla, Daniel; Annezo, Jean-pierre; Terre-terrillon, Aouregan; Le Gal, Dominique; Langlade, Aime; Bedier, Edouard; Hittier, Benoist; Grizon, James; Chabirand, Jean-michel; Robert, Stephane; Seugnet, Jean-luc; Rumebe, Myriam; Le Gall, Patrik; Bouchoucha, Marc; Baldi, Yoann; Masson, Jean-claude.
Créé en 1992, le réseau Repamo (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s’inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l’introduction et la propagation d’organismes pathogènes, en particulier ceux à réglementés et de surveiller l’évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font partie des missions institutionnelles de l’IFREMER. L’étude des hausses de mortalités (protocole II) a été poursuivie avec 52 interventions complètes ayant conduit au recueil de commémoratifs et à la réalisation d’échantillons de mollusques marins pour analyses en pathologie. Des hausses de mortalités...
Tipo: Text Palavras-chave: Réseau; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Santé; Surveillance.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25470/23625.pdf
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Bilan 2013 du réseau Repamo - Réseau national de surveillance de la santé des mollusques marins ArchiMer
Francois, Cyrille; Joly, Jean-pierre; Garcia, Celine; Lupo, Coralie; Travers, Marie-agnes; Tourbiez, Delphine; Chollet, Bruno; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Dubreuil, Christine; Serpin, Delphine; Renault, Tristan; Cordier, Remy; Hebert, Pascale; Le Gagneur, Eric; Parrad, Sophie; Gerla, Daniel; Cheve, Julien; Penot, Julia; Le Gal, Dominique; Lebrun, Luc; Le Gac-abernot, Chantal; Langlade, Aime; Bedier, Edouard; Palvadeau, Hubert; Grizon, James; Chabirand, Jean-michel; Robert, Stephane; Seugnet, Jean-luc; Rumebe, Myriam; Le Gall, Patrick; Bouchoucha, Marc; Baldi, Yoann; Masson, Jean-claude.
Créé en 1992, le réseau Repamo (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s’inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Repamo a pour objectif de détecter précocement les infections dues à des organismes pathogènes exotiques et émergents affectant les mollusques marins sauvages et d’élevage. L’étude des hausses de mortalités a été poursuivie avec 52 interventions complètes ayant conduit au recueil de commémoratifs et à la collecte d’échantillons de mollusques marins pour analyses en pathologie. Des hausses de mortalités d’huîtres creuses (Crassostrea gigas) (44 interventions) ont été recensées dans la majorité des bassins de production de mai à...
Tipo: Text Palavras-chave: Réseau Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Santé.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00197/30798/29167.pdf
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Bilan 2015 du dispositif national de surveillance de la santé des mollusques marins ArchiMer
Lupo, Coralie; Osta Amigo, Axel; Fleury, Elodie; Robert, Stephane; Garcia, Celine; Arzul, Isabelle; Baillon, Laury; Bechemin, Christian; Canier, Lydie; Chollet, Bruno; Dechamps, Lucie; Dubreuil, Christine; Faury, Nicole; Francois, Cyrille; Godfrin, Yoann; Lapegue, Sylvie; Morga, Benjamin; Travers, Marie-agnes; Tourbiez, Delphine; Masson, Jean-claude; Verin, Francoise; Cordier, Remy; Gangnery, Aline; Louis, Wilfried; Mary, Charlotte; Normand, Julien; Penot, Julia; Cheve, Julien; Dagault, Francoise; Le Jolivet, Aurore; Le Gal, Dominique; Lebrun, Luc; Bellec, Gwenael; Bouget, Jean-francois; Cochennec-laureau, Nathalie; Palvadeau, Hubert; Grizon, James; Chabirand, Jean-michel; Pepin, Jean-francois; Seugnet, Jean-luc; D'Amico, Florence; Maurer, Daniele; Le Gall, Patrik; Mortreux, Serge; Baldi, Yoann; Orsoni, Valerie; Bouchoucha, Marc; Le Roy, Valerian; Pouvreau, Stephane; Queau, Isabelle; Lamoureux, Alice.
Depuis 1992, la surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français est assurée par le réseau de Pathologie des Mollusques (Repamo). Ses activités s’inscrivent dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Depuis son évaluation par la plateforme nationale d’épidémiosurveillance en santé animale en 2012, l’objectif de surveillance est la détection précoce des infections dues à des organismes pathogènes exotiques et émergents affectant les mollusques marins sauvages et d’élevage. L’année 2015 est la première année de transition pour laquelle un début d’évolution des modalités de surveillance de la santé des mollusques marins animées par l’Ifremer a été amorcé. Un dispositif hybride de surveillance a été mis en place, s’appuyant sur...
Tipo: Text Palavras-chave: Réseau; Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Santé; Mortalité; Maladie.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00324/43486/42945.pdf
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Contribution to the understanding of the cycle of the protozoan parasite Marteilia refringens ArchiMer
Arzul, Isabelle; Chollet, Bruno; Boyer, S.; Bonnet, D.; Gaillard, Juliette; Baldi, Yoann; Robert, Maeva; Joly, Jean-pierre; Garcia, Celine; Bouchoucha, Marc.
The paramyxean parasite Marteilia refringens infects several bivalve species including European flat oysters Ostrea edulis and Mediterranean mussels Mytilus galloprovincialis. Sequence polymorphism allowed definition of three parasite types ‘M’, ‘O’ and ‘C’ preferably detected in oysters, mussels and cockles respectively.Transmission of the infection from infected bivalves to copepods Paracartia grani could be experimentally achieved but assays fromcopepods to bivalves failed. In order to contribute to the elucidation of the M. refringens life cycle, the dynamics of the infection was investigated in O. edulis, M. galloprovincialis and zooplankton over one year in Diana lagoon, Corsica (France). Flat oysters appeared non-infected while mussels were infected...
Tipo: Text Palavras-chave: Bivalves; Marteilia refringens; Copepods; Paracartia latisetosa; Zooplankton; Parasite life cycle.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00165/27635/25768.pdf
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Etude de la contamination chimique chez quatre espèces de poisson en Méditerranée. Rapport final des actions 2017-2018 du dispositif de suivi CONTAMED ArchiMer
Mille, Tiphaine; Mauffret, Aourell; Baudrier, Jerome; Wessel, Nathalie; Bouchoucha, Marc.
Le dispositif de suivi CONTAMED vise à suivre les niveaux de contamination de plusieurs maillons de réseaux trophiques méditerranéens et à approfondir la compréhension des processus de bioaccumulation et de transfert des contaminants métalliques et organiques. CONTAMED se décompose en 3 protocoles ; les actions 2017-2018 correspondent à la réalisation des protocoles 1 et 3. Le protocole 1 est le suivi de la contamination en mercure dans le muscle des 2 espèces communes de rougets le long de la façade méditerranéenne française avec pour objectif supplémentaire cette année de mieux appréhender les variations saisonnières de la contamination en mercure dans le but de définir la période d’échantillonnage optimale et donc de stabiliser le protocole du réseau de...
Tipo: Text Palavras-chave: Contaminants chimiques Réseaux trophiques; Méditerranée Surveillance DCSMM.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00458/56962/58860.pdf
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Etude sur les risques de contamination microbiologique des oursins ArchiMer
Chavanon, Fabienne; Bouchoucha, Marc.
L’objet principal de cette étude est d’évaluer et suivre les niveaux de contamination des oursins dans un secteur identifié comme exposé aux sources de contamination microbiologique, afin de vérifier l’hypothèse selon laquelle les oursins, organismes brouteurs et non filtreurs, sont peu ou pas sensibles à la contamination microbiologique par rapport à des coquillages du groupe III.Les résultats des analyses montrent que pour cette zone classée A par arrêté préfectoral, les oursins, sont susceptibles d’être fortement contaminés lors de pollutions bactériologiques.La contamination peut être plus importante que dans les moules, organismes filtreurs.
Tipo: Text Palavras-chave: Microbiologie; Classement de zone; Oursin.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00170/28147/26378.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Région PACA (Provence-Alpes-Côte d’Azur). Edition 2014 ArchiMer
Henry, Maryvonne; Bouchoucha, Marc.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et de contrôle chimique ROCCH, ce rapport effectue un bilan national et décrit le programme annuel de la Région PACA (Provence- Alpes-Côte d’Azur). Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité et l’évolution des zones de production de coquillages classées.
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; ROCCH; Contaminants chimiques; E. Coli; Contamination bactériologique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production; Région PACA (Provence-Alpes-Côte d’Azur)..
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00233/34418/32815.pdf
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Expérimentation RINBIO 2011. Suivi de la cinétique de contamination chimique de moules (Mytillus galloprovincialis): Synthèse des mesures de contaminants chimiques dans l'eau. ArchiMer
Gonzalez, Jean-louis; Bouchoucha, Marc; Chiffoleau, Jean-francois; Andral, Bruno.
Une des exploitations possibles des données acquises dans le cadre du réseau RINBIO est d'évaluer la concentration sous forme "biodisponible" de différents contaminants chimiques présents dans la colonne d'eau. Afin d'étudier cette possibilité, une expérimentation été conduite en parallèle sur trois sites en 2011 (baie du Lazaret, cap Cepet et baie de Calvi). Dans ces sites, des moules ont été "transplantées" et des mesures de la concentration de différents contaminants chimiques dans la colonne d'eau ont été réalisées. Le présent rapport traite plus spécifiquement des données concernant l'évolution temporelle des concentrations en métaux traces et composés hydrophobes mesurées pour les trois sites ateliers : par DGT (Diffusive Gradient in Thin film) et...
Tipo: Text Palavras-chave: RINBIO; Contaminants chimiques; Métaux traces; Contaminants hydrophobes; Moules; Échantillonneurs passifs; DGT; SBSE..
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00357/46855/46743.pdf
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Faecal contamination of echinoderms: first report of heavy Escherichia coli loading of sea urchins from a natural growing area ArchiMer
Bouchoucha, Marc; Piquet, Jean-come; Chavanon, Fabienne; Dufresne, C.; Le Guyader, Soizick.
Although little evidence existed to support that view, European countries and in particular France, have regarded echinoderms, including sea urchins, as low risk in terms of feacal contamination. It is hypothesized that the sea urchins mode of feeding, which is based on grazing and differs from bivalve molluscs, would prevent it from concentrating high levels of Escherichia coli. Here, we monitored E. coli levels in sea urchins (Paracentrotus lividus) and in filter-feeder mussels (Mytillus galloprovincialis), collected concurrently from the same natural area over a 1-year period to verify this assumption. Sea urchins were collected on the seafloor, whereas mussels were collected from the water column at a depth of 4 m. Our results showed heavy bacterial...
Tipo: Text Palavras-chave: E. coli; Fecal contamination; Mussel; Sea urchin; Shellfish monitoring program.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00310/42086/41400.pdf
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Fine-Scale Cartography of Human Impacts along French Mediterranean Coasts: A Relevant Map for the Management of Marine Ecosystems ArchiMer
Holon, Florian; Mouquet, Nicolas; Boissery, Pierre; Bouchoucha, Marc; Delaruelle, Gwenaelle; Tribot, Anne-sophie; Deter, Julie.
Ecosystem services provided by oceans and seas support most human needs but are threatened by human activities. Despite existing maps illustrating human impacts on marine ecosystems, information remains either large-scale but rough and insufficient for stakeholders (1 km² grid, lack of data along the coast) or fine-scale but fragmentary and heterogeneous in methodology. The objectives of this study are to map and quantify the main pressures exerted on near-coast marine ecosystems, at a large spatial scale though in fine and relevant resolution for managers (one pixel = 20 x 20 m). It focuses on the French Mediterranean coast (1,700 km of coastline including Corsica) at a depth of 0 to 80 m. After completing and homogenizing data presently available under...
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00275/38600/37129.pdf
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Food web structure of a Mediterranean coralligeneous ecosystem ArchiMer
Belloni, Bruno; Sartoretto, Stephane; Cresson, Pierre; Bouchoucha, Marc; Guillou, Gael; Lebreton, Benoit; Ruitton, Sandrine; Harmelin-vivien, Mireille.
The coralligenous ecosystem is one of the biodiversity hotspots in the Mediterranean Sea. This study aims at determining (i) the organic matter (OM) sources at the base of the food web in a coralligenous  ecosystem  near  Marseille  (Cap  Caveau,  Frioul  Island)  and  (ii)  the  global functional structure of its community. For that purpose, C and N stable isotope analyses were performed on 78 compartments or species collected in this habitat between 30 and 40 m depth. Results  suggested  that  the  pelagic  particulate  organic  matter  (POM),  mainly  composed  of phytoplankton, was the main OM source fuelling coralligenous food webs, followed by sedimented organic matter (SOM) and some macrophytes. At least three level of consumers were identified from...
Tipo: Text Palavras-chave: Food webs; Coralligenous ecosystem; Stable isotopes; Carbon; Nitrogen.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00483/59511/62396.pdf
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