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A new set of differentially expressed signaling genes is early expressed in coffee leaf rust race II incompatible interaction. Repositório Alice
DIOLA, V.; BRITO, G. G. de; CAIXETA, E. T.; PEREIRA, L. F. P.; LOUREIRO, M. E..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Host-specific resistance; R-genes; Transcript-derived fragments.; Hemileia Vastatrix..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/982262
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Aceleração do melhoramento do cafeeiro via seleção genômica: agilidade e eficácia no lançamento de novas cultivares. Infoteca-e
CAIXETA, E. T.; RESENDE, M. D. V. de; ALKIMIM, E. R.; SOUSA, T. V.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; ALVES, R. S..
Neste documento, foram demonstrados os usos da seleção assistida por marcadores moleculares e da seleção genômica nas espécies Coffea arabica e Coffea canephora. O uso dessas técnicas seletivas possibilitou o aumento na eficiência nos programas de melhoramento dessas espécies. Além disso, evidencia a importância da utilização de diferentes metodologias de seleção, sendo explorado os benefícios de cada técnica seletiva, tornando os programas de melhoramento mais eficientes e competitivos.
Tipo: Livros Palavras-chave: Melhoramento Genético Vegetal; Seleção Genótipa; Variedade; Café; Coffea Arábica; Coffea Canephora; Hemileia Vastatrix; Marcador Molecular.
Ano: 2022 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1145724
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An overview of physiological specialization of coffee leaf rust: new designation of pathotypes. Repositório Alice
ZAMBOLIM, l.; CAIXETA, E. T..
Coffee leaf rust is the most important disease thorought the world. The disease caused by a biotrofic fungi growing areas of the world coffee leaf rust causes losses from Central American coffee park. identified in 1860. Madagascar and Java). I the disease was identified in Brazil. America, Caribean and Mexico. Currently, more than 50 identified by using coffee differentials clones of CIFC in the world. The most comum and widespread resistance genes ( identified by the differential interaction of genes of the host and of the pathogen. M technique, found two different genes in HdT 832/1 and HdT 832/2 not yet identified in differential clones ( to refer the isolates of system. Several pathotypes was found in several countri based on a set of differentials of...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Hemileia Vastatrix; Leaf rust; Coffea; Pathotypes.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1139326
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Análise da diversidade genética de cafeeiros do Banco de Germoplasma da UFV/EPAMIG utilizando marcadores RAPD. Repositório Alice
ALVARENGA, S. M.; CAIXETA, E. T.; OLIVEIRA, A. C. B. de; RUFINO, R. J. N.; BRITO, G. G. de; PEREIRA, A. A.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S..
O conhecimento da diversidade genética do germoplasma utilizado em programas de melhoramento genético é importante para o planejamento de estratégias de trabalho. Técnicas de marcadores moleculares fornecem informações sobre distâncias genéticas entre acessos de Bancos de Germoplasma. Dessa forma, no presente trabalho, 92 acessos do Banco de Germoplasma da UFV/EPAMIG foram submetidos a uma análise de diversidade genética, utilizando-se 20 primers RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). As amplificações deram origem a um total de 42 bandas polimórficas. As distâncias genéticas entre os genótipos, baseadas no complemento de Jaccard, variaram de zero a 100%. No dendrograma obtido observou-se a formação de cinco grupos diferentes ao nível de 50% de distância...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Diversidade genética; Marcadors RAPD.; Café.; Coffea..
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/909263
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Análise molecular do rDNA de Hemileia vastatrix. Repositório Alice
SANTANA, M. F.; ZAMBOLIM, E. M.; OLIVEIRA, L. O. de; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, L..
Os espaçadores transcritos internos (ITS1 e ITS2) e o gene 5,8S do rDNA nuclear de 15 populações de H. vastatrix foram amplificados por PCR com o objetivo de estudar a diversidade genética. Os fragmentos amplificados foram clonados, e dos clones resultantes, 4 a 7 foram seqüenciados. As 82 seqüências resultantes revelaram a existência de 68 haplótipos definidos por 63 substituições de base e cinco indels. Entre os 68 haplótipos, 64 foram exclusivos, isto é, cada um deles foi detectado em uma única lavoura, dois (1 e 2) foram compartilhados entre lavouras distintas e dois (19 e 29) foram exclusivos, mas detectados duas vezes na mesma lavoura. Os haplótipos geraram uma rede única mostrando que 65 deles são de origem mais recente e de distribuição restrita, e...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Haplótipos; ITS (Internal transcribed spacer); RDNA; Diversidade genética.; Hemileia Vastatrix..
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/906053
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Artificial neural networks compared with Bayesian generalized linear regression for leaf rust resistance prediction in Arabica coffee. Repositório Alice
SILVA, G. N.; NASCIMENTO, M.; SANT'ANNA, I. de C.; CRUZ, C. D.; CAIXETA, E. T.; CARNEIRO, P. C. S.; ROSADO, R. D. S.; PESTANA, K. N.; ALMEIDA, D. P. de; OLIVEIRA, M. da S..
The objective of this work was to evaluate the use of artificial neural networks in comparison with Bayesian generalized linear regression to predict leaf rust resistance in Arabica coffee (Coffea arabica). This study used 245 individuals of a F2 population derived from the self-fertilization of the F1 H511-1 hybrid, resulting from a crossing between the susceptible cultivar Catuaí Amarelo IAC 64 (UFV 2148-57) and the resistant parent Híbrido de Timor (UFV 443-03). The 245 individuals were genotyped with 137 markers. Artificial neural networks and Bayesian generalized linear regression analyses were performed. The artificial neural networks were able to identify four important markers belonging to linkage groups that have been recently mapped, while the...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Inteligência artificial; Predição.; Marcador molecular; Coffea Arábica; Hemileia Vastatrix.; Artificial intelligence; Genetic markers; Prediction..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1069618
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Aspectos gerais da biologia e da diversidade genética de Coffea canephora. Repositório Alice
SOUZA, F. de F.; FERRÃO, L. F. V.; CAIXETA, E. T.; SAKIYAMA, N. S.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de.
s primeiros registros históricos sobre o café foram encontrados em um manuscrito no Iêmen, em 575. As primeiras descrições científicas da planta foram apresentadas em 1591 e 1592, pelo botânico veneziano Prospero Alpino, em suas obras De Medicina Aegyptiorum e De Plantis Aegypitii Liber. No entanto, coube a Antoine Jussieu, em sua obra Histoire Du Café, publicada em 1716, a primeira classificação botânica do cafeeiro como Jasminum arabicum. Posteriormente, em 1737, Carl Von Linné (Lineu) reclassificou a espécie, dando-lhe o nome de Coffea arabica (MARTINS, 2008). A nomenclatura da tribo Coffeeae foi originalmente proposta por De Candolle, em 1807. Em sua classificação, esta tribo era bastante abrangente e incluía um grande número de gêneros, muitos dos...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Caracter morfologico; Café; Marcador molecular; Coffea canephora; Espécie; Coffea liberica.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1041502
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Aspectos gerais da biologia e da diversidade genética de Coffea canephora. Infoteca-e
SOUZA, F. de F.; FERRÃO, L. F. V.; CAIXETA, E. T.; SAKIYAMA, N. S.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de.
O capítulo apresenta uma discussão que inclui a caracterização de genótipos da coleção ativa de germoplasma de café da Embrapa Rondônia.
Tipo: Capítulo em livro técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Variabilidade genética; Café conilon; Caracter morfologico; Café; Coffea Canephora; Coffea liberica.
Ano: 2015 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1048385
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Aspectos gerais da biologia e da diversidade genética de Coffea canephora. Infoteca-e
SOUZA, F. de F.; FERRÃO, L. F. V.; CAIXETA, E. T.; SAKIYAMA, N. S.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de.
O capítulo apresenta uma discussão que inclui a caracterização de genótipos da coleção ativa de germoplasma de café da Embrapa Rondônia.
Tipo: Livro técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Variabilidade genética; Café conilon; Coffea Canephora.
Ano: 2015 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1040700
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Assessment of est-ssr markers for genetic analysis on coffee. Repositório Alice
MISSIO, R. F.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOIM, E. M.; PENA, G. F.; RIBEIRO, A. P.; ZAMBOLIM, L.; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Coffea sp; UPGMA.; Microsatellite markers; AMOVA; DNA markers.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/880408
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Avaliação da resistência de cultivares de café à raça II de Hemileia vastatrix Berk. et Br. Repositório Alice
CAPUCHO, A. S.; ZAMBOLIM, L.; ZAMBOLIM, E. M.; CAIXETA, E. T.; FRANCHINI, E. de A.; PEREIRA, A. A..
A ferrugem do cafeeiro, causada por Hemileia vastatrix, pode ser controlada eficientemente pela utilização de cultivares resistentes. A resistência vertical (qualitativa) é oligogênica, e é governada por poucos genes podendo segregar para suscetibilidade a raça II se controlada por poucos genes e, por isso, com resistência não durável anulada pelo surgimento de novas raças. Assim, o conhecimento da segregação para suscetibilidade à raça II torna-se importante em patossistemas em que o patógeno apresenta alta variabilidade como H. vastatrix. Como algumas variedades lançadas como resistentes já estão sendo atacadas pela ferrugem, este trabalho objetivou avaliar 25 cultivares de café lançados como resistentes quanto à segregação para a sucetibilidade à raça...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Cultivar resistente; Resistência vertical; Resistência durável; Teste de resistência.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/906080
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Breeding potential and genetic diversity of "híbrido do timor" coffee evaluated by molecular markers. Repositório Alice
SETOTAW, T. A.; CAIXETA, E. T.; PENA, G F.; ZAMBOLIM, E. M.; PEREIRA, A. A..
AFLP, RAPD and SSR molecular markers were used to study the genetic diversity and genetic structure of the Híbrido de Timor germplasm. The principal coordinate analysis, UPGMA cluster analysis based on genetic dissimilarity of Jaccard, Bayesian model-based cluster analysis, percentage of polymorphic loci, Shannon?s information index and Nei gene diversity were employed to assess the genetic diversity. The analyses demonstrated a high genetic diversity among Híbrido de Timor accessions. UPGMA and Bayesian cluster analyses grouped the accessions into three clusters. The genetic structure of Híbrido de Timor is reported. The management of Híbrido de Timor germplasm variability and its potential use in breedin programs are discussed.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Bayesian analysis; Coffee breeding; DNA markers; Principal coordinate analysis; Rust resistance..
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/880496
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Caracterização da resistência genética do híbrido de Timor UFV 427-15 à ferrugem do cafeeiro. Repositório Alice
CAIXETA, E. T.; RUFINO, R. J. N.; OLIVEIRA, A. C. B. de; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Herança da resistência; Resistência a ferrugem do cafeeiro.; Hemileia Vastatrix..
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/908995
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Caracterização da resistência vertical e horizontal do cafeeiro à ferrugem (Hemileia vastatrix Berk. & Br) em acesso de híbrido de Timor. Repositório Alice
BARBOSA, J. C.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; CAPUCHO, A. S.; RUFINO, R. N.; ALVARENGA, S. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Herança da resistência; Resistência vertical e horizontal; Melhoramento do cafeeiro.; Hemileia Vastatrix..
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/909268
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Caracterização de raças fisiológicas de Hemileia vastatrix. Repositório Alice
LELIS, T. de P.; ZAMBOLIM, E. M.; PAIXÃO, G. P. da; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, L..
Até o ano de 1983, eram conhecidas no Brasil as raças I, II, III, X, XV, XVII e XXIV de Hemileia vastatrix. Desde então, e apesar da suplantação da resistência de variedades de cafeeiros por novas raças do patógeno, nenhum outro estudo de caracterização foi realizado. Para conhecer as raças de H. vastatrix que ocorrem nas lavouras comerciais e experimentais de cafeeiros foram coletadas 150 amostras de ferrugem em genótipos susceptíveis e resistentes nos estados de Minas Gerais, Espírito Santo São Paulo e Paraná. Em nove, das 150 amostras que estão sendo caracterizadas, foram identificadas, neste trabalho, as raças I (v2,5) em amostra proveniente do Híbrido de Timor, e a II (v5) e III (v1,5) em derivados de C. arábica. A raça II prevaleceu sobre a I e III,...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: H. vastatrix; Coffea spp.; Raça Fisiológica..
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/903689
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Caracterização funcional e perfil de expressão in silico de quitinases do CAFEST. Repositório Alice
ALVARENGA, S. M.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S..
O CafEST é a base de dados que armazena as 200 mil ESTs geradas pelo Projeto Brasileiro do Genoma Café. Em trabalho anterior, sequências potencialmente associadas com a defesa do cafeeiro a doenças foram identificadas. Entre essas sequências, genes de quitinases. As proteínas codificadas por esses genes são enzimas que podem desempenhar funções como metabolismo de quitina, mecanismos de defesa contra patógenos e estresse abiótico, nutrição, parasitismo entre outras. Dada a importância desta enzima para a planta, o objetivo do presente trabalho foi analisar as ESTs de quitinase identificadas previamente. Para isso foi realizada uma caracterização funcional das sequências e construído um perfil de expressão in silico. Os resultados mostraram que essas...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Bioinformática.; Genoma.; Coffea..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/903963
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Caracterização molecular de cultivares de café resistentes à ferrugem. Repositório Alice
SOUSA, T. V.; CAIXETA, E. T.; ALKIMIM, E. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S..
Os ganhos alcançados com o melhoramento genético do cafeeiro no Brasil resultaram na obtenção de cultivares com potencial produtivo muito superior ao das cultivares tradicionais. Atualmente, 123 cultivares de C. arabica estão registradas, destas oito são protegidas. Para que uma cultivar possa ser registrada e ou protegida é obrigatório que ela seja distinta, homogênea e estável (DHE). Na comprovação de DHE de uma cultivar são usados descritores mínimos, sendo que os marcadores morfológicos tem sido os mais utilizados. No entanto, as cultivares comerciais são cada vez mais próximas fenotipicamente, o que dificulta a discriminação precisa desses materiais por meio desses descritores. Assim sendo, uma alternativa que venha auxiliar nos testes de DHE é de...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Melhoramento do cafeeiro; Marcador SSR; Fingerprinting de cultivares.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/975905
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Categorização funcional de sequências expressas envolvidas na defesa do cafeeiro a doenças. Repositório Alice
ALVARENGA, S. M.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S..
O entendimento dos mecanismos de defesa e da interação do cafeeiro com patógenos pode ser útil no desenvolvimento de novas alternativas para um controle eficiente das doenças. Tem sido demonstrado, em diferentes espécies de plantas, que genes R, responsáveis pelo reconhecimento dos patógenos, apresentam domínios conservados, como NBS (Nucleotide Binding Site) e LRR (Leucine Rich Repeat). Dessa forma, nesse trabalho, seqüências do Projeto Brasileiro do Genoma Café, previamente identificadas como contendo domínios NBS e LRR, foram funcionalmente categorizadas. A categorização foi realizada em 140 EST-contigs, sendo que 99 foram classificados em pelo menos uma das categorias funcionais do Gene Ontology. Essa categorização permitiu associar os produtos...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: In silico; Mineração de dados; ESTs; Classificação funcional.; Genoma; Doença de Planta..
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/903148
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Coefficient of parentage in Coffea arabica L. cultivars grown in Brazil. Repositório Alice
SETOTAW, T. A.; CAIXETA, E. T.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; CRUZ, C. D.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S..
The coefficient of parentage among 121 cultivars of Coffea arabica L. in Brazil released from 1939 to 2009 was estimated and used to study the genetic diversity and the breeding pattern of the breeding programs. A low genetic diversity was observed within the C. arabica cultivars of Brazil. The genetic base of 121 cultivars released in Brazil between 1939 and 2009 was defined by 13 ancestors. Seven ancestors contribute with 97.55% of the genetic base of C. arabica cultivars. Bourbon Vermelho contributed with 52.76% for the genetic pool of the C. arabica cultivars of Brazil followed by Sumatra (19.05%) and Híbrido de Timor (11.59%). Mundo Novo and Icatu Vermelho contributed with 87.65% for the genetic base of the C. arabica cultivars. It was calculated that...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Coffea Arábica.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125279
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Coeficiente de parentesco entre cultivares de café arábica. Repositório Alice
SETOTAW, T. A.; PEREIRA, A. A.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; OLIVEIRA, A. C. B. de; SAKIYAMA, N. S..
A diversidade genética em 44 cultivares de café arábica foi analisada com base no coeficiente de parentesco. O valor médio do coeficiente de parentesco foi alto, indicando a baixa diversidade genética das cultivares brasileiras de café. Por outro lado, a análise do coeficiente de parentesco ao longo de vários períodos indicou que, como resultado do trabalho dos programas de melhoramento, a diversidade genética das cultivares disponíveis aos produtores aumentou nas últimas duas décadas.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Coeficiente de parentesco; Diversidade genética.; Coffea Arábica..
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/903688
Registros recuperados: 107
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