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16s rDNA-metagenomic sequencing of bone lesions caused by femoral head necrosis in broilers. Repositório Alice
ZANELLA, R.; CANTAO, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; RHOADS, D. D.; AL-RUBAYE, A.; WIDEMAN, R. F.; LEDUR, M. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Melhoramento genético animal; Galinha; Animal genetics; Chickens.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1014240
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Age effects on gene expression related to the bacterial chondronecrosis with osteomyelitis in broiler. Repositório Alice
CANTAO, M. E.; ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; IBELLI, A. M. G.; PANDOLFI, J. R. C.; SETTLES, M.; LEDUR, M. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Gene expression; Metabolomics; Proteomics..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1037119
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Análise comparativa de transcriptoma de frangos normais e afetados com necrose da cabeça do fêmur. Repositório Alice
GOLDONI, I.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; HUL, L. M.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Problemas locomotores; Expressão gênica; RNA-Seq; Frango de Corte; Fêmur; Genética Animal; Aparelho Locomotor.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1135374
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Análise de associação genômica para hérnia umbilical em suínos comerciais utilizando abordagem de marcadores múltiplos. Repositório Alice
LAGOS, E. B.; PIRES, M. P.; ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; MORES, M. A. Z.; FERNANDES, L. T.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Anel umbilical; Blossoc; Defeitos congênitos; Influência genética; Perdas econômicas; Suinocultura; Genética Animal; Marcador Genético.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116904
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Análise integrada do transcriptoma e exoma revela novos genes relacionados ao acometimento de hérnia escrotal em suínos. Repositório Alice
ROMANO, G. de S.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; MORES, M. A. Z.; COUTINHO, L. L.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Genes diferencialmente expressos; Suinocultura; Genética Animal; Sus Scrofa Domesticus; Hérnia; Mutação.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116907
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Assessment of bacterial and archaeal community structure in swine wastewater treatment processes. Repositório Alice
SILVA, M. L. B. da; CANTAO, M. E.; MEZZARI, M. P.; MA, J.; NOSSA, C. W..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Archaeal; Bacterial; Pyrosequencing; Swine wastewater.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1033273
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Associations of the osteopontin gene with performance traits in a paternal broiler line. Repositório Alice
IBELLI, A. M. G.; FORNARI, M. B.; NEIS, K. L.; ZANELLA, R.; TESSMANN, A. L.; PANDOLFI, J. R. C.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O..
Tipo: Separatas Palavras-chave: SNPs; Genetic.; Genética; Frango de corte; Broiler chickens; Gallus gallus..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/971303
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Biological processes related to ribosome and mitochondrial functions might be involved in the osteochondrosis latens manifestation in gilts. Repositório Alice
IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; MORES, N.; MORES, M. A. Z.; CANTAO, M. E.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
Abstract: The articular osteochondrosis (OC) is a disturbance of endochondral ossification occurring in humans and livestock animals. In pigs, OC is one of the major causes of leg weakness, leading to economic losses and reducing the animal welfare. The aim of this study was to evaluate the differential gene expression related to OC latens in femoral articular cartilage in swine. Thus, samples of MS115 5-months-old gilts, normal (control group) and affected with OC latens (affected group), were collected and submitted to histopathological and gene expression analysis. A total of 1,734 genes was differentially expressed (DE) between the two groups. Several biological processes (BP) were enriched including those already known as involved with OC, such as...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Desenvolvimento ósseo; Características do fêmur; Osteocondrose articular; Problemas de locomoção; Locomotor problems; RNA-Seq; Melhoramento Genético Animal; Suíno; Gene; Osso; Fêmur; Animal genetic resources; Swine; Osteochondrosis; Gene expression; Lameness; Leg weakness.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1093227
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Caracterização metagenômica do microbioma intestinal de aves de corte através do sequenciamento parcial do gene 16S-rRNA. Repositório Alice
SAVOLDI, I. R; DAL PIZZOL, M. S.; CARMO, K. B. do; IBELLI, A. M. G.; KRAMER, B.; MORES, M. A. Z.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; JAENISCH, F. R. F.; AVILA, V. S. de; KRABBE, E. L.; LEDUR, M. C.; PANDOLFI, J. R. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: 16S rRNA; Frangos de corte; Microbioma intestinal; Alistipes.; Lachnospiraceae; Ruminococcaceae..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1059132
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Comparative characterization of the archaeal community in the amazon forest: native forest and oil palm plantation by high-throughput sequencing. Repositório Alice
DOMENECH, D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y.; CARVALHO B. J.; KYAW, C. M.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F..
ALAM 2014; CCM 2014.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Floresta amazônica; Óleo de palma; Sequenciamento de alto rendimento; Mata nativa; Comunidades microbianas; Archaeae; Solo cultivado.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1014172
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Comparative study of poultry gut and litter microbiota through a metagenomic approach. Repositório Alice
PANDOLFI, J. R. C.; SILVA, V. S.; KRAMER, B.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; LOYOLA, W.; COLDEBELLA, A.; RECH, D. V.; TREVISOL, I. M.; ESTEVES, P. A.; JAENISCH, F. R. F.; KLEIN, T. A. P.; VAZ, C. S. L.; CARON, L.; SCHIOCHET, M. F.; LOPES, L. dos S.; IBELLI, A. M. G.; TESSMANN, A. L.; MORES, N.; BRENTANO, L.; SANTOS, F. B. de O.; LEDUR, M. C.; IANISKI, F.; SILVA, M. L. B. da.
Projeto/Plano de Ação: 11.11.11.111.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Microbiologia; Produção Animal.; Metagenomics; Broiler chickens; Poultry production.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/953157
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Condronecrose bacteriana com osteomielite (BCO): um problema subestimado na avicultura de corte. Infoteca-e
PEIXOTO, J. de O.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C..
A Embrapa Suínos e Aves, em uma de suas linhas de pesquisa, vem desenvolvendo estudos em genômica com foco em problemas locomotores, tanto em aves como em suínos. Em aves, a variação genética normal de características de integridade óssea e os fatores genéticos associados à BCO estão sendo investigados.
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Problemas locomotores; Gênomica; Frango de corte; Melhoramento genético animal; Broiler chickens; Livestock breeding; Breeding and Genetic Improvement; Animal genetics.
Ano: 2015 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1031511
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Continuous circulation of human-origin seasonal influenza A viruses in swine in Brazil. Repositório Alice
SCHAEFER, R.; GAVA, D.; HAACH, V.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, J. R. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Influenza A; Human-origin; Circulation.; Swine..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1033915
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Descobertas de variantes envolvidas na ocorrência de hérnia escrotal em suínos pela análise do exoma. Repositório Alice
ROMANO, G. de S.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; WEBER, T.; MORES, M. A. Z.; MORES, N.; PEDROSA, V. B.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Doenças congênitas; Sequenciamento; Suinocultura; Genética Animal; Hérnia; Sus Scrofa Domesticus.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116906
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Detecting levels of autozygosity in two pure lines of pigs using genomic and pedigree data. Repositório Alice
ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; CARDOSO, F. F.; FREITAS, L.; OTAVIANO, A.; CAETANO, A. R.; LEDUR, M. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Melhoramento genético; Avicultura; Biologia molecular.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1013818
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Differentially expressed genes in the femur cartilage transcriptome clarify the understanding of femoral head separation in chickens. Repositório Alice
HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; MARCELINO, D. E. P.; FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. O.; CANTAO, M. E.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
Locomotor problems are among one of the main concerns in the current poultry industry, causing major economic losses and affecting animal welfare. The most common bone anomalies in the femur are dyschondroplasia, femoral head separation (FHS), and bacterial chondronecrosis with osteomyelitis (BCO), also known as femoral head necrosis (FHN). The present study aimed to identify differentially expressed (DE) genes in the articular cartilage (AC) of normal and FHS-affected broilers by RNA-Seq analysis. In the transcriptome analysis, 12,169 genes were expressed in the femur AC. Of those, 107 genes were DE (FDR < 0.05) between normal and affected chickens, of which 9 were downregulated and 98 were upregulated in the affected broilers. In the gene-set...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Expressão gênica; Sequenciamento de RNA; Cartilagem da cabeça do fêmur; Separação da cabeça femoral; Análises de expressão diferencial; Reação da cadeia de polimerase; Transcriptoma da cartilagem do fêmur; Differential expression analysis; Frango; Frango de Corte; Broiler chickens; Gene expression; Quantitative polymerase chain reaction; Transcriptome.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1135377
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Downregulation of growth plate genes involved with the onset of femoral head separation in young broilers. Repositório Alice
IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; ZANELLA, R.; GOUVEIA, J. J. de S.; CANTAO, M. E.; COUTINHO, L. L.; MARCHESI, J. A. P.; DAL PIZZOL, M. S.; MARCELINO, D. E. P.; LEDUR, M. C..
Abstract: Femoral head separation (FHS) is characterized by the detachment of growth plate (GP) and articular cartilage, occurring in tibia and femur. However, the molecular mechanisms involved with this condition are not completely understood. Therefore, genes and biological processes (BP) involved with FHS were identified in 21-day-old broilers through RNA sequencing of the femoral GP. 13,487 genes were expressed in the chicken femoral head transcriptome of normal and FHS-affected broilers. From those, 34 were differentially expressed (DE; FDR &#8804;0.05) between groups, where all of them were downregulated in FHS-affected broilers. The main BP were enriched in receptor signaling pathways, ossification, bone mineralization and formation, skeletal...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Necrose da cabeça femoral; Femoral head necrosis; RNA-Seq; FBN2; FHS; Frango; Galinha; Genética Animal; Chickens; Gene expression.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1145416
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Draft genome sequence of Pasteurella multocida strain 11246. Repositório Alice
CANTAO, M. E.; OLIVEIRA FILHO, J. X. de; KICH, J. D.; KLEIN, C. S.; ZANELLA, R.; MORES, M. A. Z.; REBELATTO, R.; MORES, N..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Pneumonia; Suíno; Pasteurella Multocida.; Bacterial pneumonia..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/979713
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Duodenum transcriptome profile of laying hens submitted to different levels of calcium and phosphorus in the diet. Repositório Alice
SALMÓRIA, L. A.; IBELLI, A. M. G.; TAVERNARI, F. de C.; PEIXOTO, J. de O.; MARCELINO, D. E. P.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: RNA sequencing; Differentially expressed genes; Sequenciamento de RNA; Genes diferencialmente expressos; Frango; Chickens.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1141686
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Estrutura populacional de uma linha paterna de frangos de corte usando análise de registros de pedigree. Repositório Alice
CARVAJAL, A. B.; MARCHESI, J. A. P.; BERNARDES, P. A.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Número efetivo de fundadores; Tamanho efetivo populacional.; Endogamia.; Aves..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1058966
Registros recuperados: 72
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