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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Variedade; Genótipo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/923298
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/923169
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/938894
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Variedade; Genótipo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/922956
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Análise ampla do genoma funcional de feijoeiro em condições de deficiência hídrica. Repositório Alice
PEREIRA, W. J.; MELO, A. T. de O.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; VIANELLO, R. P..
Esse estudo teve como objetivo desenvolver e sequenciar bibliotecas de cDNA a partir de diferentes tecidos e genótipos de feijão e analisar em resposta aos tratamentos específicos os níveis diferenciais de expressão gênica. Foram avaliados os genótipos fenotipicamente divergentes BAT477, caracterizado como tolerante à seca, e Pérola, como suscetível.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Deficiência hídrica; Genoma.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039617
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Association mapping for yield and grain quality traits in rice (Oryza sativa L.). Repositório Alice
BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, R. P. V.; BRESEGHELLO, F.; COELHO, A. S. G.; MENDONÇA, J. A.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, C..
Association analysis was applied to a panel of accessions of Embrapa Rice Core Collection (ERiCC) with 86 SSR and field data from two experiments. A clear subdivision between lowland and upland accessions was apparent, thereby indicating the presence of population structure. Thirty-two accessions with admixed ancestry were identified through structure analysis, these being discarded from association analysis, thus leaving 210 accessions subdivided into two panels. The association of yield and grain-quality traits with SSR was undertaken with a mixed linear model, with markers and subpopulation as fixed factors, and kinship matrix as a random factor. Eight markers from the two appraised panels showed significant association with four different traits,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Association analysis; Core collection; Genetic structure; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Germoplasma; Rice; Germplasm conservation.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/862017
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Avaliação da resposta à brusone em germoplasma japônica tropical de arroz. Repositório Alice
RIBEIRO, A. G.; MELLO, R. N. de; BORBA, T. C. de O.; COELHO, A. S. G..
A brusone (agente causal - Magnaporthe oryzae) é considerada a doença mais importante para a cultura do arroz no mundo. Devido à alta variabilidade das populações do patógeno, cultivares que possuem resistência vertical deixam de ser efetivas apenas 2 a 3 anos após seu lançamento. Sendo assim, o objetivo deste trabalho foi identificar potenciais fontes de resistência horizontal à M. oryzae para uso pelo programa de melhoramento de arroz da Embrapa.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza Sativa; Brusone; Germoplasma.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118023
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Avaliação genotípica de linhagens e cultivares brasileiras e introduzidas da coleção nuclear de arroz da Embrapa por meio da caracterização agronômica e molecular. Repositório Alice
BUENO, L. G.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. O.; OLIVEIRA, J. P..
Avaliar a diversidade genética de linhagens e cultivares brasileira e do exterior da CNAE, por meio de caracteres agronômicos e marcadores moleculares SSR.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Caracterização agronômica; Caracterização molecular; SSR; Arroz; Oryza sativa; Germoplasma.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/866754
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Biochemical and metabolic profiles of Trichoderma strains isolated from common bean crops in the Brazilian Cerrado, and potential antagonism against Sclerotinia sclerotiorum. Repositório Alice
LOPES, F. A. C.; STEINDORFF, A. S.; GERALDINE, A. M.; BRANDÃO, R. S.; MONTEIRO, V. N.; LOBO JUNIOR, M.; COELHO, A. S. G.; ULHOA, C. J.; SILVA, R. N..
Some species of Trichoderma have successfully been used in the commercial biological control of fungal pathogens, e.g., Sclerotinia sclerotiorum, an economically important pathogen of common beans (Phaseolus vulgaris L.). The objectives of the present study were (1) to provide molecular characterization of Trichoderma strains isolated from the Brazilian Cerrado; (2) to assess the metabolic profile of each strain by means of Biolog FF Microplates; and (3) to evaluate the ability of each strain to antagonize S. sclerotiorum via the production of cell wall-degrading enzymes (CWDEs), volatile antibiotics, and dual-culture tests. Among 21 isolates, we identified 42.86 % as Trichoderma asperellum, 33.33 % as Trichoderma harzianum, 14.29 % as Trichoderma...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Cerrado; Sclerotinia sclerotiorum; Trichoderma; Fungo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/933549
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Climatic oscillations in the production of Eucalyptus benthamii x E. dunnii shoots in mini-clonal hedge. Repositório Alice
PIRES, P. P.; WENDLING, I.; SOUZA, A. M. de; COELHO, A. S. G..
Detailed knowledge on the factors influencing the production of minicuttings, especially focusing on management and environmental optimization is important. Therefore, this study aimed at evaluating the influence of temperature, relative humidity and PAR (photosynthetically active radiation) and their oscillations in mini-clonal hedges of three E. benthamii x E. dunnii hybrid clones regarding survival, vigor and productive capacity of ministumps. A mini-clonal hedge with a semi-hydroponic system was formed, with five replicates of five ministumps per clone, submitted to 41 successive collections of minicuttings during one year. A multiple linear regression model for minicutting production was adjusted according to maximum, average and minimum climatic...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Minicutting; Miniestaquia; Eucalipto; Clone; Eucalyptus; Cloning (plants); Photosynthetically active radiation.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1106351
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Comparative linkage mapping of Oryza glumaepatulaand Oryza sativa interspecific crosses based on microsatellite and expressed sequence tag markers. Repositório Alice
RANGEL, P. N.; BRONDANI, R. P. V.; COELHO, A. S. G.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, C..
Molecular linkage maps representing the rice genome have been an important tool for breeding programs because they allow the elucidation of polygenic traits and are an efficient tool for monitoring wild introgressions in interspecific crosses. Common markers among rice genetic maps are important in defining the homology of chromosomes and the synteny between genomic target regions. We used 148 markers (expressed sequence tags, microsatellites and single nucleotide polymorphisms) to construct a molecular linkage map based on co-dominant markers for an interspecific backcross population using a wild rice ( Oryza glumaepatula) from Brazil and performed a comparative analysis with other interspecific maps. The comparative analysis revealed a Spearman...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Rice; Molecular markers; Oryza glumaepatula; Microsatellite.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/215913
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Comparative proteomics in the genus Paracoccidioides. Repositório Alice
PIGOSSO, L. L.; PARENTE, A. F. A.; COELHO, A. S. G.; SILVA, L. P. da; BORGES, C. L.; BAILÃO, A. M.; SOARES, C. M. de A..
bitstream/item/179974/1/1-s2.0-S1087184513001291-main.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Phylogenetic species; Comparative proteomic profiles; Paracoccidioides.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/979961
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Construção de mapa genético de Eucalyptus utilizando microssatélites. Repositório Alice
CHEDIAK, G. L. de C.; COELHO, A. S. G.; BRONDANI, R. P. V..
O objetivo principal deste trabalho é a construção de mapas genéticos baseados em locos microssatélites e identificação de regiões genômicas associadas a características físico-químicas da madeira utilizando um cruzamento entre a espécies E. grandis e um híbrido E. Urophylla x E. Globulus.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Eucalipto; Melhoramento genético vegetal; Marcador molecular; Microssatélite; Conpeex.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/217546
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Development of microsatellite markers in Annona crasiflora Mart., a brazilian cerrado fruit tree species Repositório Alice
PEREIRA, M. F.; BANDEIRA, L. F.; BLANCO, A. J. V.; CIAMPI, A. Y.; COELHO, A. S. G..
bitstream/item/177842/1/SP-19615-ID-30902.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diversidade Genética; Annona Crassiflora; Araticum; Cerrado.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/190628
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Efetividade da seleção recorrente genotípica no melhoramento do arroz irrigado. Repositório Alice
MORAIS JUNIOR, O. P. de; BRESEGHELLO, F.; DUARTE, J. B.; MORAIS, O. P. de; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. de O.; RANGEL, P. H. N..
Nosso objetivo foi avaliar a efetividade deste método em atingir progresso genético, mantendo a variabilidade genética e aumentando o potencial da população para a extração de linhagens superiores quanto à produtividade, altura de planta e duração do ciclo até a floração. A população de arroz irrigado utilizada neste trabalho foi a CNA12S, a qual tem ampla base genética e já foi submetida a três ciclos de seleção recorrente.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Ganho genético; Tamanho efetivo; Arroz irrigado; Oryza sativa; Melhoramento genético vegetal; Seleção recorrente.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078675
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Evaluation of genetic parameters and clonal selection of Eucalyptus in the Cerrado region. Repositório Alice
OLIVEIRA, R. de S.; RIBEIRO, C. V. G.; NERES, D. F.; PORTO, A. C. da M.; RIBEIRO, D.; SIQUEIRA, L. de; ZAUZA, E. A. V.; COELHO, A. S. G.; REIS, C. F.; ALFENAS, A. C.; NOVAES, E..
Eucalyptus plantations in Brazil are expanding toward the northern and mid-western regions of the country. The objective of the present study was to select clones adapted to the local conditions, with a focus on the Cerrado region. Three clonal experiments were conducted in the municipalities of Catalão, Corumbá-de-Goiás, and Luziânia, in Goiás State, with 109 genotypes of eucalypts. The experimental design consisted of a randomized complete block design with single-tree plots and 29 blocks. Diameter at breast height and total height of all trees were measured four years after planting, for use in the estimation of wood volume for each genotype. The genotype × environmental interaction was significant and predominantly (74%) complex. The genotypic...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Clonal forestry; Biometric models; G×E interaction; Forest breeding; Melhoramento genético; Wood productivity; Eucalipto; Madeira; Seleção Genética; Produtividade; Eucalyptus.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125510
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Genetic structure and gene flow in Eugenia dysenterica DC in the Brazilian Cerrado utilizing SSR markers. Repositório Alice
ZUCCHI, M. I.; BRONDANI, R. P. V.; PINHEIRO, J. B.; CHAVES, L. J.; COELHO, A. S. G.; VENCOVSKY, R..
The ''cagaita tree'' (Eugenia dysenterica) is a plant found widespread in the Brazilian Cerrado. Its fruit is used for popular consumption and for industrial purposes. This study opens a new perspective for the generation of population genetic data and parameters estimates for devising sound collection and conservation procedures for Eugenia dysenterica. A battery of 356 primer pairs developed for Eucalyptus spp. was tested on the ''cagaita tree''. Only 10 primer pairs were found to be transferable between the two species. Using a polyacrilamide gel, an average of 10.4 alleles per locus was detected, in a sample of 116 individuals from 10 natural ''cagaita tree'' populations. Seven polymorphic loci allowed estimation of genetic parameters, including...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genetic diversity; Tropical tree; SSR; Eugenia Dysenterica; Cagaita; Cerrado; Variação Genética; Marcador Molecular; Myrtaceae.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1122034
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Genome-wide analysis of the transcriptional response to drought stress in root and leaf of common bean. Repositório Alice
PEREIRA, W. J.; MELO, A. T. de O.; COELHO, A. S. G.; RODRIGUES, F. A.; MAMIDI, S.; ALENCAR, S. A. de; LANNA, A. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; NASCIMENTO JUNIOR, I. R. do; BORBA, T. C. de O.; VIANELLO, R. P..
Genes related to the response to drought stress in leaf and root tissue of drought-susceptible (DS) and tolerant (DT) genotypes were characterized by RNA-Seq. In total, 54,750 transcripts, representative of 28,590 genes, were identified; of these, 1,648 were of high-fidelity (merge of 12 libraries) and described for the first time in the Andean germplasm. From the 1,239 differentially expressed genes (DEGs), 458 were identified in DT, with a predominance of genes in categories of oxidative stress, response to stimulus and kinase activity. Most genes related to oxidation-reduction terms in roots were early triggered in DT (T75) compared to DS (T150) suggestive of a mechanism of tolerance by reducing the damage from ROS. Among the KEGG enriched by DEGs...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Functional genomics; Feijão; Phaseolus Vulgaris; Deficiência Hídrica; Raiz; Folha; Beans; Soil water deficit; Genomics; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1121822
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Identificação de genitores para resistência à Magnaporthe oryzae em arroz utilizando-se a análise AMMI. Repositório Alice
CRISPIM, B. C. F.; RÉSIO, L.; BUENO, L. G.; COELHO, A. S. G.; MELLO, R. N. de.
Com o objetivo de identificar genitores para resistência à Magnaporthe oryzae entre fontes de resistência e linhagens elites, 47 genótipos foram avaliados para resistência utilizando-se 11 isolados coletados na safra 2008/2009.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Brusone; Melhoramento genético vegetal.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/924076
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In-depth genome characterization of a Brazilian common bean core collection using DArTseq high-density SNP genotyping. Repositório Alice
VALDISSER, P. A. M. R.; PEREIRA, W. J.; ALMEIDA FILHO, J. E.; MÜLLER, B. S. F.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P. de; VIANNA, J. P. G.; ZUCCHI, M. I.; LANNA, A. C.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; MORAES, A. da C.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
Background: Common bean is a legume of social and nutritional importance as a food crop, cultivated worldwide especially in developing countries, accounting for an important source of income for small farmers. The availability of the complete sequences of the two common bean genomes has dramatically accelerated and has enabled new experimental strategies to be applied for genetic research. DArTseq has been widely used as a method of SNP genotyping allowing comprehensive genome coverage with genetic applications in common bean breeding programs. Results: Using this technology, 6286 SNPs (1 SNP/86.5 Kbp) were genotyped in genic (43.3%) and non-genic regions (56. 7%). Genetic subdivision associated to the common bean gene pools (K = 2) and related to grain...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diversity arrays technology; Diversity analysis; Loci under selection; Core collection; Feijão; Phaseolus vulgaris; Genética vegetal; Linkage disequilibrium; Genotyping; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076278
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