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A large-scale analysis of resistance gene analogs (RGAs) encoding NBS domains in the genus Elaeis. Repositório Alice
SANTOS, M. de L.; ALVES, G. S. C.; COTTA, M. G.; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; ALVES, A. A.; MILLER, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T..
bitstream/item/171242/1/Resumo50CBFito-0637.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: E guineensis; E oleifera; NBS-LRRs; Biotic stress.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085646
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A large-scale analysis of resistance gene analogs (RGAs) encoding NBS domains in the genus Elaeis. Repositório Alice
SANTOS, M. de L.; SANTOS, M. de L.; COTTA, M. G.; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; ALVES, A. A.; MILLER, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T..
bitstream/item/173848/1/CBFITO-ePoster637.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: NBS-LRR; Elaeis guineenses; Elaeis oleífera; Biotic stress.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088997
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Aluminum-induced genes in grass species. Repositório Alice
NODA, R. W.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; CARNEIRO, N. P.; LANA, U. G. de P.; MAGALHAES, J. V. de; COSTA, M. M. do C.; SILVA, F. R. D.; BRAMMER, S. P.; LÂNGARO, N. C.; CARVALHO, L. J. C. B.; BEVITORI, R.; PURCINO, A. A. C..
bitstream/item/25479/1/Aluminum-induced.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Tolerância a alumínio; Sequence analysis; Genetics; Aluminum; Genes.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/873120
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Analysis of the transcriptome in Aspergillus tamarii during enzymatic degradation of sugarcane bagasse. Repositório Alice
MIDORIKAWA, G. E. O.; CORREA, C. L.; NORONHA, E. F.; FERREIRA FILHO, E. X.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G..
bitstream/item/183671/1/Midorikawa-et-al-2018-Frontiers-in-Bioengineering-and-Biotechnology.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Carbohydrate-active enzymes; XlnR; Sugar transporters; ClrA; Aspergillus tamarii; Transcriptome; Lignocellulose; Bioethanol.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096563
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Brazilian coffee genome project: an EST-based genomic resource. Repositório Alice
VIEIRA, L. G. E.; ANDRADE, A. C.; COLOMBO, C. A.; MORAES, A. H. de A.; METHA, A.; OLIVEIRA, A. C. de; LABATE, C. A.; MARINO, C. L.; MONTEIRO-VITORELLO, C. de B.; MONTE, D. C.; GIGLIOTI, E.; KIMURA, E. T.; ROMANO, E.; KURAMAE, E. E.; LEMOS, E. G. M.; ALMEIDA, E. R. P. de; JORGE, E. C.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; SILVA, F. R. da; VINECKY, F.; SAWAZAKI, H. E.; DORRY, H. F. A.; CARRER, H.; ABREU, I. N.; BATISTA, J. A. N.; TEIXEIRA, J. B.; KITAJIMA, J. P.; XAVIER, K. G.; LIMA, L. M. de; CAMARGO, L. E. A. de; PEREIRA, L. F. P.; COUTINHO, L. L.; LEMOS, M. V. F.; ROMANO, M. R.; MACHADO, M. A.; COSTA, M. M. do C.; SÁ, M. F. G. de; GOLDMAN, M. H. S.; FERRO, M. I. T.; TINOCO, M. L. P.; OLIVEIRA, M. C.; VAN SLUYS, M-A.; SHIMIZU, M. M.; MALUF, M. P.; EIRA, M. T. S. da; GUERREIRO FILHO, O.; ARRUDA, P.; MAZZAFERA, P.; MARIANI, P. D. S. C.; OLIVEIRA, R. L. B. C. de; HARAKAVA, R.; BALBAO, S. F.; TSAI, S. M.; MAURO, S. M. Z. di; SANTOS, S. N.; SIQUEIRA, W. J.; COSTA, G. G. L.; FORMIGHIERI, E. F.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G..
bitstream/item/177955/1/ID-26742-1.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Projeto genoma; Brasil; Café.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/187149
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Characterization of novel microsatellite markers in Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4. Repositório Alice
MILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; MENEZES, N. N. P.; SOUZA JUNIOR, M. T.; COSTA, M. M. do C.; AZEVEDO, V. C. R.; AMORIM, E. P.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; CIAMPI, A. Y..
Banana is a nutritionally important crop across tropical and sub-tropical countries in sub-Saharan Africa, Central and South America and Asia. Although cultivars have evolved from diploid, triploid and tetraploid wild Asian species of Musa acuminata (A genome) and Musa balbisiana (B genome), many of today's commercial cultivars are sterile triploids or diploids, with fruit developing via parthenocarpy. As a result of restricted genetic variation, improvement has been limited, resulting in a crop frequently lacking resistance to pests and disease. Considering the importance of molecular tools to facilitate development of disease resistant genotypes, the objectives of this study were to develop polymorphic microsatellite markers from BAC clone sequences for...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Banana; Musa sp.; Varieties; Marcador molecular; Melhoramento genetico vegetal.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/860025
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Contrasting effects of wild Arachis dehydrin under abiotic and biotic stresses. Repositório Alice
MOTA, A. P. Z.; OLIVEIRA, T. N.; VINSON, C. C.; WILLIAMS, T. C. R.; COSTA, M. M. do C.; ARAUJO, A. C. G. de; DANCHIN, E. G. J.; SA, M. F. G. de; GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M..
bitstream/item/196886/1/fpls-10-00497.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genome-wide; Arabidopsis; Drought; Freezing; Meloidogyne; Root-knot nematodes.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1108633
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Differentially expressed genes during flowering and grain filling in common bean (Phaseolus vulgaris) grown under drought stress conditions. Repositório Alice
MÜLLER, B. S. de F.; SAKAMOTO, T.; SILVEIRA, R. D. D.; ZAMBUSSI-CARVALHO, P. F.; PEREIRA, M.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; COSTA, M. M. do C.; GUIMARÃES, C. M.; PEREIRA, W. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO-BRONDANI, R. P..
Drought stress, particularly during the flowering and grain-filling stages of growth, contributes to serious yield loss in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The aim of this study was to identify genes induced in response to drought stress using transcriptome analysis of contrasting genotypes. Using leaf tissues of tolerant (BAT 477) and susceptible common bean genotypes (Pérola), collected at the flowering and grain-filling stages, four complementary deoxyribonucleic acid representational difference analysis subtractive libraries were constructed and then sequenced. A total of 7,203 (77.6 %) sequences with an average sequence size of 570 bp were considered valid, for a combined 4 Mbp sequence. According to a differential display analysis, 802 expressed...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Deficiência hídrica; Beans; Abiotic stress; Water stress.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/994817
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Expressão diferencial de genes em Pleurotus pulmonarius associados a degradação enzimática e destoxificação da torta de pinhão-manso. Repositório Alice
GOMES, T. G.; ALVES, G. S. C.; HADI, S. I. I. A.; COSTA, M. M. do C.; MENDONCA, S.; MILLER, R. N. G.; SIQUEIRA, F. G. de.
bitstream/item/184260/1/EnPI-2018-8.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Transcritoma; NGS; Pré-tratamento biológico; Macrofungos; Jatropha Curcas.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097269
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Expressed sequence-tag analysis of ovaries of Brachiaria brizantha reveals genes associated with the early steps of embryo sac differentiation of apomictic plants. Repositório Alice
SILVEIRA, E. D.; GUIMARÃES, L. A.; DUSI, D. M. de A.; SILVA, F. R. da; MARTINS, N. F.; COSTA, M. M. do C.; ALVES-FERREIRA, M.; CARNEIRO, V. T. de C..
Abstract - In apomixis, asexual mode of plant reproduction through seeds, an unreduced megagametophyte is formed due to circumvented or altered meiosis. The embryo develops autonomously from the unreduced egg cell, independently of fertilization. Brachiaria is a genus of tropical forage grasses that reproduces sexually or by apomixis. A limited number of studies have reported the sequencing of apomixis-related genes and a few Brachiaria sequences have been deposited at genebank databases. This work shows sequencing and expression analyses of expressed sequence-tags (ESTs) of Brachiaria genus and points to transcripts from ovaries with preferential expression at megasporogenesis in apomictic plants. From the 11 differentially expressed sequences from...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Forage grass; Apomixis; Plant reproduction.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/938024
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First microsatellite markers developed from cupuassu ESTs: application in diversity analysis and cross-species transferability to cacao. Repositório Alice
SANTOS, L. F. dos; FREGAPANI, R. M.; FALCAO, L. L.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; LOPES, U. V.; GRAMACHO, K. P.; ALVES, R. M.; MICHELI, F.; MARCELLINO, L. H..
The cupuassu tree (Theobroma grandiflorum) (Willd. ex Spreng.) Schum. is a fruitful species from the Amazon with great economical potential, due to the multiple uses of its fruit´s pulp and seeds in the food and cosmetic industries, including the production of cupulate, an alternative to chocolate. In order to support the cupuassu breeding program and to select plants presenting both pulp/seed quality and fungal disease resistance, SSRs from Next Generation Sequencing ESTs were obtained and used in diversity analysis. From 8,330 ESTs, 1,517 contained one or more SSRs (1,899 SSRs identified). The most abundant motifs identified in the EST-SSRs were hepta- and trinucleotides, and they were found with a minimum and maximum of 2 and 19 repeats, respectively....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Cupuaçu; Fruta tropical; Melhoramento genético; Cacau.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1042190
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Gene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita. Repositório Alice
CASTAÑEDA, N. E. N.; ALVES, G. S. C.; ALMEIDA, R. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SANTOS, J. R. P.; CARES, J. E.; MILLER, R. N. G..
Background and Aims: Endoparasitic root-knot nematodes (RKNs) ( Meloidogyne spp.) cause considerable losses in banana ( Musa spp.), with Meloidogyne incognita a predominant species in Cavendish sub-group bananas. This study investigates the root transcriptome in Musa acuminata genotypes 4297-06 (AA) and Cavendish Grande Naine (CAV; AAA) during early compatible interactions with M. incognita . Methods: Roots were analysed by brightfield light microscopy over a 35 d period to examine nematode penetration and morphological cell transformation. RNA samples were extracted 3, 7 and 10 days after inoculation (DAI) with nematode J2 juveniles, and cDNA libraries were sequenced using lllumina HiSeq technology. Sequences were mapped to the M. acuminata ssp....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Musa acuminata; Meloidogyne incognita; Root-knot nematode; Biotic stress; Transcriptome; Monocotyledons.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076414
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Gene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita. Repositório Alice
CASTAÑEDA, N. E. N.; ALVES, G. S. C.; ALMEIDA, R. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SANTOS, J. R. P.; CARES, J. E.; MILLER, R. N. G..
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Musa acuminata; Meloidogyne incognita; Root-knot nematode; Biotic stress; Transcriptome; Monocotyledons.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074046
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Spring is coming: genetic analyses of the bud break date locus reveal candidate genes from the cold perception pathway to dormancy release in apple (Malus x domestica Borkh.) Repositório Alice
MIOTTO, Y. E.; TESSELE, C.; CZERMAINSKI, A. B. C.; PORTO, D. D.; FALAVIGNA, V. da S.; SARTOR, T.; CATTANI, A. M.; DELATORRE, C. A.; ALENCAR, S. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GRYNBERG, P.; OLIVEIRA, P. R. D. de; KVITSCHAL, M. V.; DENARDI, F.; BUFFON, V.; REVERS, L. F..
Chilling requirement (CR) for bud dormancy completion determines the time of bud break in apple (Malus × domestica Borkh.). The molecular control of bud dormancy is highly heritable, suggesting a strong genetic control of the trait. An available Infinium II SNP platform for genotyping containing 8,788 single nucleotide polymorphic markers was employed, and linkage maps were constructed in a F1 cross from the low CR M13/91 and the moderate CR cv. Fred Hough. These maps were used to identify quantitative trait loci (QTL) for bud break date as a trait related to dormancy release. A major QTL for bud break was detected at the beginning of linkage group 9 (LG9). This QTL remained stable during seven seasons in two different growing sites. To increase mapping...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bud dormancy; Linkage mapping; MdoFLC; MdoICE1; MdoPRE1; Apples; Chilling requirement.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1109789
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Spring is coming: genetic analyses of the bud break date locus reveal candidate genes from the cold perception pathway to dormancy release in apple (Malus x domestica Borkh.) Repositório Alice
MIOTTO, Y. E.; TESSELE, C.; CZERMAINSKI, A. B. C.; PORTO, D. D.; FALAVIGNA, V. da S.; SARTOR, T.; CATTANI, A. M.; DELATORRE, C. A.; ALENCAR, S. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GRYNBERG, P.; OLIVEIRA, P. R. D. de; KVITSCHAL, M. V.; DENARDI, F.; BUFFON, V.; REVERS, L. F..
bitstream/item/195614/1/fpls-10-00033.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bud dormancy; Linkage mapping; MdoFLC; MdoICE1; MdoPRE1; Apples; Chilling requirement.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1108014
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Systemic and sex-biased regulation of OBP expression under semiochemical stimuli. Repositório Alice
PAULA, D. P.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; MARTINS, N. F.; ANDOW, D. A..
bitstream/item/177766/1/s41598-018-24297-z.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: OBP transcripts; Anthonomus grandis grandis.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1092003
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