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A large-scale analysis of resistance gene analogs (RGAs) encoding NBS domains in the genus Elaeis. Repositório Alice
SANTOS, M. de L.; COTTA, M. G.; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; ALVES, A. A.; MILLER, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T..
Poster 637.
Tipo: Separatas Palavras-chave: NBS-LRR; Elaeis guineenses.; Elaeis Oleifera.; Biotic stress..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088997
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A large-scale analysis of resistance gene analogs (RGAs) encoding NBS domains in the genus Elaeis. Repositório Alice
SANTOS, M. de L.; ALVES, G. S. C.; COTTA, M. G.; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; ALVES, A. A.; MILLER, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T..
Tipo: Separatas Palavras-chave: E guineensis; E oleifera; NBS-LRRs; Biotic stress.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085646
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Aluminum-induced genes in grass species. Repositório Alice
NODA, R. W.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; CARNEIRO, N. P.; LANA, U. G. de P.; MAGALHAES, J. V. de; COSTA, M. M. do C.; SILVA, F. R. D.; BRAMMER, S. P.; LÂNGARO, N. C.; CARVALHO, L. J. C. B.; BEVITORI, R.; PURCINO, A. A. C..
AB3C X-meeting 2010.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Tolerância a alumínio; Sequence analysis; Genetics; Aluminum; Genes.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/873120
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Analyses of cupuassu (Theobroma grandiflorum) transcriptome during interaction with Moniliophthora perniciosa, the causal agent of Witches' Broom disease. Repositório Alice
FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; ALVES, R. M.; ALBUQUERQUE, P. S. B.; MARCELLINO, L. H..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Cupuaçu; Theobroma Grandiflorum; Doença; Doença de Planta; Vassoura de Bruxa.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101187
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Analysis of the transcriptome in Aspergillus tamarii during enzymatic degradation of sugarcane bagasse. Repositório Alice
MIDORIKAWA, G. E. O.; CORREA, C. L.; NORONHA, E. F.; FERREIRA FILHO, E. X.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G..
Na publicação: Orzenil Bonfim Silva-Junior.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Carbohydrate-active enzymes; XlnR; Sugar transporters; ClrA; Aspergillus tamarii; Transcriptome; Lignocellulose; Bioethanol.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096563
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Brazilian coffee genome project: an EST-based genomic resource. Repositório Alice
VIEIRA, L. G. E.; ANDRADE, A. C.; COLOMBO, C. A.; MORAES, A. H. de A.; METHA, A.; OLIVEIRA, A. C. de; LABATE, C. A.; MARINO, C. L.; MONTEIRO-VITORELLO, C. de B.; MONTE, D. C.; GIGLIOTI, E.; KIMURA, E. T.; ROMANO, E.; KURAMAE, E. E.; LEMOS, E. G. M.; ALMEIDA, E. R. P. de; JORGE, E. C.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; SILVA, F. R. da; VINECKY, F.; SAWAZAKI, H. E.; DORRY, H. F. A.; CARRER, H.; ABREU, I. N.; BATISTA, J. A. N.; TEIXEIRA, J. B.; KITAJIMA, J. P.; XAVIER, K. G.; LIMA, L. M. de; CAMARGO, L. E. A. de; PEREIRA, L. F. P.; COUTINHO, L. L.; LEMOS, M. V. F.; ROMANO, M. R.; MACHADO, M. A.; COSTA, M. M. do C.; SÁ, M. F. G. de; GOLDMAN, M. H. S.; FERRO, M. I. T.; TINOCO, M. L. P.; OLIVEIRA, M. C.; VAN SLUYS, M-A.; SHIMIZU, M. M.; MALUF, M. P.; EIRA, M. T. S. da; GUERREIRO FILHO, O.; ARRUDA, P.; MAZZAFERA, P.; MARIANI, P. D. S. C.; OLIVEIRA, R. L. B. C. de; HARAKAVA, R.; BALBAO, S. F.; TSAI, S. M.; MAURO, S. M. Z. di; SANTOS, S. N.; SIQUEIRA, W. J.; COSTA, G. G. L.; FORMIGHIERI, E. F.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Projeto genoma; Brasil; Café.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/187149
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Characterization of novel microsatellite markers in Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4. Repositório Alice
MILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; MENEZES, N. N. P.; SOUZA JUNIOR, M. T.; COSTA, M. M. do C.; AZEVEDO, V. C. R.; AMORIM, E. P.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; CIAMPI, A. Y..
Banana is a nutritionally important crop across tropical and sub-tropical countries in sub-Saharan Africa, Central and South America and Asia. Although cultivars have evolved from diploid, triploid and tetraploid wild Asian species of Musa acuminata (A genome) and Musa balbisiana (B genome), many of today's commercial cultivars are sterile triploids or diploids, with fruit developing via parthenocarpy. As a result of restricted genetic variation, improvement has been limited, resulting in a crop frequently lacking resistance to pests and disease. Considering the importance of molecular tools to facilitate development of disease resistant genotypes, the objectives of this study were to develop polymorphic microsatellite markers from BAC clone sequences for...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Banana; Marcador Molecular; Melhoramento Genético Vegetal; Musa sp.; Varieties..
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/860025
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Combinação de abordagens de análises de novo e guiadas pelo genoma para explorar dados de RNA-Seq de sementes oleaginosas para anotação de vias de ácidos graxos. Infoteca-e
LEMOS, V. N. S.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; RECH FILHO, E. L.; GRYNBERG, P..
Elaeis guineensis (dendê), Jatropha curcas (pinhão-manso) e Ricinus communis (mamona) produzem ácidos graxos que podem ser utilizados como fonte renovável na matriz energética, apresentando um grande potencial biotecnológico para as indústrias da área. O objetivo deste trabalho foi identificar transcritos relacionados com a síntese de ácidos graxos e inferir a sua presença em vias metabólicas. Para isso, o RNA total de sementes destas três espécies foi extraído e sequenciado. Os transcritomas foram montados utilizando abordagens de novo e guiados pelo genoma e filtrados com o programa Evidential Gene para a obtenção de resultados robustos. Uma base de dados contendo 527 sequências de 170 códigos de enzimas únicos de 12 vias de metabolismo de ácidos graxos...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Pinhão-manso; RNA-Seq; Vias metabólicas; Dendê; Mamona; Elaeis Guineensis; Jatropha Curcas; Ricinus Communis.
Ano: 2021 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1131672
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Comparative transcriptomics of cupuassu (Theobroma grandiflorum) offers insights into the early defense mechanism to Moniliophthora perniciosa, the causal agent of witches' broom disease. Repositório Alice
FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; ALBUQUERQUE, P. S. B.; ALVES, R. M.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; BRIGIDO, M. M.; MARCELLINO, L. H..
Na publicação; Joseilde Oliveira Silva-Werneck.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Differential gene expression; Functional genomics; Plant-pathogen interaction; RNA-Seq; Transcriptome.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1148790
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Contrasting effects of wild Arachis dehydrin under abiotic and biotic stresses. Repositório Alice
MOTA, A. P. Z.; OLIVEIRA, T. N.; VINSON, C. C.; WILLIAMS, T. C. R.; COSTA, M. M. do C.; ARAUJO, A. C. G. de; DANCHIN, E. G. J.; SA, M. F. G. de; GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M..
Na publicação: Ana Claudia Guerra Araujo, Maria Fatima Grossi-de-Sá, Patricia Messenberg Guimaraes.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Genome-wide; Arabidopsis; Drought; Freezing; Meloidogyne; Root-knot nematodes.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1108633
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Differentially expressed genes during flowering and grain filling in common bean (Phaseolus vulgaris) grown under drought stress conditions. Repositório Alice
MÜLLER, B. S. de F.; SAKAMOTO, T.; SILVEIRA, R. D. D.; ZAMBUSSI-CARVALHO, P. F.; PEREIRA, M.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; COSTA, M. M. do C.; GUIMARÃES, C. M.; PEREIRA, W. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO-BRONDANI, R. P..
Drought stress, particularly during the flowering and grain-filling stages of growth, contributes to serious yield loss in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The aim of this study was to identify genes induced in response to drought stress using transcriptome analysis of contrasting genotypes. Using leaf tissues of tolerant (BAT 477) and susceptible common bean genotypes (Pérola), collected at the flowering and grain-filling stages, four complementary deoxyribonucleic acid representational difference analysis subtractive libraries were constructed and then sequenced. A total of 7,203 (77.6 %) sequences with an average sequence size of 570 bp were considered valid, for a combined 4 Mbp sequence. According to a differential display analysis, 802 expressed...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Deficiência hídrica; Beans; Abiotic stress; Water stress.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/994817
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Expressão diferencial de genes em Pleurotus pulmonarius associados a degradação enzimática e destoxificação da torta de pinhão-manso. Repositório Alice
GOMES, T. G.; ALVES, G. S. C.; HADI, S. I. I. A.; COSTA, M. M. do C.; MENDONCA, S.; MILLER, R. N. G.; SIQUEIRA, F. G. de.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Transcritoma; NGS; Pré-tratamento biológico; Macrofungos; Jatropha Curcas.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097269
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Expressed sequence-tag analysis of ovaries of Brachiaria brizantha reveals genes associated with the early steps of embryo sac differentiation of apomictic plants. Repositório Alice
SILVEIRA, E. D.; GUIMARÃES, L. A.; DUSI, D. M. de A.; SILVA, F. R. da; MARTINS, N. F.; COSTA, M. M. do C.; ALVES-FERREIRA, M.; CARNEIRO, V. T. de C..
Abstract - In apomixis, asexual mode of plant reproduction through seeds, an unreduced megagametophyte is formed due to circumvented or altered meiosis. The embryo develops autonomously from the unreduced egg cell, independently of fertilization. Brachiaria is a genus of tropical forage grasses that reproduces sexually or by apomixis. A limited number of studies have reported the sequencing of apomixis-related genes and a few Brachiaria sequences have been deposited at genebank databases. This work shows sequencing and expression analyses of expressed sequence-tags (ESTs) of Brachiaria genus and points to transcripts from ovaries with preferential expression at megasporogenesis in apomictic plants. From the 11 differentially expressed sequences from...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Forage grass; Apomixis; Plant reproduction.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/938024
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First microsatellite markers developed from cupuassu ESTs: application in diversity analysis and cross-species transferability to cacao. Repositório Alice
SANTOS, L. F. dos; FREGAPANI, R. M.; FALCAO, L. L.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; LOPES, U. V.; GRAMACHO, K. P.; ALVES, R. M.; MICHELI, F.; MARCELLINO, L. H..
The cupuassu tree (Theobroma grandiflorum) (Willd. ex Spreng.) Schum. is a fruitful species from the Amazon with great economical potential, due to the multiple uses of its fruit´s pulp and seeds in the food and cosmetic industries, including the production of cupulate, an alternative to chocolate. In order to support the cupuassu breeding program and to select plants presenting both pulp/seed quality and fungal disease resistance, SSRs from Next Generation Sequencing ESTs were obtained and used in diversity analysis. From 8,330 ESTs, 1,517 contained one or more SSRs (1,899 SSRs identified). The most abundant motifs identified in the EST-SSRs were hepta- and trinucleotides, and they were found with a minimum and maximum of 2 and 19 repeats, respectively....
Tipo: Separatas Palavras-chave: Melhoramento genético.; Cacau; Cupuaçu; Fruta Tropical..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1042190
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Gene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita. Repositório Alice
CASTAÑEDA, N. E. N.; ALVES, G. S. C.; ALMEIDA, R. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SANTOS, J. R. P.; CARES, J. E.; MILLER, R. N. G..
Background and Aims: Endoparasitic root-knot nematodes (RKNs) ( Meloidogyne spp.) cause considerable losses in banana ( Musa spp.), with Meloidogyne incognita a predominant species in Cavendish sub-group bananas. This study investigates the root transcriptome in Musa acuminata genotypes 4297-06 (AA) and Cavendish Grande Naine (CAV; AAA) during early compatible interactions with M. incognita . Methods: Roots were analysed by brightfield light microscopy over a 35 d period to examine nematode penetration and morphological cell transformation. RNA samples were extracted 3, 7 and 10 days after inoculation (DAI) with nematode J2 juveniles, and cDNA libraries were sequenced using lllumina HiSeq technology. Sequences were mapped to the M. acuminata ssp....
Tipo: Separatas Palavras-chave: Root-knot nematode.; Monocotyledons; Meloidogyne Incognita; Musa Acuminata.; Biotic stress; Transcriptome..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076414
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Gene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita. Repositório Alice
CASTAÑEDA, N. E. N.; ALVES, G. S. C.; ALMEIDA, R. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SANTOS, J. R. P.; CARES, J. E.; MILLER, R. N. G..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Root-knot nematode.; Monocotyledons; Meloidogyne Incognita; Musa Acuminata.; Biotic stress; Transcriptome..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074046
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Overexpression of a soybean Globin (GmGlb1-1) gene reduces plant susceptibility to Meloidogyne incognita. Repositório Alice
BASSO, M. F.; LOURENCO, I. T.; MOREIRA-PINTO, C. E.; MENDES, R. A. G.; PAES-DE-MELO, B.; NEVES, M. R. das; MACEDO, A. F.; FIGUEIREDO, V.; GRANDIS, A.; MACEDO, L. L. P. de; ARRAES, F. B. M.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; ENRICH-PRAST, A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; GOMES, A. C. M. M.; SILVA, M. C. M. da; FLOH, E. I. S.; BUCKERIDGE, M. S.; ENGLER, J. de A.; SA, M. F. G. de.
Na publicação: Isabela Tristan Lourenço-Tessutti; Leonardo Lima Pepino Macedo; Francismar Corrêa Marcelino-Guimaraes; Maria Cristina Mattar Silva; Maria Fatima Grossi-de-Sa.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Glyma 11G121800; New biotechnology tools; Phytoglobins; Plant-nematode interaction; Rootknot nematodes; PI595099; BRS133; Glycine Max; Soja; Nematóide; Soybeans; Nematoda.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1151081
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Overexpression of the GmEXPA1 gene reduces plant susceptibility to Meloidogyne incognita. Repositório Alice
BASSO, M. F.; LOURENCO, I. T.; MOREIRA‐PINTO, C. E.; MENDES, R. A. G.; PEREIRA, D. G.; GRANDIS, A.; MACEDO, L. L. P. de; MACEDO, A. F.; GOMES, A. C. M. M.; ARRAES, F. B. M.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; SILVA, M. C. M. da; FLOH, E. I. S.; BUCKERIDGE, M. S.; ENGLER, J. de A.; SA, M. F. G. de.
FIRST ONLINE.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Soja; Nematóide; Soybeans; Nematoda.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1151082
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Prediction and identification of miRNAS in Elaeis Guinensis Jacq and analysis of their expression in oil palm plants under salinity drought stress. Repositório Alice
SALGADO, F. F.; VIEIRA, L. R.; SILVA, V, N. B.; LEAO, A. P.; GRYNBERG, P.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T..
Oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) is an oilseed crop of great economic importance. The oil palm industry has a large-scale production worldwide and uses high efficient extraction and refining processes to obtain palm oil and palm kernel oil. In Brazil, currently, there is an extensive area suitable for oil palm planting outside the Amazon rainforest; however, these areas go through long periods of water scarcity and demand artificial irrigation to be sustainable. One-quarter of the irrigated area in agriculture has a problem with salinity stress.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Abiotic stress; Transcription factors; Non-coding RNA; Oil palm products.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1149420
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Priming of indirect defence responses in maize is shown to be genotype-specific. Repositório Alice
MICHEREFF, M. F. F.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; LAUMANN, R. A.; ZHOU, J.-J.; SCHIMMELPFENG, P. H. C.; BORGES, M.; PICKETT, J. A.; BIRKETT, M. A.; MORAES, M. C. B..
Maria Carolina Blassioli-Moraes.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Plant-plant communication; Plant defence; Plant genotypes; Volatiles compounds; Spodoptera Frugiperda; Natural enemies.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1131742
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