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	Provedor de dados Repositório Alice (241) Infoteca-e (2) Autor COUTINHO, L. L. (243) REGITANO, L. C. de A. (137) LEDUR, M. C. (66) TIZIOTO, P. C. (48) CESAR, A. S. M. (47) MOURÃO, G. B. (40) IBELLI, A. M. G. (36) PEIXOTO, J. de O. (33) ZERLOTINI NETO, A. (29) ALENCAR, M. M. de (28) OLIVEIRA, P. S. N. de (27) MUDADU, M. de A. (26) AFONSO, J. (25) DINIZ, W. J. da S. (24) GASPARIN, G. (24) TULLIO, R. R. (24) CANTAO, M. E. (23) MOREIRA, G. C. M. (22) MOURAO, G. B. (22) ROCHA, M. I. P. (22) Mais... Palavra-chave Bos Indicus (25) Beef cattle (22) Gene expression (19) Gado Nelore (18) Expressão gênica (17) Ovino (15) Broiler chickens (14) Nellore (14) Gado de Corte (13) Melhoramento genético animal (13) Frango de corte (12) Single nucleotide polymorphism (12) Cattle (10) Genoma (9) Genome (9) Melhoramento Genético Animal (9) Nelore (9) Ovinocultura (9) Quantitative trait loci (9) Carne (8) Mais... Tipo do documento Separatas (108) Artigo de periódico (80) Anais e Proceedings de eventos (31) Parte de livro (15) -- (4) Resumo em anais e proceedings (3) Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) (1) Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) (1) Mais... Ano 2023 (1) 2022 (12) 2021 (8) 2020 (7) 2019 (18) 2018 (15) 2017 (22) 2016 (22) 2015 (21) 2014 (22) 2013 (23) 2012 (8) 2011 (5) 2010 (11) 2009 (9) 2008 (1) 2007 (6) 2006 (1) 2005 (6) 2004 (2) Mais... País Brazil (243) Idioma Inglês (146) Português (96) Espanhol (1)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 243 Primeira ... 1 2 3 4 5 6 7 8 9 ... Última 16s rDNA-metagenomic sequencing of bone lesions caused by femoral head necrosis in broilers. Repositório Alice ZANELLA, R.; CANTAO, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; RHOADS, D. D.; AL-RUBAYE, A.; WIDEMAN, R. F.; LEDUR, M. C.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Melhoramento genético animal; Galinha; Animal genetics; Chickens. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1014240 A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J. S.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Transcription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: DNA bovino; Expressão gênica; Gene expression in cattle; Gene expression regulation. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102174 A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J. S.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Transcription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an... Tipo: Separatas Palavras-chave: DNA bovine; Gene expression in cattle; Gene expression regulation. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101203 A Genome-Wide Association Study of Meat Tenderness in Nelore Beef Cattle. Repositório Alice TIZIOTO, P.; DECKER, J.; TAYLOR, J.; SCHNABEL, R.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; SONSTEGARD, T.; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R.; NASSU, R. T.; FEIJO, G. L. D.; SIQUEIRA, F.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Genome map; Tagging; Characterization.; Cattle.. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/989023 A genome-wide scan for selection signatures in Nellore cattle. Repositório Alice SOMAVILLA, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; SIQUEIRA, F.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; COUTINHO, L. L.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.. Brazilian Nellore cattle (Bos indicus) have been selected for growth traits for over more than four decades. In recent years, reproductive and meat quality traits have become more important because of increasing consumption, exports and consumer demand. The identification of genome regions altered by artificial selection can potentially permit a better understanding of the biology of specific phenotypes that are useful for the development of tools designed to increase selection efficiency. Therefore, the aims of this study were to detect evidence of recent selection signatures in Nellore cattle using extended haplotype homozygosity methodology and BovineHD marker genotypes (>777 000 single nucleotide polymorphisms) as well as to identify corresponding... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Single nucleotid; Relative extended haplotype homozygosity; Single nucleotide polymorphisms; Bos Indicus; Beef cattle; Genotyping; Linkage disequilibrium. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/998406 A genômica na bovinocultura de corte. Repositório Alice COUTINHO, L. L.; JORGE, E. C.; ROSÁRIO, M. F. do; REGITANO, L. C. de A.. Genômica: definição e conceito; Aplicações da genômica; Perspectivas das aplicações da genômica. Tipo: Separatas Palavras-chave: Genômica; Melhoramento genético.; DNA.. Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/862890 A network landscape from CNVs to Nellore cattle beef tenderness. Repositório Alice SILVA, V. H.; GIACHETTO, P. F.; TIZIOTO, P. L.; GONÇALVES, T. M.; REGITANO, L. C. A.; COUTINHO, L. L.. This work aims to perform a couple of in silico network analysis from CNVs standpoint, shedding light to possible metabolic connections to tenderness. It was used 671 Nellore males to infer CNVs, through SNP-chip (Illumina Bovine HD Beadchip®, containing approximately 770 thousand SNPs) and PennCNV software methodology. CNV regions (CNVRs) were inferred by CNVRuler (recurrence 0.1). Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Gado de Corte; Genoma.; Beef cattle; Nellore; Genome. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/969359 A network landscape from CNVs to Nellore cattle beef tenderness. Repositório Alice SILVA, V. H.; GIACHETTO, P. F.; TIZIOTO, P. L.; GONÇALVES, T. M.; REGITANO, L. C. A.; COUTINHO, L. L.. This work aims to perform a couple of in silico network analysis from CNVs standpoint, shedding light to possible metabolic connections to tenderness. It was used 671 Nellore males to infer CNVs, through SNP-chip (Illumina Bovine HD Beadchip®, containing approximately 770 thousand SNPs) and PennCNV software methodology. CNV regions (CNVRs) were inferred by CNVRuler (recurrence 0.1). Tipo: Separatas Palavras-chave: Genoma.; Gado de Corte; Beef cattle; Nellore; Genome. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/988596 A single nucleotide polymorphism in NEUROD1 is associated with production traits in nelore beef cattle. Repositório Alice OLIVEIRA, P. P. A.; TIZIOTO, P. C.; MALAGO JUNIOR, W.; NASCIMENTO, M. L. do; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. da S.; SOUZA, M. M. de; LANNA, D. P. D.; TULLIO, R. R.; MOURAO, G. B.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Feed efficiency and carcass characteristics are late-measured traits. The detection of molecular markers associated with them can help breeding programs to select animals early in life, and to predict breeding values with high accuracy. The objective of this study was to identify polymorphisms in the functional and positional candidate gene NEUROD1 (neurogenic differentiation 1), and investigate their associations with production traits in reference families of Nelore cattle. A total of 585 steers were used, from 34 sires chosen to represent the variability of this breed. By sequencing 14 animals with extreme residual feed intake (RFI) values, seven single nucleotide polymorphisms (SNPs) in NEUROD1 were identified. The investigation of marker effects on... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Candidate gene; Feed efficiency; Bos Indicus; Body composition. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1053741 Adiponectin receptor 2 gene associated with bone traits in broiler chickens. Repositório Alice GODOY, T. F.; SILVA, V. H.; TESSMANN, A. L.; PANDOLFI, J. R. C.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Osso; Frango de corte; Genetica animal; Animal genetics; Broiler chickens; Bone formation. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1014179 Allele- and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: a candidate for meat tenderness in cattle. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; ROCHA, M. I. P.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Nelore; Expressão alélica diferencial; Maciez da carne; Gado Nelore; Alleles. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1052240 Allele specific expression analysis in bovine muscle tissue. Repositório Alice SOUZA, M. M.; MOKRY, F. C.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A.; CESAR, A. S. M.; MORÉ, D.; MOURÃO, G.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C.. Imprinted genes have been target of many studies, mainly in human and mouse, and lately in bovines due to the interest of understanding the epigenetic mechanisms underlying important meat quality phenotypes and the possibility of applying it in animal breeding programs in the future. Genomic DNA from 146 steers was genotyped using the Illumina BovineHD BeadChip in order to identify heterozygous individuals with known allele origin. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Bioinformática; Expressão gênica; Genoma; Bioinformatics; Gene expression; Genome. Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1035220 Allele specific expression analysis in bovine muscle tissue. Repositório Alice SOUZA, M. M.; MOKRY, F. C.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A.; CESAR, A. S. M.; MORÉ, D.; MOURÃO, G.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; ZERLOTINI, A.; REGITANO, L. C.. Imprinted genes have been target of many studies, mainly in human and mouse, and lately in bovines due to the interest of understanding the epigenetic mechanisms underlying important meat quality phenotypes and the possibility of applying it in animal breeding programs in the future. Genomic DNA from 146 steers was genotyped using the Illumina BovineHD BeadChip in order to identify heterozygous individuals with known allele origin. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Bioinformática; Expressão gênica; Genoma; Bioinformatics; Genome; Gene expression. Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1035029 Allele-specific expression is widespread in Bos indicus muscle and affects meat quality candidate genes. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; ROCHA, M. I. P.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; CARDOSO, T. F.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; ANDRADE, B. G. N.; MUDADU, M. de A.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Differences between the expression of the two alleles of a gene are known as allele-specific expression (ASE), a common event in the transcriptome of mammals. Despite ASE being a source of phenotypic variation, its occurrence and effects on genetic prediction of economically relevant traits are still unexplored in bovines. Furthermore, as ASE events are likely driven by cis-regulatory mutations, scanning them throughout the bovine genome represents a significant step to elucidate the mechanisms underlying gene expression regulation. To address this question in a Bos indicus population, we built the ASE profile of the skeletal muscle tissue of 190 Nelore steers, using RNA sequencing data and SNPs genotypes from the Illumina BovineHD BeadChip (770 K bp).... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Expressão gênica; Regulação da expressão gênica; Allelic expression; Allele-specific expression; Bos Indicus; Gene expression regulation. Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125395 Allele-specific gene expression in liver of Nelore cattle extremes for feed efficiency. Repositório Alice ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Allele-specific expression; Genome regulation.; Genetic improvement.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1073455 An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. Repositório Alice OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A.. Residual Feed Intake (RFI) is an economically relevant trait in beef cattle. Among the molecular regulatory mechanisms, microRNAs (miRNAs) are an important dimension in post-transcriptional regulation and have been associated with different biological pathways. Here, we performed differential miRNAs expression and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) to better understand the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in bovine skeletal muscle and liver. MiRNA and mRNA expression data were obtained from Nelore steers that were genetically divergent for RFI (N = 10 [low RFI or feed efficient]; N = 10 [high RFI or feed inefficient]). Differentially expressed and hub miRNAs such as bta-miR-486, bta-miR-7, bta-miR15a, bta-miR-21,... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: RFI; MiRNA; Gado Nelore; Beef cattle; Nellore; Skeletal muscle. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099755 An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. Repositório Alice OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A.. Residual Feed Intake (RFI) is an economically relevant trait in beef cattle. Among the molecular regulatory mechanisms, microRNAs (miRNAs) are an important dimension in post-transcriptional regulation and have been associated with different biological pathways. Here, we performed differential miRNAs expression and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) to better understand the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in bovine skeletal muscle and liver. MiRNA and mRNA expression data were obtained from Nelore steers that were genetically divergent for RFI (N = 10 [low RFI or feed efficient]; N = 10 [high RFI or feed inefficient]). Differentially expressed and hub miRNAs such as bta-miR-486, bta-miR-7, bta-miR15a, bta-miR-21,... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: MicroRNAs; Residual Feed Intake; Gado Nelore; Beef cattle; Nellore; Skeletal muscle. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102149 Análise de genes candidatos para características de produção e qualidade da carcaça em aves. Repositório Alice NINOV, K.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; COLDEBELLA, A.; BERTOL, T. M.; CAETANO, A. R.; BELICUAS, S. N. J.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L.. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Ave.; Frango de corte; Produção.. Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/876763 Análise de qualidade de RNA para estudo do perfil transcriptômico de animais extremos para eficiência alimentar da raça Nelore. Repositório Alice SERRA, V.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A.. Editado por Ana Rita de Araújo nogueira, simone Cristina Méo Nicura Tipo: Separatas Palavras-chave: Perfil transcriptômico; Raça Nelore.; RNA.. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/965648 Análise integrada do transcriptoma e exoma revela novos genes relacionados ao acometimento de hérnia escrotal em suínos. Repositório Alice ROMANO, G. de S.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; MORES, M. A. Z.; COUTINHO, L. L.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C.. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Genes diferencialmente expressos; Suinocultura; Genética Animal; Sus Scrofa Domesticus; Hérnia; Mutação. Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116907 Registros recuperados: 243 Primeira ... 1 2 3 4 5 6 7 8 9 ... Última

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