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An approximate theory of selection assuming a finite number of quantitative trait loci Inra
Chevalet, C..
Une théorie approchée de la sélection est développée dans le cas d’un caractère quantitatif dont la variabilité génétique est due à un nombre fini de locus génétiquement indépendants. Le calcul est développé analytiquement en admettant que toutes les distributions statistiques peuvent être approchées par des lois normales. L’analyse montre que le comportement global du système génétique dépend essentiellement d’un «nombre efficace de locus», Le, dont les valeurs vraisemblables sont sans doute faibles (3 à 20). Des simulations confirment le rôle de ce paramètre pour caractériser la réponse cumulée à la sélection et la structure génétique de la population. Le modèle généralise l’analyse de M Bulmer. Après quelques générations d’un régime de sélection,...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: SELECTION; VARIANT GENETIQUE.
Ano: 1994 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9500008906052856&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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Commentaires sur une proposition d’extension du modèle génétique additif classique à des situations non-panmictiques Inra
Chevalet, C..
On précise quelques résultats obtenus par LANGLOIS (Ann. Génét. Sél. anim., 13, 151-163, 1981) sur l’expression des ressemblances entre apparentés en présence d’homogamie et de corrélation entre les effets du génotype et du milieu. On énonce ensuite les règles générales de calcul qui ont été utilisées implicitement, on en donne quelques exemples et on discute leur intérêt et les difficultés qui peuvent surgir.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: MODELE GENETIQUE; RESULTATS; HOMOGAMIE.
Ano: 1981 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20088adb7b25&uri=/notices/prodinra1/2008/06/
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Conditional probabilities of identity of genes at a locus linked to a marker Inra
Chevalet, C.; Gillois, M.; Vu Tien Khang, J..
On donne une méthode pour calculer les probabilités d’identité entre des gènes d’un locus, conditionnées par l’observation des phénotypes en un locus marqueur lié. La méthode proposée réunit 2 approches : les probabilités d’identité conditionnelles, au locus marqueur, sont calculées en construisant les évènements possibles du processus de la ségrégation des gènes ; les probabilités conditionnelles d’identité en un locus voisin sont calculées ensuite par la méthode des arbres géniques, modifiée pour tenir compte des conditions réalisées au locus marqueur. Les résultats dépendent des relations de dominance entre allèles et des fréquences alléliques au locus marqueur ; pour une liaison étroite, ils peuvent être très différents des résultats non...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: MARQUEUR; IDENTITE ENTRE GENES; POLYMORPHISME GENETIQUE; PHENOTYPE; PEDIGREE.
Ano: 1984 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB8900000667012919&uri=/notices/prodinra1/2008/02/
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Etude theorique sur la selection du caractere "production de miel" chez l'abeille. I Modele genetique et statistique Inra
Chevalet, C.; Cornuet, J.M..
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PRODUCTION DE MIEL; MODELE GENETIQUE; MODELE STATISTIQUE; APIDAE; HYMENOPTERA; APIS.
Ano: 1982 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB8707607003969&uri=/notices/prodinra1/2009/12/
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Etude theorique sur la selection du caractere "production de miel" chez l'abeille. II. Plan de selection combinee de reines en fecondation naturelle Inra
Cornuet, J.M.; Chevalet, C..
Tipo: Journal Article Palavras-chave: HYMENOPTERA; APIS MELLIFICA; APIDAE; SELECTION; REINE; PRODUCTION DE MIEL; CONSANGUINITE; INSECTE SOCIAL.
Ano: 1987 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB8700001005423&uri=/notices/prodinra1/2009/12/
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Evolution de la consanguinite dans une population d'abeilles Inra
Chevalet, C.; Cornuet, J.M..
Tipo: Journal Article Palavras-chave: CONSANGUINITE; APIDAE; HYMENOPTERA; APIS.
Ano: 1982 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB8707608003970&uri=/notices/prodinra1/2009/12/
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Genetic variability, structure and assignment of Spanish and French pig populations based on a large sampling Inra
Boitard, S.; Chevalet, C.; Mercat, M.-J.; Meriaux, J.C.; Sanchez, A.; Tibau, J; San Cristobal, M..
The Spanish and French pig populations share the common practice of quasi systematicpaternity control of pure breed and composite line males. Ten microsatellite markers are incommon between Spain and France controls, among the 17 markers used in France and the13 used in Spain. After the adjustment of allele sizes, it is possible to merge the two datasetsand to obtain a set of 5791 animals, including the vast majority of the males in the Duroc,Landrace, Large White and Pie´train French and Spanish breeds. Twelve French compositelines are also available. The genetic diversity analysis of these pig populations is presented,as well as the assignment of an individual to its breed. The effects of heterogeneous samplingacross time and of relatedness among animals...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: Assignment; Composite lines; Genetic diversity; Pig; Structure.
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2010628ef38&uri=/notices/prodinra1/2010/12/
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Isoestérases chez le nématode Heterodera avenae : 2 - modélisation appliquée à la structure génétique de deux populations IRD
Gillois, M.; Chevalet, C.; Thomas, D.; Dalmasso, Antoine.
Tipo: Text Palavras-chave: NEMATODE PHYTOPARASITE; NEMATODE; POLYMORPHISME ENZYMATIQUE; GENETIQUE DE POPULATION; STRUCTURE GENETIQUE; CONSANGUINITE; MODELISATION; HETERODERA AVENAE.
Ano: 1981 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:00468
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Méthode de prise en compte de la consanguinité dans un modèle simple de simulation de performances Inra
Foulley, J.L.; Chevalet, C..
Cette note présente une méthode de prise en compte de la consanguinité dans la simulation de valeurs génétiques à partir de valeurs parentales. Par rapport aux formules négligeant la consanguinité adoptées par WILLHAM & THOMSON (1970) dans le cow-game et sous l’hypothèse d’un déterminisme génétique additif, cette méthode revient à changer l’écart type résiduel (formule,voir document attaché ) étant les coefficients de consanguinité du père et de la mère respectivement et σg. l’écart-type génétique. La même modification s’applique à la simulation d’un caractère corrélé.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: CONSANGUINITE; METHODE; SIMULATION DE PERFORMANCE.
Ano: 1981 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008edd0880a&uri=/notices/prodinra1/2008/05/
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Methodes mathematiques pour l'etude des genes controlant des caracteres quantitatifs Inra
Goffinet, B.; Beckmann, J.; Boichard, D.; Causse, M.; Charcosset, A.; Chevalet, C.; Christophe, C.; Colleau, J.J.; Demenais, F.; Durel, C.E.; Elsen, J.M.; Foulley, J.L.; Gallais, A.; Gotz, K.U.; Hospital, H.; Kremer, A.; Lorieux, M.; Lefort-Buson, M.; Le Roy, P.; Loisel, P.; Mangin, B.; Maurice, A.; Perrier, X.; Pons, O.; Rebaï, A.; Rodolphe, F.; San Cristobal, M.; Vu Tien Khang, J..
Nous présentons ici les travaux s’inscrivant dans le cadre du projet «Mathématiques et marqueurs moléculaires», en abrégé «MMM». Ces travaux ont pour objet l’identification et l’utilisation de gènes contrôlant des caractères quantitatifs - ou QTL (quantitative trait loci) - à partir de l’information issue des phénotypes, de la généalogie et de marqueurs moléculaires. Une première partie concerne la mise en évidence de gènes à effet majeur et l’utilisation de ces gènes en sélection, à partir d’informations phénotypiques (mesures sur le caractère dont le contrôle génétique est recherché) et généalogiques (relations de parenté entre individus de la population mesurée). La deuxième partie concerne l’utilisation conjointe de ces informations...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: MAXIMUM DE VRAISEMBLANCE; CARACTERE QUANTITATIF; SELECTION DIRIGEE; AMELIORATION DES PLANTES; CARTE GENETIQUE.
Ano: 1994 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9400023110039598&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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Minimisation des coefficients de consanguinite moyens dans les petites populations d'animaux domestiques. Inra
De Rochambeau, H.; Chevalet, C..
On décrit une méthodologie pour contrôler la consanguinité dans des petites populations d’animaux domestiques, en tenant compte des contraintes d’élevage. On considère une population divisée en groupes de reproduction comprenant un ou plusieurs mâles et des femelles. Un groupe est divisé en classes d’âge, chaque sous-ensemble de la population, défini par le sexe, le groupe de reproduction, et la classe d’âge est décrit par 3 nombres qui désignent l’effectif, les réformes et le renouvellement. La structure génétique est décrite par les coefficients de consanguinité et de parenté moyens calculés sur ces sous-ensembles de la population. Des conditions sont établies pour minimiser l’accroissement du coefficient de consanguinité pendant les premières...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: COEFFICIENT DE CONSANGUINITE; SCHEMA D'ACCOUPLEMENT; CONSERVATION DES RESSOURCES GENETIQUES; POPULATION A EFFECTIF LIMITE; ANIMAL DOMESTIQUE.
Ano: 1985 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB8808330007219&uri=/notices/prodinra1/2008/02/
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Modelisation dynamique de systemes genetiques de regulation : I. L'induction de l'operon lactose d'Escherichia coli : elaboration d'un modele Inra
Chevalet, C.; Corpet, F.; Gillois, M.; Micali, A..
Dans ce premier article, on élabore un modèle mathématique pour décrire le mécanisme de l’induction de l’opéron lactose d’Escherichia coli. Les différentes interactions moléculaires sont successivement représentées par des équations différentielles qui traduisent l’évolution dans le temps : des probabilités des états possibles de la région de contrôle de l’opéron (opérateur et promoteur), de concentrations des enzymes codées par le système (perméase et (β-galactosidase), et des concentrations des substrats et produits de ces enzymes (lactose, inducteur, glucose et galactose intracellulaires). L’ensemble constitue un système de dix équations différentielles du premier ordre, présentant des non-linéarités et des arguments retardés. La cohérence de...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: OPERON LACTOSE; ESCHERICHIA; METABOLISME DU LACTOSE; TRANSCRIPTION; ENTEROBACTERIACEAE.
Ano: 1983 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB8707600003962&uri=/notices/prodinra1/2008/02/
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Modelisation dynamique de systemes genetiques de regulation. II L'induction de l'operon lactose d'Escherichia coli : etude quantitative et numerique du modele Inra
Corpet, F.; Chevalet, C.; Gillois, M.; Micali, A..
Dans ce second article, nous faisons une analyse mathématique du modèle établi dans lapremière partie (Génét. Sél. Evol., 15, 1-30). Nous donnons des formules reliant le niveaud’expression de l’opéron et les concentrations des différentes protéines régulatrices. Elles peuventêtre très bien approchées par des relations hyperboliques. Quand l’induction est due à un inducteurgratuit, le système évolue vers un unique état induit stable et le niveau d’expression est unefonction sigmoïde de la concentration en inducteur. Dans le cas de l’induction naturelle et pourun certain nombre de souches, nous montrons que le système évolue encore vers un état uniqueet stable. Nous donnons des conditions sur certains paramètres pour définir des souches tellesque...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: OPERON LACTOSE; ESCHERICHIA; EQUATION DIFFERENTIELLE RETARDEE; CINETIQUE.
Ano: 1983 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB8707602003964&uri=/notices/prodinra1/2008/03/
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Prediction of the response to a selection for canalisation of a continuous trait in animal breeding Inra
San-Cristobal-Gaudy, M.; Elsen, J.M.; Bodin, L.; Chevalet, C..
Le problème de la sélection canalisante est traité grâce à un modèle hétéroscédastique mettant en jeu une valeur génétique pour la moyenne et une valeur génétique pour le logarithme de la variance, toutes deux associées à une seule valeur phénotypique. Pour un objectif de sélection visant à minimiser l’espérance des carrés des différences entre le phénotype et l’optimum, pour un descendant d’un candidat à la sélection, des index sont estimés et des expressions approchées de la régression parent-descendant sont calculées. La précision de ces expressions analytiques est mesurée à l’aide de simulations. Afin d’appréhender la capacité de ces populations à être canalisées vers un optimum économique, des exemples sont donnés : le rapport entre matière...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: HETEROSCEDASTICITE; INDEX DE SELECTION.
Ano: 1998 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9900007888073074&uri=/notices/prodinra1/2007/09/
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Strategie d'etablissement des cartes geniques. Exemple du porc Inra
Gellin, J.; Chevalet, C..
La cartographie génétique chez les animaux domestiques consiste d’abord à établir le long du génome un réseau de marqueurs génétiques espacés entre eux de 20 cM et dont certains sont localisés avec précision sur les chromosomes. Parmi les différentes sources de polymorphisme disponibles sur le génome, les microsatellites sont les plus intéressants à utiliser. Ils sont très polymorphes, bien répartis le long du génome et leur étude peut être automatisée. Les connaissances recueillies sur le génome seront intégrées aux analyses quantitatives actuelles grâce à la mise en œuvre de nouveaux concepts d’analyse génétique. Elles permettront une évaluation précoce des génotypes, la mise en évidence de régions du génome intervenant dans la variabilité de...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: ADN MICROSATELLITE; CARTE GENETIQUE; MARQUEUR GENETIQUE; CARACTERE QUANTITATIF.
Ano: 1994 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9500008741042595&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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Sur la diversite des bles tendres cultives en France Inra
Branlard, G.; Chevalet, C..
A partir de 78 cultivars de blés tendres inscrits au Catalogue français des variétés entre 1946 et 1978, 3 types de distances sont calculées entre chacun d’eux à l’aide des caractères suivants : apparentement, aspects morphologiques et agronomiques, polymorphisme de gliadines. Aucune corrélation n’existe entre ces 3 types de distances. L’évolution de la moyenne et de l’écart-type des distances entre les blés inscrits au cours d’une période et ceux les ayant précédés révèle une décroissance de la diversité des blés français. Plusieurs causes sont proposées.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: POLYMORPHISME; CARACTERE MORPHOLOGIQUE; PARENTE; DIVERSITE GENETIQUE.
Ano: 1984 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB8808314007205&uri=/notices/prodinra1/2008/10/
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