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Adaptation de l'index français de sélection laitière (INEL) au contexte des quotas Inra
Colleau, J.J.; Regaldo, D.; Gastinel, P.L..
La sélection des races bovines laitières s’effectue en France au travers d’un index de synthèse économique laitière (INEL). La formulation de celui-ci a été remise à jour en 1993 pour mieux tenir compte de la situation concrète des quotas laitiers, avec modulation pour les dépassements de taux butyreux par rapport à la référence.L’article explicite les raisonnements, hypothèses et paramètres tant économiques que génétiques, utilisés pour l’examen de plusieurs alternatives possibles. Les hypothèses essentielles sont la constance des surfaces et des quotas par exploitation ainsi que la prise en considération de marges nettes incluant les charges fixes.La solution finalement retenue (INEL 1993) n’accorde plus aucun intérêt économique à l’augmentation de la...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: TAUX BUTYREUX; VALEUR GENETIQUE.
Ano: 1994 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9500004626051953&uri=/notices/prodinra1/2008/02/
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Analysis of the genetic variation for adaptation to a short thermal stress on young « Bos taurus » cattle Inra
Colleau, J.J.; Singh, M.; Dupont, M.; Tanguy, D.; Briend, M.; Chambeyron, J.J.; Bibé, B..
Le but de ce travail est d’essayer de caractériser l’adaptation à la chaleur d’un certain nombre de races bovines, notamment françaises. Pour cela, 582 jeunes bovins, mâles et femelles, d’environ 14 mois et issus de 41 combinaisons génétiques élémentaires analysées dans 5 expérimentations différentes, à objectif non bioclimatologique, sont soumis en chambre chaude, à un stress thermique de 8 heures pendant lequel la température externe a été portée de 11) De 18°C à 38 °C. Les réactions classiques sont observées : augmentation de la température rectale au cours du stress (+ 0,54°C), augmentation du rythme respiratoire ( X 3), augmentation du taux de sudation, du rythme cardiaque, de la température de la peau. Les analyses statistiques sont...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: STRESS THERMIQUE; VARIATION GENETIQUE; ANALYSE STATISTIQUE; RESULTATS.
Ano: 1979 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008559037f4&uri=/notices/prodinra1/2008/06/
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Approximating selection differentials and variances for correlated selection indices Inra
Phocas, F.; Colleau, J.J..
On propose des formules de calcul approché des différentielles de sélection et des variances d’index de sélection après sélection directionnelle quand les candidats à la sélection ont des index distribués normalement et corrélés de manière quelconque. Ces formules ont pour base celles établies en cas d’équicorrélation entre observations et font intervenir des polynômes des variables suivantes : taux de sélection, coefficient de corrélation moyen et écart type moyen de ce coefficient par observation. Les coefficients des polynômes sont calculés après ajustement à des données simulées. Les situations simulées font varier la structure des corrélations (1, 2 ou 3 coefficients de corrélation intra-classe, de valeurs 0,3 à 10,99), le nombre de familles (1,...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: DIFFERENTIELLE DE SELECTION; INDICE DE SELECTION; INDICE CORPORELLE; POPULATION FINIE.
Ano: 1995 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9600002709059482&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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Combining use of embryo sexing and cloning within closed mixed MOETs for selection on dairy cattle Inra
Colleau, J.J..
On a comparé des schémas MOET (superovulation et transfert d’embryon) mixtes (c’est-à-dire conservant le testage des taureaux sur descendance) adultes avec sexage seul ou sexage et clonage des embryons femelles, en raisonnant à même nombre total d’embryons transférés. Dans les premiers schémas, les animaux normaux et issus de transplantation embryonnaire (TE) peuvent être reproducteurs. Dans les seconds, chaque catégorie de femelles (nées simples ou clonées) peut donner naissance soit à de nouveaux animaux simples (après vêlage naturel) soit à de nouveaux clones (TE). La structure optimale (tailles de sous-populations et pressions de sélection correspondantes) des 2 schémas a été calculée algébriquement en maximisant le gain génétique annuel...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: SEXAGE D'EMBRYON; CLONAGE D'EMBRYON; SELECTION; PROGRES GENETIQUE.
Ano: 1992 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9300008128034143&uri=/notices/prodinra1/2007/12/
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Efficacite genetique du transfert d'embryons dans les noyaux de selection chez les bovins laitiers. Inra
Colleau, J.J..
Les techniques actuelles de superovulation, de collecte et de transfert des embryons chez les bovins permettent théoriquement la mise en place de nouveaux programmes de sélection. Dans cet article, on aborde l’étude génétique d’un mode particulier de noyaux de sélection, utilisant le transfert d’oeufs et en vue de la sélection d’un seul caractère : la production laitière. Ces noyaux ont pour fonction et nouveauté essentielles la production systématique de très jeunes mères à taureaux connues sur une lactation suivant 2 collectes d’embryons, qui commence en moyenne après la naissance des produits, de manière à raccourcir l’intervalle de génération sur les voies femelles. La méthode de testage des mâles sur descendance et la méthode de production des...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: VARIANCE GENETIQUE; CONSANGUINITE; NOYAU DE SELECTION; TRANSPLANTATION D'EMBRYON.
Ano: 1985 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB8808318007209&uri=/notices/prodinra1/2008/02/
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Expected efficiency of selection for growth in a French beef cattle breeding scheme. I. Multistage selection of bulls used in artificial insemination Inra
Phocas, F.; Colleau, J.J.; Ménissier, F..
En races bovines allaitantes, l’amélioration génétique des caractères de croissance passe par la sélection des effets directs et des effets maternels par contrôles individuel et de descendance, en ferme et en station. Pour optimiser l’emploi de ces outils, un schéma de sélection français des taureaux d’IA a été modélisé en considérant ses principales complexités : 2 types de stations de contrôle individuel et 2 types de contrôles de descendance (en ferme et en station). afin de prendre en compte l’hétérogénéité des systèmes de production, 3 objectifs de sélection ont été établis : Hs pour les élevages naisseurs, Hf pour les élevages naisseurs-engraisseurs et un objectif moyen Hg, considéré comme le plus réaliste pour l’ensemble des troupeaux de la...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: VARIANCE D'ECHANTILLONNAGE; OBJECTIF DE SELECTION; CROISSANCE; EFFET MATERNEL; RACE BOVINE.
Ano: 1995 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9600002011053980&uri=/notices/prodinra1/2007/10/
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Expected efficiency of selection for growth in a French beef cattle breeding scheme. II. Prediction of asymptotic genetic gain in a heterogeneous population Inra
Phocas, F.; Colleau, J.J.; Ménissier, F..
Dans un schéma de sélection français en race bovine allaitante, les progrès et les retards génétiques asymptotiques sont calculés pour un objectif de sélection incluant effects directs et maternels sur la croissance. Quelle que soit la structure de la population considérée, une formulation matricielle simple permet de calculer simultanément ces progrès et ces retards génétiques asymptotiques. Ainsi, l’utilisation différentielle de l’insémination artificielle (IA) dans les troupeaux de sélection est aisément prise en compte. Pour un même taux d’IA sur l’ensemble du noyau de sélection, des progrès génétiques plus importants peuvent être obtenus en utilisant l’IA dans une partie seulement des troupeaux, plutôt qu’en considérant une plus faible...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: VARIANCE D'ECHANTILLONNAGE; CROISSANCE; PROGRES GENETIQUE; RACE BOVINE; OBJECTIF DE SELECTION.
Ano: 1995 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9600002010053979&uri=/notices/prodinra1/2007/10/
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Genetic parameters of the twisted legs syndrome in broiler chickens (meat-type chicken, unordered categorical trait, multinomial logistic transformation Inra
Le Bihan-Duval, E.; Beaumont, C.; Colleau, J.J..
Les paramètres génétiques des deux types de déformations osseuses rencontrées dans le syndrome des pattes tordues, les valgus et varus, ont été estimés dans deux lignées de poulet de type chair. Les différents défauts ont été diagnostiqués à l’âge de 6 semaines sur 14 264 animaux des deux sexes issus de 111 pères, 76 grand-pères maternels et 768 mères dans la première lignée et sur 8164 animaux des deux sexes issus de 94 pères, 71 grand-pères maternels et 553 mères dans la seconde. Les caractères étudiés correspondant à des données discrètes exclusives et non ordonnées, un modèle linéaire généralisé utilisant la transformation logistique multinomiale a été appliqué. Les paramètres de position ont été estimés par le « mode a posteriori », et les...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: TROUBLE LOCOMOTEUR; TROUBLE GENETIQUE; POULET DE CHAIR; PARAMETRE GENETIQUE.
Ano: 1996 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9600008259058579&uri=/notices/prodinra1/2007/10/
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Impact of the use of bovine somatotropin (BST) on dairy cattle selection Inra
Colleau, J.J..
On a simulé de manière aléatoire le fonctionnement d’un programme très simple de sélection laitière pour évaluer l’impact de la BST sur le progrès génétique et sur les écarts entre valeurs génétiques vraies et estimées. Les paramètres étaient le taux de traitement (10%, 30%, 50%), le taux de déclaration (total ou aléatoire), le système de choix des vaches traitées (au hasard, bonnes ou mauvaises vaches), le type de correction des données (aucune, BLUP classique ou BLUP bivariate) et certains paramètres de dispersion concernant le gain de production permis par la BST. Sachant qu’il n’y avait ni effet troupeau ni transfert embryonnaire, le taux de diminution du progrès génétique se situe dans la zone 1-10%, ne s’explique pas totalement par la...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: SOMATOTROPINE BOVINE; SELECTION; BLUP; PROGRES GENETIQUE.
Ano: 1989 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9500032317044432&uri=/notices/prodinra1/2008/01/
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Intest in quantitative genetics of Dutt's and Deack's methods for numerical computation of multivariate normal probability integrals Inra
Ducrocq, V.; Colleau, J.J..
Le calcul numérique d’intégrales de lois multinormales est souvent rendu nécessaire dans les études de génétique quantitative : c’est en particulier le cas pour l’évaluation des effets génétiques d’une sélection à niveaux indépendants sur plusieurs caractères corrélés, pour certaines méthodes d’analyse de caractères discontinus ou pour certaines études de sélection portant sur des effectifs limités. Les méthodes de Dutt et de Deak peuvent satisfaire une grande partie des besoins des généticiens. Celles-ci sont présentées dans cet article et leur précision est analysée de façon détaillée. Il apparaît que la méthode de Dutt est remarquablement précise pour les dimensions 1 à 5, sauf lorsque les seuils de troncature ou les corrélations entre variables...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: INTEGRALE MULTIPLE; SELECTION A NIVEAUX INDEPENDANTS; DISTRIBUTION MULTINORMALE; EFFET GENETIQUE.
Ano: 1986 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9200008631024528&uri=/notices/prodinra1/2008/02/
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Methodes mathematiques pour l'etude des genes controlant des caracteres quantitatifs Inra
Goffinet, B.; Beckmann, J.; Boichard, D.; Causse, M.; Charcosset, A.; Chevalet, C.; Christophe, C.; Colleau, J.J.; Demenais, F.; Durel, C.E.; Elsen, J.M.; Foulley, J.L.; Gallais, A.; Gotz, K.U.; Hospital, H.; Kremer, A.; Lorieux, M.; Lefort-Buson, M.; Le Roy, P.; Loisel, P.; Mangin, B.; Maurice, A.; Perrier, X.; Pons, O.; Rebaï, A.; Rodolphe, F.; San Cristobal, M.; Vu Tien Khang, J..
Nous présentons ici les travaux s’inscrivant dans le cadre du projet «Mathématiques et marqueurs moléculaires», en abrégé «MMM». Ces travaux ont pour objet l’identification et l’utilisation de gènes contrôlant des caractères quantitatifs - ou QTL (quantitative trait loci) - à partir de l’information issue des phénotypes, de la généalogie et de marqueurs moléculaires. Une première partie concerne la mise en évidence de gènes à effet majeur et l’utilisation de ces gènes en sélection, à partir d’informations phénotypiques (mesures sur le caractère dont le contrôle génétique est recherché) et généalogiques (relations de parenté entre individus de la population mesurée). La deuxième partie concerne l’utilisation conjointe de ces informations...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: MAXIMUM DE VRAISEMBLANCE; CARACTERE QUANTITATIF; SELECTION DIRIGEE; AMELIORATION DES PLANTES; CARTE GENETIQUE.
Ano: 1994 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9400023110039598&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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Modélisation de la diffusion des gènes Holstein à l’intérieur de la population bovine Pie Noir Française Inra
Colleau, J.J.; Tanguy, D..
L’utilisation de reproducteurs Holstein est actuellement très importante en race bovine Française Frisonne, en raison de leur supériorité laitière affirmée. La cinétique de la transmission de leurs gènes aux animaux commerciaux est étudiée dans cet article. La technique générale adoptée consiste à utiliser les méthodes de modélisation matricielle développées pour les schémas de sélection en race pure mais en fractionnant la population en sous-populations correspondant à des classes de proportion de gènes Holstein, de manière à traiter des matrices de taille constante et raisonnable. Dans ce cadre, des algorithmes de calcul approché sont proposés pour évaluer le résultat du croisement entre populations hétérogènes et pour évaluer le résultat d’une...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: CROISEMENT; MIGRATION; MODELE MATHEMATIQUE.
Ano: 1984 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20084f69f3b9&uri=/notices/prodinra1/2008/02/
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Optimum truncation points for independent culling level selection on a multivariate normal distribution, with an application to dairy cattle selection Inra
Ducrocq, V.; Colleau, J.J..
Une sélection à niveaux indépendants est souvent pratiquée dans les programmes génétiques, parce que les animaux extrêmes pour certains caractères sont rejetés, ou parce que les données qui servent à l’évaluation génétique des animaux sont recueillies séquentiellement. L’optimisation,pour un objectif donné, de ces règles de sélection équivaut à la recherche des seuils de troncature qui maximisent l’espérance de I objectif de sélection pour les animaux retenus. Un algorithme général de type Newton est établi pour effectuer cette maximisation pour un nombre quelconque de caractères distribués selon une loi mulinormale et lorsque la probabilité finale d’être retenu est fixée. A partir d’une méthode puissante de calcul d’intégrales de lois multinormales,...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: SELECTION A NIVEAUX INDEPENDANTS; SELECTION PAR ETAPE; PROGRES GENETIQUE; DISTRIBUTION MULTINORMALE INDEPENDENT CULLING LEVEL SELECTION; DAIRY CATTLE; MULTISTAGE SELECTION; GENETIC GAIN; MULTIVARIATE NORMAL DISTRIBUTION.
Ano: 1989 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008b87aea2b&uri=/notices/prodinra1/2008/01/
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Sélection laitière divergente en race bovine Normande. I. Effets sur la production de viande des taurillons Inra
Colleau, J.J.; Lefebvre, J.; Dupont, M.; Felgines, C.; Wimitzky, M..
Une première estimation des coefficients de corrélation génétique entre la production laitière d’une part et 19 variables de production de viande d’autre part a été effectuée à partir de 74 taurillons de 16 mois issus de deux premières générations d’une sélection divergente sur la production laitière. Dans le modèle d’analyse, on a considéré l’année d’engraissement comme facteur fixé et l’index laitier généalogique (établi à partir des seuls ascendants mâles testés) comme covariable. Les coefficients de corrélation génétique ont été calculés par maximum de vraisemblance dans le cadre du modèle, les écarts-types d’échantillonnage correspondants étant de l’ordre de 0,30. Une analyse de covariance simple a été effectuée dans laquelle on a supposé...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: SELECTION DIVERGENTE; CORRELATION GENETIQUE; COEFFICIENT DE PARENTE; MAXIMUM DE VRAISEMBLANCE.
Ano: 1983 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008121d5948&uri=/notices/prodinra1/2008/02/
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