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A cophenetic correlation coefficient for Tocher's method PAB
Silva,Anderson Rodrigo da; Dias,Carlos Tadeu dos Santos.
The objective of this work was to propose a way of using the Tocher's method of clustering to obtain a matrix similar to the cophenetic one obtained for hierarchical methods, which would allow the calculation of a cophenetic correlation. To illustrate the obtention of the proposed cophenetic matrix, we used two dissimilarity matrices - one obtained with the generalized squared Mahalanobis distance and the other with the Euclidean distance - between 17 garlic cultivars, based on six morphological characters. Basically, the proposal for obtaining the cophenetic matrix was to use the average distances within and between clusters, after performing the clustering. A function in R language was proposed to compute the cophenetic matrix for Tocher's method. The...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cluster analysis; Optimization methods; Clustering consistency.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2013000600003
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A irradiação gama no tempo de cocção e na absorção de água em grãos de soja com e sem lipoxigenase Ciência Rural
Biscaro,Luciana Marino e; Brazaca,Solange Guidolin Canniatti; Arthur,Valter; Dias,Carlos Tadeu dos Santos.
O processamento térmico adequado contribui para aumentar a digestibilidade e eliminar fatores antinutricionais presentes em grãos. Porém, esse processo pode ser prejudicial, causando a perda de nutrientes. A irradiação de grãos pode facilitar sua cocção, reduzindo o tempo de amolecimento. O objetivo do presente trabalho foi avaliar possíveis alterações causadas pela irradiação no tempo de cocção e embebição de grãos de soja convencionais e sem lipoxigenase. As duas cultivares analisadas ('BRS 232' - com lipoxigenase e 'BRS 257' - sem lipoxigenase) diferiram entre si na quantidade de água absorvida, no tempo de embebição e no tempo de cocção dos grãos. A irradiação dos grãos, nas doses de 4kGy e 8kGy, diminuiu a absorção de água e o tempo de cocção.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Soja; Lipoxigenase; Irradiação; Hidratação; Cocção.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010000900024
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A weighted AMMI algorithm for nonreplicated data PAB
Assis,Tatiana Oliveira Gonçalves de; Dias,Carlos Tadeu dos Santos; Rodrigues,Paulo Canas.
Abstract: The objective of this work was to propose a weighting scheme for the additive main effects and multiplicative interactions (AMMI) model, as well as to assess the usefulness of this W-AMMI model in the study of genotype x environment interaction (GxE) and quantitative trait locus x environment interaction (QxE) for nonreplicated data. Data from the 'Harrington' x TR306 barley (Hordeum vulgare) mapping population, with 141 genotypes evaluated in 25 environments, were used to compare the results from the AMMI model with those of two proposed versions of the W-AMMI model: equal weights per row and equal weights per column. The proposed W-AMMI columns algorithm is viable to analyze data with heterogeneous variance, when there are no replicates...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Hordeum vulgare; Contaminated data; Genotype-by-environment interaction; Missing data; Outliers; QTL detection.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2018000500557
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Acurácia do modelo univariado para análise de medidas repetidas por simulação multidimensional Scientia Agricola
Xavier,Lara Hoffmann; Dias,Carlos Tadeu dos Santos.
Em experimentos com medidas repetidas, quando se utiliza o esquema de parcelas subdivididas, o teste F com relação à subparcela, só terá distribuição F exata caso a matriz de covariâncias atenda a condição de esfericidade. O objetivo deste trabalho foi verificar por meio de simulações, a acurácia da análise através da observação de casos em que a matriz de covariâncias atende, ou não, à condição de esfericidade. Quando utilizadas as matrizes de covariâncias do tipo componente de variância e simetria composta, que atendem a condição de esfericidade, a acurácia da análise foi satisfatória. O mesmo não ocorreu com outras estruturas da matriz de covariâncias. Com relação aos efeitos dos parâmetros, dependendo da grandeza dos valores dos efeitos, estes...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Medidas repetidas; Matriz de covariâncias; Simulação; Acurácia.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162001000200005
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Análise AMMI com dados imputados em experimentos de interação genótipo x ambiente de algodão PAB
Arciniegas-Alarcón,Sergio; Dias,Carlos Tadeu dos Santos.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a conveniência de definir o número de componentes multiplicativos dos modelos de efeitos principais aditivos com interação multiplicativa (AMMI) em experimentos de interações genótipo x ambiente de algodão com dados imputados ou desbalanceados. Um estudo de simulação foi realizado com base em uma matriz de dados reais de produtividade de algodão em caroço, obtidos em ensaios de interação genótipo x ambiente, conduzidos com 15 cultivares em 27 locais no Brasil. A simulação foi feita com retiradas aleatórias de 10, 20 e 30% dos dados. O número ótimo de componentes multiplicativos para o modelo AMMI foi determinado usando o teste de Cornelius e o teste de razão de verossimilhança sobre as matrizes completadas por...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Gossypium hirsutum; Desbalanceamento; Imputação de dados; Modelos AMMI.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2009001100004
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Análise e quantificação do risco para a gestão eficiente do portfólio agrícola das seguradoras Rev. Econ. Sociol. Rural
Ozaki,Vitor Augusto; Dias,Carlos Tadeu dos Santos.
A presença de eventos considerados catastróficos pode comprometer o balanço financeiro da carteira agrícola das seguradoras. Por exemplo, a estiagem pode afetar não somente um produtor, mas milhares de produtores em uma vasta extensão territorial. Para contornar esse problema, as seguradoras podem diversificar geograficamente suas operações. Nesse sentido este estudo aplica a análise de agrupamentos em um conjunto de dados de produtividade municipal de milho, no período de 1990 a 2005, para o estado do Paraná. Ao todo, 39 grupos foram formados conforme características similares de produtividade esperada e risco relativo. Para que as perdas sejam minimizadas, o estudo exclui alguns municípios de alto risco e sugere a classificação dos grupos, de acordo com...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Seguro agrícola; Análise de agrupamento; Diversificação de risco.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-20032009000300001
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Avaliação microbiológica de amostras de mel de trigoníneos (Apidae: Trigonini) do Estado da Bahia Ciênc. Tecnol. Aliment.
Souza,Bruno de Almeida; Marchini,Luís Carlos; Dias,Carlos Tadeu dos Santos; Oda-Souza,Melissa; Carvalho,Carlos Alfredo Lopes de; Alves,Rogério Marcos de Oliveira.
O mel é um produto que apresenta atividade antimicrobiana atribuída a fatores físicos e químicos. Mesmo assim, ainda é possível encontrar uma série de microrganismos presentes neste produto e que servem como indicadores de qualidade. O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade microbiológica do mel produzido por espécies de abelhas sem ferrão (Trigonini) do Estado da Bahia. Quatorze amostras de mel foram avaliadas quanto ao teor de umidade, atividade de água, contagem padrão de bolores e leveduras, e presença de microrganismos do grupo coliforme. Um total de 50,0% das amostras apresentou contagem padrão para bolores e leveduras acima do máximo permitido pela regulamentação brasileira para alimentos. Esta desclassificação de amostras assepticamente...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Atividade de água; Bolores e leveduras; Coliformes; Controle de qualidade microbiológica; Mel de abelhas sem ferrão.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0101-20612009000400015
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Biologia de Mahanarva fimbriolata em gramíneas forrageiras Ciência Rural
Grisoto,Eliane; Vendramim,José Djair; Lourenção,André Luiz; Usberti Filho,José Alfredo; Dias,Carlos Tadeu dos Santos.
Estudou-se a biologia de Mahanarva fimbriolata nas gramíneas Setaria anceps cv. 'Kazungula', Brachiaria brizantha cv. 'Marandu', ecótipos BB 33, BB 39, seleções IAC-BBS 5 e IAC-BBS 8, e cana-de-açúcar. 'SP-80-1842' (testemunha) em laboratório, visando a avaliar a resistência desses genótipos a essa praga. Os parâmetros avaliados foram: mortalidade e duração da fase de ninfa, razão sexual, período de pré-oviposição, número de ovos por fêmea, longevidade, duração e viabilidade da fase embrionária. Constatou-se maior mortalidade e prolongamento na fase de ninfa em IAC-BBS 8, B. brizantha cv. 'Marandu' e S. anceps cv. 'Kazungula'. Os menores valores de longevidade e fecundidade foram verificados em IAC-BBS 8 e IAC-BBS 5 e os maiores em cana-de-açúcar. A menor...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cercopidae; Resistência de plantas a insetos; Cigarrinha-das-raízes.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782014000600015
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Calcium, potassium and magnesium treatment of Chrysanthemum morifolium cv. "Bi Time" and callogenesis in vitro Scientia Agricola
Borgatto,Fábio; Dias,Carlos Tadeu dos Santos; Amaral,Antônio Francisco Campos; Melo,Murilo.
The chemical composition and vegetative vigor of the donor plant are essential for the satisfactory performance of explants in vitro. In order to test the effect of potassium, calcium and magnesium nutritional status of Chrysanthemum morifolium plants on callogenesis in vitro, pot plants growing in sand were irrigated with nutrient solution containing different levels of potassium (0; 58.5; 117 and 234 mg L-1), calcium (0; 50; 100 e 200 mg L-1) and magnesium (0;12; 48 e 96 mg L-1). After 30 and 45 days, explants (shoot segments and leaf discs) were collected, desinfected and inoculated on MS solid medium supplemented with 0.1 mg L-1 of kinetin and 5.0 mg L-1 of nafthalene acetic acid for callogenesis induction. Callogenesis evaluated as callus fresh weight...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Matrix plant; Mineral nutrition; Tissue culture.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162002000400011
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Carioca bean genotypes for tolerance to grain darkening by natural and accelerated methods Ciência e Agrotecnologia
Spitti,Acácia Mecejana Diniz Souza; Carbonell,Sérgio Augusto Morais; Dias,Carlos Tadeu dos Santos; Sabino,Luis Gustavo; Carvalho,Cássia Regina Limonta; Chiorato,Alisson Fernando.
ABSTRACT The slow darkening of grains is sought by bean breeders because the consumers consider that darker grains demand more time for cooking. The analysis currently used takes around 90 days to differentiate grain color among genotypes. The objective was to evaluate the color as a function of the value of L* (lightness) of carioca beans, by natural and accelerated methods to verify equivalence between methods, validation of the methodology and identification of genotypes tolerant to the darkening. The grain darkening was compared and evaluated by natural darkening method under shelf conditions, in days storage, and accelerated darkening method under ultraviolet light, in hours. The natural darkening time of 90 days was statistically equal to 24 hours of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Phaseolus vulgaris L.; Coloring; Lightness; Plant breeding; Ultraviolet light..
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542019000100224
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Chemical and physical soil attributes in integrated crop-livestock system under no-tillage Rev. Ciênc. Agron.
Silva,Hernani Alves da; Moraes,Anibal de; Carvalho,Paulo César de Faccio; Fonseca,Adriel Ferreira da; Caires,Eduardo Fávero; Dias,Carlos Tadeu dos Santos.
Although integrated crop-livestock system (ICLS) under no-tillage (NT) is an attractive practice for intensify agricultural production, little regional information is available on the effects of animal grazing and trampling, particularly dairy heifers, on the soil chemical and physical attributes. The objective of this study was to evaluate the effects of animal grazing on the chemical and physical attributes of the soil after 21 months of ICLS under NT in a succession of annual winter pastures (2008), soybeans (2008/2009), annual winter pastures (2009), and maize (2009/10). The experiment was performed in the municipality of Castro (PR) in a dystrophic Humic Rhodic Hapludox with a clay texture. The treatments included a combination of two pasture (annual...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Tropical soil; Integrated production system; Conservationist agricultural; Soil acidity.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1806-66902014000500010
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Choosing components in the additive main effect and multiplicative interaction (AMMI) models Scientia Agricola
Dias,Carlos Tadeu dos Santos; Krzanowski,Wojtek Janusz.
The additive main effect and multiplicative interaction (AMMI) models allows analysts to detect interactions between rows and columns in a two-way table. However, there are many methods proposed in the literature to determine the number of multiplicative components to include in the AMMI model. These methods typically give different results for any particular data set, so the user needs some guidance as to which methods to use. In this paper we compare four commonly used methods using simulated data based on real experiments, and provide some general recommendations.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Two-way table; Principal components; Simulation.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162006000200009
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Comparação de metodologias para a determinação do pH e do ponto de congelamento do leite bovino cru sob diferentes características de conservação R. Bras. Zootec.
Araújo,Viviane Maia de; Cassoli,Laerte Dagher; Zampar,Aline; Silva,Augusto Cesar Lima da; Dias,Carlos Tadeu dos Santos; Machado,Paulo Fernando.
Objetivou-se comparar metodologias de referência com a espectroscopia de infravermelho com transformada de Fourier para análises do pH e do ponto de congelamento sob diferentes condições de conservação em amostras de leite bovino cru. Foram coletadas amostras de leite de tanques de expansão em 57 propriedades. Cada amostra foi subdividida em 45 frascos (40 mL), que foram distribuídos de acordo com a temperatura de armazenamento (-20; 7 e 25ºC), a idade da amostra (0, 3, 6 e 9 dias) e os níveis de adição de água (0, 2, 4 e 6%). Foi adicionado bronopol a 44 frascos e um foi mantido sem adição do conservante para controle. O pH e o ponto de congelamento foram determinados pela metodologia de referência (potenciômetro e crioscópio eletrônico, respectivamente)...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Acidez no leite; Crioscopia; Leite de tanques.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982011000700030
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Comparation of logistic regression methods and discrete choice model in the selection of habitats Scientia Agricola
Cardozo,Sandra Vergara; Manly,Bryan Frederick John; Dias,Carlos Tadeu dos Santos.
Based on a review of most recent data analyses on resource selection by animals as well as on recent suggestions that indicate the lack of an unified statistical theory that shows how resource selection can be detected and measured, the authors suggest that the concept of resource selection function (RSF) can be the base for the development of a theory. The revision of discrete choice models (DCM) is suggested as an approximation to estimate the RSF when the choice of animal or groups of animals involves different sets of available resource units. The definition of RSF requires that the resource which is being studied consists of discrete units. The statistical method often used to estimate the RSF is the logistic regression but DCM can also be used. The...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Resource selection; Maximum likelihood; Binomial distribution; Comparison test.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162010000300011
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Conservação de maçã minimamente processada com o uso de películas comestíveis Ciênc. Tecnol. Aliment.
Fontes,Luciana Cristina Brigatto; Sarmento,Silene Bruder Silveira; Spoto,Marta Helena Fillet; Dias,Carlos Tadeu dos Santos.
O objetivo do trabalho foi avaliar o efeito de películas comestíveis na conservação de maçãs da cultivar Royal Gala Minimamente Processadas (MP) durante armazenamento refrigerado por 13 dias. Os tratamentos foram: o controle, a solução conservadora (1% ácido ascórbico; 0,5% ácido cítrico; 0,7% NaCl; 0,25% CaCl2) e as películas [dextrina (5,5%), fécula de mandioca (3%) e alginato de sódio (2%) com CaCl2 (0,6%)]. A solução conservadora reduziu a taxa respiratória e a produção de etileno em relação ao controle e promoveu maior claridade da polpa. Os tratamentos com películas apresentaram redução média de 38% na taxa respiratória e mais de 50% na produção de etileno em relação ao controle, sendo o alginato o mais eficiente. A película de alginato apresentou...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Maçã; Processamento mínimo; Películas comestíveis.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0101-20612008000400017
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Controle genético da regeneração in vitro em progênies de Eucalyptus grandis Ciência Rural
Bravo,Carlos David Vera; Gonçalves,Antônio Natal; Dias,Carlos Tadeu dos Santos; Vencovsky,Roland.
Com o objetivo de avaliar o controle genético da regeneração direta in vitro a partir de plântulas de Eucalyptus grandis, foram utilizadas sementes de 10 progênies de polinização aberta da população base, origem Atherton, localizada em Anhembi, Estado de São Paulo. Vinte dias de cultivo após a germinação, 196 segmentos distais dos hipocótilos por progênie foram inoculados in vitro num Delineamento em Blocos Completos Aleatorizado Generalizado, com duas unidades experimentais por bloco e sete repetições por bloco, usando a interação blocos por progênie como estimadora do erro experimental. Após 14 semanas de cultivo, foram feitas avaliações da regeneração. Houve diferenças significativas de regeneração entre as progênies (P<0,0001) com extremos de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Regeneração in vitro; Controle genético; Eucalyptus grandis; Herdabilidade.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782008000800014
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Distribution-free multiple imputation in an interaction matrix through singular value decomposition Scientia Agricola
Bergamo,Genevile Carife; Dias,Carlos Tadeu dos Santos; Krzanowski,Wojtek Janusz.
Some techniques of multivariate statistical analysis can only be conducted on a complete data matrix, but the process of data collection often misses some elements. Imputation is a technique by which the missing elements are replaced by plausible values, so that a valid analysis can be performed on the completed data set. A multiple imputation method is proposed based on a modification to the singular value decomposition (SVD) method for single imputation, developed by Krzanowski. The method was evaluated on a genotype × environment (G × E) interaction matrix obtained from a randomized blocks experiment on Eucalyptus grandis grown in multienvironments. Values of E. grandis heights in the G × E complete interaction matrix were deleted randomly at three...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Missing data; Nonparametric; Eigenvalue; Eigenvector; Genotype-environment.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162008000400015
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ESTAQUIA SEMI-LENHOSA: UM MÉTODO RÁPIDO E ALTERNATIVO PARA A PRODUÇÃO DE MUDAS DE LIMA ÁCIDA 'TAHITI' Scientia Agricola
Prati,Patricia; Mourão Filho,Francisco de Assis Alves; Dias,Carlos Tadeu dos Santos; Scarpare Filho,João Alexio.
Avaliou-se o efeito de várias concentrações e tempos de exposição de dois reguladores de crescimento no enraizamento de estacas de lima ácida `Tahiti' (Citrus latifolia Tanaka). Experimentos complementares também avaliaram a eficiência do enraizamento de estacas de laranjas `Pêra' e `Valencia' (Citrus sinensis L. Osbeck) comparando-a com a da lima ácida `Tahiti'. Os trabalhos experimentais foram conduzidos, em Piracicaba, SP, em câmara de nebulização intermitente, com estacas ponteiro, semi-lenhosas, coletadas 5 meses após a brotação, com 10 cm de comprimento, sem as 3 folhas basais. O delineamento experimental adotado foi o de blocos casualizados com 4 repetições para todos os ensaios realizados. A avaliação dos tratamentos foi realizada 90 dias após a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Citrus latifolia; Citrus sinensis; Propagação.
Ano: 1999 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90161999000100025
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Estimadores de componentes de variância em delineamento de blocos aumentados com tratamentos novos de uma ou mais populações PAB
Duarte,João Batista; Vencovsky,Roland; Dias,Carlos Tadeu dos Santos.
O objetivo do trabalho foi comparar, por meio de simulação, as estimativas de componentes de variância produzidas pelos métodos ANOVA (análise da variância), ML (máxima verossimilhança), REML (máxima verossimilhança restrita) e MIVQUE(0) (estimador quadrático não viesado de variância mínima), no delineamento de blocos aumentados com tratamentos adicionais (progênies) de uma ou mais procedências (cruzamentos). Os resultados indicaram superioridade relativa do método MIVQUE(0). O método ANOVA, embora não tendencioso, apresentou as estimativas de menor precisão. Os métodos de máxima verossimilhança, sobretudo ML, tenderam a subestimar a variância do erro experimental (<img SRC="http:/img/fbpe/pab/v36n9/6475s2.gif">) e a superestimar as variâncias...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Modelo misto; Melhoramento vegetal; Seleção recorrente; Autógamas; Parâmetros genéticos.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2001000900009
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Evaluation of the mutagenicity and antimutagenicity of Ziziphus joazeiro Mart. bark in the micronucleus assay Genet. Mol. Biol.
Boriollo,Marcelo Fabiano Gomes; Resende,Marielly Reis; Silva,Thaísla Andrielle da; Públio,Juliana Yoshida; Souza,Luiz Silva; Dias,Carlos Tadeu dos Santos; Oliveira,Nelma de Mello Silva; Fiorini,João Evangelista.
The aim of this study was to evaluate the mutagenicity (clastogenicity/aneugenicity) of a glycolic extract of Ziziphus joazeiro bark (GEZJ) by the micronucleus assay in mice bone marrow. Antimutagenic activity was also assessed using treatments associated with GEZJ and doxorubicin (DXR). Mice were evaluated 24-48 h after exposure to positive (N-nitroso-N-ethylurea, NEU - 50 mg.kg-1 and DXR - 5 mg.kg-1) and negative (150 mM NaCl) controls, as well as treatment with GEZJ (0.5-2 g.kg-1), GEZJ (2 g.kg-1) + NEU and GEZJ (2 g.kg-1) + DXR. There were no significant differences in the frequencies of micronucleated polychromatic erythrocytes in mice treated with GEJZ and GEJZ + DXR compared to the negative controls, indicating that GEZJ was not mutagenic. Analysis...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Antimutagenicity; Bone marrow; Doxorubicin; Micronucleus assay; Mutagenicity; Zizyphus joazeiro Mart. (raspa-de-Juá).
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572014000300016
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