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Análise de componentes principais no estudo da diversidade genética de caprinos. Repositório Alice
PIRES, L. C.; MACHADO, T. M. M.; ARAUJO, A. M. de; COSTA, M. da S.; BRANCO, J. da F. C.; EUCLYDES, R. F.; CHAKIR, M.; ESPESCHIT, C. J. B..
Analisou-se dados biométricos de raças exóticas Toggenbourg, Saanen, Anglonubiana, Alpina e Boer. No Marrocos, foram amostrados caprinos locais Drâa, Zagora e Rhâali. Mensurou-se altura de cernelha (AC), altura da maçã do peito ao chão (AP) e comprimento de orelha (CO). A profundidade torácica foi calculada (AC-AP) e foram estabelecidos índices entre duas medidas corporais. As variáveis foram submetidas à análise de componentes principais (ACP) através do programa SAS v. 9.0. Do total de sete componentes, os dois primeiros foram suficientes para acumular 74,87% da variância total dos dados. Na representação gráfica da distribuição dos indivíduos, observou-se que Toggebourg, Saanen e Alpina ocuparam apenas os quadrantes esquerdos e Zagora apenas nos...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Biometria; Caprino; Raça; Recurso Genético..
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/52955
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Aspectos genéticos e ambientais da curva de lactação de vacas da raça Guzerá. Repositório Alice
CABUCI, J. A.; EUCLYDES, R. F.; TEODORO, R. L.; VERNEQUE, R. da S.; LOPES, P. S.; SILVA, M. de A..
O conhecimento das relações genéticas entre os parâmetros da curva de lactação e a produção de leite é importante para a seleção de vacas e de touros. Os registros de produção de leite de 583 vacas da raça Guzerá, filhas de 165 reprodutores, foram usados para estimação dos parâmetros da curva de lactação em dois modelos matemáticos. As informações referentes às produções de leite foram obtidas usando-se a base de dados extraída do Arquivo Zootécnico Nacional, mantido na Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa Gado de Leite). As análises foram efetuadas usando-se o sistema MTDFREML, sob modelo animal que incluiu os efeitos fixos de rebanho-ano-estação de parto e, como covariável, a idade da vaca ao parto, com termos linear e quadrático. Como...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Correlacoes geneticas; Metodo REML; Modelos Matematicos; Raca guzera; Genetic correlations; Guzera breed; Mathematical model; REML; Curva de Lactação; Lactation curve.
Ano: 2001 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/594695
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Cluster evaluation of brazilian and moroccan goat populations using physical measurements. Repositório Alice
PIRES, L. C.; MACHADO, T. M. M.; ARAUJO, A. M. de; SILVA, J. B. L. da; EUCLYDES, R. F.; COSTA, M. da S.; OLSON, T. A..
The aim of this study was to compare the genetic diversity of 12 populations of goats in Brazil and Morocco (n = 796) through the use of physical measurements and different multivariate techniques.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Divergência.; Biometria; Recurso Genético..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/973822
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Diversidade biométrica entre populações caprinas no Brasil e no Marrocos. Repositório Alice
MACHADO, T. M. M.; PIRES, L. C.; ARAUJO, A. M. de; EUCLYDES, R. F.; TORRES, R. de A.; CHAKIT, M..
O objetivo neste trabalho foi analisar o discernimento genético entre 12 populações caprinas (n=796) por meio de dados biométricos e de análises estatísticas. Mensurou-se altura de cernelha (AC), altura da maçã do peito ao chão (AP) e comprimento de orelha de cabras adultas. A profundidade torácica foi calculada (AC-AP). Foi adotada a distância euclidiana média padronizada e o método Unweighted Pair Group Method With Arithmetic Mean (UPGMA). O coeficiente de correlação cofenética apresentado pelo dendrograma (CCC = 0,82), denota que o método UPGMA contribuiu para a interpretação fidedigna da divergência dos grupos genéticos caprinos. Os resultados obtidos com este método permitem preconizá-lo para trabalhos futuros que venham a incluir um maior número de...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Análise de agrupamento; Discernimento genético; Medida corporal; UPGMA.; Recurso Genético..
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/861491
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Diversidade genética entre populações caprinas com base em caracteres morfológicos. Repositório Alice
PIRES, L. C.; MACHADO, T. M. M.; ARAÚJO, A. M. de; EUCLYDES, R. F.; TORRES, R. de A..
Objetivou-se avaliar as relações fenéticas existentes entre 21 diferentes populações caprinas no Brasil, África, Europa continental e ilhas mediterrâneas (n=3499) a partir das análises de caracteres morfológicos de herança genética conhecida, através da construção do dendrograma. Foram utilizadas freqüências alélicas em cada população para a presença ou ausência dos caracteres orelhas reduzidas, chifres, pêlos longos, brincos, barba, pelagem ruão, eumelanina marrom e padrão pigmentar eumelânico. No dendrograma observou-se a divisão de quatro ramos. Dois deles constituíram grandes grupos (83% de bootstrap), Destes, o primeiro foi composto pelas raças européias leiteiras, ecótipos do Piauí (exceto Nambi que ficou excluído de ambos os ramos) e pela raça Boer....
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Dendrograma; Distância genética; Frequências alélicas; Traço fenotípico.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/580321
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Estimação de componentes de variância sob influência de genes de efeito principal, comparando-se metodologias Baynesiana e clássica sob diferentes cenários. Repositório Alice
ASSIS, G. M. L. de; CARNEIRO JUNIOR, J. M.; EUCLYDES, R. F.; TORRES, R. de A.; LOPES, P. S..
Quatro diferentes tipos de população foram simulados com o objetivo de verificar a influência de genes de efeito principal e do tamanho da população na estimação de componentes de variância sob seleção. A estimação foi realizada por meio da utilização e comparação das metodologias clássica e Bayesiana (a Bayesiana com três níveis de informação a priori). As metodologias REML e Bayesiana com prior não-informativo, em geral, produziram resultados bastante semelhantes. Em populações cuja característica é governada por genes de efeito principal, as estimativas dos componentes de variância genética aditiva foram pouco acuradas, exceto quando se utilizou metodologia Bayesiana com prior informativo. A inclusão das informações de parentesco e dos registros de...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Avaliação genética; Genetic parameters; Amostragem de Gibbs; Gibbs sampling; Inferência Bayesiana; Bayesian inference; Metodologia REML; Informação a priori; Heterogeneidade de variância; Componentes de variância; Gene de efeito principal (NGEP); Sistema Genesys; Varianza genética.; Heterogeneidad genética; Genes mayores; Cruce de animales; Análisis estadístico; Estimatica; Simulación por computadora; Melhoramento genético animal; Parâmetro genético; Análise estatística; Genoma; Modelo de simulação.; Animal breeding; Genome; Genetic variance; Major genes; Genetic heterogeneity; Statistical analysis; Computer simulation..
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/501455
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Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias. Repositório Alice
CARNEIRO JUNIOR, J. M.; ASSIS, G. M. L. de; EUCLYDES, R. F.; TORRES, R. de A.; LOPES, P. S..
Foi simulado um genoma de 3.000 centimorgans de comprimento considerando uma única característica quantitativa, governada por 800 locos com dois alelos por loco. Segundo a estrutura genômica proposta, foram simulados 1.500 machos e 1.500 fêmeas que formaram a população-base. A partir da população-base foram formadas duas populações iniciais, uma grande e outra pequena. Dois tipos de estruturas de heterogeneidade de variâncias foram inseridos nas populações iniciais: heterogeneidade de variância genética aditiva e heterogeneidade de variâncias genética aditiva e ambiental. Para obtenção destas estruturas, foram feitos descartes estratégicos dos valores genéticos aditivos e ambientais de acordo com o tipo de heterogeneidade e o nível de variabilidade...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Avaliação genética; Genetic parameters; Amostragem de Gibbs; Gibbs sampling; Inferência Bayesiana; Bayesian inference; Metodologia REML; Informação a priori; Heterogeneidade de variância; Componentes de variância; Sistema Genesys; Cruce de animales; Varianza genética.; Análisis estadístico; Heterogeneidad genética; Simulación por computadora; Melhoramento genético animal; Parâmetro genético; Estimativa; Análise estatística; Genoma; Modelo de simulação; Animal breeding; Genome; Genetic variance; Genetic heterogeneity; Statistical analysis; Computer simulation..
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/505159
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Estimation of genetic parameters for growth traits in Tabapuã cattle using a multi-trait model. Repositório Alice
MENEZES, G. R. de O.; TORRES, R. de A.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SILVA, L. O. C. da; GONDO, A.; EUCLYDES, R. F..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Avaliação genética.; Gado de Corte..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/970268
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Estimation of genetic parameters for test-day milk yield in holstein cows using a random regression model. Repositório Alice
COBUCI, J. A.; EUCLYDES, R. F.; LOPES, P. S.; COSTA, C. N.; TORRES, R. de A.; PEREIRA, C. S..
Test-day milk yield records of 11,023 first-parity Holstein cows were used to estimate genetic parameters for milk yield during different lactation periods. (Co)variance components were estimated using two random regression models, RRM1 and RRM2, and the restricted maximum likelihood method, compared by the likelihood ratio test. Additive genetic variances determined by RRM1 and additive genetic and permanent environmental variances estimated by RRM2 were described, using the Wilmink function. Residual variance was constant throughout lactation for the two models. The heritability estimates obtained by RRM1 (0.34 to 0.56) were higher than those obtained by RRM2 (0.15 to 0.31). Due to the high heritability estimates for milk yield throughout lactation and...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Produção Leiteira; Gado Holandês; Parâmetro Genético.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/594884
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Estudo de diversidade entre populações de cabras SRD com base em dados biométricos. Repositório Alice
PIRES, L. C.; MACHADO, T. M. M.; EUCLYDES, R. F.; TORRES, R. de A.; ARAÚJO, A. M. de.
Objetivou-se analisar recursos genéticos disponíveis e sua diversidade através de dados biométricos de caprinos sem raça definida (SRD) para discernimento genético entre populações das diferentes mesorregiões e microrregiões do Ceará...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Distância euclidiana; Diversidade genética.; Caprino; Marcador Genético; Recurso Genético..
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/69630
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Genetic evaluation for persistency of lactation in Holstein cows using a random regression model. Repositório Alice
COBUCI, J. A.; EUCLYDES, R. F.; COSTA, C. N.; TORRES, R. de A.; LOPES, P. S.; PEREIRA, C. S..
A model for analyzing test day records including both fixed and random coefficients was applied to the genetic evaluation of first lactation data for Holstein cows. Data comprising 87045 test-day milk yield records from calving between 1997 and 2001 from Holstein herds in 10 regions of the Brazilian state of Minas Gerais. Six persistency of lactation measures were evaluated using breeding values obtained by random regression analyses. The Wilmink function was used to model the additive genetic and permanent environmental effects. Residual variance was constant throughout lactation. Ranking for animals did not change among criteria for persistency measurements, but ranking changes were observed when the estimated breeding value (EBV) for persistency of...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Genetic evaluation; Persistency of lactation; Rank correlation; Random regression models.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/595956
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Genetic evaluation of Alpine goats using different milk control intervals. Repositório Alice
SILVA, F. G.; TORRES, R. A.; BRITO, L. F.; SILVA, L. P.; MENEZES, G. R. de O.; BRITO, L. C.; EUCLYDES, R. F.; RODRIGUES, M. T..
The objective of this study was to compare the results of genetic evaluations by using different milk control intervals to reduce the cost of milk yield controls without harming the quality of genetic evaluation of the animals. We analyzed test day milk yield data from the Goat Sector of Universidade Federal de Viçosa.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Correlação de Spearman.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/970345
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Incorporation of lactations with non-conventional drying-off causes in genetic evaluation of Gyr dairy cattle. Repositório Alice
REIS FILHO, J. C.; TORAL, F. L. B.; VERNEQUE, R. da S.; VERCESI FILHO, A. E.; TORRES, R. DE A.; EUCLYDES, R. F..
Test-day records of milk yields from the first three lactations were used to verify consequences of incorporation of lactation with non-conventional drying-off causes in genetic evaluation of Gyr dairy cattle. The first file (File1) was composed of test-day records of lactations with conventional drying-off causes. In the second file (File2), the test-day records of lactations with non-conventional drying-off causes were included, such as drying-off by death or separation of the calf, disease, death or sale of cow, and removal of cow from milking control. Data were analyzed by mixed models, using an autoregressive process to adjust the random effects of long-term and short-term environment. The inclusion of test-day records from lactations with...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Autoregressivo; Desenvolvimento; Parametros geneticos; Consistência.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/943237
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Influência da heterogeneidade de variâncias na avaliação genética de bovinos de corte da raça Tabapuã. Repositório Alice
CAMPELO, J. E. G; LOPES, P. S.; TORRES, R. A.; SILVA, L. O. C. da; EUCLYDES, R. F.; ARAÚJO, C. V.; PEREIRA, C. S..
Verificou-se a influência da heterogeneidade de variâncias na avaliação genética de bovinos de corte da raça Tabapuã. Dados de pesos corrigidos aos 120, 240 e 420 dias de idade foram estratificados com base no desvio-padrão fenotípico do peso aos 120 dias dos agrupos de contemporâneos com três classes: baixo (<14,9kg), médio (14,9 a 18,9kg) e akti (>18,9kg) desvio-padrão. Nas análises de múltiplas características, em que o peso foi considerado característica distinta em cada classe de desvio-padrão constatou-se que as variâncias genéticas e residuais foram maiores com o aumento do desvio-padrão da classe. As herdabilidades foram 0,26, 0,32 e 0,37 (peso aos 120 dias), 0,28, 0,35, e 0,35 (peso aos 240 dias) e 0,14, 0,18 e 0,18 (peso aos 420 dias) nas...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Bovino de corte; Tabapuã; Interação genótipo ambiente; Genotype environment interaction; Genetic parameters; Melhoramento Genético Animal; Parâmetro Genético; Animal breeding; Beef cattle.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/325476
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Interação reprodutor x rebanho na produção de leite da raça Holandesa no Brasil. Repositório Alice
ARAUJO, C. V.; TORRES, R. A.; COSTA, C. N.; LOPES, P. S.; PERREIRA, C. S.; EUCLYDES, R. F.; TORRES FILHO, R. A..
Registros de produção de leite de vacas da raça Holandesa foram utilizados na verificação da efetividade da inclusão da interação reprodutor x rebanho no modelo estatístico para estimação de componentes de variâncias, como uma forma de ajustamento para heterogeneidade de variância entre rebanhos. Com base no desvio-padrão fenotípico da produção de leite, ajustada a 305 dias de lactação e à idade adulta da vaca, os rebanhos foram estratificados em três classes: alto (>1375 kg), médio (1165 a 1375 kg) e baixo (<1165 kg) desvios-padrão fenotípicos. Componentes de variância em análise de características múltiplas, em que se considerou a produção de leite ajustada a 305 dias de lactação e à idade adulta em cada classe de desvio-padrão fenotípico como...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Componentes de variancia; Interacao reprodutor; Producao e Leite; Variance components; Rebanho; Milk yield.
Ano: 2001 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/594692
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Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. Repositório Alice
SILVA, M. V. G. B. da; MARTINEZ, M. L.; TORRES, R. de A.; LOPES, P. S.; EUCLYDES, R. F.; PEREIRA, C. S.; MACHADO, M. A.; ARBEX, W..
O procedimento de mapeamento por intervalo baseado em modelo aleatório foi aplicado para estudar sua robustez e propriedades no mapeamento de dois QTLs, em populações constituídas de famílias de meios-irmãos. Sob o modelo aleatório, a localização e os componentes de variância foram estimados usando o método da máxima verossimilhança. A estimação dos parâmetros foi baseada na metodologia de pares de irmãos. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir das proporções IBD de dois marcadores flanqueadores. As estimativas dos parâmetros dos QTLs (localizações e componentes de variância) e do poder de detecção, em uma característica com h2 = 0,25, foram obtidas usando dados simulados, variando-se o número de famílias,...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Mapeamento por intervalo; Marcador Genético.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/594886
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Predição de valores genéticos utilizando inferência bayesiana e frequência em dados simulados. Repositório Alice
CARNEIRO JUNIOR, J. M.; ASSIS, G. M. L. de; EUCLYDES, R. F.; MARTNS, W. M. de O.; WOLTER, P. F..
Dados simulados foram utilizados para comparar as metodologias Eblup e Bayesiana, em dados com homogeneidade de variâncias, heterogeneidade de variância genética e heterogeneidade de variância genética e ambiental. Para obtenção dessas estruturas foram feitos descartes estratégicos dos valores genéticos aditivos e ambientais de acordo com o tipo de heterogeneidade e o nível de variabilidade desejada (alta, média ou baixa), sendo utilizados dois tamanhos de população (grande e pequena). Para a metodologia Bayesiana foram utilizados três níveis de informação a priori: não informativo, pouco informativo e informativo. A presença da heterogeneidade de variâncias causa problemas para a seleção dos melhores indivíduos, principalmente se a heterogeneidade estiver...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Avaliação genética; Genetic parameters; Inferência Bayesiana; Bayesian inference; Metodologia Eblup; Informação a priori; Heterogeneidade de variância; Componentes de variância; Análisis estadístico; Cruce de animales; Heterogeneidad genética; Simulación por computadora; Varianza genética.; Melhoramento genético animal; Parâmetro genético; Estimativa; Análise estatística; Método estatístico; Modelo de simulação; Animal breeding; Genetic variance; Genetic heterogeneity; Statistical analysis; Computer simulation..
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/866226
Registros recuperados: 17
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