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Análise de diversidade em genótipos de feijão-caupi do programa de melhoramento da Embrapa Meio-Norte. Repositório Alice
NASCIMENTO, A. T. B. do; SILVA, C. B.; COSTA, M. M. R.; FERREIRA NETO, J. R. C.; ROCHA, M. de M.; SILVA, K. J. D. e; KIDO, E. A..
O feijão-caupi [Vigna unguiculata (L.) Walp.] se constitui em um dos principais componentes da dieta alimentar nas regiões Nordeste e Norte do Brasil, principalmente na zona rural, pois é pouco exigente em fertilidade de solos e apresenta certa tolerância a altas temperaturas e à seca. Seu melhoramento genético, no entanto, se faz necessário, em razão da produtividade ainda pequena quando comparada com o feijão comum. Neste contexto, marcadores moleculares podem ser de grande valia, quando usados como ferramentas no estudo da variabilidade genética dentro e entre espécies distintas, sendo essa informação de grande relevância para os programas de melhoramento. Dentre os diferentes tipos de marcadores existentes, os microssatélites (ou SSR, Simple Sequence...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Variabilidade genética; Germoplasma; Melhoramento genético.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/963641
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Avaliação de diferentes métodos de extração de RNA total em folhas de Vitis vinifera infectadas por Xanthomonas campestris. Repositório Alice
SILVA, J. B. da; SILVA, R. L. de O.; FERREIRA NETO, J. R. C.; ARAÚJO, F. T. de; PANDOLFI, V.; ARAÚJO, A. C. C. de; LEMOS, A. B.; RÊGO, M. de S.; OLIVEIRA, M. F. de; MELO, N. F. de; ISEPPON, A. M. B..
Este trabalho objetivou testar diferentes protocolos de extração de RNA para tecidos foliares de videira infectadas por X. campestres e identificar o mais eficiente para o tecido avaliado..
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vitis vinifera; Xanthomonas campestres; RNA; Uva; Melhoramento genético; Folha; Doença; Bactéria; Genetic improvement.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1057616
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Composição química de nove genótipos de feijão-caupi. Repositório Alice
FERREIRA NETO, J. R. C.; SILVA, S. M. de S.; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; FRANCO, L. J. D..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética; Vigna unguiculata; Melhoramento; Nutrição.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/68309
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Composição química dos grãos secos em genótipos de feijão-caupi. Repositório Alice
FERREIRA NETO, J. R. C.; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; SILVA, S. M. de S.; LOPES, A. C. de A.; FRANCO, L. J. D..
O objetivo deste trabalho foi analisar os teores de proteína, fibra, cálcio e fósforo em grãos de nove genótipos de feijão-caupi, com o propósito de fornecer dados para a seleção de cultivares e linhagens superiores do ponto de vista nutricional. As análises foram realizadas no Laboratório de Bromatologia da Embrapa Meio-Norte, Teresina, PI. Os grãos foram moídos e peneirados, individualmente e posteriormente foram submetidos a análises químicas utilizando-se métodos bromatológicos. O experimento foi delineado em blocos inteiramente ao acaso, com nove tratamentos e três repetições. Os genótipos apresentaram diferenças significativas para os teores de proteína, fibra e cálcio (0,07% a 0,12%). Os caracteres que apresentaram maior variabilidade foram teor de...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vigna unguiculata; Nutrição; Melhoramento de planta.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/68741
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Desenvolvimento de marcadores moleculares AFLP para mapeamento genético em feijão-caupi. Repositório Alice
CORREIA, C. N.; SILVA, R. L. de O.; FERREIRA NETO, J. R. C.; ALMEIDA, J. C. Q. P. de; SILVA, M. D. da; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, E. A..
bitstream/item/182816/1/cong2740.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão de Corda; Marcador Molecular; Melhoramento Genético Vegetal.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/630762
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Differential transcriptional profiling of phakopsora pachyrhizi-infected soybean revealed by high-thoughput supersage. Repositório Alice
KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; FERREIRA NETO, J. R. C.; BARBOSA, P. D. de A.; ANDRADE, P. P. de; LANE, R.; GUIMARÃES, F. C. M.; ABDELNOOR, R. V.; BENKO-ISEPPON, A. M..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Soja.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/952758
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Extração de DNA genômico de tecido foliar adulto de Mangifera indica L. para reações de polimorfismo de DNA amplificado ao acaso (RAPD). Repositório Alice
LIMA, P. S. da C.; FERREIRA NETO, J. R. C.; OLIVEIRA, J. A.; COSTA, J. H. da S.; SOUZA, V. A. B. de..
O trabalho teve por objetivo avaliar a concentração e a pureza do DNA extraído de folhas adultas de manga.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Manga; Mangifera indica.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/926312
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Mapa genético de feijão-caupi com marcadores derivados de marcadores gênicos e não codificantes. Repositório Alice
AMORIM, L. L. B.; ONOFRE, A. V. C.; FERREIRA NETO, J. R. C.; SILVA, R. L. O. da; CORREIA, C. N.; SILVA, M. D. da; CARVALHO, R. de; HORRES, R.; MORETZSOHN, M. de C.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; MONTE, S. J. H.; PANDOLFI, V.; ANDRADE, G. P.; PIO-RIBEIRO, G.; KIDO, É. A.; BENKO-ISEPPON, A. M..
O presente estudo buscou a construção de um mapa genético de feijão-caupi, incluindo genes de resistência ao vírus do mosaico severo do caupi (CPSMV), bem como sua associação a marcadores moleculares. Para isso, uma população de 94 RILs F6, segregando para reação ao vírus foi genotipada a partir de quatro categorias de marcadores: SSR-EST, ISSR, DAF e CAPS. Adotando o LOD de 2,0 e uma frequência máxima de recombinação de 0,40, foram mapeados 53 locos em 11 grupos de ligação cobrindo uma distância de recombinação total de 716,2 cM. O gene de resistência ao CPSMV foi mapeado no grupo de ligação 1, entre dois marcadores SSR-EST, a 6,1 cM do primeiro e 24,1 do segundo. As etapas seguintes envolvem o mapeamento fino desta região, visando identificar marcadores...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão de Corda; Marcador Molecular; Vírus.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/657084
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Mapeamento genético e marcadores moleculares associados à resistência do feijão-caupi ao vírus do mosaico severo. Repositório Alice
AMORIM, L. L. B.; ONOFRE, A. V. C.; FERREIRA NETO, J. R. C.; SILVA, R. L. O. da; CORREIA, C. N.; SILVA, M. D. da; CARVALHO, R. de; HORRES, R.; MORETZSOHN M. de C.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; PANDOLFI, V.; BARBOSA P. F. de A.; ANDRADE, G. P. de; PIO-RIBEIRO, G.; MONTE, S. J. H. do; KIDO, E. A.; BENKO-ISEPPON, A. M..
bitstream/item/182870/1/Pag3.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caupi; Marcador Molecular; Vírus.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/513544
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Mineração de motivos SSR em sequências expressas de feijão-caupi contendo TAGS supersage diferecialmente expressas sob desidratação radicular. Repositório Alice
SANTOS, R.; BASANTE, C.; FERREIRA NETO, J. R. C.; PANDOLFI, V.; ROCHA, M. de M.; SILVA, K. J. D. e; NEPOMUCENO, A.; BRONDANI, R. P. V.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, E. A..
O feijão-caupi é uma planta importante na nutrição e na economia de pequenos produtores das regiões Norte e Nordeste do Brasil. Entretanto, sua produtividade ainda é pequena, quando comparada com seu potencial e o de outras leguminosas. Uma das alternativas para auxiliar o melhoramento genético da cultura e associar tecnologias modernas, como o desenvolvimento de marcadores moleculares do tipo microssatélites (SSR) e a identificação de genes importantes em resposta a estresses, via estudos de transcriptômica, proporcionados pela técnica SuperSAGE. Nesse sentido, tags SuperSAGE de 26 pb, de genótipo tolerante a desidratação radicular, que foram observadas sendo induzidas após aplicação do estresse (até 150 min), em relação ao controle sem estresse, foram...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vigna unguiculata; Estresse abiótico; Biblioteca genômica; Bioinformática.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/963655
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Mineração de motivos SSR em sequências expressas de feijão-caupi contendo TAGS supersage diferecialmente expressas sob desidratação radicular. Repositório Alice
SANTOS, R.; BASANTE, C.; FERREIRA NETO, J. R. C.; PANDOLFI, V.; ROCHA, M. de M.; SILVA, K. J. D. e; NEPOMUCENO, A.; BRONDANI, R. P. V.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, E. A..
O feijão-caupi é uma planta importante na nutrição e na economia de pequenos produtores das regiões Norte e Nordeste do Brasil. Entretanto, sua produtividade ainda é pequena, quando comparada com seu potencial e o de outras leguminosas. Uma das alternativas para auxiliar o melhoramento genético da cultura e associar tecnologias modernas, como o desenvolvimento de marcadores moleculares do tipo microssatélites (SSR) e a identificação de genes importantes em resposta a estresses, via estudos de transcriptômica, proporcionados pela técnica SuperSAGE. Nesse sentido, tags SuperSAGE de 26 pb, de genótipo tolerante a desidratação radicular, que foram observadas sendo induzidas após aplicação do estresse (até 150 min), em relação ao controle sem estresse, foram...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vigna unguiculata; Estresse abiótico; Biblioteca genômica; Bioinformática.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/965091
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Modulação transcricional de genes associados à fosforilação oxidativa em genótipos contrastantes de feijão-caupi submetidos à desidratação radicular. Repositório Alice
FERREIRA NETO, J. R. C.; COSTA, M. M. R.; PANDOLFI, V.; SILVA, R. L. de O.; SILVA, K. J. D. e; NEPOMUCENO, A. L.; BRONDANI, R. P. V.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, É. A..
Mitocôndrias são conhecidas como as "estações energéticas" da célula. Elas abrigam o processo de fosforilação oxidativa, através do qual o transporte de elétrons por meio de carreadores é acoplado ao bombeamento de prótons para o espaço intermembranar gerando um gradiente eletroquímico que fornece energia para a síntese de ATP. Tal molécula é de suma importância para os organismos vivos, pois cede energia para os processos celulares. No presente trabalho, foi analisada, via unitags SuperSAGE e de acordo com a base de dados KEGG, a regulação dos genes associados a enzimas participantes da fosforilação oxidativa, em genótipos contrastantes de feijão-caupi cultivados em hidroponia e submetidos à desidratação radicular por até 150 min. Resultados apresentaram...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vigna unguiculata; Transcriptômica; SuperSAGE; Bioinformática.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/963656
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Modulação transcricional de genes associados à fosforilação oxidativa em genótipos contrastantes de feijão-caupi submetidos à desidratação radicular. Repositório Alice
FERREIRA NETO, J. R. C.; COSTA, M. M. R.; PANDOLFI, V.; SILVA, R. L. de O.; SILVA, K. J. D. e; NEPOMUCENO, A. L.; BRONDANI, R. P. V.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, É. A..
Mitocôndrias são conhecidas como as "estações energéticas" da célula. Elas abrigam o processo de fosforilação oxidativa, através do qual o transporte de elétrons por meio de carreadores é acoplado ao bombeamento de prótons para o espaço intermembranar gerando um gradiente eletroquímico que fornece energia para a síntese de ATP. Tal molécula é de suma importância para os organismos vivos, pois cede energia para os processos celulares. No presente trabalho, foi analisada, via unitags SuperSAGE e de acordo com a base de dados KEGG, a regulação dos genes associados a enzimas participantes da fosforilação oxidativa, em genótipos contrastantes de feijão-caupi cultivados em hidroponia e submetidos à desidratação radicular por até 150 min. Resultados apresentaram...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vigna unguiculata; Transcriptômica; SuperSAGE; Bioinformática.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/965089
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Natural antisense transcripts in plants: a review and identification in soybean infected with Phakopsora pachyrhizi SuperSAGE Library. Repositório Alice
BRITTO-KIDO, S. de A.; FERREIRA NETO, J. R. C.; PANDOLFI, V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, E. A..
Natural antisense ranscripts (NAT) are RNA molecules complementary to other endogenous RNAs. They are capable of regulating the expression of target genes at different levels (transcription, mRNA stability, translation, etc.). Such a property makes them ideal for interventions in organisms? metabolism. The present study reviewed plant NAT aspects, including features, availability and genesis, conservation and distribution, coding capacity, NAT pair expression, and functions. Besides, an in silico identification of NATs pairs was presented, using deepSuperSAGE libraries of soybean infected or not with Phakopsora pachyrhizi.Resultsshowed that around 1/3 of the 77,903 predicted trans-NATs (by PlantsNATsDB database) detected had unitags mapped in both...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Soja.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/962186
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Preliminary genetic linkage map of cowpea (Vigna unguiculata). Repositório Alice
AMORIM, L. L. B.; ONOFRE, A. V. C.; CARVALHO, R.; MORETZSOHN, M. de C.; FERREIRA NETO, J. R. C.; SILVA, R. L. O.; CORREIA, C. N.; SILVA, M. D.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; ANDRADE, G. P.; PIO-RIBEIRO, G.; KIDO, E. A.; BENKO-ISEPPON, A. M..
2010
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão-caupi.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/881828
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Resposta do feijão-caupi ao estresse salino e ao ataque de vírus via bibliotecas de ESTs. Repositório Alice
PANDOLFI, V.; BARBOSA, P. K. de A.; SILVA, A. M. da; LIRA, N. P. V. de; KIDO, E. A.; CALSA JUNIOR, T.; AMORIM, L. L. B.; ONOFRE, A. V. C.; SILVA, L. C. B. da; FERREIRA NETO, J. R. C.; MONTE, S. J. H. do; BRANDÃO, R. M. S. de S.; ARAUJO, A. de S.; CASTRO, J. A. F. de; HOULLOU-KIDO, L. M.; GRANJEIRO, T. B.; LIMA, A. S.; LOBO, M. D. P.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. M.; FREIRE FILHO, F. R.; ANDRADE, G. P.; PIO-RIBEIRO, G.; ISEPPON, A. M. B..
bitstream/item/182842/1/pag26.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caupi; Vigna Unguiculata; Vírus.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/513238
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Soybean aquaporins: diferential expression, genome distribuition and structure. Repositório Alice
BEZERRA-NETO, J. P.; BELARMINO, L.; PANDOLFI, V.; FERREIRA NETO, J. R. C.; GUIMARÃES, F. C. M.; ROMERO, C.; KIDO, E. A.; NEPOMUCENO, A. L.; BENKO-ISEPPON, A. M..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Soja.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/952760
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Transcriptoma supersage de feijão-caupi sob desidratação radicular. Repositório Alice
BASANTE, C.; FERREIRA NETO, J. R. C.; PANDOLFI, V.; SILVA, K. J. D. e; ROCHA, M. de M.; NEPOMUCENO, A.; BRONDANI, R. P. V.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, E. A..
O feijão-caupi é uma planta de ampla plasticidade fenotípica, podendo produzir mesmo em condições não satisfatória para outras culturas. Assim, identificar genes estresse responsivo nesta cultura é de vital importância, tanto para a espécie quanto para outras leguminosas. Estudos em transcriptômica, proporcionados pela técnica SuperSAGE, origina tags de 26 pb que podem ser quantificadas e estatisticamente analisadas, sendo classificadas em superexpressas ou reprimidas. Unitags (tags diferentes) de raízes de feijao-caupi submetidas a estresse de desidratação radicular (de até 150 min, após exposição ao ar) foram analisadas procurando-se identificar unitags diferencialmente expressas nas respostas dos genótipos analisados, considerados tolerante e sensível a...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vigna unguiculata; Estresse abiótico; Genômica; Bioinformática.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/963654
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Transcriptoma supersage de feijão-caupi sob desidratação radicular. Repositório Alice
BASANTE, C.; FERREIRA NETO, J. R. C.; PANDOLFI, V.; SILVA, K. J. D. e; ROCHA, M. de M.; NEPOMUCENO, A.; BRONDANI, R. P. V.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, E. A..
O feijão-caupi é uma planta de ampla plasticidade fenotípica, podendo produzir mesmo em condições não satisfatória para outras culturas. Assim, identificar genes estresse responsivo nesta cultura é de vital importância, tanto para a espécie quanto para outras leguminosas. Estudos em transcriptômica, proporcionados pela técnica SuperSAGE, origina tags de 26 pb que podem ser quantificadas e estatisticamente analisadas, sendo classificadas em superexpressas ou reprimidas. Unitags (tags diferentes) de raízes de feijao-caupi submetidas a estresse de desidratação radicular (de até 150 min, após exposição ao ar) foram analisadas procurando-se identificar unitags diferencialmente expressas nas respostas dos genótipos analisados, considerados tolerante e sensível a...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vigna unguiculata; Estresse abiótico; Genômica; Bioinformática.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/965090
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