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A draft genome assembly for the forage grass Urochloa ruziziensis based on single-molecule real-time sequencing. Repositório Alice
PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E..
ABSTRACT: Ruzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, and known for its high nutritional quality. It is closely related to other important forage species of Urochloa, playing a crucial role in the breeding program of brachiaria grasses, which is mostly focused on inter-specific hybrids. Previous studies from our group based on shallow Illumina sequencing resulted in the development of the first molecular markers for the species, as well as in assessments of germplasm diversity and structure. Assembly and analysis of complete plastid genomes for four Urochloa species allowed the characterization of their phylogenetic divergence. Here, we strengthen the set of genomic tools for tropical...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Montagem de sequência de DNA; Bioinformática; De novo Assembly; Brachiaria Ruziziensis; Pastagem; Genoma.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099953
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A importância da pesquisa genômica e o sequenciamento de DNA. Infoteca-e
FERREIRA, M. E.; BORGES NETO, C. R..
bitstream/CENARGEN/24079/1/cot091.pdf
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Sequenciamento de DNA.; Genoma; Pesquisa..
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/184921
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A phased diploid genome assembly for the forage grass urochloa ruziziensis based on single-molecule real-time sequencing. Repositório Alice
PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E..
Ruzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, known for its high nutritional quality. It is closely related to important forage species of Urochloa, and plays a crucial role in the breeding program of brachiaria grasses, mostly focused on inter-specific hybirds. Previous studies from our group based on shallow Illumina sequencing resulted in the development of the first molecular markers for the species (Silva et al., 2013), as well as in assessments of germplasm diversity and structure (Pessoa-Filho et al., 2015). Assembly and analysis of complete plastid genomes for four Urochloa species allowed the characterization of their phylogenetic divergence (Pessoa-Filho et al., 2017). Here, we...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Brasil; Genoma; Capim Urochloa.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107378
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A protocol for canopy cover monitoring on forest restoration projects using low-cost drones. Repositório Alice
ALBUQUERQUE, R. W.; MATSUMOTO, M. H.; CALMON, M.; FERREIRA, M. E.; VIEIRA, D. L. M.; GROHMANN, C. H..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Remotely piloted aircraft; Tree cover; Protocol; Forest restoration; Unmanned aerial vehicles.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1147103
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A set of multiplex panels of microsatellite markers for rapid molecular characterization of rice accessions. Repositório Alice
PESSOA-FILHO, M.; BELÓ, A.; ALCOCHETE, A. A. N.; RANGEL, P. H. N.; FERREIRA, M. E..
This study aimed to analyze the efficiency of three new microsatellite multiplex panels, which were designed to evaluate a total of 16 loci of the rice genome, based on single PCR reactions of each panel. A sample of 548 accessions of traditional upland rice landraces collected in Brazil in the last 25 years was genotyped, a database of allelic frequencies was established, estimates of genetic parameters were performed and analysis of genetic structure of the collection was developed.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Microssatélite; Arroz; Marcador Molecular; Oryza Sativa; Genome; Rice.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/216792
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Aboveground biomass estimation in Amazonian Tropical Forests: a comparison of aircraft- and GatorEye UAV- borne LiDAR data in the Chico Mendes Extractive Reserve in Acre, Brazil. Repositório Alice
OLIVEIRA, M. V. N. d'; BROADBENT, E. N.; OLIVEIRA, L. C. de; ALMEIDA, D. R. A.; PAPA, D. de A.; FERREIRA, M. E.; ZAMBRANO, A. M. A.; SILVA, C. A.; AVINO, F. S.; PRATA, G. A.; MELLO, R. A.; FIGUEIREDO, E. O.; JORGE, L. A. de C.; JUNIOR, L.; ALBUQUERQUE, R. W.; BRANCALION, P. H. S.; WILKINSON, B.; COSTA, M. O. da.
Tropical forests are often located in dicult-to-access areas, which make high-quality forest structure information dicult and expensive to obtain by traditional field-based approaches. LiDAR (acronym for Light Detection And Ranging) data have been used throughout the world to produce time-ecient and wall-to-wall structural parameter estimates for monitoring in native and commercial forests. In this study, we compare products and aboveground biomass (AGB) estimations from LiDAR data acquired using an aircraft-borne system in 2015 and data collected by the unmanned aerial vehicle (UAV)-based GatorEye Unmanned Flying Laboratory in 2017 for ten forest inventory plots located in the Chico Mendes Extractive Reserve in Acre state, southwestern Brazilian Amazon....
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Bosques tropicales; Inventario forestal; Monitoreo; Biomassa aérea; Teledetección; Vehículos aéreos no tripulados; Drone; GatorEye; Seringal Filipinas (AC); RESEX Chico Mendes; Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Floresta Tropical; Inventário Florestal; Reconhecimento Florestal; Estimativa; Sensoriamento Remoto; Raio Laser; Tropical forests; Forest inventory; Monitoring; Aboveground biomass; Remote sensing; Unmanned aerial vehicles; Lidar.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1122818
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Afforestation of savannas: an impending ecological disaster. Repositório Alice
FERNANDES, G. W.; COELHO, M. S.; MACHADO, R. B.; FERREIRA, M. E.; AGUIAR, L. M. de S.; DIRZO, R.; SCARIOT, A.; LOPES, C. R..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Non-forest ecosystem; Restoration ecology; Eucalyptus plantation; Bonn challenge; CO2 sequestration; Cerrado.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1062832
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Analise da diversidade genetica do arroz silvestre americano (Oryza spp) atraves de marcadores moleculares. Repositório Alice
BUSO, G. S. C.; BERTOZO, M. R.; RANGEL, P. H.; FERREIRA, M. E..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Diversidade genetica; Marcadores moleculares; Genetic diversity; Molecular markers; Arroz Silvestre.; Wild rice..
Ano: 1996 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/171468
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Análise da variabilidade genética de acessos de melão utilizando marcadores RAPD. Repositório Alice
LINS, T. C. L.; SILVA, N. J. M. L.; LOURENÇO, R. T.; RITSCHEL, P. S.; FERREIRA, M. E.; BUSO, J. A.; BUSO, G. S. C..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos
Ano: 2000 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/186759
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Análise da variabilidade genética e caracterização molecular de acessos do banco de germoplasma de pimentas e pimentões. Repositório Alice
LINS, T. C. L.; TAVARES, H. M. F.; LOURENÇO, R. T.; REIFSCHNEIDER, F. J. B.; BUSO, G. S. C.; FERREIRA, M. E..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/188803
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Análise de populações de Magnaporthe grisea do Estado do Tocantins utilizando SSR. Repositório Alice
GARRIDO, R.; RANGEL, P. H. N.; FERREIRA, M. E..
A brusone do arroz causada por Magnaporthe grisea é a principal doença desta cultura. Sob condições ambientais favoraveis, o patógeno pode causar epidemias que acarretam perdas econômicas. 0 objetivo do trabalho foi estudar a estrutura genética de populações de M. grisea, coletadas em lavouras comerciais de arroz do Estado do Tocantins, com marcadores SSR.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Arroz; Brusone; Doença; Oryza Sativa; Marcador Molecular; Magnaporthe grisea; Rice.
Ano: 2001 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/208513
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Análise de sequências de DNA cloroplástico de espécies do gênero Capsicum. Infoteca-e
BUSO, G. S. C.; AMARAL, Z. P. de S.; BIANCHETTI, L. de B.; FERREIRA, M. E..
bitstream/CENARGEN/23669/1/bp037.pdf
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Analise de sequencias; DNA cloropastico; Evolucao; CAPS.; Filogenia; Pimenta.; Capsicum..
Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/176888
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Análise genética de acessos cultivados e silvestres de Capsicum utilizando marcadores moleculares. Repositório Alice
KRATKA, P. C.; TRISTAN, R. L.; TAVARES, H. M. E.; LINS, T. C. L.; BIANCHETTI, L.; FERREIRA, M. E.; AMARAL, Z. P.; BUSO, G. S. C..
Tipo: Parte de livro
Ano: 2001 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/186063
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Análise genética de acessos de arroz vermelho (Oryza spp.) coletados no Brasil e na Venezuela: híbrido interespecífico, variedade tradicional ou erva daninha? Repositório Alice
LINS, T. C. L.; SILVA, N. J. M. L.; AMARAL, Z. P. S.; RANGEL, P. H. N.; FERREIRA, M. E..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Caracterização biológica.
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/189045
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Análise genética de novas espécies de capsicum e sua relação com espécies cultivadas do gênero, através de marcadores moleculares. Repositório Alice
LOPES, F. F. R.; KRATKA, P. C.; BIANCHETTI, L.; FERREIRA, M. E.; AMARAL, Z. P.; BUSO, G. S. C..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/188805
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Avaliação da variabilidade genética em linhagens e cultivares de melão (Cucumis melo) utilizando marcadores moleculares. Repositório Alice
LOURENÇO, R. T.; LINS, T. C. de; BUSO, J. A.; FERREIRA, M. E.; PAIVA, W. O.; BUSO, G. S. C..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos
Ano: 2000 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/186762
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Avaliação de características morfofisiológicas em uma coleção nuclear de arroz para tolerância à seca. Repositório Alice
PEREIRA, M. da C. P.; SOUZA, N. O. S.; FERREIRA, M. E.; REIS, M. I. C. C. dos; LIMA, B. P. de.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Oryza sativa L; Melhoramento de plantas; Maturação; Pós-colheita.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1026276
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Avaliação de linhagens cl de arroz irrigado da embrapa em ensaios de VCU, no RS - safra 2016/17. Repositório Alice
MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; RANGEL, P. H. N.; FAGUNDES, P. R. R.; MORAIS, O. P. de; FRANCO, D. F.; COLOMBARI FILHO, J. M.; CASTRO, A. P. de; ANDRES, A.; TORGA, P. P.; NUNES, C. D. M.; MOURA NETO, F. P.; FERREIRA, M. E.; SOUZA, J. A. C. de; STRECK, E. A.; AGUIAR, G. A.; FACCHINELLO, P. H.; GOVEIA, J. V..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Cultivares; Ganho genético; Sistema Clearfield.; Produtividade; Seleção..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075167
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Avaliação de progênies derivadas de cruzamentos envolvendo o acesso com espiguetas agrupadas da Embrapa. Repositório Alice
COLOMBARI FILHO, J. M.; DURÃO, R. da S.; RANGEL, P. H. N.; FERREIRA, M. E.; MENDONÇA, J. A.; VIDOTTI, M. S..
O presente trabalho teve como objetivo realizar a avaliação de progênies F3:5 provenientes de cruzamentos biparentais envolvendo cultivares/linhagens-elite e o acesso com espiguetas agrupadas da Embrapa, com base no caráter produção de grãos.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Arroz irrigado; Oryza sativa; Melhoramento genético vegetal; Progênie.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/988680
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Avaliação de uma coleção de germoplasma de arroz para resistência às principais doenças no sul do Estado do Tocantins. Repositório Alice
SANTOS, G. R.; CASTRO NETO, M. D.; RANGEL, P. H. N.; FERREIRA, M. E.; DIAS NETO, J. J.; SILVA, L. M. A.; SARMENTO, R. A..
O objetivo do presente trabalho foi avaliar uma coleção nuclear de arroz constituída de 100 genótipos quanto à resistência as principais doenças em sistema de terras altas.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Tocantins; Coleção nuclear.; Arroz; Banco de Germoplasma; Doença de Planta; Oryza Sativa.; Rice..
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/217561
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