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Análise proteômica de raízes de feijão (Phaseolus vulgaris) inoculadas com Rhizobium tropici. Infoteca-e
SCHIAVON, A. L.; RODRIGUES, E. P.; BATISTA, J. S. S.; GOMES, D. F.; HUNGRIA, M..
2010
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Raízes de feijão.
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/859113
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Associação micorrízica em plantas nativas da caatinga: ocorrência e eficiência simbiótica para produção de mudas. Repositório Alice
GOMES, D. F.; CARVALHO, D. T. Q.; MORAIS, T. A. L.; MELO, N. F.; MELO, A. M. Y..
2008
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caatinga; Planta nativa; Muda; Produção; Fungo; Solo.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/160849
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Draft genome sequence of Pseudomonas fluorescens strain ET76, isolated from rice Rhizosphere in Northwestern Morocco. Repositório Alice
AARAB, S.; ARAKRAK, A.; JAVIER OLLERO, F.; MEGÍAS, M.; GOMES, D. F.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M..
Pseudomonas fluorescens ET76 was isolated from rice rhizosphere in northwestern Morocco. Its draft genome was estimated to be 6,681,652 bp with 5,789 coding sequences (CDSs). Genes encoding for type I to VI secretion systems, PvdQ, proteases, siderophores, hydrogen cyanide synthase, ACC-deaminase, among others, highlight its potential use in biological control of plant pathogens.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pseudomonas fluorescens; Arroz; Oryza sativa L; Rice.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1063357
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Efeito da inoculação com Bradyrhizobium japonicum no proteoma de raízes de soja. Repositório Alice
BATISTA, J. S. da S.; RODRIGUES, E. P.; TORRES, A. R.; GOMES, D. F.; HUNGRIA, M..
A simbiose entre rizóbios e plantas leguminosas, resultando no processo de fixação biológica de nitrogênio (FBN), caracteriza uma das mais importantes interações planta-microrganismo, devido à sua contribuição ao ciclo global de N. Tal interação é um processo complexo, que ocorre mediante a troca de sinais moleculares entre ambos os simbiontes. No Brasil, estirpes selecionadas de Bradyrhizobium japonicum, cujas taxas de fixação de N2 e eficiência simbiótica são comprovadamente reconhecidas, são recomendadas para a utilização em inoculantes comerciais para a soja. Uma das estirpes utilizadas em inoculantes comerciais é a CPAC 15 (=SEMIA 5079), reconhecida por sua elevada competitividade e capacidade saprofítica. Uma maior compreensão sobre a sinalização...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Microbiologia.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/918526
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Expressão do gene de nodulação nodD2 de Rhizobium tropici estirpe CIAT 899T sob estresse osmótico e indução por flavonoide. Repositório Alice
ROLLA-SANTOS, A. A. P.; GOMES, D. F.; MEGÍAS, M.; OLLERO, F. J.; HUNGRIA, M..
Bactérias conhecidas coletivamente como rizóbios estabelecem simbioses com leguminosas, formando estruturas específicas, os nódulos, onde ocorre o processo de fixação biológica do nitrogênio, de grande importância para a agricultura e para o meio ambiente. O processo de nodulação é regulado por genes denominados nod, noe e nol, que em uma etapa inicial, quando induzidos por flavonoides, sintetizam moléculas de oligossacarídeos lipoquitínicos, conhecidas como fatores Nod ou LCOs. A síntese dos fatores Nod está sob controle do gene regulatório nodD. Identificar e analisar genes envolvidos na regulação da biossíntese dos fatores Nod propicia uma maior compreensão dos mecanismos dessa interação planta/bactéria. No genoma de Rhizobium tropici CIAT 899,...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Rizobio; Gene.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1010671
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Fungos micorrízicos arbusculares na rizosfera de plantas de mata ciliar do rio São Francisco, na região do vale do São Francisco. Repositório Alice
GOMES, D. F.; MELO, N. F. de; MELO. A. M. Y..
2009
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Solo; Fungo micorrizico; FMA; Mata ciliar; Vale do São Francisco; Planta.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/662542
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Genome of Rhizobium leucaenae strains CFN 299T and CPAO 29.8: searching for genes related to a successful symbiotic performance under stressful conditions. Repositório Alice
ORMEÑO-ORRILLO, E.; GOMES, D. F.; CERRO, P. del; VASCONCELOS, A. T. R.; CANCHAYA, C.; ALMEIDA, L. G. P.; MERCANTE, F. M.; JAVIER OLLERO, F.; MEGÍAS, M.; HUNGRIA, M..
Common bean (Phaseolus vulgaris L.) is the most important legume cropped worldwide for food production and its agronomic performance can be greatly improved if the benefits from symbiotic nitrogen fixation are maximized. The legume is known for its high promiscuity in nodulating with several Rhizobium species, but those belonging to the Rhizobium tropici ?group? are the most successful and efficient in fixing nitrogen in tropical acid soils. Rhizobium leucaenae belongs to this group, which is abundant in the Brazilian ?Cerrados? soils and frequently submitted to several environmental stresses. Here we present the first high-quality genome drafts of R. leucaenae, including the type strain CFN 299T and the very efficient strain CPAO 29.8. Our main objective...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fixação biológica de nitrogênio.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1056833
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Genome sequence of Bradyrhizobium embrapense strain CNPSo 2833T, isolated from a root nodule of Desmodium heterocarpon. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; GOMES, D. F.; SOUZA, R. C.; CHUEIRE, L. M. O.; HUNGRIA, M..
bitstream/item/167103/1/2017DelamutaetalBJM-Genome.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Simbiose; Genoma; Nodulação; Nitrogen fixation; Symbiosis; Genome; Nodulation.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1080233
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Genome sequence of Bradyrhizobium pachyrhizi strain PAC48T, a nitrogen-fixing symbiont of Pachyrhizus erosus (L.) Urb. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; GOMES, D. F.; SOUZA, R. C..
Bradyrhizobium pachyrhizi PAC48T has been isolated from a jicama nodule in Costa Rica. The draft genome indicates high similarity with that of Bradyrhizobium elkanii. Several coding sequences (CDSs) of the stress response might help in survival in the tropics. PAC48T carries nodD1 and nodK, similar to Bradyrhizobium (Parasponia) ANU 289 and a particular nodD2 gene.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Jicama; Pachyrhizus tuberosus; Nitrogen fixation; Pachyrhizus erosus.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1038602
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Genome sequence of Bradyrhizobium stylosanthis Strain BR 446T, a Nitrogen-Fixing Symbiont of the legume Pasture stylosanthes guianensis. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; GOMES, D. F.; SOUZA, R. C.; CHUEIRE, L. M. de O.; HUNGRIA, M..
Bradyrhizobium stylosanthis BR 446T is a nitrogen-fixing symbiont of the tropical legume pasture Stylosanthes guianensis. Its draft genome contains 8,801,717 bp and 8,239 coding sequences (CDSs). Several putative genes that might confer high competi- tiveness and saprophytic capacity under the stressful conditions of tropical soils were identified in the genome.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Nitrogen fixation.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1063360
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Genome sequence of Bradyrhizobium tropiciagri Strain CNPSo 1112T , isolated from a root nodule of Neonotonia wightii. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; GOMES, D. F.; RIBEIRO, R. A.; CHUEIRE, L. M. O.; SOUZA, R. C.; ALMEIDA, L. G. P.; VASCONCELOS, A. T. R.; HUNGRIA, M..
CNPSo 1112T is a nitrogen-fixing symbiont of perennial soybean, a tropical legume forage. Its draft genome indicates a large genome with a circular chromosome and 9,554 coding sequences (CDSs). Operons of nodulation, nitrogen fixation, and uptake hydrogenase were present in the symbiotic island, and the genome encompasses several CDSs of stress tolerance.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Nitrogen fixation.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032022
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Genome sequence of Bradyrhizobium viridifuturi strain SEMIA 690T, a nitrogen-fixing symbiont of Centrosema pubescens. Repositório Alice
HELENE, L. C. F.; GOMES, D. F.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; SOUZA, R. C.; ALMEIDA, L. G. P.; VASCONCELOS, A. T. R.; HUNGRIA, M..
SEMIA 690T is a nitrogen-fixing symbiont of Centrosema pubescens, and comprises the recently described species Bradyrhizobium viridifuturi. Its draft genome indicates that it belongs to the Bradyrhizobium elkanii superclade. SEMIA 690T carries two copies of the regulatory nodD gene, and the nod and nif operons resemble those of Bradyrhizobium diazoefficiens.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Nitrogen fixation.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032024
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Genome sequence of Rhizobium ecuadorense strain CNPSo 671T, an indigenous N2-fixing symbiont of the ecuadorian common bean (Phaseolus vulgaris L.) genetic pool. Repositório Alice
RIBEIRO, R. A.; DELAMUTA, J. R. M.; GOMES, D. F.; SOUZA, R. C.; CHUEIRE, L. M. de O.; HUNGRIA, M..
Rhizobium ecuadorense CNPSo 671T was isolated from a common bean nodule in Ecuador. The draft genome brings novelty about indigenous rhizobial species in centers of genetic diversity of the legume.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Feijão; Nitrogen fixation; Beans.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1038481
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NrcR, a new transcriptional regulator of Rhizobium tropici CIAT 899 involved in the Legume root-nodule symbiosis. Repositório Alice
CERRO, P. del; ROLLA-SANTOS, A. A. P.; VALDERRAMA-FERNANDEZ, R.; GIL-SERRANO, A.; BELLOGÍN, R. A.; GOMES, D. F.; MONTAÑO, F. P.; MEGÍAS, M.; HUNGRIA, M.; JAVIER OLLERO, F..
The establishment of nitrogen-fixing rhizobium-legume symbioses requires a highly complex cascade of events. In this molecular dialogue the bacterial NodD transcriptional regulators in conjunction with plant inducers, mostly flavonoids, are responsible for the biosynthesis and secretion of Nod factors which are key molecules for successful nodulation. Other transcriptional regulators related to the symbiotic process have been identified in rhizobial genomes, including negative regulators such as NolR. Rhizobium tropici CIAT 899 is an important symbiont of common bean (Phaseolus vulgaris L.), and its genome encompasses intriguing features such as five copies of nodD genes, as well as other possible transcriptional regulators including the NolR protein. Here...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogenio; Nitrogen fixation.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1043848
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Opening the "black box" of nodD3, nodD4 and nodD5 genes of Rhizobium tropici strain CIAT 899. Repositório Alice
CERRO, P. del; ROLLA-SANTOS, A. A. P.; GOMES, D. F.; MARKS, B. B.; ESPUNY, M. del R.; RODRÍGUEZ-CARVAJAL, M. A.; SORIA-DÍAZ, M. E.; NAKATANI, A. S.; HUNGRIA, M.; JAVIER OLLERO, F.; MEGÍAS, M..
Transcription of nodulation genes in rhizobial species is orchestrated by the regulatory nodD gene. Rhizobium tropici strain CIAT 899 is an intriguing species in possessing features such as broad host range, high tolerance of abiotic stresses and, especially, by carrying the highest known number of nodD genes?five?and the greatest diversity of Nod factors (lipochitooligosaccharides, LCOs). Here we shed light on the roles of the multiple nodD genes of CIAT 899 by reporting, for the first time, results obtained with nodD3, nodD4 and nodD5 mutants. The three nodD mutants were built by insertion of ? interposon. Nod factors were purified and identified by LC-MS/MS analyses. In addition, nodD1 and nodC relative gene expressions were measured by quantitative...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Rhizobium; Fixação de nitrogênio; Bacteriologia do solo; Nodulação; Bacteriology; Rhizobium; Nitrogen fixation; Nodulation.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039242
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Proteomic analysis of free-living Bradyrhizobium diazoefficiens: highlighting potential determinants of a successful symbiosis Repositório Alice
GOMES, D. F.; BATISTA, J. S. da S.; ROLLA, A. A. P.; SILVA, L. P. da; BLOCH, C.; GALLI-TARASAWA, L. V.; HUNGRIA, M..
Strain CPAC 7 (=SEMIA 5080) was recently reclassified into the new species Bradyrhizobium diazoefficiens; due to its outstanding efficiency in fixing nitrogen, it has been used in commercial inoculants for application to crops of soybean [Glycine max (L.) Merr.] in Brazil and other South American countries. Although the efficiency of B. diazoefficiens inoculant strains is well recognized, few data on their protein expression are available. We provided a two-dimensional proteomic reference map of CPAC 7 obtained under free-living conditions, with the successful identification of 115 spots, representing 95 different proteins. The results highlighted the expression of molecular determinants potentially related to symbiosis establishment (e.g. inositol...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Symbiosis; Nitrogen fixation; Two-dimensional proteomics; RT-qPCR; Bradyrhizobium.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/993458
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Proteomic analysis of free-living Bradyrhizobium diazoefficiens: highlighting potential determinants of a successful symbiosis. Repositório Alice
GOMES, D. F.; BATISTA, J. S. S.; ROLLA, A. A. P.; SILVA, L. P. da; TARASAWA, L. V. G.; HUNGRIA, M..
Strain CPAC 7 (=SEMIA 5080) was recently reclassified into the new species Bradyrhizobium diazoefficiens; due to its outstanding efficiency in fixing nitrogen, it has been used in commercial inoculants for application to crops of soybean [Glycine max (L.) Merr.] in Brazil and other South American countries. Although the efficiency of B. diazoefficiens inoculant strains is well recognized, few data on their protein expression are available.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Two-dimensional proteomics; RT-qPCR; Bradyrhizobium; Nitrogen fixation; Symbiosis.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/997388
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Proteomic analysis of Rhizobium freirei PRF 81 responses to low pH. Repositório Alice
TULLIO, L. D.; PAULITSCH, F.; REICHERT, P. R. S.; KLEPA, M. S.; KLEPA, M. S.; PILEGGI, M.; GOMES, D. F.; HUNGRIA, M.; BATISTA, J. S. S..
Rhizobium freirei PRF 81 is employed in common bean commercial inoculants in Brazil, due to its outstanding efficiency in fixing nitrogen, competitiveness and tolerance to abiotic stresses. Among the environmental conditions faced by rhizobia in soils, acidity is perhaps the encountered most, especially in Brazil. So, we used proteomics based approaches to study the responses of PRF 81 to a low pH condition. R. freirei PRF 81 was grown in TY medium until exponential phase in two treatments: pH 6,8 and pH 4,8. Whole-cell proteins were extracted and separated by two-dimensional gel electrophoresis, using IPG-strips with pH range 4-7 and 12% polyacrilamide gels. The experiment was performed in triplicate. Protein spots were detected in the high-resolution...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Nitrogen fixation.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1045758
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Proteomic analysis of Rhizobium freirei PRF 81T reveals the key role of central metabolic pathways in acid tolerance. Repositório Alice
TULLIO, L. D.; GOMES, D. F.; SILVA, L. P. da; HUNGRIA, M.; BATISTA, J. S. da S..
bitstream/item/194799/1/1-s2.0-S0929139318305936-main.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Abiotic stresses; Biological nitrogen fixation; PH homeostasis; Acid consuming; Two-dimensional electrophoresis; Oxidative stress.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107373
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Proteomic analysis of soybean [Glycine max (L.) Merrill] roots inoculated with Bradyrhizobium japonicum Strain CPAC 15. Repositório Alice
TORRES, A. R.; RODRIGUES, E. P.; JESIANE S. S. BATISTA; GOMES, D. F.; HUNGRIA, M..
This research intended to analyze the expression pattern of proteins in roots of the Brazilian soybean cultivar Conquista when inoculated with Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, a strain broadly used in commercial inoculants in Brazil. At ten days after bacterial inoculation, whole-cell proteins were extracted from roots and separated by 2-D gel electrophoresis. Comparative analysis revealed significant changes in the intensity of 37 spots due to the inoculation (17 up-regulated and 20 down-regulated proteins), identified by MALDI-TOF/TOF-TOF. Identified proteins were associated with COG functional categories of information storage and processing, cellular processes and signaling, metabolism, and also in the ?poorly characterized? and ?not in COG?...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Rizóbio.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/971977
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