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BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. do A.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; CHUD, T. C. S.; STAFUZZA, N. B.; ROLA, L. D.; MEIRELLES, S. L. C.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; HIGA, R. H.; SILVA, M. V. G. B.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P.. |
Background: Beef cattle breeding programs in Brazil have placed greater emphasis on the genomic study of reproductive traits of males and females due to their economic importance. In this study, genome-wide associations were assessed for scrotal circumference at 210 d of age, scrotal circumference at 420 d of age, age at first calving, and age at second calving, in Canchim beef cattle. Data quality control was conducted resulting in 672,778 SNPs and 392 animals. Results: Associated SNPs were observed for scrotal circumference at 420 d of age (435 SNPs), followed by scrotal circumference at 210 d of age (12 SNPs), age at first calving (six SNPs), and age at second calving (four SNPs). We investigated whether significant SNPs were within genic or surrounding... |
Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Gado de corte; Gado Canchim; Beef cattle; Genome-wide association study; Single nucleotide polymorphism; Quantitative trait loci. |
Ano: 2017 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074373 |
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GROSSI, D. do A.; GRUPIONI, N. V.; BUZANSKAS, M. E.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; PAZ, C. M. P.; MUNARI, D. P.. |
Os genes do fator do crescimento semelhante a insulina tipo I (IGF1) , do fator do crescimento (GH) e do fator de transcrição da pituitária (PITl) fazem parte de um sistema hormonal com papel fundamental na regulação do crescimento dos animais. Estes genes podem estar associados a características reprodutivas como a idade (IPP) e o peso ao primeiro parto (PPP) uma vez que estas características apresentam correlação favorável com características de crescimento. Assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar a associação entre os marcadores IGFl (225,227,229 e 231), GH (L e V) e PITl(+ e -) e o desempenho fenotípico de IPP e PPP em bovinos da raça Canchim, visando obter ferramentas para avaliar e melhorar o desempenho para estas características. Análises de... |
Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Marcadores genéticos.; Gado de corte; Reprodução.. |
Ano: 2009 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/83285 |
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GRUPIONI, N. V.; GROSSI, D. do A.; BUZANSKAS, M. E.; PAZ, C. C. P; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; MUNARI, D. P.. |
Na espécie bovina, os genes do fator do crescimento semelhante à insulina tipo 1 (IGFl), do hormônio do crescimento (GH) e do fator de transcrição da pituitária (PITl) podem estar associados com características de crescimento e reprodutivas, pois estão envolvidos em processos de regulação do desenvolvimento animal. Desta forma, o objetivo trabalho foi avaliar os efeitos dos marcadores moleculares IGFl, GH e PITl sobre as estimativas dos valores genéticos para a idade ao primeiro parto (VGlPP) e peso da vaca ao primeiro parto (VGppp) em bovinos da raça Canchim provenientes do rebanho da Embrapa Pecuária Sudeste. As análises para estimação dos valores genéticos foram efetuadas pelo método de máxima verossimilhança restrita, em modelo animal... |
Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Análise de associação; QTL; Seleção assistida por marcadores; Marcadores genético.. |
Ano: 2009 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/83286 |
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BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. do A.; VENTURINI, G. C.; BALDI, F.; MUNARI, D. P.; ALENCAR, M. M. de. |
Obtiveram-se, neste estudo, parâmetros genéticos para as caracteristicas de permanência de remeas no rebanho aos 76 meses de idade (PR76), idade ao primeiro parto (IPP), perímetro escrotal aos 420 dias de idade (PE420) e peso aos 420 dias de idade de machos e fêmeas (P420) de animais da raça Canchim. No modelo animal, foram incluídos o grupo de contemporâneos e os efeitos aleatórios aditivos diretos e residuais. Os dados foram analisados por meio de inferência Bayesiana, em análise uni¬característica. As médias de PR76, IPP, PE420 e P420 foram iguais a 1,57±0,73 bezerros, 39,47±7,20 meses, 24,63±3,84 cm e 260,37±46,5l kg, respectivamente. As herdabilidades foram iguais a 0,0299±0,008, 0,0236±0,009, 0,2357±0,060 e 0,2235±0,048 para PR76, IPP, PE420 e P420,... |
Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Perímetro escrotal.; Gado de corte; Bovino; Idade; Parto.. |
Ano: 2009 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/83275 |
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BUNZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. do A.; GUIDOLIN, D. G. F.; BARROZO, D.; MUNARI, D. P.; ALENCAR, M. M. de. |
Estudou-se neste trabalho dados referentes às características de idade ao segundo parto (ISP), perímetro escrotal aos 420 dias de idade (PE420) e peso aos 420 dias de idade de machos e fêmeas (P420) de animais da raça Canchim, para as quais foram obtidas estimativas de herdabilidade e correlações genéticas. No modelo animal, foram incluídos os efeitos fixos de grupo de contemporâneos e os efeitos aleatórios aditivos diretos e residuais. Utilizou-se o método da máxima verossimilhança restrita em análise bi-característica. As médias de ISP, PE420 e P420 foram iguais a 57,07±8,69 meses, 24,63±3,84 cm e 260,37±46,5l kg, respectivamente. As estimativas de herdabilidade foram 0,07±0,01, 0,2l±0,05 e 0,24±0,03, respectivamente para ISP, PE420 e P420. As... |
Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Perímetro escrotal; Peso sobreano.; Gado de corte; Bovino.. |
Ano: 2009 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/83284 |
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MOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B. da; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A.. |
Abstract. Background: The development of linkage disequilibrium (LD) maps and the characterization of haplotype block structure at the population level are useful parameters for guiding genome wide association (GWA) studies, and for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes. The elucidation of haplotype block structure can reduce the information of several single nucleotide polymorphisms (SNP) into the information of a haplotype block, reducing the number of SNPs in a coherent way for consideration in GWA and genomic selection studies. Results: The maximum average LD, measured by r2 varied between 0.33 to 0.40 at a distance of < 2.5 kb, and the minimum average values of r2 varied between 0.05 to 0.07 at distances... |
Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Genome wide association studies; Desequilíbrio de ligação; Gado de corte; Beef cattle; Single nucleotide polymorphism; Linkage disequilibrium. |
Ano: 2014 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1003463 |
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MOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B.; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A.. |
Abstract. Background: The development of linkage disequilibrium (LD) maps and the characterization of haplotype block structure at the population level are useful parameters for guiding genome wide association (GWA) studies, and for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes. The elucidation of haplotype block structure can reduce the information of several single nucleotide polymorphisms (SNP) into the information of a haplotype block, reducing the number of SNPs in a coherent way for consideration in GWA and genomic selection studies. Results: The maximum average LD, measured by r2 varied between 0.33 to 0.40 at a distance of < 2.5 kb, and the minimum average values of r2 varied between 0.05 to 0.07 at distances... |
Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Composite; Desequilíbrio de ligação; Genome wide association studies; Halplotype block; Linjage disequilibirium; Polimorfismo de nucleotídeo único.; Gado de corte.; Beef cattle; Linkage disequilibrium; Single nucleotide polymorphism.. |
Ano: 2014 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1006604 |
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MOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B.; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A.. |
he development of linkage disequilibrium (LD) maps and the characterization of haplotype block structure at the population level are useful parameters for guiding genome wide association (GWA) studies, and for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes. The elucidation of haplotype block structure can reduce the information of several single nucleotide polymorphisms (SNP) into the information of a haplotype block, reducing the number of SNPs in a coherent way for consideration in GWA and genomic selection studies. |
Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Halplotype block; Linjage disequilibirium; Composite; Beef cattle. |
Ano: 2014 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1002985 |
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