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Candidate genes for male and female reproductive traits in Canchim beef cattle. Repositório Alice
BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. do A.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; CHUD, T. C. S.; STAFUZZA, N. B.; ROLA, L. D.; MEIRELLES, S. L. C.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; HIGA, R. H.; SILVA, M. V. G. B.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P..
Background: Beef cattle breeding programs in Brazil have placed greater emphasis on the genomic study of reproductive traits of males and females due to their economic importance. In this study, genome-wide associations were assessed for scrotal circumference at 210 d of age, scrotal circumference at 420 d of age, age at first calving, and age at second calving, in Canchim beef cattle. Data quality control was conducted resulting in 672,778 SNPs and 392 animals. Results: Associated SNPs were observed for scrotal circumference at 420 d of age (435 SNPs), followed by scrotal circumference at 210 d of age (12 SNPs), age at first calving (six SNPs), and age at second calving (four SNPs). We investigated whether significant SNPs were within genic or surrounding...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Gado de corte; Gado Canchim; Beef cattle; Genome-wide association study; Single nucleotide polymorphism; Quantitative trait loci.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074373
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Efeito de substituição alélica dos marcadores genéticos de IGFl, GH e PITl sobre a idade e o peso ao primeiro parto de bovinos da raça Canchim. Repositório Alice
GROSSI, D. do A.; GRUPIONI, N. V.; BUZANSKAS, M. E.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; PAZ, C. M. P.; MUNARI, D. P..
Os genes do fator do crescimento semelhante a insulina tipo I (IGF1) , do fator do crescimento (GH) e do fator de transcrição da pituitária (PITl) fazem parte de um sistema hormonal com papel fundamental na regulação do crescimento dos animais. Estes genes podem estar associados a características reprodutivas como a idade (IPP) e o peso ao primeiro parto (PPP) uma vez que estas características apresentam correlação favorável com características de crescimento. Assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar a associação entre os marcadores IGFl (225,227,229 e 231), GH (L e V) e PITl(+ e -) e o desempenho fenotípico de IPP e PPP em bovinos da raça Canchim, visando obter ferramentas para avaliar e melhorar o desempenho para estas características. Análises de...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gado de corte; Reprodução; Marcadores genéticos.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/83285
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Efeito dos marcadores genéticos IGFl, GH e PITl sobre os valores genéticos da idade ao primeiro parto e peso ao primeiro parto em bovinos da raça Canchim. Repositório Alice
GRUPIONI, N. V.; GROSSI, D. do A.; BUZANSKAS, M. E.; PAZ, C. C. P; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; MUNARI, D. P..
Na espécie bovina, os genes do fator do crescimento semelhante à insulina tipo 1 (IGFl), do hormônio do crescimento (GH) e do fator de transcrição da pituitária (PITl) podem estar associados com características de crescimento e reprodutivas, pois estão envolvidos em processos de regulação do desenvolvimento animal. Desta forma, o objetivo trabalho foi avaliar os efeitos dos marcadores moleculares IGFl, GH e PITl sobre as estimativas dos valores genéticos para a idade ao primeiro parto (VGlPP) e peso da vaca ao primeiro parto (VGppp) em bovinos da raça Canchim provenientes do rebanho da Embrapa Pecuária Sudeste. As análises para estimação dos valores genéticos foram efetuadas pelo método de máxima verossimilhança restrita, em modelo animal...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Análise de associação; QTL; Seleção assistida por marcadores; Marcadores genético.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/83286
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Estimativas de parâmetros genéticos para características reprodutivas e de crescimento em bovinos Canchim por método Bayesiano. Repositório Alice
BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. do A.; VENTURINI, G. C.; BALDI, F.; MUNARI, D. P.; ALENCAR, M. M. de..
Obtiveram-se, neste estudo, parâmetros genéticos para as caracteristicas de permanência de remeas no rebanho aos 76 meses de idade (PR76), idade ao primeiro parto (IPP), perímetro escrotal aos 420 dias de idade (PE420) e peso aos 420 dias de idade de machos e fêmeas (P420) de animais da raça Canchim. No modelo animal, foram incluídos o grupo de contemporâneos e os efeitos aleatórios aditivos diretos e residuais. Os dados foram analisados por meio de inferência Bayesiana, em análise uni¬característica. As médias de PR76, IPP, PE420 e P420 foram iguais a 1,57±0,73 bezerros, 39,47±7,20 meses, 24,63±3,84 cm e 260,37±46,5l kg, respectivamente. As herdabilidades foram iguais a 0,0299±0,008, 0,0236±0,009, 0,2357±0,060 e 0,2235±0,048 para PR76, IPP, PE420 e P420,...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gado de corte; Bovino; Idade; Parto; Perímetro escrotal.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/83275
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Estimativas de parâmetros genéticos para características reprodutivas e de crescimento em bovinos da raça Canchim. Repositório Alice
BUNZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. do A.; GUIDOLIN, D. G. F.; BARROZO, D.; MUNARI, D. P.; ALENCAR, M. M. de..
Estudou-se neste trabalho dados referentes às características de idade ao segundo parto (ISP), perímetro escrotal aos 420 dias de idade (PE420) e peso aos 420 dias de idade de machos e fêmeas (P420) de animais da raça Canchim, para as quais foram obtidas estimativas de herdabilidade e correlações genéticas. No modelo animal, foram incluídos os efeitos fixos de grupo de contemporâneos e os efeitos aleatórios aditivos diretos e residuais. Utilizou-se o método da máxima verossimilhança restrita em análise bi-característica. As médias de ISP, PE420 e P420 foram iguais a 57,07±8,69 meses, 24,63±3,84 cm e 260,37±46,5l kg, respectivamente. As estimativas de herdabilidade foram 0,07±0,01, 0,2l±0,05 e 0,24±0,03, respectivamente para ISP, PE420 e P420. As...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gado de corte; Bovino; Perímetro escrotal; Peso sobreano.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/83284
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Implementation of DNA markers to produce genomically - enhanced EPDs in Nellore cattle. Repositório Alice
LÔBO, R. B.; NKRUMAH, D.; GROSSI, D. do A.; BARROS, P. S. de; PAIVA, P.; BEZERRA, L. A. F.; OLIVEIRA, H. N. de; SILVA, M. V. G. B..
Background: The sequencing and publication of the cattle genome and the identification of single nucleotide polymorphism (SNP) molecular markers have provided new tools for animal genetic evaluation and genomic-enhanced selection. These new tools aim to increase the accuracy and scope of selection while decreasing generation interval. The objective of this study was to evaluate the enhancement of accuracy caused by the use of genomic information (Clarifide® - Pfizer) on genetic evaluation of Brazilian Nellore cattle. Review: The application of genome-wide association studies (GWAS) is recognized as one of the most practical approaches to modern genetic improvement. Genomic selection is perhaps most suited to the improvement of traits with low heritability...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: DNA Markers; Genomic Enhanced EPDs; Genetic Evaluation; Genomic Selection; Nellore Cattle; SNP.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1064370
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Linkage disequilibrium and haplotype block structure in a composite beef cattle breed. Repositório Alice
MOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B. da; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A..
Abstract. Background: The development of linkage disequilibrium (LD) maps and the characterization of haplotype block structure at the population level are useful parameters for guiding genome wide association (GWA) studies, and for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes. The elucidation of haplotype block structure can reduce the information of several single nucleotide polymorphisms (SNP) into the information of a haplotype block, reducing the number of SNPs in a coherent way for consideration in GWA and genomic selection studies. Results: The maximum average LD, measured by r2 varied between 0.33 to 0.40 at a distance of < 2.5 kb, and the minimum average values of r2 varied between 0.05 to 0.07 at distances...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Genome wide association studies; Desequilíbrio de ligação; Gado de corte; Beef cattle; Single nucleotide polymorphism; Linkage disequilibrium.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1003463
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Linkage disequilibrium and haplotype block structure in a composite beef cattle breed. Repositório Alice
MOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B.; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A..
Abstract. Background: The development of linkage disequilibrium (LD) maps and the characterization of haplotype block structure at the population level are useful parameters for guiding genome wide association (GWA) studies, and for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes. The elucidation of haplotype block structure can reduce the information of several single nucleotide polymorphisms (SNP) into the information of a haplotype block, reducing the number of SNPs in a coherent way for consideration in GWA and genomic selection studies. Results: The maximum average LD, measured by r2 varied between 0.33 to 0.40 at a distance of < 2.5 kb, and the minimum average values of r2 varied between 0.05 to 0.07 at distances...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Beef cattle; Composite; Desequilíbrio de ligação; Genome wide association studies; Halplotype block; Linjage disequilibirium; Polimorfismo de nucleotídeo único; Beef cattle; Linkage disequilibrium; Single nucleotide polymorphism; Gado de corte.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1006604
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