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Análise de associação genômica ampla baseada em conjunto de genes: implementação em R. Repositório Alice
GUERREIRO, A. T.; HIGA, R. H..
O objetivo deste trabalho é a criação de um pacote R (R CORE TEAM, 2014) que implemente quatro diferentes métodos de GSEA no contexto de GWAS, considerando adaptações para aplicação em espécies animais de interesse para a agricultura.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Modelos mistos; Genome Wide Association Studies; Random forests; Mixed models; Single nucleotide polymorphisms.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1009826
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Desenvolvimento de pacotes estatísticos em linguagem R para análise de associação genômica ampla baseada em conjuntos de genes. Repositório Alice
GUERREIRO, A. T.; HIGA, R. H..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Linguagem R; Associação genômica; Genome Wide Association Studies.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/981924
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Implementação de 4 métodos de análise de associação genômica ampla baseada em conjunto de genes. Repositório Alice
GUERREIRO, A. T.; HIGA, R. H..
No contexto de estudos de associação genômica ampla (GWAS), métodos para a análise de enriquecimento de um conjunto de genes (GSEA) analisam conjuntos de SNPs associados a genes que compartilham mesma função biológica, localização cromossômica ou via regulatória e buscam identificar SNPs que estão relacionados com variações no fenótipo em estudo. Neste trabalho foram implementados quatro diferentes métodos de GSEA no contexto de GWAS considerando adaptações para aplicação em espécies animais de interesse para a agricultura (fenótipos quantitativos)
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Estudos de associação genômica ampla; Polimorfismo de nucleotídeo único; Modelos lineares mistos; Random forests; Mixed models; Single nucleotide polymorphism; Models.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1031168
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