SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

MATONYEI, T. K.; BARROS, B. de A.; GUIMARÃES, R. G. N.; OUMA, E. O.; CHEPROT, R. K.; APOLINÁRIO, L. C.; LIGEYO, D. O.; COSTA, M. B. R.; WERE, B. A.; KISINYO, P. O.; ONKWARE, A. O.; NODA, R. W.; GUDU, S. O.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T..

bitstream/item/215142/1/Aluminum-tolerance.pdf

Association mapping and genomic selection for sorghum adaptation to tropical soils of Brazil in a sorghum multiparental random mating population.

Palavras-chave: Genética Vegetal; Alumínio; Milho; Germoplasma.

Ano: 2020

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1124215

BERNARDINO, K. C.; MENEZES, C. B. de; SOUSA, S. M. de; GUIMARÃES, C. T.; CARNEIRO, P. C. S.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V.; HUFNAGEL, B.; PASTINA, M. M.; MAGALHAES, J. V. de.

Tropical soils where low phosphorus (P) and aluminum (Al) toxicity limit sorghum [Sorghum bicolor (L.) Moench] production are widespread in the developing world. We report on BRP13R, a multiparental random mating population (MPRMP), which is commonly used in sorghum recurrent selection targeting tropical soil adaptation. Recombination dissipated much of BRP13R?s likely original population structure and average linkage disequilibrium (LD) persisted up to 2.5 Mb, establishing BRP13R as a middle ground between biparental populations and sorghum association panels. Genome-wide association mapping (GWAS) identifed conserved QTL from previous studies, such as for root morphology and grain yield under low-P, and indicated the importance of dominance in the...

Aumento da tolerância ao alumínio em linhagens elites de milho conferido pela introgressão do alelo superior do gene ZmMATE1.

Palavras-chave: Seleção genômica; Sorgo; Genética Vegetal; Gene; Melhoramento Genético Vegetal.

Ano: 2020

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125512

APOLINÁRIO, L. C.; BARROS, B. de A.; PINTO, M. de O.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARÃES, F. F. M.; GUIMARÃES, C. T..

bitstream/item/182838/1/Aumento-tolerancia.pdf

Avaliação agronômica do milho geneticamente modificado com o gene SbMATE, que confere tolerância ao alumínio: processo de biossegurança para o primeiro estudo de campo.

Palavras-chave: Melhoramento assistido; Marcador Molecular; Toxidez; Alumínio.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1095564

VASCONCELOS, M. J. V. de; CARNEIRO, A. A.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T..

O desenvolvimento de uma planta geneticamente modificada envolve a introdução de um ou vários genes exógenos nesse organismo, sem que haja fecundação ou cruzamento. As plantas que tiveram seu código genético alterado pela introdução de uma ou mais sequências de DNA provenientes de outra espécie devem passar por rigorosas análises que comprovam suas características agronômicas e de segurança, tanto para o meio ambiente, como para os seres vivos, cujo conjunto de práticas são chamadas de biossegurança. A biossegurança de uma planta transgênica, além de trabalhos em regime de contenção, passa por liberações planejadas no meio ambiente para se obter dados agronômicos, físico-químicos e ambientais, visando o preparo de um dossiê para a liberação comercial. O...

Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Biossegurança; Zea Mays; Genética; Gene; Planta Transgênica; Biotecnologia.

Ano: 2018

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1100096

Biossegurança e avaliação agronômica do milho transgênico SbMATE segundo a Resolução Normativa 8 - CTNBio.

VASCONCELOS, M. J. V. de; FIGUEIREDO, J. E. F.; CARNEIRO, A. A.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T..

Entende-se por planta geneticamente modificada ou transgênica aquela que tenha recebido um ou vários genes exógenos em seu genoma por outros métodos que não fecundação ou cruzamento. Esta classe de planta, que teve o seu código genético alterado pela introdução de uma ou mais sequências de DNA provenientes de outra espécie, vegetal ou de microrganismo, deve passar por rigorosas análises que comprovam suas características agronômicas e de segurança, tanto para o meio ambiente, como para os seres vivos. Este conjunto de práticas ou processos denomina-se biossegurança. A biossegurança de uma planta transgênica, além de estudos feitos em regime de contenção, passa por liberações planejadas no meio ambiente para se obter dados agronômicos, físico-químicos e...

Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Biossegurança de OGM; Avaliação agronômica; Genética Vegetal; Planta Transgênica; Engenharia Genética; Zea Mays; Legislação.

Ano: 2020

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1126605

Caracterização de germoplasma de milho quanto à tolerância ao alumínio.

MENDES, G. S. B.; OLIVEIRA, R. P. de; BARROS, B. de A.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T..

O objetivo do presente trabalho foi explorar a variabilidade genética existente em um amplo grupo de linhagens-elites e de acessos do banco de germoplasma de milho da Embrapa quanto à resposta ao Al em solução nutritiva.

Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE)

Palavras-chave: Zea Mays; Genética Vegetal; Melhoramento Vegetal.

Ano: 2020

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125087

Catálogo de acessos do Banco Ativo de Germoplasma de Milho com grãos do tipo doce.

Endosperm genotyping as a strategy to differentiate the allele source in maize heterozygous progeny.

TEIXEIRA, F. F.; GUIMARÃES, C. T.; PINTO, M. de O.; PEREIRA FILHO, I. A.; COELHO, R. S.; ARAUJO, G. dos R.; PONTELLO, I. de O..

Tendo em vista a necessidade de agregar valor ao BAG Milho e a importância do milho-doce, foram traçados os objetivos do presente trabalho que são: apresentar os acessos do BAG Milho com grãos do tipo doce, seus dados de passaporte, de caracterização, informações sobre os alelos mutantes que conferem o fenótipo doce presentes nestes acessos e avaliar aspectos agronômicos e relativos à qualidade de milho-doce, assim como de algumas cultivares comerciais e com base nessas informações traçar inferências sobre a variabilidade dos recursos genéticos de milho-doce e catalogar os acessos preservados no BAG Milho.

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Melhoramento Genético Vegetal; Milho Doce; Germoplasma; Genética Vegetal.

Ano: 2019

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1116224

MARTINS, F. A.; CARNEIRO, P. C. S.; CRUZ, C. D.; CARNEIRO, J. E. S. de; GUIMARÃES, C. T..

Abstract ? The objective of this work was to distinguish the parental source of alleles in heterozygous progeny using semiquantitative polymerase chain reaction (PCR) in maize endosperm. Endosperms derived from direct and reciprocal single-cross hybrids between maize inbred lines L3 and L1113-01 were genotyped by semiquantitative PCR methodology (SQ-PCR) using fluorescent microsatellite primers. The amplification products were evaluated by the ratios of fluorescence intensity (RFI), calculated between the peaks corresponding to the alleles derived from each parental line. Based on the statistically significant contrast between RFI mean values of direct and reciprocal single-cross hybrids, it was possible to distinguish the number of alleles received from...

Enhancing phosphorus efficiency in maize and sorghum.

Palavras-chave: Allelic origin; Natural populations; Polygenes; Semiquantitative PCR; Zea mays; Heterozygote.

Ano: 2009

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/661195

SOUSA, S. M. de; HUFNAGEL, B.; AZEVEDO, G. C.; LOPES, S. M.; NEGRI, B. F.; LANA, U. G. P.; BARROS, B. A.; ALVES, M. C.; CARNEIRO, A. A.; GUIMARÃES, C. T.; MAGALHAES, J. V..

bitstream/item/175389/1/Enhancing-phosphorus.pdf

Evidence for reductive genome evolution and lateral acquisition of virulence functions in two Corynebacterium pseudotuberculosis strains.

Palavras-chave: Genética; Fósforo.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1090516

RUIZ, J. C.; D'AFONSECA, V.; SILVA, A.; ALI, A.; PINTO, A. C.; SANTOS, A. R.; ROCHA, A. A. M. C.; LOPES, D. O.; DORELLA, F. A.; PACHECO, L. G. C.; COSTA, M. P.; TURK, M. Z.; SEYFFERT, N.; MORAES, P. M. R. O.; SOARES, S. C.; ALMEIDA, S. S.; CASTRO, T. L. P.; ABREU, V. A. C.; TROST, E.; BAUMBACH, J.; TAUCH, A.; SCHNEIDER, M. P. C.; McCULLOCH, J.; CERDEIRA, L. T.; RAMOS, R. T. J.; ZERLOTINI, A.; DOMINITINI, A.; RESENDE, D. M.; COSER, E. M.; OLIVEIRA, L. M.; PEDROSA, A. L.; VIEIRA, C. U.; GUIMARÃES, C. T.; BARTHOLOMEU, D. C.; OLIVEIRA, D. M.; SANTOS, F. R.; RABELO, É. M.; LOBO, F. P.; FRANCO, G. R.; COSTA, A. F.; CASTRO, I. M.; DIAS, S. R. C.; FERRO, J. A.; ORTEGA, J. M.; PAIVA, L. V.; GOULART, L. R.; ALMEIDA, J. F.; FERRO, M. I. T.; CARNEIRO, N. P.; FALCÃO, P. R. K.; GRYNBERG, P.; TEIXEIRA, S. M. R.; BROMMONSCHENKEL, S.; OLIVEIRA, S. C.; MEYER, R.; MOORE, R. J.; MIYOSHI, A.; OLIVEIRA, G. C.; AZEVEDO, V..

Background: Corynebacterium pseudotuberculosis, a Gram-positive, facultative intracellular pathogen, is the etiologic agent of the disease known as caseous lymphadenitis (CL). CL mainly affects small ruminants, such as goats and sheep; it also causes infections in humans, though rarely. This species is distributed worldwide, but it has the most serious economic impact in Oceania, Africa and South America. Although C. pseudotuberculosis causes major health and productivity problems for livestock, little is known about the molecular basis of its pathogenicity. Methodology and Findings: We characterized two C. pseudotuberculosis genomes (Cp1002, isolated from goats; and CpC231, isolated from sheep). Analysis of the predicted genomes showed high similarity in...

Exploiting sorghum genetic diversity for enhanced aluminum tolerance: allele mining based on the AltSB locus.

Palavras-chave: Genoma de C pseudotuberculosis; Análise de genoma; Ilhas de patogenicidade; Corynebacterium Pseudotuberculosis; Caseous lymphadenitis; Pathogenicity.

Ano: 2011

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/914696

HUFNAGEL, B.; GUIMARÃES, C. T.; CRAFT, E. J.; SHAFF, J. E.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V.; MAGALHAES, J. V..

Root damage due to aluminum (Al) toxicity restricts crop production on acidic soils, which are extensive in the tropics. The sorghum root Al-activated citrate transporter, SbMATE, underlies the Al tolerance locus, AltSB, and increases grain yield under Al toxicity. Here, AltSB loci associated with Al tolerance were converted into Amplification Refractory Mutation System (ARMS) markers, which are cost effective and easy to use. A DNA pooling strategy allowed us to identify accessions harboring rare favorable AltSB alleles in three germplasm sets while greatly reducing genotyping needs. Population structure analysis revealed that favorable AltSB alleles are predominantly found in subpopulations enriched with guinea sorghums, supporting a possible Western...

Genetic diversity and heterotic grouping of sorghum lines using SNP markers.

Palavras-chave: Tolerância; Toxicidade; Alumínio; Germoplasma; Marcador Genético; Sorgo.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1093494

SILVA, K. J. da; PASTINA, M. M.; GUIMARÃES, C. T.; MAGALHAES, J. V. de; PIMENTEL, L. D.; SCHAFFERT, R. E.; PINTO, M. de O.; SOUZA, V. F. de; BERNARDINO, K. da C.; SILVA, M. J. da; BORÉM, A.; MENEZES, C. B. de.

Sorghum breeding programs are based predominantly on developing homozygous lines to produce single cross hybrids, frequently with relatively narrow genetic bases. The adoption of complementary strategies, such as genetic diversity study, enables a broader vision of the genetic structure of the breeding germplasm. The purpose of this study was to evaluate the genetic diversity of sorghum breeding lines using structure analysis, principal components (PC) and clustering analyses. A total of 160 sorghum lines were genotyped with 29,649 SNP markers generated by genotyping-by-sequencing (GBS). The PC and clustering analyses consistently divided the R (restorer) and B (maintainer) lines based on their pedigree, generating four groups. Thirty-two B and 21 R lines...

GO enrichment of microarray data from maize root under drough.

Palavras-chave: Heterose; Diversidade genética; Sorghum Bicolor; Marcador Genético; Melhoramento Genético Vegetal.

Ano: 2020

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125751

NODA, R. W.; LAAT, D. M. de; GUIMARÃES, C. T.; SOUZA, T. C. de; DIAS, L. L. C.; LOBO, F. P.; MAGALHÃES, J. V. de; COIMBRA, R. S.; MAGALHÃES, P. C.; ZERLOTINI, A.; FRANCO, G. M.; CARNEIRO, N. P..

In this study microarray data from roots of a drought tolerant inbred maize line (Embrapa?s breeding program) under two water regimes was analyzed. The analysis revealed that 746 genes were differentially expressed, of which 455 were up- and 291 were down-regulated.

Identificação de fontes de resistência à helmintosporiose (Exserohilum turcicum) do sorgo em condições de campo.

Palavras-chave: Genômica; Milho; Microarray technology; Corn; Genomics.

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/981622

Identification of candidate genes associated with drought tolerance in sorghum.

COTA, L. V.; COSTA, R. V. da; SILVA, D. D. da; GUIMARÃES, C. T..

bitstream/item/194218/1/circ-250.pdf

Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Doença de Planta; Fungo; Doença Fúngica.

Ano: 2018

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1100639

BARROS, B. de A.; CARNEIRO, A. A.; CARNEIRO, N. P.; MAGALHAES, P. C.; ALVES, M. de C.; PINTO, M. de O.; NODA, R. W.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T.; MENEZES, C. B. de; TARDIN, F. D.; SCHAFFERT, R. E..

bitstream/item/180528/1/Identification-candidate.pdf

Introgression of the bmr6 allele in biomass sorghum lines for bioenergy production.

Palavras-chave: Estresse hídrico; Genética; Sorgo; Gene.

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1093677

SILVA, M. J. da; DAMASCENO, C. M. B.; GUIMARÃES, C. T.; PINTO, M. de O.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, J. E. de S.; SCHAFFERT, R. E.; PARRELLA, R. A. da C..

Sorghum bicolor (L.) Moench is a crop that has high potential to be used for bioenergy generation. The objective of this study was to introgression of the bmr6 allele in elite lines of biomass sorghum and to obtain experimental ??brown midrib?? hybrids. Three genetic materials belonging to the Embrapa Maize and Sorghum Breeding Program were used. Two backcross programs were conducted separately, in which the CMSXS170 line was the donor of the bmr6 allele and the CMSXS652 and IS23777 lines were the recurrent ones. Through molecular markers specific for the bmr6 allele, the assisted selection was utilized for the brown midrib characteristic in the BC1F1 and BC2F1 generations. Polymorphic SNP markers were distributed throughout the genome of sorghum to...

Linkage disequilibrium and population structure in grain sorghum inbred lines using SNP markers.

Palavras-chave: Sorghum Bicolor; Etanol; Lignina.

Ano: 2020

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1124216

SILVA, K.; MENEZES, C. B. de; GUIMARÃES, C. T.; PIMENTEL, L.; PASTINA, M. M.; SCHAFFERT, R. E.; OLIVEIRA, A.; MAGALHAES, J. V. de.

bitstream/item/176231/1/Linkage-disequilibrium.pdf

Maize phophorus-starvation tolerance 1 (zmPSTOL1_3.06) gene is related to root hair formation and phosphorus starvation.

Palavras-chave: Sorghum Bicolor; Marcador Molecular; Linhagem.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1091112

NEGRI, B. F.; FERREIRA, N. F.; RIBEIRO, C. A. G.; PALHARES, P. L. S.; LANA, U. G. de P.; ALVES, M. de C.; GUIMARÃES, C. T.; CARNEIRO, A. A.; SOUSA, S. M. de.

bitstream/item/205356/1/Maize-phosphorus.pdf

Marker-assisted backcrossing of bmr6 into biomass sorghum line.

Palavras-chave: Fósforo; Milho; Gene.

Ano: 2019

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1115003

PINTO, M. de O.; SILVA, M. J.; BARROS, B. de A.; GUIMARÃES, C. T.; SCHAFFERT, R. E.; PARRELLA, R. A. da C.; DAMASCENO, C. M. B..

bitstream/item/199608/1/Marker-assisted-2.pdf

Marker-assisted introgression of ZmMATE1 gene to improve aluminum tolerance in maize elite lines.

Palavras-chave: Sorghum Bicolor; Marcador Molecular; Genética Vegetal.

Ano: 2019

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110655

FRANÇA, C. O. L.; VELOSO, L. M. S.; BARROS, B. de A.; MITRE, L. K.; PINTO, M. de O.; LANA, U. G. de P.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARÃES, C. T..

bitstream/item/176611/1/Marker-assisted.pdf