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Análise da variabilidade genética do banco de germoplasma da raça Morada Nova. Repositório Alice
IANELLA, P.; BIAZIO, G. R.; FACO, O.; SILVA, K. de M.; RAMOS, A. F.; MUNIZ, M. M. M.; CAETANO, A. R.; MARIANTE, A. da S.; PAIVA, S. R..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Banco de Germoplasma Animal da Embrapa; Raça localmente adaptada; Diversidade genética; Raça Morada Nova; Variabilidade genética; Genetic resources conservation.; Genetic diversity as resource; Ovino; Conservação; Recurso genético; Sheep..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1039009
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Animal GRIN database user manual for the management of genetic resources. Repositório Alice
WILSON, C. S.; PAIVA, S. R.; IANELLA, P.; MANAHAN, T. J.; CAJUEIRO, E. V. de M.; MARIANTE, A. da S.; BLACKBURN, H..
Introduction to Animal GRIN; Navigating the Database; Setting Up the Database (Super Users); Create Taxonomy Structure; Set Up Location Structure; Form Descriptions (All Users); Form Descriptions (Super Users); Entering Shipments; E-R Diagram for Incoming Orders; Entering Requests; Reports.
Tipo: Livros Palavras-chave: Gestão; Recurso genético; Produção animal; Segurança alimentar; Agricultural management; Management systems; Animal genetic resources; Food security.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1052284
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Banco de DNA e Tecidos Animal: quantitativo do material estocado até julho de 2015. Repositório Alice
BIAZIO, G. R. de; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; RAMOS, A. F.; CASTRO, S. T. R.; EGITO, A. A. do; PAIVA, S. R.; IANELLA, P.; MARIANTE, A. da S..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Banco de DNA.; Tecido Animal..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1027613
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Bulked segregant analysis of the pirarucu (Arapaima gigas) genome for identification of sex-specific molecular markers. Repositório Alice
ALMEIDA, I. G.; IANELLA, P.; FARIA, M. T.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R..
Arapaima gigas (Osteoglossidae) is one of the largest fish species in the Amazon Basin, attaining lengths of over 2.5 m and weights of over 100 kg. Its flesh is prized, and it has great potential for production in aquaculture systems. However, live pirarucu cannot be reliably sexed visually, even after sexual development, since this species does not have clear external sexual dimorphism. Simple and inexpensive methods for sexing immature pirarucu based on DNA markers would facilitate production of this species in commercial operations. We analyzed A. gigas male and female DNA pools with 566 RAPD primers, generating 2609 fragments, with an estimated 1341 segregating polymorphic markers, and an estimated average spacing of 714 kb, which corresponds to less...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Marcadores moleculares; Peixe neotropical; RAPD.; Genoma; Pirarucu..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/982325
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Bulked segregant analysis of the pirarucu (Arapaima gigas) genome for identification of sex-specific molecular markers. Repositório Alice
ALMEIDA, I. G.; IANELLA, P.; FARIA, M. T.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R..
Arapaima gigas (Osteoglossidae) is one of the largest fish species in the Amazon Basin, attaining lengths of over 2.5 m and weights of over 100 kg. Its flesh is prized, and it has great potential for production in aquaculture systems. However, live pirarucu cannot be reliably sexed visually, even after sexual development, since this species does not have clear external sexual dimorphism. Simple and inexpensive methods for sexing immature pirarucu based on DNA markers would facilitate production of this species in commercial operations. We analyzed A. gigas male and female DNA pools with 566 RAPD primers, generating 2609 fragments, with an estimated 1341 segregating polymorphic markers, and an estimated average spacing of 714 kb, which corresponds to less...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Peixe neotropical.; Genoma; Peixe de água doce; Pirarucu; Marcador molecular; Genome; Genetic markers; Freshwater fish; Arapaima gigas..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1007932
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Comparação de Diferentes Métodos de Extração do DNA Genômico de Músculo de Camarão-cinza (Litopenaeus vannamei). Infoteca-e
SILVA, N. M. L.; BIAZIO, G. R. de; SILVA, N. M. A. da; NEPOMUCENO, A. R.; CAETANO, A. R.; IANELLA, P..
bitstream/item/164166/1/boletim-de-pesquisa-e-desenvolvimento-3263.pdf
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Kit de extração; L vannamei; Extração de DNA.
Ano: 2017 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1075983
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Conservação in situ de recursos genéticos animais da Embrapa. Infoteca-e
ALBUQUERQUE, M. do S. M.; IANELLA, P..
bitstream/item/156822/1/Conservacao-in-situ-de-recursos-geneticos-animais-da-Embrapa.pdf
Tipo: Capítulo em livro técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Núcleos de Conservação; Recursos genéticos animais.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1065701
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Diversidade genética e estrutura de populações de raças localmente adaptadas de equinos no Brasil. Repositório Alice
IANELLA, P.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; CAETANO, A. R.; BIAZIO, G. R.; PAIVA, S. R.; MCMANUS, C. M..
Edição especial com os Anais do V Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Raças localmente adaptadas; SNP; Equus Caballus.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1104016
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D-loop haplotype diversity in Brazilian horse breeds. Repositório Alice
IANELLA, P.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; PAIVA, S. R.; EGITO, A. A. do; ALMEIDA, L. D.; SERENO, F. T. P. S.; CARVALHO, L. F. R.; MARIANTE, A. da S.; MCMANUS, C. M..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Genetic characterization; Locally adapted breeds.; Equus Caballus.; Mitochondrial DNA; Animal genetic resources..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078580
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Estrutura genética do pirarucu (Arapaima gigas) na região de Santarém, PA, Brasil. Repositório Alice
ALMEIDA, I. G. de; FARIA, M. T. de; IANELLA, P.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R..
O pirarucu (Arapaima gigas) é um peixe encontrado na Bacia Amazônica e Araguaia/Tocantins que possui grande importância econômica para populações locais. Estudos para avaliação da estrutura genética das populações naturais de pirarucu são necessários a fim de prover informações para o manejo da espécie em seu habitat natural. Desta forma, este trabalho analisou quatro comunidades próximas à região de Santarém-PA (N=99) por meio do sequenciamento de 1059 pb do gene mitocondrial ATPase. Os resultados sugerem que a variabilidade genética encontrada é similar a encontrada em estudos de maior abrangência geográfica. A rede de haplótipos gerada, mostrou dois haplogrupos dentro dos quais estão distribuídos cinco haplótipos (H) referentes a este estudo...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Recursos pesqueiros; DNA mitocondrial; Variabilidade genética; Conservação de recursos genéticos animais.; Peixe; Pirarucu..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/951467
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Genetic variability of Santa Inês samples stored in the Brazilian Animal Germplasm Biobank (BBGA). Repositório Alice
SILVA, N. M. L.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; CAETANO, A. R.; BIAZIO, G. R. DE; PAIVA, S. R.; MCMANUS, C.; IANELLA, P..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Genetic characterization; Germoplasm bank; Ovis áries SNP.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084979
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Genome sequencing and de novo assembly of tambaqui (Colossoma macropomum). Repositório Alice
CAETANO, A. R.; IANELLA, P.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B..
The South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum) is the most important native aquaculture species in Brazil. Current production levels are above 150,000 mt per year. Recent efforts to domesticate, breed and raise the species in aquaculture systems has led to significant increases in production (>10-fold) over the last decade, and development of new technologies based on genomic tools and information could help further increase productivity and production growth rates.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Colossoma Macropomum; Tambaqui; Genome assembly; Bioinformatics; Fish.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118807
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Genome sequencing and de novo assembly of tambaqui (Colossoma macropomum). Repositório Alice
CAETANO, A. R.; IANELLA, P.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Colossoma Macropomum; Tambaqui.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118288
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Genome Sequencing and de novo assembly of the South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer). Repositório Alice
LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; SILVA, N. M. A. da; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R..
The South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer) is a freshwater fish species naturally found in the Amazon river basin with an important role in local community and commercial fishing. Recent efforts to domesticate and raise the species in aquaculture systems has led to >10-fold production increases in the last decade. Current production levels are >15,000mt/year. Recently stablished initiatives to structure genetic improvement programs for increasing productivity-associated traits could greatly benefit from using genomic tools for broodstock management and assisted genetic evaluations and breeding. Multiple shotgun libraries with two different insert sizes and multiple Nextera mate pair libraries with three different sizes were...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Bioinformática; Genômica; Sequenciamento de genoma; Bioinformatics; Genomics; Genome assembly; Sequence analysis.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1038884
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Genome sequencing and de novo assembly of the South American tiger catfish (Pseudoplatystoma Punctifer) using 10X sequencing data. Repositório Alice
ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; IANELLA, P.; CAETANO, A. R..
Na publicação: Adhemar Zerlotini. PAG 2019. PO0249.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Pseudoplatystoma Punctifer; Aquacultura; Bioinformática; Aquaculture; Genome assembly; Bioinformatics.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118157
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Genome sequencing and de novo assembly of the South American tiger catfish (Pseudoplatystoma Punctifer) using 10X sequencing data. Repositório Alice
ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; IANELLA, P.; CAETANO, A. R..
PO0249
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Pseudoplatystoma Punctifer; Aquaculture.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116379
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Haplotypes of the bovine IgG2 heavy gamma chain in tick-resistant and tick-susceptible breeds of cattle. Repositório Alice
CARVALHO, W. A.; IANELLA, P.; ARNOLDI, F. G. C.; CAETANO, A. R.; MARUYAMA, S. R.; FERREIRA, B. R.; CONTI, L. H. A.; SILVA, M. R. M. da; PAULA, J. O. F.; MAIA, A. A. M.; SANTOS, I. K. F. de M..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Bovine IgG2; Allotypes; Hinge region; Rhipicephalus (Boophilus) microplus; Haplotypes.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/902013
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Implementação de requisitos corporativos de qualidade no Banco de DNA e Tecidos Animais do Cenargen. Repositório Alice
ALBUQUERQUE, M. do S. M.; RAMOS, A. F.; BIAZIO, G. R. de; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CASTRO, C. S. P. de.
A implementação de Sistemas da Qualidade nos recursos genéticos animais é uma ação contemplada na Vertente Animal do Portfólio Regen, iniciada em 2009 com o objetivo de implementar requisitos de qualidade no Banco de DNA e Tecidos Animais da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (Cenargen), escolhido como um dos pilotos. A partir de normas internacionais foram selecionados os Requisitos Corporativos de Qualidade (RCQs) que envolvem todos os processos relacionados a conservação de acervos genéticos, incluindo documentos, registros, pessoal, instalações e condições ambientais, equipamentos e rastreabilidade de medição e insumos. Um diagnóstico foi realizado com o objetivo de verificar a situação atual do Banco de DNA e de Tecidos quanto ao atendimento...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Implementação da qualidade; Requisito corporativo de qualidade; Recurso genético animal.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1103724
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Incidence of bovine leukocyte adhesion deficiency, complex vertebral malformation, and deficiency of uridine-5-monophosphate synthase carriers in brazilian girolando cattle. Repositório Alice
PAIVA, D. S.; FONSECA, I.; PINTO, I. S. B.; IANELLA, P.; CAMPOS, T. A.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: CD18; SLC35A3; UMPS; Teste de Progênie.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/981129
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Inventário de recursos genéticos animais da Embrapa. Infoteca-e
ALBUQUERQUE, M. do S. M.; IANELLA, P..
Este Inventário traz informações sobre os recursos genéticos animais que compõem o Programa de Conservação da Embrapa, como resultado da Rede de Recursos Genéticos Animais - Rede Animal, um dos quatro projetos em rede contemplados pela Plataforma Nacional de Recursos Genéticos, que se encerrou em 2015. Traz também informações detalhadas sobre os recursos genéticos animais mantidos nos núcleos de criação da Embrapa, distribuídos por todo o Território Nacional, com base nos relatos dos curadores, profissionais que atuam como guardiões desses recursos genéticos. Ao longo dessas 108 páginas, encontram-se informações detalhadas sobre raças de animais de interesse zootécnico, incluindo bovinos, caprinos, suínos, ovinos, equinos, bubalinos e asininos, que...
Tipo: Livro técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Banco de DNA; Núcleo de conservação; Recurso genetico; Banco de germoplasma; Melhoramento genético animal.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1059875
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