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16s rDNA-metagenomic sequencing of bone lesions caused by femoral head necrosis in broilers. Repositório Alice
ZANELLA, R.; CANTAO, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; RHOADS, D. D.; AL-RUBAYE, A.; WIDEMAN, R. F.; LEDUR, M. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Melhoramento genético animal; Galinha; Animal genetics; Chickens.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1014240
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A SNP in the BMP3 gene associated with carcass traits in broilers. Repositório Alice
NEIS, K. L.; IBELLI, A. M. G.; MARCHESI, J. A. P.; KAWSKI, V. L.; FORNARI, M. B.; LOPES, L. dos S.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: SNP; Carcarça.; Frango de corte; Polimorfismo genético.; Broiler chickens; Genetic polymorphism; Chicken carcasses.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/970454
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Age effects on gene expression related to the bacterial chondronecrosis with osteomyelitis in broiler. Repositório Alice
CANTAO, M. E.; ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; IBELLI, A. M. G.; PANDOLFI, J. R. C.; SETTLES, M.; LEDUR, M. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Gene expression; Metabolomics; Proteomics..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1037119
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Allele- and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: a candidate for meat tenderness in cattle. Repositório Alice
SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; ROCHA, M. I. P.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Nelore; Expressão alélica diferencial; Maciez da carne; Gado Nelore; Alleles.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1052240
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Allelic and parental-specific expression on the KCNJ11 gene in cattle. Repositório Alice
SOUZA, M.; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L.; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Separatas Palavras-chave: KCNJ11; Gene; Cattle.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/980666
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Ammonia removal from swine wastewater by simultaneous nitrification-denitrification processes within a photobioreactor. Repositório Alice
MEZZARI, M. P.; SILVA, M. L. B. da; VIANCELLI, A.; IBELLI, A. M. G.; KUNZ, A.; SOARES, H. M..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Desnitrification; Pig farming.; Suinocultura; Nitrificação; Desnitrificação; Bioquímica do Solo.; Soil biochemistry; Nitrification..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/969259
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Análise comparativa de transcriptoma de frangos normais e afetados com necrose da cabeça do fêmur. Repositório Alice
GOLDONI, I.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; HUL, L. M.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Problemas locomotores; Expressão gênica; RNA-Seq; Frango de Corte; Fêmur; Genética Animal; Aparelho Locomotor.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1135374
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Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal. Infoteca-e
HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; CARDOSO, F. F..
O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Agrupamento de dados; Expressão gênica; Rede Genômica Animal; Análise de componentes principais - PCA.; Análise Estatística..
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/885652
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Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal. Infoteca-e
HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; CARDOSO, F. F..
O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Agrupamento de dados; Expressão gênica; Rede Genômica Animal; Análise de componentes principais - PCA.; Análise Estatística.; Gene expression; Algorithms; Statistical analysis; Principal component analysis.
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/883623
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Análise de associação entre marcadores moleculares no cromossomo 3 de ovinos e resistência aos nematódeos gastrintestinais. Repositório Alice
GOUVEIA, J. J. S.; SANTIAGO, A. C.; IBELLI, A. M. G.; FREITAS, A. R. de; OLIVEIRA, M. C. de S.; GIGLIOTI, R.; ESTEVES, S. N.; REGITANO, L. C. de A..
A ovinocultura brasileira tem experimentado considerável crescimento nos últimos anos (cerca de 17% entre 2003 e 2006). Porém, apresenta números pouco significativos quando comparado ao cenário mundial. Uma das principais causas de prejuízos desta exploração é a infecção por nematódeos gastrintestinais. Em razão disso, a descoberta de marcadores moleculares para resistência a endoparasitas em ovinos tem recebido grande atenção por parte dos pesquisadores, e diversos estudos vêm sendo conduzidos em várias partes do mundo e com diversas raças. No Brasil, entretanto, estes estudos são insipientes. O objetivo deste trabalho foi verificar associação entre marcadores tipo microssatélite do cromossomo três de ovinos e a resistência aos nematódeos...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Ovinos; Nematódeos gastrintestinais; Marcadores moleculares.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/33079
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Análise de associação genômica para hérnia umbilical em suínos comerciais utilizando abordagem de marcadores múltiplos. Repositório Alice
LAGOS, E. B.; PIRES, M. P.; ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; MORES, M. A. Z.; FERNANDES, L. T.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Anel umbilical; Blossoc; Defeitos congênitos; Influência genética; Perdas econômicas; Suinocultura; Genética Animal; Marcador Genético.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116904
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Análise de conjunto de genes de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal. Infoteca-e
HIGA, R. H.; IBELLI, A. M. G.; CARDOSO, F. F.; REGITANO, L. C. de A..
O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de conjuntos de genes para dados de experssão gênica, conforme utilizada no escopo da RGA. Na seção 2 é apresentado o procedimento correspondente à análise de GSA proposta por (EFRON; TIBSHIRANI, 2007), utilizado na RGA. Um exemplo completo, incluindo principais comandos do correspondente script R é apresentado na seção 3.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Bioinformática; Expressão gênica; Rede Genômica Animal; Análise de genes; Bioinformatics; Gene expression.
Ano: 2011 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/920185
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Análise de métodos para a conservação de RNA. Repositório Alice
SOUZA, J. R. T; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A..
Amostras de RNA com elevado grau de pureza e integridade são necessárias em diversos métodos de análise da expressão gênica. Em virtude da possibilidade de degradação enzimática, métodos eficazes de extração e armazenamento dessas amostras são necessários. Existem hoje no mercado reagentes que permitem a extração e a purificação de RNA de diversas amostras, com rapidez e eficiência, pois contêm simultaneamente desnaturantes, como o isotiocianato de guanidina, que impedem a ação enzimática, e solventes orgânicos que isolam o RNA do DNA e das proteínas. O objetivo deste projeto foi comparar a qualidade e integridade de RNA extraídos a partir de tecidos armazenados em RNAlater. e de tecidos crioliofilizados, e testar diferentes métodos de armazenamento para...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Métodos de conservação; Crioliofilização.; RNA..
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/48100
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Análise integrada do transcriptoma e exoma revela novos genes relacionados ao acometimento de hérnia escrotal em suínos. Repositório Alice
ROMANO, G. de S.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; MORES, M. A. Z.; COUTINHO, L. L.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Genes diferencialmente expressos; Suinocultura; Genética Animal; Sus Scrofa Domesticus; Hérnia; Mutação.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116907
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Análise por componentes principais, de medidas fisiológicas de bovinos submetidos a teste de tolerâncias ao calor. Repositório Alice
ALENCAR, M. M. de; RIBEIRO, A. R. B.; FREITAS, A. R. de; REGITANO, L. C. de A.; IBELLI, A. M. G..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Comportamento; Medidas fisiológicas.; Calor..
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/578866
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Análise preliminar da estrutura genética populacional de galinhas nigerianas. Repositório Alice
XAVIER SILVA, J.; ARAUJO, A. C.; BRITO, L.; LEDUR, M. C.; PAIVA, S. R.; ABREU JÚNIOR, P. B. de; IBELLI, A. M. G.; CARNEIRO, P. L. S..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Galinhas nigerianas; Genética; Espécie Nativa.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1128150
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Associação de um SNP no gene da calmodulina com características de integridade da tíbia em frangos de corte. Repositório Alice
CARMO, K. B. do; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; ONO, R. K.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Integridade óssea; CALM.; Frango de corte; Genética animal; Polimorfismo genético; Cálcio..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083259
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Associação do receptor da adiponectina com cortes nobres e características relacionadas à deposição de gordura em uma linhagem paterna de frangos de corte. Repositório Alice
CRUZ, V. A. R. da; IBELLI, A. M. G.; MARCHESI, J. A. P.; PANDOLFI, J. R. C.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P..
Tipo: Separatas Palavras-chave: SNP; Gordura abdominal; ADIPOR 1; Frango de corte.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/968188
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Associação entre microssatélite localizado no cromossomo OAR3 e peso ao abate de ovinos pertencentes a três grupos genéticos. Repositório Alice
GOUVEIA, J. J. S.; SANTIAGO, A. C.; IBELLI, A. M. G.; TIZIOTO, P. C.; ESTEVES, S. N.; BARIONI JUNIOR, W.; REGITANO, L. C. de A..
A ovinocultura tem uma enorme importância em várias regiões do mundo e isso pode ser demonstrado pelo volume de produção e de dinheiro gerado por esta atividade. Apesar de o Brasil apresentar excelentes condições ambientais e mercado bastante favorável, a produção nacional ainda é desprezível no contexto mundial. A baixa produtividade brasileira na ovinocultura se deve, ao menos em parte, ao baixo potencial genético do rebanho nacional. Algumas características importantes que poderiam ser usadas nos programas de melhoramento genético apresentam baixa herdabilidade, difícil mensuração ou correlações negativas com outras características. Nesse contexto, a genética molecular, através da identificação das regiões cromossômicas responsáveis pelo controle das...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Associação; Cromossomo; Grupo Genético.; Crescimento; Ovino; Peso..
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/48711
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Associação entre polimorfismos de única base (SNP) dos genes PPARGC1A e PSMC1 com espessura de gordura subcutânea em animais da raça Canchim. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; GASPARIN, G.; IBELLI, A. M. G.; OLIVIERA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Polimorfismos; Raça Canchim; Espessura de gordura.; Genes..
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/573412
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