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A protocol for measuring canopy temperature of sugarcane plots in the field using a thermal imager embarked in an UAV. Repositório Alice
SANTOS, T. T.; CASARI, R. A. C. N.; OLIVEIRA, N. G.; DIAS, B. B. A.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C.; SOUSA, C. A. F. de.
bitstream/item/173736/1/Proceedings-of-II-LAPhPB-pg.26.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Thermography; Plant breeding; Drought tolerance; Remote sensing.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088874
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A simple and highly efficient Agrobacterium-mediated transformation protocol for Setaria viridis. Repositório Alice
MARTINS, P. K.; RIBEIRO, A. P.; DIAS, B. B. A.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C..
Abstract: The production and use of sugarcane in Brazil is very important for bioenergy production and is recognized as one of the most efficient in the world. In our laboratory, Setaria viridis is being tested as a model plant for sugarcane. S. viridis has biological attributes (rapid life cycle, small genome, diploid, short stature and simple growth requirements) that make it suitable for use as a model system. We report a highly efficient protocol for Agrobacterium-mediated genetic transformation of S. viridis. The optimization of several steps in tissue culture allowed the rapid regeneration of plants and increased the rate of transformation up to 29%. This protocol could become a powerful tool for functional genomics in sugarcane
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Model system; C4 metabolism; Green millet; Cana de Açúcar; Bioenergia; Milho Verde; Genoma; Bioenergy; Sugarcane; Setaria viridis; Genomics.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1025487
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Análise do potencial econômico de variedade de cana geneticamente modificada para produção de açúcar. Repositório Alice
GARCIA, B. de O.; MOLINARI, H. B. C.; PACHECO, T. F.; KOBAYASHI, A. K.; BARBOSA, G. V. S.; PAIVA, L. V.; GUIDUCCI, R. do C. N..
O objetivo deste trabalho é analisar o impacto econômico ex ante de variedade de cana‑de‑açúcar geneticamente modificada para fabricação do açúcar, considerando o desempenho da variedade na fase industrial, em cenários de adoção da tecnologia. Trata‑se de uma variedade de cana geneticamente modificada, que possibilita a redução de 70% do escurecimento do caldo de cana na etapa de processamento. Foram utilizados dados de mercado, relativos ao custo total, custo de insumos e custo da etapa de clareamento do caldo de cana, no processo de produção de açúcar. A partir dos resultados obtidos na pesquisa, estimou‑se o impacto da variedade modificada no custo de produção, tendo em vista mudanças no processamento,...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Cana de Açúcar; Açúcar; Custo de Produção; Melhoramento Genético Vegetal; Cane sugar; Production costs; Genetic improvement.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1127025
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Avaliação de impacto ex ante da adoção do ativo tecnológico cana flex para produção de etanol de segunda geração. Repositório Alice
GUIDUCCI, R. do C. N.; MOLINARI, H. B. C.; PACHECO, T. F.; KOBAYASHI, A. K..
Resumo: O presente estudo avaliou o impacto ex ante de uma cultivar de cana-de-açúcar voltada para o melhor aproveitamento da biomassa na produção de etanol de segunda geração (E2G). Foram feitas estimativas de ganhos econômicos em cenários de adoção da tecnologia, tendo como fonte de receita a produção de E2G e a comercialização de créditos de descarbonização (CBIOS), no âmbito do Programa Nacional de Biocombustível (RenovaBio). Avaliou-se também o retorno do investimento em P&D frente aos ganhos esperados. Os resultados evidenciaram que se 10% do bagaço de cana produzido na safra 2018/19 fosse destinado à produção de E2G, o diferencial da Cana Flex comparado a uma variedade não modificada implicaria em aumento de 393.263,6 m3 na produção de E2G, com...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Programa Nacional de Biocombustível (RenovaBio); Biocombustível; Cana de Açúcar; Etanol; Impacto Econômico; Biofuels; Ethanol; Cane sugar; Economic impact.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1128736
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BAHD5 - novo gene-alvo para aumento de sacarose em gramíneas. Repositório Alice
SAMPAIO, B. L.; DUARTE, K. E.; SOUZA, W. R.; VINECKY, F.; AMARAL, H. de O.; SIFUENTES, D. N.; DIAS, B. B. A.; KOBAYASHI, A. K.; OLIVEIRA, P. A. de; MOLINARI, H. B. C..
bitstream/item/184279/1/EnPI-2018-13.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Perfil metabólico; Acúmulo de açúcar; Gramínea.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097285
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Caracterização da estrutura genética do pinhão manso (Jatropha curcas L.): isolamento de fragmentos de dna enriquecidos com sequências de microssatélites. Repositório Alice
BRITTO, F. B.; DINIZ, F. M.; KOBAYASHI, A. K.; LIMA, P. S. C.; ARAÚJO, E. C. E.; BENTZEN, P..
O pinhão manso (Jatropha curcas) é uma planta oleaginosa que vem se destacando por apresentar um alto potencial na produção de biocombustíveis. Por este motivo o interesse em sua exploração comercial vem aumentado consideravelmente. Assim, torna-se imprescindível o desenvolvimento de tecnologias moleculares de monitoramento e seleção de populações naturais e cultivares. Nesse contexto, marcadores moleculares como os microssatélites são amplamente utilizados. No entanto, os genomas de organismos eucariontes são muito amplos e, assim, o isolamento de seqüências de microssatélites específicas, que possam atuar como marcadores, torna-se uma tarefa complexa. O presente trabalho teve como objetivo estabelecer um protocolo para isolar fragmentos de DNA...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Enzimas de Restrição; Sonda; Biodiesel; Planta oleaginosa.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/70169
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Development of a protocol aiming at the estimation of pigment contents in maize leaves by hyperspectral remote sensing. Repositório Alice
CASARI, R. A. C. N.; SILVA, V. N. B.; FERREIRA, T. M. M.; SANTOS, T. T.; DIAS, B. B. A.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C.; SOUZA JUNIOR, M. T.; SOUSA, C. A. F. de.
The goal of this study was to develop and validate a protocol for the estimation of photosynthetic pigment contents in maize leaves using algorithms derived from hyperspectral images generated from visible to the infrared region of the electromagnetic spectrum.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Milho; Clorofila; Carotenoide; Pigmento; Zea mays; Chlorophyll; Carotenoids; Drought stress; Water stress.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077420
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Development of a protocol aiming at the estimation of pigment contents in maize leaves by hyperspectral remote sensing. Repositório Alice
CASARI, R. A. das C. N.; SOUSA, C. A. F. de; SANTOS, T. T.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C.; SOUZA JUNIOR, M. T.; DIAS, B. B. A.; FERREIRA, T. M. M.; SILVA, V. N. B..
bitstream/item/173705/1/Hugo-et-al-I09.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Zea mays; Chlorophyll; Carotenoids; Drougth stress.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088844
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Development of drought-tolerant sugarcane overexpressing the AtDREB2A CA gene. Repositório Alice
SOUZA, W. R. de; OLIVEIRA, N. G. de; VINECKY, F.; RIBEIRO, A. P.; BASSO, M. F.; CASARI, R. A. das C. N.; DIAS, B. B. A.; NEPOMUCENO, A. L.; KOBAYASHI, A. K.; NAKASHIMA, K.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; MOLINARI, H. B. C..
Sugarcane is considered an important economic crop not only for sugar production, but also for ethanol generation, serving as an expandable green alternative to the usage of crude oil. To take advantage of the use of sugarcane as a renewable source for bioethanol production, it is important to increase its productivity without increasing land usage, which includes sugarcane cultivation under hostile conditions, such as waterlimited environments. In this study, we demonstrated that stress-inducible overexpression of the transcription factor AtDREB2A CA conferred drought tolerance in sugarcane subjected to water deficiency under greenhouse conditions. In addition, transgenic plants expressing AtDREB2A CA accumulated higher levels of sucrose than...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: AtDREB2A CA; ZmRab17 promoter; Abiotic stress; Saccharum; Transcription factors.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1130044
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Development of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala. Repositório Alice
RAPOSO, R. S.; SOUZA, I. G. B.; VELOSO, M. E. da C.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; DINIZ, F. M..
The last few years have seen a significant increase in the number of large-scale sequencing projects generating whole genome databases. These sequence databases can be surveyed (genome sequence survey) for tandem repeats as an alternative means to develop microsatellites for monitoring and selecting natural populations and cultivars of Jatropha curcas. A total of 100 tandem repeats were revealed from mining 368 genomic surveyed sequences available in the Kazusa DNA Research Institute database. Twenty microsatellite sequences were successfully amplified, resulting in repeatable and scorable polymerase chain reaction products. Genotyping of J. curcas accessions from the Guatemalan population revealed 18 polymorphic loci. The average number of alleles per...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Microssatélite; Cultura energética; Planta oleaginosa; Pinhão de purga; Biocombustível; Microsatellites; Energy crop; Physic nut; Biofuel; Genetic diversity; Euphorbiaceae.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1017730
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Divergence of DNA methylation and gene expression in Setaria viridis accessions under drought stress. Repositório Alice
SANTIAGO, T. R.; DUARTE, K. E.; SOUZA, W. R. de; STEINDORFF, A. S.; FORMIGHIERI, E. F.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C..
bitstream/item/184332/1/EnPI-2018-20.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Methylomes; TE menthylation; Whole genome bisulphite sequencing; Differential methylation.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097377
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Effect of drought on the gas exchanges of maize genotypes with different levels of drought tolerance. Repositório Alice
SILVA, V. N. B.; FERREIRA, T. M. M.; PAIVA, D. S. de.; CASARI, R. A. das C. N.; MOLINARI, H. B. C.; KOBAYASHI, A. K.; SOUZA JUNIOR, M. T.; SOUSA, C. A. F. de.
bitstream/item/173706/1/Hugo-et-al-I11.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Zea mays; Water deficit stress.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088847
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Effect of drought on the photochemical apparatus of maize plants as evaluated by parameters derived from chlorophyll fluorescence. Repositório Alice
FERREIRA, T. M. M.; PAIVA, D. S.; CASARI, R. A. das C. N.; SILVA, V. N. B.; MOLINARI, H. B. C.; KOBAYASHI, A. K.; SOUZA JUNIOR, M. T.; SOUSA, C. A. F. de.
bitstream/item/173707/1/Hugo-et-al-I12.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Zea mays; Light curve; Water deficit stress.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088849
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Enhanced resistance to citrus canker in transgenic sweet orange expressing the sarcotoxin IA gene. Repositório Alice
KOBAYASHI, A. K.; VIEIRA, L. G. E.; BESPALHOK FILHO, J. C.; LEITE, R. P.; PEREIRA, L. F. P.; MOLINARI, H. B. C.; MARQUES, V. V..
Citrus canker, caused by the bacterial pathogen Xanthomonas citri subp. Citri (Xcc), is a serious disease reported in most citrus-producing areas around the world. Although different levels of field resistance to citrus canker have been reported in sweet oranges, they are usually not sufficient to provide adequate control of the disease. Ectopic over-expression of antibacterial genes is one of the potential strategies to increase plant resistance to bacterial diseases. Previous in vitro results showed that sarcotoxin IA, an antimicrobial peptide isolated from the flesh fly (Sarcophaga peregrina), can be efficient to control different plant pathogenic bacteria, including Xcc. Transgenic BPera^ sweet orange (Citrus sinensis [L.] Osbeck) plants constitutively...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Citrus canker; Mature tissue transformation; Bacterial disease resistance; Antimicrobial peptides; Agrobacterium radiobacter.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083330
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Ensaio de déficit hidríco de Setaria viridis transformada com o gene órfão CcUNK8 de Coffea canephora. Repositório Alice
DUARTE, K. E.; VIEIRA, N. G.; RÊGO, E. C. S.; MARTINS, P. K.; RIBEIRO, A. P.; CUNHA, B. A. D. B. da; MOLINARI, H. B. C.; KOBAYASHI, A. K.; SOUSA, C. A. de; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C..
As plantas respondem e se adaptam as condições de estresses com uma série de alterações morfológicas, fisiológicas e moleculares. Ao nível molecular, a expressão diferencial de genes para tolerar as condições adversas é um bom indicativo da resposta da planta ao meio ambiente. Encontrar a função destes genes pode facilitar o entendimento da relação planta-ambiente. No intuito de entender os processos que levam algumas plantas a terem uma maior tolerância à seca, ocorreram avanços na descoberta e descrição de genes envolvidos neste processo. Algumas destas sequencias não possuem nenhuma similaridade com sequencias depositadas nos bancos de dados públicos, e são denominadas ?no hits ? ou genes órfãos. O gene CcUNK8 (UNKnown) foi previamente identificado em...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gene órfão; Estresse abiótico; Expressão gênica; Gene expression orphan genes; Coffea canephora; Seca; Coffea canephora; Abiotic stress; Drought.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1041178
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Finished genome of the fungal wheat pathogen Mycosphaerella graminicola Reveals dispensome structure, chromosome plasticity, and stealth pathogenesis. Repositório Alice
GOODWIN, S. B.; M?BAREK, S. B.; DHILLON, B.; WITTENBERG, A. H. J.; CRANE, C. F.; HANE, J. K.; FOSTER, A. J.; LEE, T. A. J. van der; GRIMWOOD, J.; AERTS, A.; ANTONIW, J.; BAILEY, A.; BLUHM, B.; BOWLER, J.; BRISTOW, J.; BURGT, A. van der; CANTO CANCHE, B.; CHURCHILL, A. C. L.; CONDE FERRÀEZ, L.; COOLS, H. J.; COUTINHO, P. M.; CSUKAI, M.; DEHAL, P.; WIT, P. de; DONZELLI, B.; GEEST, H. C. van de; HAM, R. C. H. H. van; HAMMOND KOSACK, K. E.; HENRISSAT, B.; KILIAN, A.; KOBAYASHI, A. K.; KOOPMANN, E.; KOURMPETIS, Y.; KUZNIAR, A.; LINDQUIST, E.; LOMBARD, V.; MALIEPAARD, C.; MARTINS, N. F.; MEHRABI, R.; NAP, J. P. H.; PONOMARENKO, A.; RUDD, J. J.; SALAMOV, A.; SCHMUTZ, J.; SCHOUTEN, H. J.; SHAPIRO, H.; STERGIOPOULOS, I.; TORRIANI, S. F. F.; TU, H.; VRIES, R. P. de; WAALWIJK, C.; WARE, S. B.; WIEBENGA, A.; ZWIERS, L.; OLIVER, R. P.; GRIGORIEV, I. V.; KEMA, G. H. J..
2011
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Mycosphaerella graminicola; Fungus; Fungo.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/913905
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Genetic improvement of Jatropha for biodiesel production. Repositório Alice
LAVIOLA, B. G.; ROCHA, R. B.; KOBAYASHI, A. K.; ROSADO, T. B.; BHERING, L. L..
2010
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Reprodução; Melhoramento de culturas; Jatropha curcas.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/926075
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Genetic parameters and variability in physic nut accessions during early developmental stages. Repositório Alice
LAVIOLA, B. G.; ROSADO, T. B.; BHERING, L. L.; KOBAYASHI, A. K.; RESENDE, M. D. V. de.
The objective of this work was to estimate the genetic parameters and variability among accessions (half-sib families) of physic nut (Jatropha curcas) during the early stages of development. For this study, 110 accessions in the first year of development of the physic nut germplasm bank, maintained at Embrapa Cerrados, DF, Brazil, were evaluated in situ. The experiment was established in a randomized complete block design, with two replicates and five plants per plot arranged in rows at 4x2 m spacing. Grain yield, total number of branches per plant, plant height, stem diameter, canopy projection on the row, canopy projection between rows, canopy volume, number of days until first flowering and height of the first inflorescence were evaluated. Estimates of...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Banco de germoplasma; Melhoramento vegetal; Germplasm bank; Plant breeding.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/876248
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Genetic parameters and variability in physic nut accessions during early developmental stages. Repositório Alice
LAVIOLA, B. G.; ROSADO, T. B.; BHERING, L. L.; KOBAYASHI, A. K.; RESENDE, M. D. V. de.
The objective of this work was to estimate the genetic parameters and variability among accessions (half?sib families) of physic nut (Jatropha curcas) during the early stages of development. For this study, 110 accessions in the first year of development of the physic nut germplasm bank, maintained at Embrapa Cerrados, DF, Brazil, were evaluated in situ. The experiment was established in a randomized complete block design, with two replicates and five plants per plot arranged in rows at 4x2 m spacing. Grain yield, total number of branches per plant, plant height, stem diameter, canopy projection on the row, canopy projection between rows, canopy volume, number of days until first flowering and height of the first inflorescence were evaluated. Estimates of...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Jatropha curcas; Banco de germoplasma; Melhoramento genético.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/876472
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Identification and characterization of core abscisic acid (ABA) signaling components and their gene expression profile in response to abiotic stresses in Setaria viridis. Repositório Alice
DUARTE, K. E.; SOUZA, W. R. de; SANTIAGO, T. S.; SAMAPAIO, B. L.; RIBEIRO, A. P.; COTTA, M. G.; DIAS, B. B. A.; MARRACCINI, P. R. R.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C..
bitstream/item/201305/1/HUGO-1-s41598-019-40623-5.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Abiotic stresses; Gene expression; Genetic engineering.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1111623
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