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Accessing lipases from soil metagenoma and their application for microbial biofuel production. Repositório Alice
TAVARES, P.; SILVA, M. R. S. S.; KRUGER, R. H.; NORONHA, E. F.; QUIRINO, B. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Produção microbiana de biocombustível.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/908068
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Accessing lipases from soil metagenome as an aid for biofuel production. Repositório Alice
TAVARES, P.; BERGMANN, J.; KRUGER, R. H.; NORONHA, E.; QUIRINO, B. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Lipases; Soil metagenome; Biofuel production.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/908059
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Antibiotic resistance elements isolated from metagenomic libraries constructed with Cerrado soil samples. Repositório Alice
SANTOS, D. F. K. dos; CASTRO, A. P. de; CARVALHO, L. S.; ARAÚJO JÚNIOR, S. D.; PALUAN, S. de F.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Resistência a antibiótico; Biblioteca metagenômica; Solo do Cerrado.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/908076
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Avaliação da diversidade microbiana do processo de produção de etanol de cana-de-açúcar por meio de abordagem independente de cultivo. Repositório Alice
COSTA, O. Y. A.; SOUTO, B. de M.; TUPINAMBA, D. D.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. M.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Produção de etanol.; Cana de Açúcar..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1031510
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Bacterial diversity dynamics in microbial consortia selected for lignin utilization. Repositório Alice
MENDES, I. V.; GARCIA, M. B.; BITENCOURT, A. C. A.; SANTANA, R. H.; LINS, P. de C.; SILVEIRA, R.; SIMMONS, B. A.; GLADDEN, J. M.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F..
Abstract:Lignin is nature?s largest source of phenolic compounds. Its recalcitrance to enzymatic conversion is still a limiting step to increase the value of lignin. Although bacteria are able to degrade lignin in nature, most studies have focused on lignin degradation by fungi. To understand which bacteria are able to use lignin as the sole carbon source, natural selection over time was used to obtain enriched microbial consortia over a 12-week period. The source of microorganisms to establish these microbial consortia were commercial and backyard compost soils. Cultivation occurred at two different temperatures, 30°C and 37°C, in defined culture media containing either Kraft lignin or alkaline-extracted lignin as carbon source. iTag DNA sequencing of...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Biotecnologia; Carbono; Lignina; Composto Fenólico; Lignin; Phenolic compounds; Carbon; Energy conversion; Biotechnology; Degradation; Application technology.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1134421
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Brazilian microbiome project: revealing the unexplored microbial diversity - challenges and prospects. Repositório Alice
PYLRO, V. S.; ROESCH, L. F. W.; ORTEGA, J. M.; AMARAL, A. M. do; TÓTOLA, M. R.; HIRSCH, P. R.; ROSADO, A. S.; GÓES-NETO, A.; SILVA, A. L. da C.; ROSA, C. A.; MORAIS, D. K.; ANDREOTE, F. D.; DUARTE, G. F.; MELO, I. S. de; SELDIN, L.; LAMBAIS, M. R.; HUNGRIA, M.; PEIXOTO, R. S.; KRUGER, R. H.; TSAI, S. M.; AZEVEDO, V..
The Brazilian Microbiome Project (BMP) aims to assemble a Brazilian Metagenomic Consortium/Database. At present, many metagenomic projects underway in Brazil are widely known. Our goal in this initiative is to co-ordinate and standardize these together with new projects to come. It is estimated that Brazil hosts approximately 20 % of the entire world's macroorganism biological diversity. It is 1 of the 17 countries that share nearly 70 % of the world's catalogued animal and plant species, and is recognized as one of the most megadiverse countries. At the end of 2012, Brazil has joined GBIF (Global Biodiversity Information Facility), as associated member, to improve the access to the Brazilian biodiversity data in a free and open way. This was an important...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Diversidade microbiana; Biodiversidade; Microrganismo; Biodiversity.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1000621
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Colocando a biodiversidade microbiana brasileira a serviço da indústria de biocombustíveis. Repositório Alice
QUIRINO, B. F.; BERGMANN, J. C.; RAMOS, N. S. P. L.; PALUAN, S. de F.; SOUTO, B. de M.; RODRIGUES, L. P.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Biocombustíveis.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/976242
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Comparative characterization of the archaeal community in the amazon forest: native forest and oil palm plantation by high-throughput sequencing. Repositório Alice
DOMENECH, D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y.; CARVALHO B. J.; KYAW, C. M.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F..
ALAM 2014; CCM 2014.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Floresta amazônica; Óleo de palma; Sequenciamento de alto rendimento; Mata nativa; Comunidades microbianas; Archaeae; Solo cultivado.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1014172
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Comparative characterization of the archaeal community in the amazon forest: native forest and oil palm plantation by high-throughput sequencing. Repositório Alice
DOMENECH, D.; CANTÃO, M. E.; COSTA, O. Y.; CARVALHO B. J.; KYAW, C. M.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F..
Memorias do: XXII Congresso Latinoamericano de Microbiologia - ALAM; 4 Congresso Colombiano de Microbiologia - 4 CCM, 2014, Cartagena, Colombia.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Floresta amazônica; Óleo de palma; Sequenciamento de alto rendimento; Mata nativa; Comunidades microbianas; Archaeae; Solo cultivado.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1003009
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Culture-independent assessment of the microbial diversity in the sugarcane-ethanol production process. Repositório Alice
ASSIS, O. Y. de; SOUTO, B. de M.; DOMENECH, D.; CARVALHO B. J.; KRUGER, R. H.; KYAM, C. M.; CHAVES B. C.; QUIRINO, B. F..
Trabalho apresentado no XXII Congresso Latinoamericano de Microbiología - ALAM 2014 e 4 Congresso Colombiano de Microbiología - 4 CCM 2014.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Diversidade microbiana; Produção de etanol; Etanol de segunda geração.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1003475
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Diversidade microbiana e degradação de lignina em cultura enriquecida. Repositório Alice
GARCIA, M. B.; MENDES, I. V.; SANTANA, R. H.; KRUGER, R. H.; GLADDEN, J.; QUIRINO, B. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Consórcio microbiano; Diversidade bacteriana; Lignina.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097635
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Functional screening of a Caatinga goat (Capra hircus) rumen metagenomic library reveals a novel GH3 beta-xylosidase. Repositório Alice
SOUTO, B. de M.; ARAÚJO, A. C. B. de; HAMANN, P. R. V.; BASTOS, A. de R.; CUNHA, I. de S.; PEIXOTO, J.; KRUGER, R. H.; NORONHA, E. F.; QUIRINO, B. F..
Functional screening of metagenomic libraries is an effective approach for identification of novel enzymes. A Caatinga biome goat rumen metagenomic library was screened using esculin as a substrate, and a gene from an unknown bacterium encoding a novel GH3 enzyme, BGL11, was identified. None of the BGL11 closely related genes have been previously characterized. Recombinant BGL11 was obtained and kinetically characterized. Substrate specificity of the purified protein was assessed using seven synthetic aryl substrates. Activity towards nitrophenyl-beta-D-glucopyranoside (pNPG), 4-nitrophenyl- beta -D-xylopyranoside (pNPX) and 4-nitrophenyl- beta -D-cellobioside (pNPC) suggested that BGL11 is a multifunctional enzyme with beta-glucosidase, beta-xylosidase,...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Enzima; Clonagem; Programa de Computador; Peptídeo; Metagenomics; Enzymes; Cloning (animals); Signal peptide; Prevotella; Computer software; Screening.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1129624
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Identification of clones with Beta-Glucosidase and cellobiohydrolase activities from a goat rumen metagenomic library. Repositório Alice
SOUTO, B. de M.; CARVALHO, L. S.; LOPIES, N. S. P. R.; CUNHA, I. S.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Second generation bioethanol; Cellobiohydrolase; Metagenome.; Beta-glucosidase..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/908053
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Identification of glycosyl hydrolases in the microbial biodiversity of Brazil using a metagenomic approach. Repositório Alice
QUIRINO, B. F.; BERGMAN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; PALUAN, S. G.; RAMOS, N. S. P. L.; SOUTO, B. de M.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H..
Poster Session 1: 7-44.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Metagenômica; Biodiversidade microbiana; Brasil.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/924173
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Isolamento e Caracterização de Microrganismos Isolados a Partir de Solo de Cerrado para a Produção de Etanol de Segunda Geração. Repositório Alice
ARAUJO, A. C. B.; CARVALHO, L. S.; TUPINAMBA, D. D.; ALMEIDA, J. M.; FAVARO, L. C. de L.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Biocombustiveis; Microbiologia de solo.; Etanol..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/938984
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New strategies to look at old problems: fatal yellowing in palm oil tree. Repositório Alice
BERGMANN, J. C.; BOARI, A. de J.; KRUGER, R. H.; TAVARES P.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; QUIRINO, B. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Fatal Yellowing; Next generation sequencing.; Biodiesel; Metagenomics..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/908045
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Prospecção de celulases e hemicelulases utilizando diferentes substratos por abordagem metagenômica. Repositório Alice
RODRIGUES, L. P.; SCHROEDER, L. F.; RAMOS, N. S. P. L.; RAMOS, T. G.; MOURA, C. O.; SOUTO, B. de M.; BERGMANN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; JUNIOR, D. A. J.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Celulases; Hemicelulases; Metagenomica..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/938979
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Triagem de Bibliotecas Metagenômicas para Isolamento de Clones com Atividade de Celobiohidrolase. Repositório Alice
CARVALHO, L. S.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Metagenômica; Celobiohidrolases; Celulases.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/938973
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Two glycosyl hydrolase clones isolated from a small-insert metagenomic library from Amazon soil environmental DNA. Repositório Alice
PALUAN, S. de F.; BITENCOURT, A. C. A.; PORTO, W. F.; SANTOS, D. F. K. dos; SOUTO, B. de M.; KRUGER, R. H.; FRANCO, O. L.; QUIRINO, B. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Bioetanol; Segunda geração.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/908080
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