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	Provedor de dados Repositório Alice (37) Autor LIMA, A. O. de (37) REGITANO, L. C. de A. (37) COUTINHO, L. L. (21) TIZIOTO, P. C. (21) AFONSO, J. (19) DINIZ, W. J. da S. (16) ROCHA, M. I. P. (15) OLIVEIRA, P. S. N. de (14) HIGA, R. H. (13) MOKRY, F. B. (13) MUDADU, M. de A. (11) BUSS, C. E. (10) MEIRELLES, S. L. C. (9) NICIURA, S. C. M. (9) CESAR, A. S. M. (8) MOURÃO, G. B. (7) SOUZA, M. M. de (7) ZERLOTINI NETO, A. (7) ALENCAR, M. M. de (6) GROMBONI, C. F. (6) Mais... Palavra-chave Beef cattle (9) Gado Nelore (6) Bos Indicus (5) Cattle (5) Single nucleotide polymorphism (5) Expressão gênica (4) Feed efficiency (4) Gado de Corte. (4) Gene expression (4) Bovino (3) Gado de Corte (3) Linkage disequilibrium (3) Nellore (3) Polimorfismo de nucleotídeo único (3) Bos Indicus. (2) Composite (2) Desequilíbrio de ligação (2) Gado de corte (2) Gene expression. (2) Genome regulation. (2) Mais... Tipo do documento Separatas (19) Artigo de periódico (11) Anais e Proceedings de eventos (7) Ano 2023 (1) 2020 (2) 2019 (3) 2018 (3) 2017 (9) 2016 (4) 2015 (1) 2014 (3) 2013 (7) 2012 (4) Mais... País Brazil (37) Idioma Inglês (27) Português (10)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 37 Primeira ... 1 2 ... Última Allele-specific gene expression in liver of Nelore cattle extremes for feed efficiency. Repositório Alice ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Allele-specific expression; Genome regulation.; Genetic improvement.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1073455 An insight into the linkage disequilibrium map of the Canchim beef cattle breed. Repositório Alice MOKRY, F. B.; LIMA, A. O. de; MUDADU, M. A.; HIGA, R. H.; MEIRELLES, S. L. C.; REGITANO, L. C. de A.. The development of linkage disequilibrium (LD) maps is very important for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes, as LD can be defined as the non-random segregation of a pair of alleles at polymorphic sites. Canchim is a composite beef cattle breed which was developed in the 1960's by the crossing of Bos indicus (3/8) x Charolais (5/8) animals. The objective in this study was to analyze the extension of LD maps from a Canchim beef cattle population. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Desequilíbrio de ligação.; Gado.; Linkage disequilibrium; Cattle; Zebu; Haplotypes. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/946432 An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. Repositório Alice OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A.. Residual Feed Intake (RFI) is an economically relevant trait in beef cattle. Among the molecular regulatory mechanisms, microRNAs (miRNAs) are an important dimension in post-transcriptional regulation and have been associated with different biological pathways. Here, we performed differential miRNAs expression and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) to better understand the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in bovine skeletal muscle and liver. MiRNA and mRNA expression data were obtained from Nelore steers that were genetically divergent for RFI (N = 10 [low RFI or feed efficient]; N = 10 [high RFI or feed inefficient]). Differentially expressed and hub miRNAs such as bta-miR-486, bta-miR-7, bta-miR15a, bta-miR-21,... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: RFI; MiRNA; Gado Nelore; Beef cattle; Nellore; Skeletal muscle. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099755 An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. Repositório Alice OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A.. Residual Feed Intake (RFI) is an economically relevant trait in beef cattle. Among the molecular regulatory mechanisms, microRNAs (miRNAs) are an important dimension in post-transcriptional regulation and have been associated with different biological pathways. Here, we performed differential miRNAs expression and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) to better understand the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in bovine skeletal muscle and liver. MiRNA and mRNA expression data were obtained from Nelore steers that were genetically divergent for RFI (N = 10 [low RFI or feed efficient]; N = 10 [high RFI or feed inefficient]). Differentially expressed and hub miRNAs such as bta-miR-486, bta-miR-7, bta-miR15a, bta-miR-21,... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: MicroRNAs; Residual Feed Intake; Gado Nelore; Beef cattle; Nellore; Skeletal muscle. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102149 Análise de qualidade de RNA para estudo do perfil transcriptômico de animais extremos para eficiência alimentar da raça Nelore. Repositório Alice SERRA, V.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A.. Editado por Ana Rita de Araújo nogueira, simone Cristina Méo Nicura Tipo: Separatas Palavras-chave: Perfil transcriptômico; Raça Nelore.; RNA.. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/965648 Associação de SNPs com características de carcaça em uma população da raça Canchim. Repositório Alice MOKRY, F. B.; LIMA, A. O. de; URBINATI, I.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; HIGA, R. H.; REGITANO, L. C. de A.. Foram genotipados 400 animais Canchim que apresentavam fenótipos para área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS). Após o controle de qualidade, foi realizado análise de associação dos SNPs com AOL e EGS por meio da metodologia de RandomForest. Os 400 indivíduos foram também reamostrados 10 vezes formando grupos de 200 indivíduos mais representativos e menos aparentados. Foi criado um grupo de SNPs contendo apenas os SNPs que foram selecionados em todas as análises, considerados os SNPs mais robustos totalizando 197 SNPs para AOL e 162 SNPs para EGS. Após o ajuste de uma regressão selecionou-se um conjunto de 20 SNPs para AOL com R2=0,59 e um conjunto de 17 SNPs para EGS com R2=0,49. Esses SNPs ainda precisam ser validados para... Tipo: Separatas Palavras-chave: Espessura de gordura; Subcutânea; Randomforest.; Carne; Gado de Corte.. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/943064 Associação de SNPs com características de carcaça em uma população da raça Canchim. Repositório Alice MOKRY, F. B.; LIMA, A. O. de; URBINATI, I.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; HIGA, R. H.; REGITANO, L. C. de A.. Resumo: Foram genotipados 400 animais Canchim que apresentavam fenótipos para área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS). Após o controle de qualidade, foi realizado análise de associação dos SNPs com AOL e EGS por meio da metodologia de RandomForest. Os 400 indivíduos foram também reamostrados 10 vezes formando grupos de 200 indivíduos mais representativos e menos aparentados. Foi criado um grupo de SNPs contendo apenas os SNPs que foram selecionados em todas as análises, considerados os SNPs mais robustos totalizando 197 SNPs para AOL e 162 SNPs para EGS. Após o ajuste de uma regressão selecionou-se um conjunto de 20 SNPs para AOL com R2=0,59 e um conjunto de 17 SNPs para EGS com R2=0,49. Esses SNPs ainda precisam ser validados... Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Área de olho de lombo; Bovino de corte; Espessura de gordura subcutânea; Random forest; Ribeye area; Backfat; Single nucleotide polymorphism; Beef cattle. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/946729 Associação entre variantes cis regulatórias do gene KCNJ11e características econômicas em bovinos Nelore. Repositório Alice OLIVEIRA, K. S. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; REGITANO, L. C. de A.. Características de produção como eficiência alimentar e de qualidade da carne bovina são de suma importância para o agronegócio, agroindústria e consumidores. Assim, ferramentas biotecnológicas como a genômica podem adicionar informações para identificar potenciais biomarcadores com a finalidade de auxiliar os programas de melhoramento e seleção de bovinos de corte. Tipo: Separatas Palavras-chave: SNP; Expressão gênica; Sítio de ligação de fator de transcriçã0; Ilha CpG; Qualidade da carne; Bos Indicus. Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1115556 Association analyses pointed the TIPARP as a potential candidate gene influencing residual feed intake variation in Nelore cattle. Repositório Alice LIMA, A. O. de; OLIVEIRA, P. S. N. de; TIZIOTO, P. C.; AFONSO, J.; SOMAVILLA, A. L.; DINIZ, W. J. da S.; SILVA, J. V. da; ROCHA, M. I. P.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Haplótipo; SNPs; Gado de corte; Gado nelore; Haplotypes; Nellore. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1056239 Co-expression network analysis identifies genes associated with iron content in bovine muscle. Repositório Alice DINIZ, W. J. da S.; CESAR, A. S. M.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; AFONSO, J.; ROCHA, M. I. P.; LIMA, A. O. de; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti, ESALQ/USP; Wellison Jarles da Silva Diniz, UFSCar. Tipo: Separatas Palavras-chave: Network analysis; Systems biology.; Gene expression.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075630 Co-expression network analysis identifies genes associated with meat tenderness. Repositório Alice DINIZ, W. J. da S.; CESAR, A. S. M.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; AFONSO, J.; ROCHA, M. I. P.; LIMA, A. O. de; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tenderness is an important trait of meat quality and is known to be influenced by several factors including genetic composition. Tipo: Separatas Palavras-chave: Network analysis; System biology.; Gene expression.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1080848 Differentially expressed genes in Longissimus dorsi muscle of Nelore steers divergent for average daily gain. Repositório Alice SILVA, J. V. da; TIZIOTO, P. C.; NEUBERN, P. S. N. de; AFONSO, J.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: RNA-seq; ADG; Gado Zebu; Zebu. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1056895 Genes diferencialmente expressos no músculo Longissimus dorsi de novilhos nelore divergentes para eficiência bruta. Repositório Alice SILVA, J. V. da; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; AFONSO, J.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: RNA-seq; Eficiência alimentar.; Bos Indicus.. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1054252 Genetic regulators of mineral amount in Nelore cattle muscle predicted by a new co-expression and regulatory impact factor approach. Repositório Alice AFONSO, J.; FORTES, M. R. S.; REVERTER, A.; DINIZ, W. J. da S.; CESAR, A. S. M.; LIMA, A. O. de; PETRINI, J.; SOUZA, M. de S.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. A.; REGITANO, L. C. de A.. Mineral contents in bovine muscle can affect meat quality, growth, health, and reproductive traits. To better understand the genetic basis of this phenotype in Nelore (Bos indicus) cattle, we analysed genome-wide mRNA and miRNA expression data from 114 muscle samples. The analysis implemented a new application for two complementary algorithms: the partial correlation and information theory (PCIT) and the regulatory impact factor (RIF), in which we included the estimated genomic breeding values (GEBVs) for the phenotypes additionally to the expression levels, originally proposed for these methods. We used PCIT to determine putative regulatory relationships based on significant associations between gene expression and GEBVs for each mineral amount. Then, RIF... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Expressão gênica; Bos Indicus; Gado Nelore; Cattle; Gene expression. Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1124802 Genome-wide association study for backfat thickness in Canchim beef cattle using Random Forest approach. Repositório Alice MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; LIMA, A. O. de; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B. da; CARDOSO, F. F.; OLIVEIRA, M. M. de; URBINATI, I.; NICIURA, S. C. M.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.. Background: Meat quality involves many traits, such as marbling, tenderness, juiciness, and backfat thickness, all of which require attention from livestock producers. Backfat thickness improvement by means of traditional selection techniques in Canchim beef cattle has been challenging due to its low heritability, and it is measured late in an animal?s life. Therefore, the implementation of new methodologies for identification of single nucleotide polymorphisms (SNPs) linked to backfat thickness are an important strategy for genetic improvement of carcass and meat quality. Results: The set of SNPs identified by the random forest approach explained as much as 50% of the deregressed estimated breeding value (dEBV) variance associated with backfat thickness,... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Metabolismo lipídico; Aprendizado de máquina; Inteligência artificial; Machine learning; Tecido adiposo subcutâneo.; Gado de Corte.; Single nucleotide polymorphism; Beef cattle; Lipid metabolism; Artificial intelligence; Subcutaneous fat. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/977539 Genome-wide association study for backfat thickness in Canchim beef cattle using Random Forest approach. Repositório Alice MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; LIMA, A. O. de; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B.; CARDOSO, F. F.; OLIVEIRA, M. M. de O.; URBINATI, I.; NICIURA, S. C. M.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.. Article 47. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Bovino. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/959917 Genome-wide association study for backfat thickness in Canchim beef cattle using Random Forest approach. Repositório Alice MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; LIMA, A. O. de; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B.; CARDOSO, F. F.; OLIVEIRA, M. M. de; URBINATI, I.; NICIURA, S. C. M.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.. Meat quality involves many traits, such as marbling, tenderness, juiciness, and backfat thickness, all of which require attention from livestock producers. Backfat thickness improvement by means of traditional selection techniques in Canchim beef cattle has been challenging due to its low heritability, and it is measured late in an animal?s life. Therefore, the implementation of new methodologies for identification of single nucleotide polymorphisms (SNPs) linked to backfat thickness are an important strategy for genetic improvement of carcass and meat quality. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Machine learning; Tropical composition cattle; Bovino; Lipid metabolism; Subcutaneous fat. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/959968 Identification of a pleiotropic locus for beef quality and feed efficiency in cattle using bi-trait genome-wide association analysis. Repositório Alice BUSS, C. E.; PETRINI, J.; MOURAO, G. B.; GEISTLINGER, L.; WOLF, J. B.; DINIZ, W. J. da S.; ROCHA, M. I. P.; AFONSO, J.; LIMA, A. O. de; TIZIOTO, P. C.; TULLIO, R. R.; ANDRADE, B. G.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti, ESALQ/USP; Wellison Jarles da Silva Diniz, UFSCar. Tipo: Separatas Palavras-chave: Feed efficiency; Genome?wide association.; Lipolysis; Pleiotropy.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075651 Identification of genes associated with copper-deficient fatty acid increase in Nelore cattle. Repositório Alice AFONSO, J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; SILVA, J. V. da; BUSS, C. E.; GROMBONI, C. F.; MOURAO, G. B.; NOGUEIRA, A. R. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Genome regulation.; Gene expression; Meat production.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079227 Identification of pleiotropic loci for daily weight gain and intramuscular fat in cattle using bivariate genome-wide association analysis. Repositório Alice BUSS, C. E.; DINIZ, W. J. da S.; ANDRADE, B. G.; LIMA, A. O. de; GEISTLINGER, L.; AFONSO, J.; TULLIO, R. R.; TIZIOTO, P. C.; PETRINI, J.; COUTINHO, L. L.; WOLF, J. B.; MOURAO, G. B.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Feed efficiency; Transcription factor.; Pleiotropy.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079239 Registros recuperados: 37 Primeira ... 1 2 ... Última

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