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A gene-transcription factor network associated with residual feed intake based on SNVs/InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds. Repositório Alice
VERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B..
The aim of this study was to analyze whole-genome re-sequencing data focusing on SNVs and InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds related to RFI. Thus, genes showing SNVs/InDels in TF binding sites (5' UTR variants) were used to search for TF related to feed intake and to generate a gene-TF network for RFI across two purebred and one admixed dairy cattle breeds. Moreover, we were able to perform a comparative analysis accessing similarities and dissimilarities at the genomic level across these breeds.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Sequência de dados; Single Nucleotide Variations (SNVs); Insertions/deletions (InDels); Whole-genome; Whole-genome re-sequencing data; Gado de Corte; Bos Indicus; Variação Genética; Cattle breeds.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105518
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Análise de genes diferencialmente expressos em resposta à infecção por Streptococcus agalactiae. Repositório Alice
CARVALHO, B. de O.; PEREIRA, H. P.; SEIBERLICK, O. S. G.; REIS, D. R. de L.; CARVALHO, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F..
Resumo: As doenças infectocontagiosas estão entre os problemas que mais acarretam prejuízos econômicos na pecuária brasileira e mundial, sendo a mastite a principal enfermidade acometida aos bovinos. A mastite pode ser definida como uma inflamação da glândula mamária que é causada, mais frequentemente, por micro-organismos patogênicos ambientais ou contagiosos. Podendo culminar na redução da quantidade e no comprometimento da qualidade do leite, podendo levar até a perda total da potencialidade secretora da glândula mamaria do animal infectado ou mesmo a sua morte. Estudos relacionados aos mecanismos de resposta e resistência de animais à mastite foram realizados a fim de contribuir para a compreensão dos mecanismos genéticos de resistência e resposta a...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: CD 14; NFKBIA; PCR em tempo real; Resposta inflamatória; STAT3.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1111976
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Análise de RFLP em cultura de calos de milho (Zea mays L.) e suas plantas regeneradas. Repositório Alice
MARTINS, M. F.; VASCONCELOS, M. J. V.; CARVALHO, C. H. S.; PAIVA, E..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Genética..
Ano: 1992 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/478605
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Análise eletroforética microluídica "Lab-on-a-chip" das proteinas do leite para detectar adulteração de leite bovino adicionado com soro. Repositório Alice
SANTOS, A. S. DE O; MEURER, V. M.; PINTO, I. S. B.; NASCIMENTO, L. S. DE Q.; BORGES, C. A. V.; EGITO, A. S. do; FURTADO, M. A. M.; MARTINS, M. F..
[Lab-on-a-chip microfluidic electrophoretic analisys of milk proteins to detect additional whey in bovine milk adulteration].
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Adulteração do leite; Métodos de análise; Identificação do leite; Milk protein.; Cow milk; Feed adulteration; Caprino; Leite de cabra; Adulteração; Eletroforese; Análise química; Proteína; Goat milk; Electrophoresis; Analytical methods..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1033593
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Avaliação de abordagens estatísticas para análise da expressão gênica diferencial em dados reais de RNA-seq Repositório Alice
SBARDELLA, A. P; FONSECA, I.; WELLER, M. A. DEL C. A.; STAFUZZA, N. B.; OLIVEIRA, J. R.; WATANABE, R. N.; COSTA, R, M. da; CARVAJAL, A. B.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MUNARI, D. P..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Expressão diferencial; Bovinos de leite; Sequenciamento.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1072447
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Banco de DNA de Bovinos: avaliação de metodologias alternativas para extração de DNA. Repositório Alice
BRION, C. T.; SANTOS, L. B.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Genética molecular bovinos; Métodos de extração.; DNA..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1034534
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Calcium partition in Minas Padrão cheese and its bioaccessibility during ripening time. Repositório Alice
PEREIRA, J. P. F.; MAGESTE, A. C.; CAMPOS, N. DA S.; SOUSA, R. A. DE; FRANCISQUINI, J. A.; PERRONE, I. T.; CARVALHO, A. F. DE; NUNES, R. M.; MARTINS, M. F.; SILVA, P. H. DA F. DA.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Minerals; Cheeses; Calcium.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118149
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Características físico-químicas e microbiológicas de queijo de coalho produzido no Ceará. Repositório Alice
COSTA, R. G. B.; SÁ, J. F. O. de; BORGES, M. de F.; MARTINS, M. F.; MOREIRA, G. de M. M.; COSTA JÚNIOR, L. C. G..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Queijo coalho; Bactérias patogênicas.; Contaminação..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1029289
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Comparação de parâmetros bioquímicos e celulares de bezerros taurinos e zebuínos ao nascimento: implicações clínicas e associação com fenótipos de resistência contra carrapatos. Repositório Alice
LOURES, C.; SOARES, G.; SOARES, I. K. de A.; CUNHA FILHO, J. A. da; DOMINGUES, R.; GASPAR, E. B.; REIS, D. R. de L.; CAMPOS, M. M.; MARTINS, M. F.; PRATA, M. C. de A.; MACHADO, M. A.; CARVALHO, W. A..
Bovinos taurinos e zebuínos apresentam respostas fenotípicas contrastantes de resistência à endo e ectoparasitas, como o carrapato Rhipicephalus microplus. Para caracterização da resposta imune que medeia esses fenótipos antes da exposição ao carrapato bovino foram feitas análises dos parâmetros celulares e bioquímicos em neonatos holandeses (taurino) e Gir (zebuíno), antes do recebimento de colostro. O hematócrito, volume globular, hemoglobina e leucometria global apresentaram-se significativamente diminuídos em animais holandeses. Esses mesmos bezerros também apresentaram número maior de picos febris, indicativo de inflamação sistêmica, quando comparados aos animais Gir, sugerindo que a rusticidade de animais zebuínos pode ser inata e estar associada com...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Resposta imune; Parâmetro bioquímico; Gado Gir; Gado Holandês; Bezerro; Rhipicephalus microplus.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1134687
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Comparação de parâmetros celulares e bioquímicos de sangue periférico de vacas taurinas (Holandês) e zebuínas (Gir) no pós-parto imediato. Repositório Alice
SOARES, G.; LOURES, C.; SOARES, I. K. de A.; CUNHA FILHO, J. A. da; DOMINGUES, R.; GASPAR, E. B.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; PRATA, M. C. de A.; MACHADO, M. A.; CARVALHO, W. A.; CAMPOS, M. M..
Bovinos taurinos e zebuínos apresentam características de resistência a endo e ectoparasitas e estresse térmico distintas em cada raça, estando altamente correlacionado com a evolução das espécies em regiões europeias e tropicais, respectivamente. O desenvolvimento de resposta imune, com participação de células e fatores bioquímicos, medeia alterações metabólicas e fisiológicas que refletem nos fenótipos apresentados, sendo de extrema importância caracterizar esses fenômenos imunológicos. Nesse sentido, foram comparados parâmetros celulares e bioquímicos de sangue periférico de vacas taurinas (Holandês) e zebuínas (Gir) no pós-parto imediato. Foram detectadas diferenças significativas na concentração de hemoglobina corpuscular média (CHCM), no número de...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Raça taurina; Raça zebuína; Resposta imune; Carrapato; Raça; Gado Holandês; Gado Gir.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1134691
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Comparação dos métodos manual e automatizado de extração de DNA no Laboratório de Genética Molecular. Repositório Alice
MARTINS, S. A. V.; FONSECA, I.; VIEIRA, F. de O.; MENDONÇA, J. F. M. de; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Material genético; Método automatizado.; Qualidade..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1042766
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Desempenho do girolando nos rebanhos do nordeste do Brasil. Infoteca-e
FREITAS, A. F. DE; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A.; SANTOS, K. C. L. dos; SILVA, M. V. G. B..
bitstream/item/126301/1/Cnpgl-2014-Girolando-Desempenho.pdf
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Rusticidade; Precocidade; Produção de leite.; Cruzamento..
Ano: 2014 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/991836
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Desenvolvimento de teste de genotipagem em bovinos para o SNP A1/A2 do gene da beta caseína, usando a técnica de tetra-primer ARMS-PCR. Repositório Alice
MALUF, V. H. H. K.; LIMA, T. R. de; CAMPOS, R. A.; SOARES, I. K. de A.; PEREIRA, H. P.; DOMINGUES, R.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A..
O leite é um alimento rico em nutriente e proteínas, sendo um alimento muito importante na saúde humana. A beta caseína é uma das proteínas mais abundantes no leite bovino, e 12 variantes já foram descritas na literatura. As mais encontradas são as variantes A1 e A2, que diferem entre si por uma troca de nucleotídeo (SNP), que acarreta uma troca de aminoácido. A digestão da beta caseína A1 no trato gastrintestinal humano tem como um de seus produtos finais um peptídeo bioativo denominado beta casomorfina 7, que foi relacionado a várias doenças em humanos. Amostras de DNA de touros da raça Girolando, previamente genotipados para este SNP, foram usados para o desenvolvimento de uma metodologia de genotipagem por tetra-primer ARMS-PCR. Após várias...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Beta-caseína; A1A2; Genotipagem; ARMS-PCR; Bovino.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1134696
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Detecção de células viáveis de patógenos em queijo Minas Padrão pela técnica de PCR em Tempo Real. Repositório Alice
MENDONÇA, J. F. M. de; VIEIRA, F. de O.; FONSECA, I.; ARCURI, E. F.; RIBEIRO, J. B.; BORGES, M. de F.; MARTINS, M. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Micro-organismos patogênicos; Derivados lácteos; QPCR; Viabilidade.; Ema..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1029283
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Detecção de células viáveis de Salmonella spp. em queijo Coalho pela técnica de PCR em Tempo Real. Repositório Alice
VIEIRA, F. de O.; MENDONÇA, J. F. M. de; FONSECA, I.; ARCURI, E. F.; RIBEIRO, J. B.; MARTINS, M. F..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: EMA-PCR; Metodologias moleculares; Segurança do alimento.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1033998
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Detection of potential genetic variants affecting gene function in Guzerat cattle. Repositório Alice
ZERLOTINI NETO, A.; STAFUZZA, N. B.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B..
Guzerat is a dual-purpose breed recognized for important traits to its adaptation to adverse tropical environments such as resistance to parasites, heat tolerance and ability to intake forage with low nutritional value. Once genetic variation responsible for this traits has so far not been well characterized, the aim of this study was to identity single nucleotide variants (SNVs) and insertion/deletions (Indels) in Guzerat cattle breed from whole genome re-sequencing in order to characterize loss-of-function variants which could be associated with complex traits in this cattle breed.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Bioinformática; Single nucleotide variants; Bioinformatics; Cattle.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1067540
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Detection of viable Salmonella Typhimurium and Staphylococcus aureus in coalho cheese by real-time PCR. Repositório Alice
MENDONÇA, J. F. M. DE; VIEIRA, F. DE O.; FONSECA, I.; RIBEIRO, J. B.; ARCURI, E. F.; BORGES, M. DE F.; BORGES, C. A. V.; SÁ, J. F. O. DE; MARTINS, M. F..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Lacticínios; Viabilidade celular; Agentes intercalantes de DNA; Doenças transmitidas por alimentos; Microrganismos patogênicos; Cell viability; Dairy products.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116341
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Development of tetra-primer ARMS-PCR protocol to genotype the prolactin receptor SNP 39136666 and assessment of this SNP in Brazilian locally adapted cattle breeds. Repositório Alice
REIS, D. R. de L.; PEREIRA, H. P.; EGITO, A. A. do; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; KIM, E. S.; SONSTEGARD, T. S.; MARTINS, M. F.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A..
Communication.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Gado.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1134440
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DNA proviral do Vírus da Artrite Encefalite Caprina (CAEV) em sêmen durante infecção aguda e crônica. Repositório Alice
SOUZA, K. C.; ANDRIOLI, A.; PINHEIRO, R. R.; SIDER, L. H.; MARTINS, M. F.; MOTTA, I. G. B.; PEIXOTO, R. M.; TEIXEIRA, M. F. S..
Resumo: Sabe-se que o Vírus da Artrite Encefalite Caprina (CAEV) é transmitido pela via reprodutiva, portanto, faz-se necessário um entendimento da dinâmica do CAEV no sêmen de reprodutores tanto na infecção aguda como em infecção crônica. Para a previsão da magnitude do CAEV no sêmen e o tempo de máximo risco da transmissão sexual do lentivírus. Para tanto, 11 reprodutores caprinos (n = 5) recentemente infectados e (n = 6) em fase crônica da infecção tiveram sêmen coletado ao longo de três meses. O DNA das amostras foi extraído utilizando QIAamp DNA mini kit (QIAgen, USA) de acordo com as instruções do fabricante. Dois rounds da reação em cadeia da polimerase nested (nPCR) foram realizados para amplificar um fragmento de 185pb do DNA proviral do CAEV com...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Gag gene; Provirus; Recent infection; Caprino; Transmissão de Doença; Caprine arthritis encephalitis virus; Sexually transmitted diseases.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107403
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Efeito da temperatura das amostras de leite na concentração de cálcio solúvel e de beta-caseina: interferencia no teste de estabilidade frente ao etanol. Repositório Alice
COSTA, F. F.; BRITO, M. A. V. P. e; SOUZA, G. N. de; PEREIRA, D. B. C.; PINTO, I. S. B.; MARTINS, M. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Qualidade bicrobiologica.; Contaminação Bacteriana; Etanol; Glândula Mamaria..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/986757
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