SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

VERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B..

The aim of this study was to analyze whole-genome re-sequencing data focusing on SNVs and InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds related to RFI. Thus, genes showing SNVs/InDels in TF binding sites (5' UTR variants) were used to search for TF related to feed intake and to generate a gene-TF network for RFI across two purebred and one admixed dairy cattle breeds. Moreover, we were able to perform a comparative analysis accessing similarities and dissimilarities at the genomic level across these breeds.

Análise de genes diferencialmente expressos em resposta à infecção por Streptococcus agalactiae.

Palavras-chave: Sequência de dados; Single Nucleotide Variations (SNVs); Insertions/deletions (InDels); Whole-genome; Whole-genome re-sequencing data; Gado de Corte; Bos Indicus; Variação Genética; Cattle breeds.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105518

CARVALHO, B. de O.; PEREIRA, H. P.; SEIBERLICK, O. S. G.; REIS, D. R. de L.; CARVALHO, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F..

Resumo: As doenças infectocontagiosas estão entre os problemas que mais acarretam prejuízos econômicos na pecuária brasileira e mundial, sendo a mastite a principal enfermidade acometida aos bovinos. A mastite pode ser definida como uma inflamação da glândula mamária que é causada, mais frequentemente, por micro-organismos patogênicos ambientais ou contagiosos. Podendo culminar na redução da quantidade e no comprometimento da qualidade do leite, podendo levar até a perda total da potencialidade secretora da glândula mamaria do animal infectado ou mesmo a sua morte. Estudos relacionados aos mecanismos de resposta e resistência de animais à mastite foram realizados a fim de contribuir para a compreensão dos mecanismos genéticos de resistência e resposta a...

Análise eletroforética microluídica "Lab-on-a-chip" das proteinas do leite para detectar adulteração de leite bovino adicionado com soro.

Palavras-chave: CD 14; NFKBIA; PCR em tempo real; Resposta inflamatória; STAT3.

Ano: 2019

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1111976

SANTOS, A. S. DE O; MEURER, V. M.; PINTO, I. S. B.; NASCIMENTO, L. S. DE Q.; BORGES, C. A. V.; EGITO, A. S. do; FURTADO, M. A. M.; MARTINS, M. F..

[Lab-on-a-chip microfluidic electrophoretic analisys of milk proteins to detect additional whey in bovine milk adulteration].

Avaliação de abordagens estatísticas para análise da expressão gênica diferencial em dados reais de RNA-seq

Palavras-chave: Adulteração do leite; Métodos de análise; Identificação do leite; Caprino; Leite de cabra; Adulteração; Eletroforese; Análise química; Proteína; Goat milk; Cow milk; Feed adulteration; Electrophoresis; Milk protein; Analytical methods.

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1033593

SBARDELLA, A. P; FONSECA, I.; WELLER, M. A. DEL C. A.; STAFUZZA, N. B.; OLIVEIRA, J. R,; WATANABE, R. N.; COSTA, R, M. da; CARVAJAL, A. B.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MUNARI, D. P..

2017

Banco de DNA de Bovinos: avaliação de metodologias alternativas para extração de DNA.

Palavras-chave: Expressão diferencial; Bovinos de leite; Sequenciamento.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1072447

BRION, C. T.; SANTOS, L. B.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A..

2015

Calcium partition in Minas Padrão cheese and its bioaccessibility during ripening time.

Palavras-chave: Genética molecular bovinos; DNA; Métodos de extração.

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1034534

PEREIRA, J. P. F.; MAGESTE, A. C.; CAMPOS, N. DA S.; SOUSA, R. A. DE; FRANCISQUINI, J. A.; PERRONE, I. T.; CARVALHO, A. F. DE; NUNES, R. M.; MARTINS, M. F.; SILVA, P. H. DA F. DA.

bitstream/item/208143/1/Artigo-Marta-Minas-Padrao.pdf

Características físico-químicas e microbiológicas de queijo de coalho produzido no Ceará.

Palavras-chave: Minerals; Cheeses; Calcium.

Ano: 2019

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118149

COSTA, R. G. B.; SÁ, J. F. O. de; BORGES, M. de F.; MARTINS, M. F.; MOREIRA, G. de M. M.; COSTA JÚNIOR, L. C. G..

Comparação dos métodos manual e automatizado de extração de DNA no Laboratório de Genética Molecular.

Palavras-chave: Queijo coalho; Contaminação; Queijo coalho; Contaminação; Bactérias patogênicas.

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1029289

MARTINS, S. A. V.; FONSECA, I.; VIEIRA, F. de O.; MENDONÇA, J. F. M. de; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B..

2015

Controle de qualidade em queijo minas padrão : métodos físico-químicos, microbiológicos e moleculares.

Palavras-chave: Material genético; Qualidade; Método automatizado.

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1042766

COSTA, R. G. B.; MARTINS, M. F.; MENDONÇA, J. F. M. DE; BORGES, M. DE F..

bitstream/item/206817/1/Livro-queijo-minas-2019.pdf

Tipo: Livro científico (ALICE)

Palavras-chave: Produtos lácteos; Microbiologia alimentar; Segurança de alimentos.

Ano: 2019

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116679

Desempenho do girolando nos rebanhos do nordeste do Brasil.

FREITAS, A. F. DE; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A.; SANTOS, K. C. L. dos; SILVA, M. V. G. B..

bitstream/item/126301/1/Cnpgl-2014-Girolando-Desempenho.pdf

Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Rusticidade; Precocidade; Produção de leite.; Cruzamento..

Ano: 2014

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/991836

Detecção de células viáveis de Salmonella spp. em queijo Coalho pela técnica de PCR em Tempo Real.

VIEIRA, F. de O.; MENDONÇA, J. F. M. de; FONSECA, I.; ARCURI, E. F.; RIBEIRO, J. B.; MARTINS, M. F..

2015

Detection of potential genetic variants affecting gene function in Guzerat cattle.

Palavras-chave: EMA-PCR; Metodologias moleculares; Segurança do alimento.

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1033998

ZERLOTINI NETO, A.; STAFUZZA, N. B.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B..

Guzerat is a dual-purpose breed recognized for important traits to its adaptation to adverse tropical environments such as resistance to parasites, heat tolerance and ability to intake forage with low nutritional value. Once genetic variation responsible for this traits has so far not been well characterized, the aim of this study was to identity single nucleotide variants (SNVs) and insertion/deletions (Indels) in Guzerat cattle breed from whole genome re-sequencing in order to characterize loss-of-function variants which could be associated with complex traits in this cattle breed.

Detection of viable Salmonella Typhimurium and Staphylococcus aureus in coalho cheese by real-time PCR.

Palavras-chave: Bioinformática; Single nucleotide variants; Bioinformatics; Cattle.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1067540

MENDONÇA, J. F. M. DE; VIEIRA, F. DE O.; FONSECA, I.; RIBEIRO, J. B.; ARCURI, E. F.; BORGES, M. DE F.; BORGES, C. A. V.; SÁ, J. F. O. DE; MARTINS, M. F..

bitstream/item/206473/1/ART19051.pdf

DNA proviral do Vírus da Artrite Encefalite Caprina (CAEV) em sêmen durante infecção aguda e crônica.

Palavras-chave: Lacticínios; Viabilidade celular; Agentes intercalantes de DNA; Doenças transmitidas por alimentos; Microrganismos patogênicos; Cell viability; Dairy products.

Ano: 2019

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116341

SOUZA, K. C.; ANDRIOLI, A.; PINHEIRO, R. R.; SIDER, L. H.; MARTINS, M. F.; MOTTA, I. G. B.; PEIXOTO, R. M.; TEIXEIRA, M. F. S..

Resumo: Sabe-se que o Vírus da Artrite Encefalite Caprina (CAEV) é transmitido pela via reprodutiva, portanto, faz-se necessário um entendimento da dinâmica do CAEV no sêmen de reprodutores tanto na infecção aguda como em infecção crônica. Para a previsão da magnitude do CAEV no sêmen e o tempo de máximo risco da transmissão sexual do lentivírus. Para tanto, 11 reprodutores caprinos (n = 5) recentemente infectados e (n = 6) em fase crônica da infecção tiveram sêmen coletado ao longo de três meses. O DNA das amostras foi extraído utilizando QIAamp DNA mini kit (QIAgen, USA) de acordo com as instruções do fabricante. Dois rounds da reação em cadeia da polimerase nested (nPCR) foram realizados para amplificar um fragmento de 185pb do DNA proviral do CAEV com...

Efeito da temperatura das amostras de leite na concentração de cálcio solúvel e de beta-caseina: interferencia no teste de estabilidade frente ao etanol.

Palavras-chave: Gag gene; Provirus; Recent infection; Caprino; Transmissão de Doença; Caprine arthritis encephalitis virus; Sexually transmitted diseases.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107403

COSTA, F. F.; BRITO, M. A. V. P. e; SOUZA, G. N. de; PEREIRA, D. B. C.; PINTO, I. S. B.; MARTINS, M. F..

2014

Efeito de diferentes fontes energéticas da dieta sobre a produção de metano utilizando a técnica de fermentação ruminal ex situ (microrúmen).

Palavras-chave: Contaminação bacteriana; Etanol; Glandula mamaria; Qualidade bicrobiologica.

Ano: 2014

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/986757

MARTINS, M. F.; SOLÓRZANO, L. A. R.; PERNA JÚNIOR, F.; BERNDT, A.; CASTRO, A. L. de; FERREIRA, F. A.; PINEDO, L. A.; RODRIGUES, P. H. M..

O objetivo do experimento foi avaliar o efeito de diferentes fontes energéticas da dieta sobre a fermentação ruminal em bovinos. O delineamento adotado foi o quadrado latino 3x3 replicado, com período de 16 dias e 3 tratamentos: Controle: Dieta de baixo extrato etéreo; Soja: Dieta de alto extrato etéreo (inclusão de 15% de soja grão); Polpa: Dieta de baixo extrato etéreo e alta participação de pectina (inclusão de 15% de polpa cítrica). As coletas de conteúdo ruminal foram realizadas no 16º dia experimental, sendo realizadas antes, 3, 6, 9 e 12 horas após a alimentação matinal. Utilizou-se a técnica de fermentação ruminal ex situ, a qual consiste em incubar frascos de penicilina contendo conteúdo ruminal sólido e líquido em banho termostático por 30min....

Effect of inclusion or non-inclusion of short lactations and cow and/or dam genetic group on genetic evaluation of Girolando dairy cattle.

Palavras-chave: Ácidos graxos de cadeia curta; Fermentação ruminal; Gases de efeito estufa; Grãos de soja; Polpa cítrica.

Ano: 2012

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/939510

CANAZA-CAYO, A. W.; SILVA, M. V. G. B.; COBUCI, J. A.; MARTINS, M. F.; LOPES, P. S..

The objective of this study was to evaluate the effects of inclusion or non-inclusion of short lactations and cow (CGG) and/or dam (DGG) genetic group on the genetic evaluation of 305-day milk yield (MY305), age at first calving (AFC), and first calving interval (FCI) of Girolando cows. Covariance components were estimated by the restricted maximum likelihood method in an animal model of single trait analyses. The heritability estimates for MY305, AFC, and FCI ranged from 0.23 to 0.29, 0.40 to 0.44, and 0.13 to 0.14, respectively, when short lactations were not included, and from 0.23 to 0.28, 0.39 to 0.43, and 0.13 to 0.14, respectively, when short lactations were included. The inclusion of short lactations caused little variation in the variance...

Estrutura populacional da raça Girolando.

Palavras-chave: Genetic group; Girolando; Heritability; Short lactation; Variance components.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1053168

CANAZA-CAYO, A. W.; LOPES, P. S.; SILVA, M. V. G. B.; COBUCI, J. A.; TORRES, R. de A.; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A..

O objetivo neste estudo foi avaliar a estrutura genética da população de bovinos da raça Girolando no Brasil. Analisou-se o arquivo de pedigree de 26.969 animais, composto de 3.031 machos e 23.938 fêmeas. A partir dos coeficientes estimados, pode-se concluir que a endogamia nos rebanhos da raça Girolando foi de pequena magnitude e que as práticas de acasalamento foram adequadas durante o período avaliado. No entanto, é importante continuar com o monitoramento desses coeficientes a fim de prevenir perda de variabilidade genética.

Expressed sequenced tags profiling of resistant and susceptible Gyr x Holstein cattle infested with the tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus.

Palavras-chave: Coeficiente de endogamia; Raça Girolando; Tamanho efetivo populacional.

Ano: 2014

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1006603

NASCIMENTO, C.S.; MACHADO, M. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F.; PEIXOTO, J. de O.; FURLONG, J.; PRATA, M. C. de A.; VERNEQUE, R. da S.; TEODORO, R. L.; LOPES, P. S..

Tick resistance in cattle is mainly found in zebu (Bos indicus) animals, although it is also present in some taurine (B. taurus) breeds. In order to characterize functional genes involved in tick resistance/susceptibility in cattle, two cDNA libraries were generated using skin tissues of selected Holstein x Gyr animals. A total of 2700 high-quality reads from both resistant and susceptible cDNA were assembled into 458 sequences (contigs) and 834 singletons, with a mean size of 447.7 nucleotides. Assignment of homologous proteins by BLASTX revealed 790 (61.1%) and 300 (23.2%) hits in resistant and susceptible cDNA, respectively; 121 of these hits matched bovine proteins. A total of 502 (38.9%) unique sequences were found to have no significant homology with...