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Análise da diversidade genética de variedades tradicionais de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites. Repositório Alice
PRADO, G. S.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P. de; OLIVEIRA, J. P. de; COSTA, J. G. C. da; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
No Brasil, foi estabelecida, a partir da década de 70, uma rede de pesquisa com ênfase na conservação e uso dos recursos genéticos do feijoeiro comum. O banco de germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão detém aproximadamente 17.345 acessos, dos quais 4.325 são variedades tradicionais (VTs). Esses acessos representam uma rica fonte de genes que conferem adaptação a diferentes ambientes, resistência a doenças e propriedades agronômicas diferenciadas que podem ser exploradas por meio de técnicas moleculares que fornecem medidas bastante eficientes e diretas da variabilidade genética existente dentro e entre os acessos. Esse estudo teve como objetivo a avaliação da variabilidade genética de VTs de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites (SSRs).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/984476
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Análise da diversidade genética e estruturação populacional entre marcadores SSRs e SNPs em germoplasma de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
FARIA, B. M. S. de; MENEZES, I. P. P. de; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; COELHO, G. R. C.; BORBA, T. C. de O.; ABREU, A. G. de; BRONDANI, C.; BARROS, E. G. de; VIANELLO, R. P..
O objetivo desse estudo foi avaliar o poder de informação genética dos marcadores SSRs e SNPs para aplicações no melhoramento genético do feijoeiro comum.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético vegetal; Germoplasma; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/964150
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Análise de SSRs para retrocruzamento assistido visando introgressão do transgene de resistência ao VMDF. Repositório Alice
MOTA, A. P. S.; MENEZES, I. P. P. de; SOUZA, T. L. P. O. de; FARIA, J. C. de; VIANELLO, R. P..
O objetivo desse estudo foi o de identificar marcadores microssatélites (SSRs) polimórficos entre as cultivares Pérola e BRS Pontal, doadoras do evento 5.1, e as cultivares BRS Estilo, BRS Ametista, BRS Notável e BRS Esplendor, receptoras do transgene, bem como outras cultivares potenciais incluindo BRS Embaixador, Rudá, BRS Agreste, And 277, BRS MG Tesouro, BRSMG Realce, CNFP10729, BRS 9435 Cometa, BRS Horizonte e BRS Esteio.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Doença de planta; Virus; Marcador molecular.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/941377
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Caracterização de germoplasma cultivado de Phaseolus vulgaris que compõem ensaios de VCU utilizando marcadores microssatélites. Repositório Alice
MOTA, A. P. S.; MENEZES, I. P. P. de; VEIGA, M. M. A.; BRONDANI, C.; BORBA, T. C. de O.; PEREIRA, H. S.; VIANELLO, R. P..
O objetivo desse estudo foi o de caracterizar a variabilidade genética de linhagens de feijoeiro comum que compõem diversos ensaios de VCU do programa de melhoramento genético da Embrapa Arroz e Feijão utilizando marcadores microssatélites em sistemas de amplificação simultânea e detecção semi-automatizada dos perfis genéticos gerados.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Germoplasma; Marcador molecular; Melhoramento genético vegetal.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/912170
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Definição de metodologias associadas à utilização de marcadores moleculares associados à resistência a doenças em algodoeiros. Repositório Alice
MAGALHAES, F. O. da C.; CUNHA, N. O.; BARROSO, P. A. V.; SUASSUNA, N. D.; HOFFMANN, L. V.; ALLEM, L. N.; MENEZES, I. P. P. de; BRANQUINHO, A. A..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: GOSSYPIUM; ALGODÃO; MARCADORES MICROSSATÉLITES; SELEÇÃO ASSISTIDA; SEQUENCIADOR.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903678
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Diversidade genética entre cultivares de feijão carioca da Embrapa estimada com base em marcadores microssatélites. Repositório Alice
MOTA, A. P. S.; VIANELLO, R. P.; BATISTA, C. E. A.; MENEZES, I. P. P. de; SOUZA, T. L. P. O..
O objetivo desse estudo foi analisar a diversidade genética, por meio de 121 marcadores microssatélites, entre oito cultivares de feijão carioca desenvolvidas e lançadas no Brasil pela Embrapa, são elas: BRS Notável, BRS Estilo, BRS Ametista, BRS Pontal, BRS Horizonte, BRS Cometa, Pérola e Cometa.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético vegetal; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/964154
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Estrutura e diversidade genética de cultivares de arroz do Banco de Germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão lançadas entre os anos de 1983-2005. Repositório Alice
COELHO, G. R. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; MENEZES, I. P. P. de; BORBA, T. C. de O.; MENDONÇA, J. A.; RODRIGUES, L. A.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade de 29 cultivares, lançadas por programas de melhoramento genético de arroz do Brasil entre os anos de 1983 e 2005, por meio de 24 marcadores microssatélites.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diversidade gênica; Discriminação de cultivar; Recurso genético; Banco de germoplasma; Arroz; Variedade; Marcador genético.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1064619
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Genetic diversity of arboreal cotton populations of the Brazilian semiarid: a remnant primary gene pool for cotton cultivars. Repositório Alice
MENEZES, I. P. P. de; HOFFMANN, L. V.; LIMA, T. H. de; SILVA, A. R. da; LUCENA, V. S.; BARROSO, P. A. V..
Mocó cotton belong to the same species as the cultivated species, Gossypium hirsutum, and cultivated forms were mainly landraces but also developed as cultivars, bearing good fiber quality and drought tolerant when cropped as a perennial species. The northeast Brazil crop system based on this cotton type is finished, with a few small area planted in the three main States, where it was previously cultivated (Ceará, Paraíba, and Rio Grande do Norte), but in others, maintenance is accomplished by single dooryard plants. Plants were found in all visited Northeast Brazil municipalities, sometimes in the North of the country, and were collected for ex situ preservation and evaluation. Most of seeds had no fuzz (62.2%) and 94.6% of the genotypes presented spot in...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Algodão.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1082821
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Genetic diversity of Gossypium barbadense from the central Brazilian Amazon. Repositório Alice
HOFFMANN, L. V.; CARDOSO, K. C. M.; ROCHA, A. S. N. da C.; OLIVEIRA, A. I. D. de; ABREU, A. G. de; PEREIRA, C. C. de O.; MALAFAIA, G.; MENEZES, I. P. P. de.
The Amazon Basin is a center of diversity of Gossypium barbadense and the strategy for conservation of this genetic resource depends on the knowledge of the diversity maintained in Amazonas State. During two expeditions, in 2012 and 2014, plants were collected in ten municipalities in the state of Amazonas, in the central Brazilian Amazon region. The molecular diversity was estimated by SSR markers for 50 samples collected in 2012. The morphological diversity of 24 plants collected in 2014 was assessed ex situ and compared to that of 50 plants of the same and other cotton varieties from other Brazilian states. Most of plants evaluated in situ in Amazonas had purple petioles and veins (82%), associated to medicinal use, and kidney seeds (78%). The ex situ...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Recurso genético; Algodão; Gossypium barbadense; Genetic resources; Cotton.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1086630
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Genetic diversity of high performance cultivars of upland and irrigated Brazilian rice. Repositório Alice
COELHO, G. R. C.; BRONDANI, C.; HOFFMANN, L. V.; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. de O.; MENDONCA, J. A.; RODRIGUES, L. A.; MENEZES, I. P. P. de.
The objective of this study was to analyze the diversity and discrimination of high-performance Brazilian rice cultivars using microsatellite markers. Twenty-nine rice cultivars belonging to EMBRAPA Arroz e Feijão germplasm bank in Brazil were genotyped by 24 SSR markers to establish their structure and genetic discrimination. It was demonstrated that the analyzed germplasm of rice presents an expressive and significant genetic diversity with low heterogeneity among the cultivars. All 29 cultivars were differentiated genetically, and were organized into two groups related to their upland and irrigated cultivation systems. These groups showed a high genetic differentiation, with greater diversity within the group that includes the cultivars for irrigated...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Banco de germoplasma; Recurso genético; Arroz; Irrigação; Marcador molecular; Genetic diversity; Genetic resources; Rice; Irrigation; Molecular marker.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1082851
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Genética populacional de Gossypium mustelinum presentes no Rio de Contas, Bahia, Brasil. Repositório Alice
MENEZES, I. P. P. de; HOFFMANN, L. V.; GAIOTTO, F. A.; CIAMPI, A. Y.; BARROSO, P. A. V..
Objetivou-se com este trabalho diagnosticar o modo de manutenção in situ e analisar a diversidade genética, por meio de marcadores de microssatélites, de populações de G. mustelinum presentes na bacia do rio de Contas da Bahia, Brasil.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bahia-BA; Diversidade genética; Algodão.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1052280
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Gossypium barbadense: an Approach for in Situ Conservation in Cerrado, Brazil. Repositório Alice
CASTRO, A. A.; HOFFMANN, L. V.; LIMA, T. H.; OLIVEIRA, A. I. D.; BRITO, R. R.; MENDES, L. de M. O.; PEREIRA, C. C. O.; MALAFAIA, G.; MENEZES, I. P. P. de.
Abandonment of planting of Gossypium barbadense has endangered its existence. The objective was to determine the characteristicof the maintenance of Gossypium barbadense in the Central-West Region of Brazil, with the aim to foster the conservation of the species. Expeditions were conducted in 2014-2015 in Southeast Goiás, where cotton collection has not been reported before. Data from previous collections in Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul and Distrito Federal available in Albrana database were considered this study. In the Central-West Region of Brazil, 466 accesses of G. barbadense were recorded, found most frequently in backyards (91.4%), but also spontaneous plants (7.5%), farm boundary (0.8%) and commercial farming (0.2%) have also been found....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Gossypium barbadense; Cerrado; Gossypium hirsutum; Algodão; Cotton.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066078
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In-depth genome characterization of a Brazilian common bean core collection using DArTseq high-density SNP genotyping. Repositório Alice
VALDISSER, P. A. M. R.; PEREIRA, W. J.; ALMEIDA FILHO, J. E.; MÜLLER, B. S. F.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P. de; VIANNA, J. P. G.; ZUCCHI, M. I.; LANNA, A. C.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; MORAES, A. da C.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
Background: Common bean is a legume of social and nutritional importance as a food crop, cultivated worldwide especially in developing countries, accounting for an important source of income for small farmers. The availability of the complete sequences of the two common bean genomes has dramatically accelerated and has enabled new experimental strategies to be applied for genetic research. DArTseq has been widely used as a method of SNP genotyping allowing comprehensive genome coverage with genetic applications in common bean breeding programs. Results: Using this technology, 6286 SNPs (1 SNP/86.5 Kbp) were genotyped in genic (43.3%) and non-genic regions (56. 7%). Genetic subdivision associated to the common bean gene pools (K = 2) and related to grain...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diversity arrays technology; Diversity analysis; Loci under selection; Core collection; Feijão; Phaseolus vulgaris; Genética vegetal; Linkage disequilibrium; Genotyping; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076278
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Molecular characterization of high performance inbred lines of Brazilian common beans. Repositório Alice
CARDOSO, P. C. B.; VEIGA, M. M.; MENEZES, I. P. P. de; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. O.; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
The identification of germplasm genetic variability in breeding programs of the common bean (Phaseolus vulgaris) is essential for determining the potential of each combination of parent plants to obtain superior genotypes. The present study aimed to estimated the extent of genetic diversity in 172 lineages and cultivars of the common bean by integrating five tests of value for cultivation and use (VCU) that were conducted over the last eight years by the breeding program of Embrapa Arroz e Feijão in Brazil. Nine multilocus genotyping systems composed of 36 fluorescent microsatellite markers distributed across 11 different chromosomes of the common bean were used, of which 24 were polymorphic in all trials. One hundred and eighty-seven alleles were...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético; Variação genética; Inbred lines; Genetic lines.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/953582
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Protocolo de extração de DNA e genotipagem de SSRs em larga escala para uso no melhoramento do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). Infoteca-e
VALDISSER, P. A. M. R.; MOTA, A. P. S.; BUENO, L. G.; MENEZES, I. P. P. de; COELHO, G. R. C.; MAGALHÃES, F. O. da C.; VIANELLO, R. P..
O objetivo deste comunicado é o de ajustar e estabelecer procedimentos laboratoriais de extração de DNA e genotipagem molecular em larga escala favorecendo a implementação de uma rotina eficiente de seleção assistida por marcadores pelo programa de melhoramento genético do feijoeiro comum.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Protocolo de extração; Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético vegetal; Extração; DNA; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/957563
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