SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

RAMOS, E. Z.; MIDORIKAWA, G. E. O.; FAVARO, L. C. de L.; SILVA, A. S. da; GOTTSCHALK, L. M. F.; BON, E. P. S..

The use of lignocellulosic materials that are the constituents of the plant cell wall have shown to be a great opportunity for sustainable industrial development. The polysaccharide part of these materials, the cellulose and the hemicellulose, can be degraded into their monomeric sugars by microorganisms, such as Trichoderma harzianum, that secrete extracellular enzymes. However, the industrial production of hydrolytic enzymes rely on the development of molecular biology tools to achieve the economical production of enzyme pools with greater hydrolytic potential. In this work the fungus T. harzianum (CFAM-422) was transformed by Agrobacterium tumefaciens and a herbicide was used as a selective agent, making it an efficient strategy to obtain strains with...

Analysis of the transcriptome in Aspergillus tamarii during enzymatic degradation of sugarcane bagasse.

Palavras-chave: Biologia Molecular; Biologia de Sistemas Aplicadas a Bioprocessos; Trichoderma harzianum.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076996

MIDORIKAWA, G. E. O.; CORREA, C. L.; NORONHA, E. F.; FERREIRA FILHO, E. X.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G..

bitstream/item/183671/1/Midorikawa-et-al-2018-Frontiers-in-Bioengineering-and-Biotechnology.pdf

Caracterização enzimática e identificação molecular de fungos endofíticos de Paullinia cupana var. sorbilis E Rhizophora mangle.

Palavras-chave: Carbohydrate-active enzymes; XlnR; Sugar transporters; ClrA; Aspergillus tamarii; Transcriptome; Lignocellulose; Bioethanol.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096563

PEIXOTO, J. S. G.; PEREIRA, V. M.; JARAMILLO, P. M. D.; MIDORIKAWA, G. E. O.; MELO, I. S.; AZEVEDO, J. L.; PEREIRA, J. O.; SILVA, F. M.; FAVARO, L. C. de L..

2016

Caracterização molecular de transformantes de Trichoderma lentiforme CFAM-422 visando à identificação de genes envolvidos na clivagem de polissacarídeos.

Palavras-chave: Bioprospecção; Fungos; Celulases.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1062580

FELIX, R. A.; MIDORIKAWA, G. E. O.; SILVA, A. S.; BOM, E. P. da S.; FAVARO, L. C. de L..

bitstream/item/163918/1/Paginas-de-Anais-IV-EnPI3-23-28.pdf

Characterization of Aspergillus flavus strains from Brazilian Brazil nuts and cashew by RAPD and ribosomal DNA anlysis.

Palavras-chave: Mutagênese insercional; Transformação mediada por Agrobacterium tumefaciens; Melhoramento genético; Fungos filamentosos.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075762

MIDORIKAWA, G. E. O.; PINHEIRO, M. R. R.; VIDIGAL, B. S.; ARRUDA, M. C.; COSTA, F. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; RIBEIRO, S. G.; FREIRE, F.; MILLER, R. N. G..

bitstream/item/177841/1/SP-19618-ID-30903.pdf

Characterization of Aspergillus species on Brazil nut from the Brazilian Amazonian region and development of a PCR assay for identification at the genus level.

Palavras-chave: Controle; Micotoxins; Aspergillus Flavus.

Ano: 2008

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/190632

MIDORIKAWA, G. E. O.; SOUZA, M. de L. M. de; SILVA, O. F.; DIAS, J. do S. A.; KANZAKI, L. I. B.; HANADA, R. E.; MESQUITA, R. M. L. C.; GONCALVES, R. C.; ALVARES, V. de S.; BITTENCOURT, D. M. de C.; MILLER, R. N. G..

Brazil nut is a protein-rich extractivist tree crop in the Amazon region. Fungal contamination of shells and kernel material frequently includes the presence of aflatoxigenic Aspergillus species from the section Flavi. Aflatoxins are polyketide secondary metabolites, which are hepatotoxic carcinogens in mammals. The objectives of this study were to identify Aspergillus species occurring on Brazil nut grown in different states in the Brazilian Amazon region and develop a specific PCR method for collective identification of member species of the genus Aspergillus. Results:Polyphasic identification of 137 Aspergillus strains isolated from Brazil nut shell material from cooperatives across the Brazilian Amazon states of Acre, Amapá and Amazonas revealed five...

Determinação de agente seletivo para seleção de transformantes de Trichoderma lentiforme CFAM-422.

Palavras-chave: Castanha do brasil; Amazônia; Doença de planta; Castanha do pará; Bertholletia excelsa; Fungo; Identificação; Aspergillus flavus; Aflatoxina; Plant diseases and disorders; Brazil nuts; Fungi; Pathogen identification; Enfermedades y desórdenes de las plantas; Nuez del Brasil; Identificación de patógenos.

Ano: 2014

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/987473

RAMOS, E. Z.; ARAÚJO, J. C.; MIDORIKAWA, G. E. O.; SILVA, A. S. da.; GOTTSCHALK, L. M. F.; FAVARO, L. C. de L.; BON, E. P. da S..

Disruption of the glucose repressor gene cre1 in Trichoderma harzianum CFAM-422 and its effect on plant cell wall degrading enzymes production.

Palavras-chave: Trichoderma lentiforme; Transformação genética; Método de seleção.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075969

TAMIETTI, M. S.; MIDORIKAWA, G. E. O.; MENDES, T. D.; DAMASO, M. C. T.; BOM, E. P. S.; SILVA, A. S.; GOTTSCHALK, L. M. F.; NORONHA, E. F.; FAVARO, L. C. de L..

2017

Enhancement of Trichoderma harzianum CFAM-422 for cellulase and hemicellulase production by deletion of the carbon catabolite repressor gene cre1.

Palavras-chave: Trichoderma harzianum; Produção de enzima.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1071796

TAMIETTI, M. S.; MIDORIKAWA, G. E. O.; MENDES, T. D.; DAMASO, M. C. T.; BOM, E. P. S.; SILVA, A. S.; GOTTSCHALK, L. M. F.; NORONHA, E. F.; FAVARO, L. C. de L..

Carbon catabolite repression (CCR) is a mechanism by which microorganisms can utilize preferably highly energetic compounds over those of difficult degradation. For Trichoderma reesei, the protein that acts as repressor in the presence of glucose is CRE1. In this project, we aim to delete cre1 gene in Trichoderma harzianum CFAM-422 and obtain mutants with enhanced production of biomass degrading enzymes. Disruption of cre1 in T. harzianum CFAM-422 was performed by gene replacement of cre1 for hph (hygromycin B phosphotransferase) via homologous recombination. Hygromycin resistant mutants and parental strains enzyme production was evaluated in both inductive and repressive conditions in four different carbon sources. Enzymatic indexes (EI) were determined...

Exploring fungal biodiversity in Brazil for natural colorants production.

Palavras-chave: Celulase; Processos de hidrolise enzimática de biomassa; Trichoderma harzianum; Carbon Catabolite Repression; Cellulolytic and hemicellulolytic enzymes.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076994

SAMPAIO, B. L.; MIDORIKAWA, G. E. O.; SILVA, C. A. L.; SANTOS, L. C. Z.; OLIVEIRA, P. A. de.

The objectives of this study were to select novel pigment-producing fungal strains, characterize the major colored metabolites in the selected crude extracts, and evaluate the extracts for their stability to light, pH, and temperature.

Isolamento de leveduras endofíticas de folhas de melancia e seu potencial biotecnológico.

Palavras-chave: Fermentação submersa; Fungo; Biodiversidade; Fermentação; Fungi; Biodiversity; Anthraquinones; Submerged fermentation; Food coloring.

Ano: 2020

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1126349

ISHIZAWA, T. A.; MIDORIKAWA, G. E. O.; CAMPOS, F. S.; PARRIÃO, B. C.; FAVARO, L. C. de L.; AGUIAR, R. W. de S..

bitstream/item/184537/1/EnPI-2018-34.pdf

Molecular identification of member species of Aspergillus section flavi contaminating brazilnut material from Acre and Amazonas.

Palavras-chave: Endófitos; Leveduras; Citrullus Lanatus.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097643

TRINDADE, L. de S.; MIDORIKAWA, G. E. O.; MESQUITA, R. M. L. C.; BITTENCOURT, D. de C. M.; GONCALVES, R. C.; MILLER, R. N. G..

Identificaçao molecular de especies membros do Aspergillus seçao flavi contaminantes de castanha do brasil nos estados de Acre e Amazonas.

Percepção das cores com ImageJ: elaboração de um guia para análise de imagens de microrganismos produtores de corantes naturais.

Palavras-chave: Castanha-do-Brasil.

Ano: 2012

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/932890

FALCAO, R.; FRANCO, P. F.; CONCEIÇÃO, A. A.; MIDORIKAWA, G. E. O.; SIQUEIRA, F. G. de; OLIVEIRA, P. A. de; FAVARO, L. C. de L..

As cores são vistas pelos olhos humanos que traduzem a informação baseada em suas percepções e preferências. As cores podem ser entendidas como fótons percebidos da luz do dia onde vermelho corresponde a fótons de luz de comprimento longo (baixa frequência), amarelo e verde intermediários e azul comprimento de onda curto (alta frequência). Dessa forma a cor pode ser quantificada e analisada em sistemas de computador para determinar a quantidade de vermelho, verde e azul presente em cada cor. Este trabalho teve como objetivo criar uma estratégia baseada em análise de imagem digital para identificação das cores de microrganismos visando auxiliar a seleção de linhagens produtoras de corantes sem a necessidade de manipulação das amostras.

Prospecção, seleção e identificação de bactérias produtoras de corantes.

Palavras-chave: Espectrofotômetro; Imagem digital; Microrganismo; Corante; Colorimetria; Microorganisms; Dyes; Colorimetry; Digital images.

Ano: 2020

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1127718

MIDORIKAWA, G. E. O.; SANTOS, L. C. Z.; OLIVEIRA, P. A. de; FAVARO, L. C. de L..

Os corantes naturais podem ser extraídos de uma variedade de plantas, animais e microrganismos. A maioria dos corantes naturais utilizados para diferentes fins é produzida a partir de plantas, entretanto, pigmentos extraídos de plantas para uso industrial possuem o gargalo da produção, estabilidade e custo. Uma alternativa mais sustentável para a produção de corantes naturais é a via biotecnológica utilizando microrganismos. O conhecimento de técnicas de cultivo, processamento e facilidade de manipulação, tornam a produção de corantes por microrganismos em larga escala um atrativo para a indústria de cosméticos, de alimentos, têxtil, de pintura, entre outras. Este trabalho apresenta a prospecção de uma coleção de bactérias associadas a plantas nativas e...

Transcriptome profiling-based analysis of carbohydrate-active enzymes in Aspergillus terreus involved in plant Bbomass degradation.

Palavras-chave: Metabólicos secundários; Bioprospecção; Corante; Biotecnologia; Microrganismo; Bactéria.

Ano: 2020

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1127761

CORRÊA, C. L.; MIDORIKAWA, G. E. O.; FERREIRA FILHO, E. X.; NORONHA, E. F.; ALVES, G. S. C.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G..

bitstream/item/217530/1/fbioe-08-564527.pdf

Transformação de Trichoderma harzianum BRM27158 por Agrobacterium tumefaciens e caracterização de uma biblioteca de transformantes.

Palavras-chave: Lignocellulosic biomass; Biorefinery; Carbohydrate-active enzymes; Aspergillus terreus; Transcriptome.

Ano: 2020

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1126336

TAMIETTI, M. S.; MIDORIKAWA, G. E. O.; JARAMILLO, P. M. D.; CUNHA, D. C. da.; NUNES, J. F. R.; FAVARO, L. C. de L.; NORONHA, E. F..

bitstream/item/184534/1/EnPI-2018-32.pdf

Transformação mediada por Agrobacterium tumefaciens do fungo celulótico Trichoderma harzianum CFAM422 e obtenção de uma biblioteca de transformantes.

Palavras-chave: Transformação mediada por Agrobacterium; NRPS; Controle Biológico; Trichoderma.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097640

SHIMIZU, A. M. F.; JARAMILLO, P. M. D.; MIDORIKAWA, G. E. O.; SILVA, A. S.; BON, E. P. S.; FAVARO, L. C. de L..

2015