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Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of Trichoderma harzianum CFAM-422 using an herbicide resistance gene as selection marker. Repositório Alice
RAMOS, E. Z.; MIDORIKAWA, G. E. O.; FAVARO, L. C. de L.; SILVA, A. S. da; GOTTSCHALK, L. M. F.; BON, E. P. S..
The use of lignocellulosic materials that are the constituents of the plant cell wall have shown to be a great opportunity for sustainable industrial development. The polysaccharide part of these materials, the cellulose and the hemicellulose, can be degraded into their monomeric sugars by microorganisms, such as Trichoderma harzianum, that secrete extracellular enzymes. However, the industrial production of hydrolytic enzymes rely on the development of molecular biology tools to achieve the economical production of enzyme pools with greater hydrolytic potential. In this work the fungus T. harzianum (CFAM-422) was transformed by Agrobacterium tumefaciens and a herbicide was used as a selective agent, making it an efficient strategy to obtain strains with...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Biologia de Sistemas Aplicadas a Bioprocessos.; Biologia Molecular; Trichoderma Harzianum..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076996
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Analysis of the transcriptome in Aspergillus tamarii during enzymatic degradation of sugarcane bagasse. Repositório Alice
MIDORIKAWA, G. E. O.; CORREA, C. L.; NORONHA, E. F.; FERREIRA FILHO, E. X.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G..
Na publicação: Orzenil Bonfim Silva-Junior.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Carbohydrate-active enzymes; XlnR; Sugar transporters; ClrA; Aspergillus tamarii; Transcriptome; Lignocellulose; Bioethanol.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096563
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Caracterização enzimática e identificação molecular de fungos endofíticos de Paullinia cupana var. sorbilis E Rhizophora mangle. Repositório Alice
PEIXOTO, J. S. G.; PEREIRA, V. M.; JARAMILLO, P. M. D.; MIDORIKAWA, G. E. O.; MELO, I. S.; AZEVEDO, J. L.; PEREIRA, J. O.; SILVA, F. M.; FAVARO, L. C. de L..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Bioprospecção; Fungos; Celulases.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1062580
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Caracterização molecular de transformantes de Trichoderma lentiforme CFAM-422 visando à identificação de genes envolvidos na clivagem de polissacarídeos. Repositório Alice
FELIX, R. A.; MIDORIKAWA, G. E. O.; SILVA, A. S.; BOM, E. P. da S.; FAVARO, L. C. de L..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Mutagênese insercional; Transformação mediada por Agrobacterium tumefaciens; Melhoramento genético; Fungos filamentosos.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075762
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Characterization of Aspergillus flavus strains from Brazilian Brazil nuts and cashew by RAPD and ribosomal DNA anlysis. Repositório Alice
MIDORIKAWA, G. E. O.; PINHEIRO, M. R. R.; VIDIGAL, B. S.; ARRUDA, M. C.; COSTA, F. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; RIBEIRO, S. G.; FREIRE, F.; MILLER, R. N. G..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Controle; Micotoxins; Aspergillus Flavus.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/190632
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Characterization of Aspergillus species on Brazil nut from the Brazilian Amazonian region and development of a PCR assay for identification at the genus level. Repositório Alice
MIDORIKAWA, G. E. O.; SOUZA, M. de L. M. de; SILVA, O. F.; DIAS, J. do S. A.; KANZAKI, L. I. B.; HANADA, R. E.; MESQUITA, R. M. L. C.; GONCALVES, R. C.; ALVARES, V. de S.; BITTENCOURT, D. M. de C.; MILLER, R. N. G..
Brazil nut is a protein-rich extractivist tree crop in the Amazon region. Fungal contamination of shells and kernel material frequently includes the presence of aflatoxigenic Aspergillus species from the section Flavi. Aflatoxins are polyketide secondary metabolites, which are hepatotoxic carcinogens in mammals. The objectives of this study were to identify Aspergillus species occurring on Brazil nut grown in different states in the Brazilian Amazon region and develop a specific PCR method for collective identification of member species of the genus Aspergillus. Results:Polyphasic identification of 137 Aspergillus strains isolated from Brazil nut shell material from cooperatives across the Brazilian Amazon states of Acre, Amapá and Amazonas revealed five...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Castanha do brasil; Enfermedades y desórdenes de las plantas; Nuez del Brasil.; Identificación de patógenos; Doença de planta; Castanha do pará; Bertholletia excelsa; Fungo; Identificação; Aspergillus flavus; Aflatoxina; Plant diseases and disorders; Brazil nuts; Fungi; Pathogen identification; Amazonia..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/987473
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Determinação de agente seletivo para seleção de transformantes de Trichoderma lentiforme CFAM-422. Repositório Alice
RAMOS, E. Z.; ARAÚJO, J. C.; MIDORIKAWA, G. E. O.; SILVA, A. S. da; GOTTSCHALK, L. M. F.; FAVARO, L. C. de L.; BON, E. P. da S..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Trichoderma lentiforme; Transformação genética; Método de seleção.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075969
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Disruption of the glucose repressor gene cre1 in Trichoderma harzianum CFAM-422 and its effect on plant cell wall degrading enzymes production. Repositório Alice
TAMIETTI, M. S.; MIDORIKAWA, G. E. O.; MENDES, T. D.; DAMASO, M. C. T.; BOM, E. P. S.; SILVA, A. S.; GOTTSCHALK, L. M. F.; NORONHA, E. F.; FAVARO, L. C. de L..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Produção de enzima.; Trichoderma Harzianum..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1071796
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Enhancement of Trichoderma harzianum CFAM-422 for cellulase and hemicellulase production by deletion of the carbon catabolite repressor gene cre1. Repositório Alice
TAMIETTI, M. S.; MIDORIKAWA, G. E. O.; MENDES, T. D.; DAMASO, M. C. T.; BOM, E. P. S.; SILVA, A. S.; GOTTSCHALK, L. M. F.; NORONHA, E. F.; FAVARO, L. C. de L..
Carbon catabolite repression (CCR) is a mechanism by which microorganisms can utilize preferably highly energetic compounds over those of difficult degradation. For Trichoderma reesei, the protein that acts as repressor in the presence of glucose is CRE1. In this project, we aim to delete cre1 gene in Trichoderma harzianum CFAM-422 and obtain mutants with enhanced production of biomass degrading enzymes. Disruption of cre1 in T. harzianum CFAM-422 was performed by gene replacement of cre1 for hph (hygromycin B phosphotransferase) via homologous recombination. Hygromycin resistant mutants and parental strains enzyme production was evaluated in both inductive and repressive conditions in four different carbon sources. Enzymatic indexes (EI) were determined...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Processos de hidrolise enzimática de biomassa; Carbon Catabolite Repression; Cellulolytic and hemicellulolytic enzymes.; Celulase; Trichoderma Harzianum..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076994
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Exploring fungal biodiversity in Brazil for natural colorants production. Repositório Alice
SAMPAIO, B. L.; MIDORIKAWA, G. E. O.; SILVA, C. A. L.; SANTOS, L. C. Z.; OLIVEIRA, P. A. de.
The objectives of this study were to select novel pigment-producing fungal strains, characterize the major colored metabolites in the selected crude extracts, and evaluate the extracts for their stability to light, pH, and temperature.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Fermentação submersa; Fungo; Biodiversidade; Fermentação; Fungi; Biodiversity; Anthraquinones; Submerged fermentation; Food coloring.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1126349
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Isolamento de leveduras endofíticas de folhas de melancia e seu potencial biotecnológico. Repositório Alice
ISHIZAWA, T. A.; MIDORIKAWA, G. E. O.; CAMPOS, F. S.; PARRIÃO, B. C.; FAVARO, L. C. de L.; AGUIAR, R. W. de S..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Endófitos; Leveduras; Citrullus Lanatus.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097643
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Molecular identification of member species of Aspergillus section flavi contaminating brazilnut material from Acre and Amazonas. Repositório Alice
TRINDADE, L. de S.; MIDORIKAWA, G. E. O.; MESQUITA, R. M. L. C.; BITTENCOURT, D. de C. M.; GONCALVES, R. C.; MILLER, R. N. G..
Identificaçao molecular de especies membros do Aspergillus seçao flavi contaminantes de castanha do brasil nos estados de Acre e Amazonas.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Castanha-do-Brasil.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/932890
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Percepção das cores com ImageJ: elaboração de um guia para análise de imagens de microrganismos produtores de corantes naturais. Repositório Alice
FALCAO, R.; FRANCO, P. F.; CONCEIÇÃO, A. A.; MIDORIKAWA, G. E. O.; SIQUEIRA, F. G. de; OLIVEIRA, P. A. de; FAVARO, L. C. de L..
As cores são vistas pelos olhos humanos que traduzem a informação baseada em suas percepções e preferências. As cores podem ser entendidas como fótons percebidos da luz do dia onde vermelho corresponde a fótons de luz de comprimento longo (baixa frequência), amarelo e verde intermediários e azul comprimento de onda curto (alta frequência). Dessa forma a cor pode ser quantificada e analisada em sistemas de computador para determinar a quantidade de vermelho, verde e azul presente em cada cor. Este trabalho teve como objetivo criar uma estratégia baseada em análise de imagem digital para identificação das cores de microrganismos visando auxiliar a seleção de linhagens produtoras de corantes sem a necessidade de manipulação das amostras.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Espectrofotômetro; Imagem digital; Microrganismo; Corante; Colorimetria; Microorganisms; Dyes; Colorimetry; Digital images.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1127718
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Prospecção, seleção e identificação de bactérias produtoras de corantes. Repositório Alice
MIDORIKAWA, G. E. O.; SANTOS, L. C. Z.; OLIVEIRA, P. A. de; FAVARO, L. C. de L..
Os corantes naturais podem ser extraídos de uma variedade de plantas, animais e microrganismos. A maioria dos corantes naturais utilizados para diferentes fins é produzida a partir de plantas, entretanto, pigmentos extraídos de plantas para uso industrial possuem o gargalo da produção, estabilidade e custo. Uma alternativa mais sustentável para a produção de corantes naturais é a via biotecnológica utilizando microrganismos. O conhecimento de técnicas de cultivo, processamento e facilidade de manipulação, tornam a produção de corantes por microrganismos em larga escala um atrativo para a indústria de cosméticos, de alimentos, têxtil, de pintura, entre outras. Este trabalho apresenta a prospecção de uma coleção de bactérias associadas a plantas nativas e...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Metabólicos secundários; Bioprospecção; Corante; Biotecnologia; Microrganismo; Bactéria.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1127761
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Selection of fungal strains for the bioconversion of biodiesel crude glycerol into citric acid. Repositório Alice
MENDES, T. D.; PACHECO, T. F.; BRAGA, S. C.; NAKAI, D. K.; MIDORIKAWA, G. E. O.; GONCALVES, S. B.; SALUM, T. F. C.; FAVARO, L. C. de L.; DAMASO, M. C. T..
Citric acid (CA) is one of the most valuable organic acids in the market as it can be used in diverse biotechnological applications, such as in the food industry, as flavoring agent and as food preservative, besides cosmetics, pharmaceuticals, and cleaning sectors. This acid can be produced by a biotechnological route and the most common producing microorganisms are filamentous fungi and yeasts (Amato, Becci and Beolchini, 2020). Considering that the Brazilian biodiesel production in 2021 was 6.76 million m3, and that 10 kg of crude glycerol are generated for each 100 kg of biodiesel produced, a large amount of that byproduct is available in the market. Then, the objective of this work was to screen filamentous fungi capable of producing citric acid from...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Ácido Orgânico; Ácido Cítrico; Food preservatives; Cosmetics; Pharmaceutical industry; Cleaning.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1148589
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Transcriptome profiling-based analysis of carbohydrate-active enzymes in Aspergillus terreus involved in plant Bbomass degradation. Repositório Alice
CORRÊA, C. L.; MIDORIKAWA, G. E. O.; FERREIRA FILHO, E. X.; NORONHA, E. F.; ALVES, G. S. C.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Lignocellulosic biomass; Biorefinery; Carbohydrate-active enzymes; Aspergillus terreus; Transcriptome.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1126336
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Transformação de Trichoderma harzianum BRM27158 por Agrobacterium tumefaciens e caracterização de uma biblioteca de transformantes. Repositório Alice
TAMIETTI, M. S.; MIDORIKAWA, G. E. O.; JARAMILLO, P. M. D.; CUNHA, D. C. da; NUNES, J. F. R.; FAVARO, L. C. de L.; NORONHA, E. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Transformação mediada por Agrobacterium; NRPS; Controle Biológico; Trichoderma.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097640
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Transformação mediada por Agrobacterium tumefaciens do fungo celulótico Trichoderma harzianum CFAM422 e obtenção de uma biblioteca de transformantes. Repositório Alice
SHIMIZU, A. M. F.; JARAMILLO, P. M. D.; MIDORIKAWA, G. E. O.; SILVA, A. S.; BON, E. P. S.; FAVARO, L. C. de L..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Trichoderma harzianum CFAM422.; Agrobacterium Tumefaciens..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1031356
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