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Genotipagem por meio de marcadores SNP em cevada (Hordeum vulgare): um estudo de caso em cultivares e populações resultantes de retrocruzamentos. Infoteca-e
MUDADU, M. de A.; LAU, E. Y.; PEREIRA, J. F.; MINELLA, E..
Este documento representa o primeiro passo no sentido de aumentar a utilização de marcadores SNP em cevada por grupos de pesquisa no Brasil. As formas de obtenção e análise dos dados são detalhadas utilizando-se estudo de caso sobre diversidade genética de cultivares e incorporação de um importante gene por meio de cruzamento e retrocruzamentos. Este relato aproveita a experiência de pesquisadores da Embrapa Trigo e da Embrapa Informática Agropecuária e abre a possibilidade para que milhares de marcadores SNP possam ser utilizados para diferentes finalidades, potencializando um melhoramento de cevada mais preciso e com maiores ganhos genéticos.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Marcador molecula; Chip SNP; Genotipagem; Melhoramento genético; Cevada; Hordeum Vulgare; Single nucleotide polymorphism; Genetic improvement; Genotyping.
Ano: 2019 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1116075
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Imputação de genótipos em bovinos: um guia passo a passo. Infoteca-e
MUDADU, M. de A.; CARVALHO, H. G. de; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F..
O programa de melhoramento genético no Brasil está implementando o uso de marcadores genéticos, um procedimento chamado seleção genômica (SG). SG consiste em genotipar uma população de referência com fenótipos conhecidos e na descoberta de marcadores genéticos associados. O efeito dos marcadores são estimados e validados de forma a tornar possível predizer os valores genéticos dos cadidatos à seleção baseado nos seus genótipos. A genotipagem de alta densidade tem custo elevado, de forma que usa-se genotipar a população de referência usando chips de alta densidade de marcadores e genotipar com menor custo os candidatos a seleção usando chips de baixa densidade de marcadores. A imputação de genótipos é então aplicada para expandir os dados de genotipagem dos...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Genotipagem em alta densidade; Imputação de genótipos; Bioinformática; Genotyping; Bioinformatics.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1064163
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PATERNITYHD versão 1.0 - um software para cálculo da probabilidade de exclusão de paternidade com dados de genotipagem em painel de alta densidade de SNPs em bovinos. Infoteca-e
MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; TIZIOTO, P. C..
bitstream/item/49701/1/Documentos103.pdf
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Bioinformática; Software; Paternidade.
Ano: 2011 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/908998
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