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Genome-wide identification of NBS resistance genes in Populus trichocarpa Inra
Kohler, A.; Rinaldi, C.; Duplessis, S.; Baucher, M.; Geelen, D.; Duchaussoy, F.; Meyers, BC; Boerjan, W.; Martin, F..
As the largest class of disease resistance R genes, the genes encoding nucleotide binding site and leucine-rich repeat proteins (“NBS-LRR genes”) play a critical role in defending plants from a multitude of pathogens and pests. The diversity of NBS-LRR genes was examined in the Populus trichocarpa draft genome sequence. The NBS class of genes in this perennial tree is large and diverse, comprised of ∼400 genes, at least twice the complement of Arabidopsis. The NBS family can be divided into multiple subfamilies with distinct domain organizations. It includes 119 Coiled-Coil-NBS-LRR genes, 64 TIR-NBS-LRR genes, 34 BED-finger-NBS-LRR, and both truncated and unusual NBS- and NBS-LRR-containing genes. The transcripts of only 34 NBS-LRR genes were detected in...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: Populus; NBS-LRR; Resistance.
Ano: 2008 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2010b08a4238&uri=/notices/prodinra1/2010/10/
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