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Agrupamento de progênies de diferentes matrizes de castanheira-do-Brasil quanto a germinação e desenvolvimento inicial. Repositório Alice
GIUSTINA, L. D.; BALDONI, A. B.; GREGOLIN, F. S.; TARDIN, F. D.; TONINI, H.; TEODORO, P. E.; NEVES, L. G..
A castanheira-do-brasil (Bertholletia excelsa Bonpl.) é uma espécie que apresenta barreiras em seu processo germinativo, sendo este considerado lento e desuniforme. Essas barreiras dificultam a produção de mudas, sendo um entrave na cadeia produtiva da espécie. O objetivo do estudo foi avaliar a uniformidade da germinação das sementes e o desenvolvimento inicial de progênies provenientes de diferentes árvores de castanheira-do-brasil, visando selecionar matrizes promissoras para a produção de mudas. Para isso, foram coletados 98 frutos provenientes de nove matrizes, previamente selecionadas no centro de uma parcela permantente, de uma população natural em Itaúba, MT. As sementes desses frutos foram plantadas em caixas de areia, e avaliados o número de dias...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bertholletia excelsa; Castanha do pará; Altura da planta.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1087224
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Agrupamento de progênies de diferentes matrizes de castanheira-do-Brasil quanto a germinação e desenvolvimento inicial. Repositório Alice
GIUSTINA, L. D.; BALDONI, A. B.; GREGOLIN, F. S.; TARDIN, F. D.; TONINI, H.; TEODORO, P. E.; NEVES, L. G..
A castanheira-do-brasil (Bertholletia excelsa Bonpl.) é uma espécie que apresenta barreiras em seu processo germinativo, sendo este considerado lento e desuniforme. Essas barreiras dificultam a produção de mudas, sendo um entrave na cadeia produtiva da espécie. O objetivo do estudo foi avaliar a uniformidade da germinação das sementes e o desenvolvimento inicial de progênies provenientes de diferentes árvores de castanheira-do-brasil, visando selecionar matrizes promissoras para a produção de mudas. Para isso, foram coletados 98 frutos provenientes de nove matrizes, previamente selecionadas no centro de uma parcela permantente, de uma população natural em Itaúba, MT. As sementes desses frutos foram plantadas em caixas de areia, e avaliados o número de dias...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bertholletia excelsa; Castanha do pará; Altura da planta.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1086881
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Análise preliminar de dados de sequenciamento por captura (Capture-seq na identificação de marcadores SNPs associados a tolerância à seca em arroz. Repositório Alice
VIEIRA, A. F.; VALDISSER, P. A. M. R.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; NEVES, L. G.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi analisar um conjunto de dados de sequenciamento de captura de 300 genótipos de arroz de terras altas para 2.500 unigenes previamente identificados como relacionados a tolerância à seca na espécie.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Marcador molecular; Resistência à seca.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066152
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Caracterização da divergência genética de sorgo sacarino na região de Cáceres-MT. Repositório Alice
OLIVEIRA, T. C. de; GONÇALVES, D. de L.; RODRIGUES, A. P. S.; BARELLI, M. A. A.; TARDIN, F. D.; NEVES, L. G..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sorghum bicolor; Variabilidade genética; Técnicas de agrupamento.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/992133
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Desenvolvimento de árvores de paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum) após 1 ano de plantio. Repositório Alice
BOTIN, A. A.; MARQUES, J. A. de B.; OLIVEIRA, F. L. de; SILVA, E. S. da; AWABDI, C. P.; SILVA, A. J. R.; TARDIN, F. D.; BALDONI, A. B.; NEVES, L. G..
O paricá é uma espécie florestal nativa da região Amazônica, muito utilizada na indústria madeireira, na recomposição de áreas degradadas, e também vem sendo aplicada em sistemas integrados de produção, pelas suas características favoráveis, como crescimento rápido e copa pouco adensada. Porém, ainda há uma grande escassez de informações sobre a espécie, principalmente sobre o desenvolvimento, manejo e utilizações. O objetivo desse trabalho foi avaliar o crescimento das árvores de paricá com 12 meses de idade, em um experimento estabelecido na Embrapa Agrossilvipastoril, com delineamento experimental em blocos ao acaso, com 4 repetições, 58 procedências e 5 plantas por procedência, com plantio no espaçamento 4 m x 4 m. Foram avaliadas a altura (m) e o...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mato Grosso; Sinop-MT; Paricá; Schizolobium Parahyba; Schizolobium Amazonicum.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1119797
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Dissimilaridade genética de genótipos regenerantes de Bertholletia excelsa Bonpl. Repositório Alice
GIUSTINA, L. D.; BALDONI, A. B.; TARDIN, F. D.; TONINI, H.; NEVES, L. G..
O uso de marcadores moleculares tem auxiliado os programas de melhoramento genético, principalmente com espécies perenes, como a castanheira-do-brasil (Bertholletia excelsa Bonpl.). A obtenção de informações sobre a heterogeneidade entre os indivíduos é importante para a seleção de genótipos superiores e contrastantes. A castanheira-do-brasil é uma espécie de importância econômica, pela comercialização de suas amêndoas, e há interesse em atividades voltadas ao melhoramento da espécie. Para tanto, o objetivo da pesquisa foi investigar a dissimilaridade genética entre genótipos regenerantes de castanheira-do-brasil. Os frutos para o plantio das sementes foram coletados de matrizes em uma parcela permanente de floresta nativa, no município de Itaúba, MT. O...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Microssatélites; Castanha do Para; Melhoramento Genético Vegetal.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1087203
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Dissimilaridade genética de genótipos regenerantes de Bertholletia excelsa Bonpl. Repositório Alice
GIUSTINA, L. D.; BALDONI, A. B.; TARDIN, F. D.; TONINI, H.; NEVES, L. G..
bitstream/item/168062/1/Dissimilaridade-genetica.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Microssatélite; Castanha do pará; Melhoramento genético vegetal.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1081366
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Diversidade nucleotídica e utilização de SNPs para o mapeamento de genes candidatos em Eucalyptus spp. Infoteca-e
NEVES, L. G.; FARIA, D. A. de.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PASQUALI, G.; GRATTAPAGLIA..
2008
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Eucalyptus spp; Eucalipto; Diversidade nucleotídica; SNP; Mapeamento genético.
Ano: 2008 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/191157
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Ganho de seleção no melhoramento genético intrapopulacional do maracujazeiro-amarelo. Repositório Alice
KRAUSE, W.; SOUZA, R. S. DOS; NEVES, L. G.; CARVALHO, M. L. DA S.; VIANA, A. P.; FALEIRO, F. G..
2012
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Maracujazeiro; Passiflora edulis; Índice de seleção.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/920757
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Genomic prediction in contrast to a genome-wide association study in explaining heritable variation of complex growth traits in breeding populations of Eucalyptus. Repositório Alice
MÜLLER, B. S. F.; NEVES, L. G.; ALMEIDA FILHO, J. E. de; RESENDE JUNIOR, M. F. R.; MUÑOZ, P. R.; SANTOS, P. E. T. dos; PALUDZYSZYN FILHO, E.; KIRST, M.; GRATTAPAGLIA, D..
Background: The advent of high-throughput genotyping technologies coupled to genomic prediction methods established a new paradigm to integrate genomics and breeding. We carried out whole-genome prediction and contrasted it to a genome-wide association study (GWAS) for growth traits in breeding populations of Eucalyptus benthamii (n =505) and Eucalyptus pellita (n =732). Both species are of increasing commercial interest for the development of germplasm adapted to environmental stresses. Results: Predictive ability reached 0.16 in E. benthamii and 0.44 in E. pellita for diameter growth. Predictive abilities using either Genomic BLUP or different Bayesian methods were similar, suggesting that growth adequately fits the infinitesimal model. Genomic...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genomic selection; GWAS; Seleção genômica; SNP genotyping; Espécie exótica; Eucalipto; Melhoramento genético vegetal; Eucalyptus benthamii; Eucalyptus pellita; Genetic relationships; Marker-assisted selection; Plant breeding.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1080149
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Genomic prediction in contrast to a genome-wide association study in explaining heritable variation of complex growth traits in breeding populations of Eucalyptus. Repositório Alice
MÜLLER, B. S. F.; NEVES, L. G.; ALMEIDA FILHO, J. E. de; RESENDE JUNIOR, M. F. R.; MUÑOZ, P. R.; SANTOS, P. E. T. dos; PALUDZYSZYN FILHO, E.; KIRST, M.; GRATTAPAGLIA, D..
Background: The advent of high-throughput genotyping technologies coupled to genomic prediction methods established a new paradigm to integrate genomics and breeding. We carried out whole-genome prediction and contrasted it to a genome-wide association study (GWAS) for growth traits in breeding populations of Eucalyptus benthamii (n =505) and Eucalyptus pellita (n =732). Both species are of increasing commercial interest for the development of germplasm adapted to environmental stresses. Results: Predictive ability reached 0.16 in E. benthamii and 0.44 in E. pellita for diameter growth. Predictive abilities using either Genomic BLUP or different Bayesian methods were similar, suggesting that growth adequately fits the infinitesimal model. Genomic...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genomic selection; GWAS; SNP genotyping; Genetic relationships; Seleção genômica; Eucalipto; Espécie exótica; Melhoramento genético vegetal; Eucalyptus benthamii; Eucalyptus pellita; Marker-assisted selection; Genetic relationships; Plant breeding.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1080081
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Genomic selection for growth traits in Eucalyptus benthamii and E. pellita populations using a genome-wide Eucalyptus 60K SNPs chip. Repositório Alice
MÜLLER, B. S. F.; NEVES, L. G.; RESENDE JÚNIOR, M. F. R.; MUÑOZ, P. R.; KIRST, M.; SANTOS, P. E. T. dos; PALUDZYSZYN FILHO, E.; GRATTAPAGLIA, D..
2015
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Eucalyptus; Espécie exótica; Espécie florestal; Seleção genômica; Melhoramento genético.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1022008
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Germinação de progênies de Bertholletia Excelsa bonpl. advindas de uma população natural. Repositório Alice
GIUSTINA, L. D.; GREGOLIN, F. S.; BALDONI, A. B.; TONINI, H.; NEVES, L. G..
Bertholletia excelsa Bonpl., a castanheira-do-brasil, é nativa da Floresta Amazônica e está na lista de espécies ameaçadas de extinção. É considerada uma planta modelo pelo uso de seus recursos (extração da castanha), mantendo a floresta de pé (Wadt et al., 2005). Quando se trata de romper a barreira física, ou seja, a quebra do ouriço para acessar as sementes, poucos são os animais que conseguem concluir esta tarefa. O principal dispersor é a cutia (Dasyprocta sp.) (Ortiz, 1995; Peres; Baider, 1997), animal capaz de roer e abrir o fruto a partir de um pequeno orifício existente em uma das extremidades. Parte das amêndoas é utilizada na alimentação das cotias, mas outra parte é enterrada para uso posterior. Algumas destas sementes são esquecidas, e com...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Itaúba; Mato Grosso; Bertholletia excelsa; Castanha do Pará; Germinação.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088799
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Hierarchical outcrossing among and within fruits in Bertholletia excelsa Bonpl. (Lecythidaceae) open-pollinated seeds. Repositório Alice
GUSTINA, L. D.; BALDONI, A. B.; TONINI, H.; AZEVEDO, V. C. R.; NEVES, L. G.; TARDIN, F. D.; SEBBENN, A. M..
Knowing the mating patterns is important to determine the number of trees necessary for seed collection for conservation ex situ, tree breeding and environmental reforestation purposes. We investigated B. excelsa individuals and fruits, to check mating system index variations in a population by using open-pollinated seeds which were hierarchically sampled within and among fruits from nine trees genotyped for ten microsatellite loci. Outcrossing rate ( tm ) changed between trees (0.49?1.0) and fruits (0.53?1.0), but seeds were predominantly produced by outcrossing (0.92) at mean population level. Mating between related trees ( tm  ts ) was detected in six trees (0.04?0.08) and in 32 fruits in trees (0.03?0.22), thus it suggests that the...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador Genético; Bertholletia Excelsa; Polinização; Semente; Melhoramento; Árvore; Conservação; Genética; Castanha do Para.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096307
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Identificação de marcadores SNPs associados à tolerância à deficiência hídrica em arroz por meio de sequenciamento de DNA por captura (CaptureSeq). Repositório Alice
VIEIRA, A. F.; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. de O.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; NEVES, L. G.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi identificar genes relacionados à tolerância à deficiência hídrica em arroz a partir de dados de sequenciamento de DNA e avaliação fenotípica em experimento de campo.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; DNA; Deficiência hídrica.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084573
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Independent and Joint-GWAS for growth traits in Eucalyptus by assembling genome-wide data for 3373 individuals across four breeding populations. Repositório Alice
MULLER, B. S. F.; ALMEIDA FILHO, J. E. de; LIMA, B. M.; GARCIA, C. C.; MISSIAGGIA, A.; AGUIAR, A. M.; TAKAHASHI, E.; KIRST, M.; GEZAN, S. A.; SILVA JUNIOR, O. B. da; NEVES, L. G.; GRATTAPAGLIA, D..
bitstream/item/189761/1/M-ller-et-al-2019-New-Phytologist.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genome-wide association study (GWAS); High-throughput SNP genotyping; Joint-GWAS; Regional heritability mapping (RHM); Relatedness; Eucalyptus; Meta-analysis.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1103026
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Mapeamento associativo para identificação de marcadores SNPs associados à tolerância à seca em arroz de terras altas. Repositório Alice
VIEIRA, A. F.; VALDISSER, P. A. M. R.; GUIMARÃES, C. M.; VIANELLO, R. P.; NEVES, L. G.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi identificar marcadores moleculares SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) associados à tolerância à seca por meio da metodologia de mapeamento associativo.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mapeamento; Arroz; Oryza Sativa; Marcador Molecular; Resistência a Seca.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1122611
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Marcadores SNPs derivados de captureseq associados a tolerância à seca em arroz. Repositório Alice
VIEIRA, A. F.; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. de O.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; NEVES, L. G.; BRONDANI, C..
Como parte do esforço de incorporar a tolerância à seca em genótipos elite do programa de melhoramento da Embrapa, esse trabalho objetivou identificar genes e alelos relacionados a esse caráter. O estudo foi realizado em 300 acessos de arroz de terras altas, avaliados quanto a tolerância à seca em experimentos de campo por 3 anos (2010 a 2012), e genotipados por sequenciamento de DNA por captura de 2.500 unigenes previamente identificados como relacionados à tolerância a deficiência hídrica, permitindo realizar um estudo de mapeamento associativo.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sequenciamento por captura; GWAS; SNPs; Arroz; Oryza sativa; Resistência a seca; Melhoramento genético vegetal.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078652
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Marcadores SNPs relacionados a tolerância à seca em arroz a partir do sequenciamento de 2500 genes candidatos. Repositório Alice
VIEIRA, A. F.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; CASTRO, A. P. de; NEVES, L. G.; BRONDANI, C..
Este trabalho objetivou identificar marcadores moleculares SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) relacionados com a tolerância à seca para uso na seleção assistida de genitores e linhagens do programa de melhoramento genético do arroz.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz Sequeiro; Oryza Sativa; Marcador Molecular; Drought tolerance.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1104830
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Marker-assisted elimination of drought-susceptible accessions in upland rice breeding. Repositório Alice
VIEIRA, A. F.; PANTALIÃO, G. F.; ABREU, F. M.; SILVEIRA, R. D.; GARCIA, A. L. B.; NEVES, L. G.; VIANELLO, R. P.; CASTRO, A. P. de; BRONDANI, C..
Breeding for water-deficit tolerance is fundamental to guarantee the sustainability of upland rice production, mainly due to the possibility of an increased frequency of drought episodes due to climate change. This work aimed to identify single nucleotide polymorphism (SNP) markers, derived from RNA sequencing (RNA-Seq), genome-wide association study (GWAS) and candidate genes from Arabidopsis, with potential for use in marker-assisted selection (MAS) for drought tolerance. RNA-Seq and GWAS were efficient in identifying useful SNP markers from the data obtained from three years of field experiments for 175 upland rice accessions, which were sequenced using 32 genes by Capture-Seq. Three genes were equally able to generate SNP markers that discriminated 95%...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Melhoramento genético vegetal; Resistência a seca; Rice; Genotyping by sequencing; Plant breeding; Genetic techniques and protocols; Single nucleotide polymorphism; Nucleotide sequences; Sequence analysis; Drought tolerance.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088846
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