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A Modified protocol for total RNA isolation from forage peanuts. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; CAMPOS, T. de.
The development of specific protocols for extraction of high-quality RNA are key advances in molecular techniques for elucidating biological processes and mechanisms. The forage peanut has significant economic value for use in mixed pastures. However, it is difficult to extract high-quality RNA from forage peanuts due to high contents of tannins, polysaccharides, and other secondary metabolites. Here, it is described an efficient method for obtaining high-quality, high-yield total RNA that is usable in downstream transcriptome analysis. This modifications helped eliminate the problems associated with the presence of high concentrations of secondary metabolites in forage peanut leaves, and lacked signs of degradation. O desenvolvimento de protocolos...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Amendoim forrageiro; Forage peanut; Cacahuetes forrajeros; Ácido ribonucleico; Metabólico secundário; Secondary metabolic; High quality; Alta calidad; RNA extraction; Extracción de ARN; Leguminosa Forrageira; Melhoramento Genético Vegetal; RNA; Extração; Rendimento; Qualidade; Forage legumes; Arachis pintoi; Plant breeding.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125058
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Análise conjunta do ensaio brasileiro de linhagens de aveia branca conduzido em 2011. Repositório Alice
PACHECO, M. T.; FEDERIZZI, L. C.; LÂNGARO, N. C.; ALMEIDA, J. L. de; OLIVEIRA, A. C. de; SILVA, J. A. G. da; OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. C. da; GODOY, R..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Aveia branca; Ensaio.; Linhagem..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/925975
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Análise conjunta dos ensaios regional e brasileiro de linhagens de aveia branca conduzidos entre 2008 e 2011. Repositório Alice
PACHECO, M. T.; FEDERIZZI, L. C.; LÂNGARO, N. C.; ALMEIDA, J. L. de; OLIVIEIRA, A. C. de; SILVA, J. A. D da; OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. C. da; RAMOS JÚNIOR, E. U.; GODOY, R.; OLIVIERA, P. H. de.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Aveia Branca; Linhagens.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/925921
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Análise do genoma funcional de Arachis pintoi e desenvolvimento de novos marcadores moleculares. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de.
O amendoim forrageiro (Arachis pintoi Krapov. e W.C. Greg.) tem apresentado resultados importantes na pecuária por seu alto valor nutritivo, o que tem contribuído no aumento da produção de leite, ganho de peso no gado de corte e redução no tempo de abate em até nove meses. Além disso, seu uso como cobertura verde em consórcios com culturas comerciais tem contribuído na redução da erosão, manutenção da umidade do solo, ciclagem de nutrientes, fixação biológica de nitrogênio e baixas emissões de óxido nitroso. O uso de sequenciamento nova geração (NGS) pode auxiliar no conhecimento da biologia da espécie e desenvolvimento de novas cultivares. O objetivo do presente trabalho foi analisar o genoma funcional de Arachis pintoi por meio de dados de RNA-Seq e...
Tipo: Teses Palavras-chave: Amendoim forrageiro; Forage peanut; Cacahuetes forrajeros; Marcador microssatélite; Genetic analysis; RNA-Seq; Leguminosas forrajeras; Fitomejoramiento; Polimorfismo de nucleótido simple; Repeticiones de microsatélite; Análisis genético; Leguminosa Forrageira; Melhoramento Genético Vegetal; Marcador Genético; Genoma; Análise; Forage legumes; Plant breeding; Genetic markers; Single nucleotide polymorphism; Microsatellite repeats; Genome.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1127550
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Avaliação da taxa de cruzamento de Arachis pintoi. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de; RUFINO, P. B.; AZÊVEDO, H. S. F. da S.; ASSIS, G. M. L. de; SEBBENN, A. M.; CAMPOS, T. de.
Uma das principais mudanças na paisagem amazônica é o desmatamento das florestas para implantação de pastagens. A espécie Arachis pintoi tem demonstrado um grande potencial na utilização em pastagens, tanto para recuperação de solo como para produção de forragem. O estudo avaliou a taxa de cruzamento natural de A. pintoi utilizando marcadores moleculares. A taxa de cruzamento multiloco (tm) e uniloco (ts) foram, respectivamente, 0,330 e 0,262, evidenciando um sistema de cruzamento misto (t<0,95) com predominância de autofecundação (66,9%). Um fator que pode contribuir para essa taxa de polinização cruzada é a presença de insetos polinizadores nas flores do amendoim forrageiro. Portanto, a taxa de cruzamento poderá ser utilizada para orientar as...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Amandoim forrageiro; Taxa de cruzamento.; Leguminosa Forrageira; Pastagem; Pecuária.; Arachis pintoi..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1036557
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Avaliação do desenvolvimento de maracujá-doce (Passiflora alata Dryander) propagado por estaquia e por semente em condições de pomar comercial. Repositório Alice
RONCATTO, G.; NOGUEIRA FILHO, G. C.; RUGGIERO, C.; OLIVEIRA, J. C. de; MARTINS, A. B. G..
O trabalho foi realizado na Área de Propagação de Fruteiras do Departamento de Produção Vegetal da Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Universidade Estadual Paulista (FCAV/UNESP), Jaboticabal-SP, e em área de produtor, no município de Araguari-MG, com o objetivo de verificar o potencial de crescimento vegetativo (diâmetro do caule, altura de plantas e número de folhas) de plantas de maracujá-doce (Passiflora alata Dryander), obtidas por estaquia e por semente, comparando o desenvolvimento inicial de plantas no campo. O experimento foi conduzido no período de janeiro de 2002 a fevereiro de 2003. A formação de mudas por semente foi realizada em casa de vegetação e, por estaca, em câmara de nebulização intermitente, sob condições de telado. As...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Maracujá doce; Passiflora alata Dryander; Semillas.; Estaquillas; Huertos frutales; Propagación vegetativa; Propagação vegetativa; Estaca; Semente; Planta; Crescimento; Pomar; Vegetative propagation; Plant cuttings; Seeds; Orchards..
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/510921
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Avaliação e comparação quantitativa de segmentações por meio do índice IAVAS. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de; LUIZ, A. J. B.; FORMAGGIO, A. R.; EPIPHANIO, J. C. N..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Sensoriamento remoto.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/15113
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Avaliação preliminar da perda de nutrientes por escoamento superficial numa microbacia do Córrego Tenente Amaral, Jaciara, MT. Repositório Alice
CALHEIROS, D. F.; JESUZ, C. R. de; CABRAL, I. L. L.; ZEILHOFER, P.; IORIS, A. R.; OLIVEIRA, M. D. de; OLIVEIRA, J. C. de.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Qualidade do solo.; Qualidade da Água..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1022884
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Características da água disponível para uso doméstico nos Assentamento 72, Ladário, Mato Grosso do Sul. Repositório Alice
OLIVEIRA, M. D. de; OLIVEIRA, J. C. de; FEIDEN, A..
Embora com baixa aptidão para a agricultura e pouca disponibilidade hídrica, na borda Oeste do Pantanal, nos municípios de Corumbá e Ladário, foram estabelecidos assentamentos rurais, onde a falta de água representa uma das principais limitações à produção de alimentos, e até à dessedentação, tanto para humanos, como para animais domésticos vem do lençol freático, por poços perfurados em rochas calcárias, o que confere à água característica ?salobra?. Neste estudo caracterizamos a química da água disponível para uso doméstico no assentamento 72, em Ladário, MS, visando dar informação à população sobre qual o tipo de água disponível e os riscos que o seu consumo apresenta à saúde. A água de 17 postos, coletada no próprio poço ou em torneira próxima, foi...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Qualidade de água; Dureza da água; Saude humana; Hardness water; Nitrate.; Nitrato.; Human health; Water quality..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1065840
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Características físicas de fruto de acessos do banco de germoplasma de camucamuzeiro da Embrapa Amazônia Oriental. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de; NASCIMENTO, W. M. O. do; RIBEIRO, O. D.; ALMEIDA, G. L. de.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Pará; Brasil; Camu-camu.; Fruto; Banco de germoplasma; Melhoramento genético vegetal; Reprodução vegetal; Fruta tropical.; Amazonia..
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/883395
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Caracterização de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro para o desenvolvimento de novos microssatélites. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAMPOS, T. de.
O uso do amendoim forrageiro (Arachis pintoi) em pastagens consorciadas com gramíneas tem importância econômica e ambiental. Avanços no programa de melhoramento da espécie podem ser obtidos com a ampla informação gerada pelo sequenciamento de segunda geração. A tecnologia de RNA-Seq permite obter extensa cobertura dos genes existentes no genoma com custo consideravelmente baixo. Os dados gerados possibilitam identificar novos marcadores, validar genes e rotas metabólicas. Atualmente existem poucos microssatélites disponíveis para o amendoim forrageiro. Assim, o objetivo deste trabalho foi desenvolver novos marcadores microssatélites a partir de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro. O RNA de duas cultivares (Belomonte e Amarillo MG-100) foi...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Pastos forrajeros; Forage peanut; Cacahuetes forrajeros; RNA-Seq; RNA sequencing; Belomonte; Amarillo MG-100; Genoma funcional; Cultivo mixto; Leguminosas forrajeras; Repeticiones de microsatélite; Análisis de secuencia; Embrapa Acre; Rio Branco (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental.; Amendoim forrageiro; Pastagem Consorciada; Marcador Genético; Banco de Germoplasma.; Leguminosa Forrageira; Gramínea Forrageira; Sequence analysis; Germplasm conservation.; Forage legumes; Arachis pintoi; Microsatellite repeats; Mixed cropping; Forage grasses.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125415
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Caracterização de novos microssatélites desenvolvidos a partir do transcriptoma de amendoim forrageiro. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, L. M. da; FORMIGHIERI, E. F.; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; CAMPOS, T. de.
O amendoim forrageiro tem ganhado cada vez mais importância devido às vantagens associadas ao seu uso. Entretanto, a quantidade de microssatélites disponíveis para a espécie ainda é restrita, o que tem sido um gargalo no avanço do programa de melhoramento. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho foi desenvolver e caracterizar novos microssatélites a partir do transcriptoma de folhas de Arachis pintoi. Foram testados 186 locos em 19 acessos. Os locos com os melhores perfis de amplificação (64) foram selecionados para avaliação de polimorfismo, dos quais 63 (98,4%) apresentaram perfis polimórficos, com média de 7,37 alelos por loco. Os valores médios de heterozigosidade esperada (HE) e observada (HO) foram 0,72 e 0,31, respectivamente. Os marcadores...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Amendoim forrageiro; Forage peanut; Cacahuetes forrajeros; Transcriptoma da folha; Fitomejoramiento; Leguminosas forrajeras; Repeticiones de microsatélite; Hojas; Variación genética; Conservación del germoplasma; Embrapa Acre; Rio Branco (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Melhoramento Genético Vegetal; Leguminosa Forrageira; Marcador Genético; Variação Genética; Banco de Germoplasma; Plant breeding; Forage legumes; Arachis pintoi; Genetic markers; Microsatellite repeats; Transcriptome; Leaves; Genetic variation; Germplasm conservation.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1145988
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Caracterização funcional do transcriptoma de amendoim forrageiro. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de; FORMIGHIERI, E. F.; GARCIA, A. L. B.; MARGARIDO, G. R. A.; CAMPOS, T. de.
O uso do amendoim forrageiro em consórcios com gramíneas nas pastagens e como cobertura verde, consorciado com culturas comerciais, tem crescido nos últimos anos. A análise do genoma funcional permite a identificação de genes de interesse agronômico. Assim, o objetivo deste trabalho foi realizar a anotação funcional de genes do transcriptoma de folhas de Arachis pintoi. Dos 98.432 transcritos analisados, 69% apresentaram correspondências com o banco de dados de proteínas do National Center of Biotechnology Information. As classes função molecular (36%) e processo biológico (35,8%) representaram a maioria dos termos de Gene Ontology atribuídos, enquanto o componente celular (28,2%) apresentou menor número. A análise de expressão diferencial identificou...
Tipo: Artigo em anais e proceedings Palavras-chave: Amendoim forrageiro; Forage peanut; Cacahuetes forrajeros; Anotação funcional; RNA-seq; Transcriptoma; Hojas; Amarillo; Belomonte; Genoma; Folha; Método de Análise; Arachis pintoi; Genome; Transcriptome; Leaves.
Ano: 2023 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1157482
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Caracterização morfológica de plantas em acessos de camucamuzeiro do banco de germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental. Repositório Alice
RIBEIRO, O. D.; NASCIMENTO, W. M. O. do; ALMEIDA, E. G. L. de; OLIVEIRA, J. C. de.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Camucamu.; Melhoramento genético vegetal; Myrciaria Dubia..
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/883450
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Caracterização morfométrica de frutos de açaizeiro na Reserva Indígena Kaxinawá de Nova Olinda na região de Feijó, Acre. Repositório Alice
AZÊVEDO, H. S. F. da S.; AZEVEDO, J. M. A. de; MANIL, R. de L.; SILVA, S. M. M.; OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, L. M. da; CAMPOS, T. de.
Estudos de biometria de frutos são importantes para o entendimento da variabilidade entre genótipos. Euterpe precatoria vem se destacando entre as frutíferas amazônicas na agroindústria, devido à produção do "suco do açaí". O objetivo do estudo foi caracterizar morfométricamente frutos de açaizeiro provenientes de áreas de floresta de baixio e terra firme da Reserva Indígena Kaxinawá de Nova Olinda, no município de Feijó, Acre.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Conhecimento tradicional; Caracterização morfométrica; Morphometric characterization; Caracterización morfométrica; Terra Indígena Kaxinawá de Nova Olinda (TIKNO); Feijó (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Amazonia occidental; Western amazon.; Fructificación; Açaí; Fruto; Euterpe precatoria; Fruiting..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1062263
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Classificação orientada a objetos em imagens multitemporais ladsat aplicada na identificação de cana-de-açúcar e soja. Repositório Alice
SCHULTZ, B.; FORMAGGIO, A. R.; EBERHARDT, I. D. R.; SANCHES, I. D.; OLIVEIRA, J. C. de; LUIZ, A. J. B..
Resumo: A presente pesquisa teve por objetivo avaliar a potencialidade de dados multitemporais Landsat para classificação de cana-de-açúcar e de soja, conjuntamente, quando realizada via Análise de Imagens Orientada a Objetos (OBIA/ Random Forest). Foi utilizado um segmentador multi-resolução (SM) para gerar os polígonos (objetos). Um conjunto de 500 segmentações foi criado pela variação dos parâmetros Fe (fator de escala), Fm (forma) e Cp (compacidade), e avaliado pelo Índice de Avaliação da Segmentação (IAVAS). Da segmentação que obteve menor IAVAS, foram extraídos os atributos espectrais das médias e desvios-padrão das bandas TM/Landsat-5 [setembro (S) e outubro (O) do ano 2000] e ETM+/Landsat-7 [fevereiro (F) e março (M) do ano 2001] dos objetos, e...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Segmentação; Mapeamento; Segmentation; IAVAS; Sugarcane and soybean mapping; Imagem de satélite.; Sensoriamento remoto; Cana de açucar; Soja..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1060377
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Detecção de hibridação entre espécies de Arachis. Repositório Alice
CAMPOS, T. de; FERREIRA FILHO, J. A.; AZEVÊDO, H. S. F. da S.; TEIXEIRA, R. B.; OLIVEIRA, J. C. de; SOUSA, A. C. B. de; ASSIS, G. M. L. de.
O amendoim forrageiro (Arachis pintoi e Arachis repens) é principalmente utilizado na recuperação de pastagens degradadas, em consórcio com gramíneas. Uma das técnicas mais indicadas para se estudar polimorfismo entre sequências de DNA é através dos microssatélites. O objetivo do estudo foi identificar a ocorrência de híbridos de cruzamentos intra e interespecíficos de amendoim forrageiro com a genotipagem com marcadores microssatélites.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Amendoim forrageiro; Marcadores moleculares.; Genótipo; Hibridação; Polimorfismo.; Arachis pintoi..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1029533
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Diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de amendoim forrageiro. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de; RUFINO, P. B.; AZÊVEDO, H. S. da S.; SILVA, L. M. da; ASSIS, G. M. L. de; CAMPOS, T. de.
O amendoim forrageiro (Arachis pintoi) é uma leguminosa pertencente à família Fabaceae e tem sido utilizado em consorciação de pastagens, agregando as mesmas alto valor nutritivo e produção de forragem, além da fixação biológica de nitrogênio, reduzindo os custos do produtor. O objetivo do estudo foi analisar a diversidade genética de genótipos de amendoim forrageiro por meio de marcadores microssatélites (SSR).
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Amendoim forrageiro; Forage peanuts; Cacauhetes forrajeros; Marcador microssatélite; Embrapa Acre; Rio Branco (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Fitomejoramiento; Leguminosas forrajeras; Variación genética.; Repeticiones de microsatélite; Melhoramento genético vegetal; Leguminosa forrageira; Variação genética; Marcador genético; Banco de Germoplasma.; Plant breeding; Forage legumes; Arachis pintoi; Genetic variation; Microsatellite repeats..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075144
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Diversidade genética de etnovariedades de mandioca utilizadas na regional Juruá, Acre, para a fabricação de farinha. Repositório Alice
CAMPOS, T. de; TEIXEIRA, R. B.; AZÊVEDO, H. S. F. da S.; OLIVEIRA, J. C. de; SOUSA, A. C. B. de; FLORES, P. S..
A mandioca desempenha um papel de destaque econômico e social para o Estado do Acre. A região do vale do Juruá (AC) é reconhecida pela produção de farinha de mandioca de alta qualidade, fabricada artesanalmente. Para assessorar o processo de certificação de origem, o objetivo do trabalho foi identificar, por meio de marcadores microssatélites 4 etnovariedades de mandioca utilizadas na região para a fabricação de farinha. Cinco locos microssatélites foram avaliados e apresentaram-se polimórficos, amplificando um total de 16 alelos com uma média de 3,2 alelos por loco. Os índices de heterozigosidades esperadas foram moderadamente altos para a maioria dos locos, e variaram de 0,24 a 0,73, com um valor médio de 0,48. Os valores de heterozigosidade observada...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Produção artesanal; Indicação geográfica; Etnovariedade; Território da Cidadania; Vale do Juruá (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Tecnología tradicional; Variación genética.; Denominación de origen protegida; Explotación agrícola familiar; Harina de yuca; Mandioca; Procedência; Manihot esculenta; Farinha; Variação genética.; Agricultura familiar; Family farms; Cassava flour; Protected designation of origin; Genetic variation.; Traditional technology; Provenance.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1032785
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Diversidade genética de matrizes de açaizeiro (Euterpe precatoria) por meio de marcadores microssatélites. Repositório Alice
AZÊVEDO, H. S. F. da S.; RUFINO, P. B.; BENVINDO, F. D.; SILVA, S. M. M.; OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, L. M. da; CAMPOS, T. de.
O açaizeiro (Euterpe precatoria) é de origem amazônica e destaca-se entre os diversos recursos biológicos pela sua abundância e por produzir um importante alimento: ?suco de açaí?. A extração dos frutos do açaizeiro retira uma grande quantidade de sementes da floresta e por isso, o uso comercial pode causar perda da diversidade da espécie, podendo resultar em efeitos negativos sobre a estrutura genética das populações. O objetivo do estudo foi analisar a diversidade genética de matrizes de açaizeiro por meio de marcadores microssatélites.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Conhecimento tradicional; Análise molecular; Molecular analysis; Marcador microssatélite; Terra Indígena Kaxinawá de Nova Olinda (TIKNO); Feijó (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Amazonia occidental; Western amazon.; Variación genética; Marcadores genéticos; Açaí; Variação genética; Marcador molecular; Euterpe precatoria; Genetic variation; Genetic markers..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1062259
Registros recuperados: 59
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