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	Provedor de dados Repositório Alice (33) Autor OLIVEIRA, P. S. N. de (33) REGITANO, L. C. de A. (32) TIZIOTO, P. C. (28) COUTINHO, L. L. (27) DINIZ, W. J. da S. (14) LIMA, A. O. de (14) CESAR, A. S. M. (13) ROCHA, M. I. P. (13) AFONSO, J. (12) MOURÃO, G. B. (12) SOUZA, M. M. de (12) ZERLOTINI NETO, A. (11) MUDADU, M. de A. (10) NICIURA, S. C. M. (8) REECY, J. M. (7) BUSS, C. E. (6) KOLTES, J. E. (6) MOURAO, G. B. (5) TULLIO, R. R. (5) LANNA, D. P. D. (4) Mais... Palavra-chave Bos Indicus (9) Beef cattle (5) Gado Nelore (5) Gene expression (5) Nellore (4) Allele-specific expression (3) Bos Indicus. (3) Expressão gênica (3) Cattle (2) Conjugated linoleic acid (2) Consumo Alimentar. (2) Gene expression. (2) Genome regulation. (2) MiRNA (2) Nelore (2) Network analysis (2) Residual feed intake (2) SNPs (2) Skeletal muscle (2) ASE (1) Mais... Tipo do documento Separatas (16) Artigo de periódico (15) Anais e Proceedings de eventos (2) Ano 2022 (1) 2021 (1) 2020 (4) 2019 (1) 2018 (3) 2017 (7) 2016 (9) 2015 (1) 2014 (1) 2013 (1) 2012 (3) 2011 (1) Mais... País Brazil (33) Idioma Inglês (23) Português (10)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 33 Primeira ... 1 2 ... Última A SNP in NEUROD1 is associated with production traits in Nelore beef cattle. Repositório Alice OLIVEIRA, P. S. N. de; TIZIOTO, P. C.; NORONHA, C. T.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Candidate gene; Feed consuption.; Bos Indicus.. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/992509 Allele- and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: a candidate for meat tenderness in cattle. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; ROCHA, M. I. P.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Nelore; Expressão alélica diferencial; Maciez da carne; Gado Nelore; Alleles. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1052240 Allele-specific expression is widespread in Bos indicus muscle and affects meat quality candidate genes. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; ROCHA, M. I. P.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; CARDOSO, T. F.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; ANDRADE, B. G. N.; MUDADU, M. de A.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Differences between the expression of the two alleles of a gene are known as allele-specific expression (ASE), a common event in the transcriptome of mammals. Despite ASE being a source of phenotypic variation, its occurrence and effects on genetic prediction of economically relevant traits are still unexplored in bovines. Furthermore, as ASE events are likely driven by cis-regulatory mutations, scanning them throughout the bovine genome represents a significant step to elucidate the mechanisms underlying gene expression regulation. To address this question in a Bos indicus population, we built the ASE profile of the skeletal muscle tissue of 190 Nelore steers, using RNA sequencing data and SNPs genotypes from the Illumina BovineHD BeadChip (770 K bp).... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Expressão gênica; Regulação da expressão gênica; Allelic expression; Allele-specific expression; Bos Indicus; Gene expression regulation. Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125395 Allele-specific gene expression in liver of Nelore cattle extremes for feed efficiency. Repositório Alice ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Allele-specific expression; Genome regulation.; Genetic improvement.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1073455 An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. Repositório Alice OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A.. Residual Feed Intake (RFI) is an economically relevant trait in beef cattle. Among the molecular regulatory mechanisms, microRNAs (miRNAs) are an important dimension in post-transcriptional regulation and have been associated with different biological pathways. Here, we performed differential miRNAs expression and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) to better understand the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in bovine skeletal muscle and liver. MiRNA and mRNA expression data were obtained from Nelore steers that were genetically divergent for RFI (N = 10 [low RFI or feed efficient]; N = 10 [high RFI or feed inefficient]). Differentially expressed and hub miRNAs such as bta-miR-486, bta-miR-7, bta-miR15a, bta-miR-21,... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: RFI; MiRNA; Gado Nelore; Beef cattle; Nellore; Skeletal muscle. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099755 An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. Repositório Alice OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A.. Residual Feed Intake (RFI) is an economically relevant trait in beef cattle. Among the molecular regulatory mechanisms, microRNAs (miRNAs) are an important dimension in post-transcriptional regulation and have been associated with different biological pathways. Here, we performed differential miRNAs expression and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) to better understand the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in bovine skeletal muscle and liver. MiRNA and mRNA expression data were obtained from Nelore steers that were genetically divergent for RFI (N = 10 [low RFI or feed efficient]; N = 10 [high RFI or feed inefficient]). Differentially expressed and hub miRNAs such as bta-miR-486, bta-miR-7, bta-miR15a, bta-miR-21,... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: MicroRNAs; Residual Feed Intake; Gado Nelore; Beef cattle; Nellore; Skeletal muscle. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102149 Análise de qualidade de RNA para estudo do perfil transcriptômico de animais extremos para eficiência alimentar da raça Nelore. Repositório Alice SERRA, V.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A.. Editado por Ana Rita de Araújo nogueira, simone Cristina Méo Nicura Tipo: Separatas Palavras-chave: Perfil transcriptômico; Raça Nelore.; RNA.. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/965648 Associação genômica com maciez de carne na raça Nelore. Repositório Alice REGITANO, L. C. de A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MUDADU, M. de A.; MOURÃO, G. B.; REDE BIFEQUALI. As análises do genoma bovino, incluindo mapeamento de QTL (Quantitative Trait Loci), SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) e, mais recentemente, a genotipagem em larga escala, poderão contribuir para a seleção precoce de bovinos. A análise de associação genômica, utilizando dados da genotipagem de 470 animais no Illumina BovineHD BeadChip, identificou regiões associadas com força de cisalhamento medida 24 horas após o abate (P≤ 0,001) nos cromossomos 2, 10, 13, 16 e 21, em famílias de referência da raça Nelore. A análise dos genes localizados nessas regiões associadas com maciez de carne poderá permitir a identificação de genes de efeito maior, que poderão ser usados na seleção assistida por marcadores. Tipo: Separatas Palavras-chave: SNP chip; Maciez; Raça Nelore; Cisalhamento.; Carne.. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/943050 Association analyses pointed the TIPARP as a potential candidate gene influencing residual feed intake variation in Nelore cattle. Repositório Alice LIMA, A. O. de; OLIVEIRA, P. S. N. de; TIZIOTO, P. C.; AFONSO, J.; SOMAVILLA, A. L.; DINIZ, W. J. da S.; SILVA, J. V. da; ROCHA, M. I. P.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Haplótipo; SNPs; Gado de corte; Gado nelore; Haplotypes; Nellore. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1056239 Association of skeletal muscle transcripts with fatty acid content in Nellore cattle. Repositório Alice CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; POLETI, M. D.; ANDRADE, S. C. da S.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LANNA, D. P. D.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; KOLTES, J. E.; WATERS, E. F.; REECY, J. M.; COUTINHO, L. L.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Differentially expressed genes.; Conjugated linoleic acid; Oleic acid.. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1060623 Co-expression network analysis identifies genes associated with iron content in bovine muscle. Repositório Alice DINIZ, W. J. da S.; CESAR, A. S. M.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; AFONSO, J.; ROCHA, M. I. P.; LIMA, A. O. de; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti, ESALQ/USP; Wellison Jarles da Silva Diniz, UFSCar. Tipo: Separatas Palavras-chave: Network analysis; Systems biology.; Gene expression.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075630 Co-expression network analysis identifies genes associated with meat tenderness. Repositório Alice DINIZ, W. J. da S.; CESAR, A. S. M.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; AFONSO, J.; ROCHA, M. I. P.; LIMA, A. O. de; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tenderness is an important trait of meat quality and is known to be influenced by several factors including genetic composition. Tipo: Separatas Palavras-chave: Network analysis; System biology.; Gene expression.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1080848 Co-expression networks reveal potential regulatory roles of miRNAs in fatty acid composition of nelore cattle. Repositório Alice OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. da S.; SOUZA, M. de S.; ANDRADE, B. G.; KOLTES, J. E.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REECY, J. M.; REGITANO, L. C. de A.. Fatty acid (FA) content affects the sensorial and nutritional value of meat and plays a significant role in biological processes such as adipogenesis and immune response. It is well known that, in beef, the main FAs associated with these biological processes are oleic acid (C18:1 cis9, OA) and conjugated linoleic acid (CLA-c9t11), which may have beneficial effects on metabolic diseases such as type 2 diabetes and obesity. Here, we performed differential expression and co-expression analyses, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) and partial correlation with information theory (PCIT), to uncover the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in skeletal muscle associated with FA content. miRNA and mRNA expression data were... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Ácido linoleico conjugado; Ácido oleico; Ácidos graxos; Genômica; Redes de co-expressão; Integrative genomics; MRNA; MiRNA; Bos Indicus; Gado de Corte; Beef cattle; Conjugated linoleic acid; Oleic acid. Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110820 Differences in the skeletal muscle transcriptome profile associated with extreme values of fatty acids content. Repositório Alice CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; POLETI, M. D.; ANDRADE, S. C. da S.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; FELICIO, A. M.; NASCIMENTO, M. L. do; CHAVES, A. S.; LANNA, D. P. D.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; KOLTES, J. E.; WATERS, E. F.; MOURAO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REECY, J. M.; COUTINHO, L. L.. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Bos Indicus; Human health; Lipids. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1060542 DNA methylation may affect beef tenderness through signal transduction in Bos indicus. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; ROCHA, M. I. P.; PAN, Z.; ZHOU, H.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; AFONSO, J.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; KOLTES, J. E.; REGITANO, L. C. de A.. Abstract. Background:Beef tenderness is a complex trait of economic importance for the beef industry. Understanding the epigenetic mechanisms underlying this trait may help improve the accuracy of breeding programs. However, little is known about epigenetic effects on Bos taurus muscle and their implications in tenderness, and no studies have been conducted in Bos indicus.Results:Comparing methylation profile of Bos indicus skeletal muscle with contrasting beef tenderness at 14 days after slaughter, we identified differentially methylated cytosines and regions associated with this trait. Interestingly, muscle that became tender beef had higher levels of hypermethylation compared to the tough group. Enrichment analysis of predicted target genes suggested... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Nelore; Epigenoma; Músculo de nelore; RRBS; GNAS; EBF3; Força de cisalhamento; Shear force; Epigenome; Muscle; Metilação; Bos Taurus; Bos Indicus; Músculo; Cattle; Methylation; DNA methylation. Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1144144 Erratum to: 'Genomic structure and marker-derived gene networks for growth and meat quality traits of brazilian nelore beef cattle'. Repositório Alice MUDADU, M. de A.; PORTO NETO, L. R.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; NICIURA, S. C. M.; THOLON, P.; ALENCAR, M. M. de; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; FEIJO, G. L. D.; FERRAZ, A. L. J.; SILVA, L. O. C. da; MEDEIROS, S. R. de; LANNA, D. P. D.; NASCIMENTO, M. L. do; CHAVES, A. S.; SOUZA, A. R. D. L.; PACKER, I. U.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REVERTER, A.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Erratum; Beef cattle; Meat quality. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1065244 FABP1 and SLC2A5 expression levels affect feed efficiency-related traits. Repositório Alice DINIZ, W. J. S.; ROSA, K. O. da; TIZIOTO, P. C.; MOURÃO, G. B.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.. Improving the efficiency of production to reduce the environmental footprints is pivotal to the sustainability of livestock systems. Despite the advances in cattle feed efficiency (FE) measurement and identification of potential mechanisms involved, much is still unclear regarding the genetic and biological basis of this trait. Nevertheless, lipid and carbohydrate metabolism have been outlined as important in determining efficient and inefficient animals. To address the role of genes partaking in these processes and previously involved with residual feed intake (RFI), we carried out a liver expression profile in Nelore steers (n = 83). Six target genes (FABP1, FADS2, PPP1R26, RGS2, SLC2A5, and UCP2) were measured by qPCR analysis. A general linear mixed... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Cattle feed efficiency; Relative growth rate; Average daily gain; Gene expression; Dry matter intake. Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1127498 Genes diferencialmente expressos no músculo Longissimus dorsi de novilhos nelore divergentes para eficiência bruta. Repositório Alice SILVA, J. V. da; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; AFONSO, J.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: RNA-seq; Eficiência alimentar.; Bos Indicus.. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1054252 Genome-enabled prediction of breeding values for feedlot average daily weight gain in nelore cattle. Repositório Alice SOMAVILLA, A. L.; REGITANO, L. C. de A.; ROSA, G. J. M.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M. de; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P.. Nelore is the most economically important cattle breed in Brazil, and the use of genetically improved animals has contributed to increase beef production efficiency. The Brazilian beef feedlot industry has grown considerably in the last decade, so the selection of animals with higher growth rates on feedlot has become quite important. Genomic selection could be used to reduce generation intervals and improve the rate of genetic gains. The aim of this study was to evaluate the prediction of genomic estimated breeding values for average daily gain in 718 feedlot-finished Nelore steers. Analyses of three Bayesian model specifications (Bayesian GBLUP, BayesA, and BayesCπ) were performed with four genotype panels (Illumina BovineHD BeadChip, TagSNPs,... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Genomic selection; Bos taurus indicus; Growth. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1070097 Genome-wide distribution of allele-specific expression in Nelore steers muscle. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; NICIURA, S. C. M.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; AFONSO, J.; CESAR, A. S. M; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. The difference between the allelic expression of a gene is known as allele-specific expression (ASE), and it is a common event in mammal?s transcriptome. ASE is named genomic imprinting when guided by epigenetics mechanisms regarding the allele parental origin. Tipo: Separatas Palavras-chave: ASE; Allele-specific expression; Polimorfismo Genético; Melhoramento Genético Animal; Gene expression. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1100405 Registros recuperados: 33 Primeira ... 1 2 ... Última

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