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A gene-transcription factor network associated with residual feed intake based on SNVs/InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds. Repositório Alice
VERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B..
The aim of this study was to analyze whole-genome re-sequencing data focusing on SNVs and InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds related to RFI. Thus, genes showing SNVs/InDels in TF binding sites (5' UTR variants) were used to search for TF related to feed intake and to generate a gene-TF network for RFI across two purebred and one admixed dairy cattle breeds. Moreover, we were able to perform a comparative analysis accessing similarities and dissimilarities at the genomic level across these breeds.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sequência de dados; Single Nucleotide Variations (SNVs); Insertions/deletions (InDels); Whole-genome; Whole-genome re-sequencing data; Gado de Corte; Bos Indicus; Variação Genética; Cattle breeds.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105518
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Assessment of runs of homozygosity islands and estimates of genomic inbreeding in Gyr (Bos indicus) dairy cattle. Repositório Alice
PERIPOLLI, E.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; LIMA, A. L. F.; IRGANG, R.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; VENTURA, R. V.; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B..
Abstract BACKGROUND: Runs of homozygosity (ROH) are continuous homozygous segments of the DNA sequence. They have been applied to quantify individual autozygosity and used as a potential inbreeding measure in livestock species. The aim of the present study was (i) to investigate genome-wide autozygosity to identify and characterize ROH patterns in Gyr dairy cattle genome; (ii) identify ROH islands for gene content and enrichment in segments shared by more than 50% of the samples, and (iii) compare estimates of molecular inbreeding calculated from ROH (FROH), genomic relationship matrix approach (FGRM) and based on the observed versus expected number of homozygous genotypes (FHOM), and from pedigree-based coefficient (FPED). RESULTS: ROH were identified in...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Dairy traits; Inbreeding coefficients; ROH islands; Bos Indicus.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1100275
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Avaliação de diferentes métodos de seleção em população de bovinos de duplo propósito através de simulação genética. Repositório Alice
RODRIGUES, R. F. M; NASCIMENTO, G. C.; PANETTO, J. C. do C.; TEIXEIRA, R. B.; CORDEIRO NETO, J. A.; TEIXEIRA, B. B.; NORONHA, C. M. S.; PAIVA, A. L. da C..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Ganho genético; Genesys; Limite de seleção.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1009337
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Avaliação dos coeficientes de endogamia em bovinos da raça Gir (Bos primigenius indicus) Repositório Alice
PERIPOLLI, E.; OLIVIERI. B. F.; FEITOSA, F. L. B.; LEMOS, M. V. A. de; TONUSSI, R. L.; MUNARI, D. P.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; VENTURA, R. V.; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B..
2017
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Autozigosidade; Corridas de Homozigose; Pedigree.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1072487
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Banco de DNA de Bovinos: avaliação de metodologias alternativas para extração de DNA. Repositório Alice
BRION, C. T.; SANTOS, L. B.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética molecular bovinos; DNA; Métodos de extração.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1034534
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Desequilíbrio de ligação nos cromossomos 10 e 23 em populações Gir, F1 e F2 (Gir x Holandês) Repositório Alice
O. P. I; CARVALHO, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; G. S. E. F.; MACHADO, M. A..
2017
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: GWAS; Seleção genômica.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1072303
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Estimação de curvas de lactação de bovinos da raça Gir. Repositório Alice
MOREIRA, R. M.; BRIGHENTI, C. R. G.; PANETTO, J. C. do C.; RESENDE, J. C. de.
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Produção leiteira; Seleção animal; Zebu.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1008636
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Estudo da endogamia em populações simuladas submetidas a diferentes métodos de seleção. Repositório Alice
NASCIMENTO, G. C.; RODRIGUES, R. F. M.; CORDEIRO NETO, J. A.; TEIXEIRA, R. B.; NORONHA, C. M. S.; PAIVA, A. L. da C.; PANETTO, J. C. do C.; TEIXEIRA, B. B..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Dupla aptidão; Ganho genético; Genesys.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1008501
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Frequência alélica e genotípica do SNP ligado ao fenótipo slick hair no gene do receptor da prolactina (PRLR) em bovinos da raça Caracu. Repositório Alice
NASCIMENTO, J. C.; SEIBERLICK, O. S. G.; CARVALHO, B. O.; PEREIRA, H. P.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B..
Resumo: Em ambientes tropicais e subtropicais, a expressão de características produtivas em bovinos é dificultada pelos efeitos ambientais como o estresse térmico, agravado pelo aquecimento global. Regiões genômicas associadas à tolerância ao calor foram recentemente descritas e polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs) relacionados a essa variação foram identificados. Uma mutação no gene do receptor de prolactina, no SNP 39136666 foi relacionada à presença de um tipo diferente de pelagem denominada ?slick hair? em animais da raça Carora e Caracu, que está associado com a maior tolerância ao calor. Foram genotipados neste trabalho, 61 animais da raça Cararu Caldeano, utilizando a técnica tetra-primers ARMSPCR. A frequência alélica e genotípica foi...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genotipagem; Caracu caldeano; Tetra-primer; ARNS-PCR.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1112049
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Genetic analysis of productive and reproductive traits in multiple-breed dairy cattle populations. Repositório Alice
RIBEIRO, V. M. P.; MERLO, F. A.; GOUVEIA, G. C.; WINKELSTROTER, L. K.; ABREU, L. R. A.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; PAIVA, L. de C.; CEMBRANELLI, M. de A. R.; TORAL, F. L. B..
The objective of this work was to determine whether the random regression model using linear splines (RRMLS) is suitable to estimate the genetic parameters for productive and reproductive traits of a multiple-breed dairy cattle population, as well as to investigate the effect of the genetic group of the progeny on the genetic merit of the sire. The multiple-trait model (MTM) and the RRMLS with one knot fitted for every genetic group were used to obtain the genetic parameters. Records of 1/2 Holstein + 1/2 Gyr (1/2HG), 5/8 Holstein + 3/8 Gyr (5/8HG), and 3/4 Holstein + 1/4 Gyr (3/4HG) crossbreed dams were considered. The RRMLS showed better fitting. The additive and residual variances estimated by the MTM and the RRMLS were similar. Heritability varied from...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Raça Gir; Gir (cattle breed).
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083465
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Genetic characterization of Indubrasil cattle breed population. Repositório Alice
ZANELLA, R.; LAGO, L. V.; SILVA, A. N. da; PÉRTILLE, F.; CARVALHO, N. S. de; PANETTO, J. C. do C.; ZANELLA, G. C.; FACIOLI, F. L.; SILVA, M. V. G. B..
Abstract The Indubrasil breed was developed in the Brazilian region called Triângulo Mineiro as a result of a cross between zebu cattle. Initially, it was used as a terminal cross and currently it represents approximately 4.45% of all the Brazilian zebu cattle. Studies were conducted to estimate genetic parameters in the Indubrasil using pedigree information, however, until now, no study has been developed using large-scale genomic markers in this breed. Pedigree information are widely used to investigate population parameters; however, they can neglect some estimates when compared to the use of genomic markers. Therefore, the objective of this study was to investigate the population structure and the genetic diversity of Indubrasil cattle using a...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Indubrasil; SNPs; Genetic diversity; Inbreeding; Pedigree.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101944
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Genome Wide CNVs analysis to identify variants associated with coat color in Gyr breed. Repositório Alice
CARMO, A. S. do; OLIVEIRA JÚNIOR, G. A. de; CHUD, T. C. S.; PANETTO, J. C. do C.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B..
2015
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bos taurus indicus; Gwas; KIT; TYRO3; Variantes estruturais; Tolerância ao calor.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1041480
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Girolando breed genetic improvement program - Genetic evaluation of cows - June/2016. Infoteca-e
SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; PANETTO, J. C. do C.; FREITAS, A. F. de; PAIVA, L. DE C.; GONÇALVES, G. S.; ALVES, B. R. C..
The Girolando breed progeny test was established in 1997, as a result of the partnership between Girolando and Embrapa Dairy Cattle. In 2007, the Programa de Melhoramento Genético da Raça Girolando? PMGG (Genetic Improvement Program of the Girolando Breed) was implemented. Besides interacting with previously existing initiatives of the Girolando Breeders Association, such as the genealogical register service, the progeny test and the dairy control service, the PMGG launched the Linear Evaluation System (SLAG). The main objectives of the PMGG comprises identification of genetically superior individuals, the technically-oriented multiplication of genetics, the evaluation of economic traits and the promotion of sustainable dairy activities. The program have...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Dairy cattle; Gado de leite; Melhoramento genético; Melhoria; Raça girolando.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1049079
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Girolando breed genetic improvement program - Genetic evaluation of cows - June/2017. Infoteca-e
SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; PANETTO, J. C. do C.; PAIVA, L. DE C.; GONÇALVES, G. S.; MACHADO, M. A.; ALVES, B. R. C..
The Girolando breed progeny test was established in 1997, as a result of the partnership between Girolando and Embrapa Dairy Cattle. In 2007, the Programa de Melhoramento Genético da Raça Girolando - PMGG (Genetic Improvement Program of the Girolando Breed) was implemented. This Sire Summary/Progeny Test Results document has innovative tools and resources, for breeders and/or other professionals. Those include information regarding molecular markers, the Girolando Linear Evaluation System (SALG) and the updated genetic evaluation of age at first calving. The methods for analysis were modified for this current evaluation and are detailed further in this document.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Dairy cattle; Gado de leite; Melhoramento genético; Raça girolando; Girolando cows; Dairy cattle; Girolando breed; Animal breeding.
Ano: 2017 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1081019
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Girolando breed genetic improvement program - Sire summary - Progeny test results - July/2014. Infoteca-e
SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; PAIVA, L. DE C.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; ARBEX, W. A.; SANTOS, K. C. L. dos; PANETTO, J. C. do C.; CARVALHO, B. C. de; ALVES, B. R. C..
The Girolando breed progeny test was established in 1997, as a result of the partnership between Girolando and Embrapa Dairy Cattle. In 2007, the Programa de Melhoramento Genético da Raça Girolando? PMGG (Genetic Improvement Program of the Girolando Breed) was implemented. Besides interacting with previously existing initiatives of the Girolando Breeders Association, such as the genealogical register service, the progeny test and the dairy control service, the PMGG launched the Linear Evaluation System (SLAG). The main objectives of the PMGG comprises identification of genetically superior individuals, the technically-oriented multiplication of genetics, the evaluation of economic traits and the promotion of sustainable dairy activities. The program have...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Gado de leite; Melhoria; Raça girolando; Melhoramento genético.
Ano: 2014 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1000454
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Girolando breed genetic improvement program - Sire summary - Progeny test results - July/2015. Infoteca-e
SILVA, M. V. G. B.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MARTINS, M. F.; PAIVA, L. DE C.; PAIVA, L. DE C.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; ARBEX, W. A.; ARBEX, W. A.; ALVES, B. R. C.; ALVES, B. R. C.; PANETTO, J. C. do C.; PANETTO, J. C. do C.; CARVALHO, B. C. de; CARVALHO, B. C. de..
The Girolando breed progeny test was established in 1997, as a result of the partnership between Girolando and Embrapa Dairy Cattle. In 2007, the Programa de Melhoramento Genético da Raça Girolando? PMGG (Genetic Improvement Program of the Girolando Breed) was implemented. Besides interacting with previously existing initiatives of the Girolando Breeders Association, such as the genealogical register service, the progeny test and the dairy control service, the PMGG launched the Linear Evaluation System (SLAG). The main objectives of the PMGG comprises identification of genetically superior individuals, the technically-oriented multiplication of genetics, the evaluation of economic traits and the promotion of sustainable dairy activities. The program have...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Gado de leite; Melhoramento genético; Melhoria; Raça girolando; Dairy cattle.
Ano: 2015 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1024408
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Girolando breed genetic improvement program - Sire summary - Progeny test results - June 2016. Infoteca-e
SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; PAIVA, L. DE C.; PANETTO, J. C. do C.; ALVES, B. R. C.; CAMPOS, M. M.; CARVALHO, B. C. de; MACHADO, M. A.; REIS, D. R. de L..
The Girolando breed progeny test was established in 1997, as a result of the partnership between Girolando and Embrapa Dairy Cattle. In 2007, the Programa de Melhoramento Genético da Raça Girolando - PMGG (Genetic Improvement Program of the Girolando Breed) was implemented. This Sire Summary/Progeny Test Results document has innovative tools and resources, for breeders and/or other professionals. Those include information regarding molecular markers, the Girolando Linear Evaluation System (SALG) and the updated genetic evaluation of age at first calving. The methods for analysis were modified for this current evaluation and are detailed further in this document.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Dairy cattle; Gado de leite; Melhoramento genético; Melhoria; Raça girolando.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1050998
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Girolando breed genetic improvement program - Sire summary - Progeny test results - June 2017. Infoteca-e
SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; PAIVA, L. DE C.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; VERARDO, L. L.; GONÇALVES, G. S.; REIS, D. R. de L.; ALVES, B. R. C..
The Girolando breed progeny test was established in 1997, as a result of the partnership between Girolando and Embrapa Dairy Cattle. In 2007, the Programa de Melhoramento Genético da Raça Girolando - PMGG (Genetic Improvement Program of the Girolando Breed) was implemented. This Sire Summary/Progeny Test Results document has innovative tools and resources, for breeders and/or other professionals. Those include information regarding molecular markers, the Girolando Linear Evaluation System (SALG) and the updated genetic evaluation of age at first calving. The methods for analysis were modified for this current evaluation and are detailed further in this document.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Dairy cattle; Gado de leite; Melhoramento genético; Melhoria; Raça girolando.
Ano: 2017 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1080947
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Girolando breed genetic improvement program - Sire summary - Progeny test results - June 2018. Infoteca-e
SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; PANETTO, J. C. do C.; PAIVA, L. DE C.; GONÇALVES, G. S.; MACHADO, M. A.; REIS, D. R. de L.; ALVES, B. R. C..
The Girolando breed progeny test was established in 1997, as a result of the partnership between Girolando and Embrapa Dairy Cattle. In 2007, the Programa de Melhoramento Genético da Raça Girolando - PMGG (Genetic Improvement Program of the Girolando Breed) was implemented. This Sire Summary/Progeny Test Results document has innovative tools and resources, for breeders and/or other professionals. Those include information regarding molecular markers, the Girolando Linear Evaluation System (SALG) and the updated genetic evaluation of age at first calving. The methods for analysis were modified for this current evaluation and are detailed further in this document.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Gado de leite; Melhoramento genético; Melhoria; Raça girolando; Dairy cattle.
Ano: 2018 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1102948
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Heterose nos componentes da curva de lactação de animais da raça Girolando. Repositório Alice
DALTRO, D. dos S.; KERN, E. L.; MACHADO, J. D.; PADILHA, A. H.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; COBUCI, J. A..
2017
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Modelos matemáticos; Pico de lactação; Produção de leite; Tempo ao pico.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1072286
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