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Artificial neural networks compared with Bayesian generalized linear regression for leaf rust resistance prediction in Arabica coffee. Repositório Alice
SILVA, G. N.; NASCIMENTO, M.; SANT'ANNA, I. de C.; CRUZ, C. D.; CAIXETA, E. T.; CARNEIRO, P. C. S.; ROSADO, R. D. S.; PESTANA, K. N.; ALMEIDA, D. P. de; OLIVEIRA, M. da S..
The objective of this work was to evaluate the use of artificial neural networks in comparison with Bayesian generalized linear regression to predict leaf rust resistance in Arabica coffee (Coffea arabica). This study used 245 individuals of a F2 population derived from the self-fertilization of the F1 H511-1 hybrid, resulting from a crossing between the susceptible cultivar Catuaí Amarelo IAC 64 (UFV 2148-57) and the resistant parent Híbrido de Timor (UFV 443-03). The 245 individuals were genotyped with 137 markers. Artificial neural networks and Bayesian generalized linear regression analyses were performed. The artificial neural networks were able to identify four important markers belonging to linkage groups that have been recently mapped, while the...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Inteligência artificial; Predição.; Marcador molecular; Coffea Arábica; Hemileia Vastatrix.; Artificial intelligence; Genetic markers; Prediction..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1069618
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Avaliação da diversidade genética e testes de agressividade com isolados de Mycosphaerella musicola. Repositório Alice
SANTOS, W. N.; PESTANA, K. N.; OLIVEIRA, S. A. S. de; AMORIM, E. P.; HADDAD, F.; FERREIRA, C. F..
A bananeira (Musa spp.) assume importância econômica e social em todo o mundo sendo cultivada em mais de 136 países tropicais e subtropicais, principalmente por pequenos agricultores. No entanto, a maioria das cultivares de bananeira são suscetíveis a pragas e doenças, podendo-se destacar a Sigatoka-amarela.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Mycosphaerella musicola; Fungo; Banana; Fungal diseases of plants.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1005006
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Bulks de DNA para identificação de marcadores SCAR relacionados à resistência a Fusarium oxysporum cubense. Repositório Alice
QUEIROZ, I. dos S.; DIAS, N. dos S.; MIRANDA, C. M.; BARBOSA, A. C. O.; SANTOS, W. N.; PESTANA, K. N.; SILVA, P. H.; VELAME, L K. V. C.; HADDAD, F.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F..
A banana (Musa spp.) é uma das frutas mais consumidas no país, possui alto valor nutritivo e encontra-se disponível durante todo ano. Contudo, a bananeira ainda é acometida por vários fatores bióticos e abióticos.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Plant diseases.; Bnanana; Marcado genético; Marcador mlecular; Disorders; Genetic marker; Fusarium oxysporum cubense; Mal do Panamá; Doença de planta..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1004988
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Caracterização molecular de híbridos do banco ativo de germoplasma de citros da Embrapa Repositório Alice
BARBOSA, A. C. O.; SANTOS, R. M. F.; QUEIROZ, I. dos S.; DIAS, N. dos S.; MIRANDA, C. M.; PESTANA, K. N.; SILVA, P. H. da; SOARES FILHO, W. dos S.; GESTEIRA, A. da S.; FERREIRA, C. F..
Embora a citricultura brasileira seja uma das principais atividades agroindustriais do país, a base genética ainda é bastante estreita, tendo esse fato contribuído para a vulnerabilidade da cultura frente aos problemas fitossanitári
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Fruta cítrica; Marcador molecular; Citrus; Genetic markers.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1004975
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Fingerprint de variedades elite de bananeiras e diploides melhorados via marcadores SSR e ISSR. Repositório Alice
QUEIROZ, I. dos S.; MIRANDA, C. M.; PESTANA, K. N.; FERREIRA, C. F..
A bananeira (Musa spp.) é considerada uma cultura extremamente importante para o país, sendo considerada a segunda fruta mais consumida. A banana possui alto valor nutritivo e encontra-se disponível durante todo o ano.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Marcadores; Banco.; Musa..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1031036
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Fingerprint molecular de híbridos e porta-enxertos (PEs) de citros via marcadores moleculares ISSRs e SSR. Repositório Alice
BARBOSA, A. C. O.; SANTOS, R. M. F.; PESTANA, K. N.; FERREIRA, C. F..
O Brasil é o primeiro produtor mundial de citros e o maior exportador de suco de laranja doce, principal produto do complexo agroindustrial da citricultura brasileira. De expressiva importância socioeconômica, a citricultura é responsável por integrar o país na liderança internacional.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Marcadores; Fragment; Fruta cítrica.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1031042
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Genetic diversity and nonparametric statistics to identify possible ISSR marker association with fiber quality of pineapple. Repositório Alice
SILVA, J. M.; LIMA, P. R. L.; SOUZA, F. V. D.; LEDO, C. A. da S.; SOUZA, E. H.; PESTANA, K. N.; FERREIRA, C. F..
Due to the increasing search for renewable resources, plant fibers have become an alternative when creating new products. Studies demonstrate the potential use of pineapple fibers in composites. The objective of this work was to evaluate the genetic diversity and verify any association between ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) bands and quality of pineapple fibers for use in cements in the civil construction. The study analyzed the genetic variability of 11 pineapple genotypes, as well as the possible association of 131 bands from 16 ISSR markers with fiber quality characteristics. Eleven bands were selected based on their high correlations (0.64578* to 0.72457*) with three fiber quality variables. Of these, two bands were purified, sequenced, and...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Abacaxi.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1112718
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Genomic prediction of leaf rust resistance to Arabica coffee using machine learning algorithms. Repositório Alice
SOUSA, I. C. de; NASCIMENTO, M.; SILVA, G. N.; NASCIMENTO, A. C. C.; CRUZ, C. D.; SILVA, F. F. e; ALMEIDA, D. P. de; PESTANA, K. N.; AZEVEDO, C. F.; ZAMBOLIM, L.; CAIXETA, E. T..
Genomic selection (GS) emphasizes the simultaneous prediction of the genetic effects of thousands of scattered markers over the genome. Several statistical methodologies have been used in GS for the prediction of genetic merit. In general, such methodologies require certain assumptions about the data, such as the normality of the distribution of phenotypic values. To circumvent the non-normality of phenotypic values, the literature suggests the use of Bayesian Generalized Linear Regression (GBLASSO). Another alternative is the models based on machine learning, represented by methodologies such as Artificial Neural Networks (ANN), Decision Trees (DT) and related possible refinements such as Bagging, Random Forest and Boosting. This study aimed to use DT and...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Statistical learning; Hemileia Vastatrix; Plant breeding; Artificial intelligence.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125524
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Identificação de progênies S1 de mandioca com maior nível de endogamia com base em marcadores microssatélites. Repositório Alice
MIRANDA, C. M.; QUEIROZ, I. dos S.; DIAS, N. dos S.; BARBOSA, A. C. O.; SANTOS, W. N. dos; PESTANA, K. N.; SILVA, P. H. da; VELAME, K. V. C.; SANTOS, R. M. F.; OLIVEIRA, E. J. de; SANTOS, V. da S.; FERREIRA, C. F..
A mandioca (Manihot esculenta Crantz) é considerada uma espécie preferencialmente alógama e altamente heterozigótica, apresentando protoginia, mas podendo ocorrer autofecundação em taxas bem baixas.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Marcador molecar; Mnadioca.; Endogamia; Marcador genético.; Cassava; Genetic markers.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1004930
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Identificação e análise da expressão de genes relacionados com o mal-do-Panamá em bananeira, por meio de PCR em Tempo Real. Repositório Alice
VELAME, K. V. C.; BRAGANÇA, C. A. D.; PESTANA, K. N.; SANTOS, R. M. F.; FERREIRA, C. F.; HADDAD, F.; AMORIM, E. P..
A banana é a fruta mais consumida no mundo. No Brasil é cultivada em todo país, destacando-se como cultura de maior expressão econômica. Dentre as doenças que ocorrem o 'mal-do-Panamá', causado pelo fungo Fusarium oxysporum f.sp. cubense (Foc), altamente destrutivo limitando a produção.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Plant diseases.; Fusarium oxysporum f sp cubense; Banana; Doença de planta; Mal do Panamá.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1024100
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Improvement of the specific detection of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis based on the pthB gene. Repositório Alice
MELO, R. de C. C.; BRAGANÇA, C. A. D.; PESTANA, K. N.; SILVA, H. S. A.; FERREIRA, C. F.; OLIVEIRA, S. A. S. de.
Modifications were made in the PCR conditions aiming to overcome the problem of non-amplification of the Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) fragment, using the primer pair XV / XK described in the literature. The objective of this study was to propose changes in the primers already described (XV / XK_MOD) and validate the use of these new primers in identifying Xpm. The validation procedure was carried out with the primer pair XV and XK_MOD, using different strains of Xpm, other plant pathogenic and endophytic bacteria genera and one isolate of X. phaseoli pv. passiflorae. As a control, additional reactions were conducted in multiplex with the universal primers for the 16S rRNA gene of the bacteria together with XV / XK and XV / XK_MOD. Using the...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Mandioca; Doença de Planta; Plant diseases and disorders; Cassava.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1113116
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Inheritance study and linkage mapping of resistance loci to Hemileia vastatrix in Híbrido de Timor UFV 443-03. Repositório Alice
PESTANA, K. N.; CAPUCHO, A. S.; CAIXETA, E. T.; ALMEIDA, D. P. de; ZAMBOLIM, E. M.; CRUZ, C. D.; ZAMBOLIM, L.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; SAKIYAMA, N. S..
Coffee leaf rust (CLR) caused by Hemileia vastatrix Berk. et Br. is one of the major Coffea arabica diseases world-wide. CLR resistance has been attributed to at least nine dominant genes, as single or in combination. We present an inheritance study and mapping loci involved in the Híbrido de Timor (HDT) UFV 443-03 resistance to race I, race II, and pathotype 001 of H. vastatrix . Molecular markers were used to ascertain the phenotypic results and to map the putative resistance loci. For all tree isolates, the inheritance study indicated that the resistance of HDT UFV 443-03 is conditioned by two independent dominant loci or by three independent loci (two dominant and one recessive). Molecular marker analyses ascertained that the resistance of HDT UFV...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Leaf rust; Breeding; Chromosome mapping; Quantitative trait loci.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1039824
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Melhoramento do cafeeiro: ênfase na aplicação dos marcadores moleculares. Repositório Alice
CAIXETA, E. T.; PESTANA, K. N.; PESTANA, R. K. N..
O melhoramento genético de plantas constitui em metodologias para a criação, seleção e fixação de plantas contendo fenótipos superiores, visando o desenvolvimento de cultivares melhoradas para as necessidades dos agricultores e consumidores. Dessa forma, o melhoramento de plantas tem sido definido como ?a ciência e a arte de modificar as plantas em benefício da sociedade? ou ?a ciência, arte e o gerenciamento dos recursos visando o aperfeiçoamento das plantas para o benefício da sociedade?. Como arte, o melhoramento depende da intuição e das experiências passadas que são únicas para cada melhorista, e como ciência, depende dos princípios da agronomia, genética e outras ciências correlatas. No entanto, a tendência é aumentar a ?ciência? e depender menos da...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Hemileia vasfafrix; Café; Marcador molecular; Gene; Coffea Arábica..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1041498
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Utilização de PCR multiplex a partir de marcadores VNTR em mandioca. Repositório Alice
DIAS, N. dos S.; MIRANDA, C. M.; QUEIROZ, I. dos S.; BARBOSA, A. C. O.; PESTANA, K. N.; SILVA, P. H.; SANTOS, R. M. F.; OLIVEIRA, E. J. de; SANTOS, V. da S.; FERREIRA, C. F..
O uso de marcadores moleculares do tipo VNTR (Variable Number of Tandem Repeats) no equipamento Fragment Analyzer ? Automated TE System da Advanced Analytical,Bocasiona custos elevados por unidade de dado a ser analisado.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Genetic marker.; Mandioca; Marcador molecular.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1005004
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Variabilidade genética de populações naturais de caroá por meio de marcadores RAPD. Repositório Alice
SILVEIRA, D. G.; AMORIM, E. P.; JESUS, O. N. de; SOUZA, F. V. D.; PESTANA, K. N.; SANTOS, V. J. dos; SANTANA, J. R. F. de.
O objetivo deste trabalho foi quantificar a variabilidade genética entre e dentro de populações de caroá (Neoglaziovia variegata), por meio de marcadores "" (RAPD). Foram analisados 180 genótipos de caroá, provenientes dos municípios de Guanambi, Juazeiro e Valente, no Estado da Bahia. Foi observado elevado polimorfismo entre as populações de caroá. As dissimilaridades genéticas entre os genótipos variaram de 0,08 a 0,95, com média de 0,44. A variância molecular mostrou que 56% da variação total foi explicada pelas diferenças entre indivíduos dentro de locais. As diferenças entre municípios explicaram 17% da variação total, enquanto as diferenças entre locais dentro dos municípios explicaram 26% da variação.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Divergência genética; Marcadores moleculares; Genetic divergence; Molecular markers.; Bromeliaceae; Neoglaziovia Variegata..
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/656075
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