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| Registros recuperados: 57 | |
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| Renault, Tristan; Moreau, Pierrick; Faury, Nicole; Pepin, Jean-francois; Segarra, Amelie; Webb, Stephen. |
| Although there are a number of ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1) variants, it is expected that the true diversity of this virus will be known only after the analysis of significantly more data. To this end, we analyzed 72 OsHV-1 "specimens" collected mainly in France over an 18-year period, from 1993 to 2010. Additional samples were also collected in Ireland, the United States, China, Japan, and New Zealand. Three virus genome regions (open reading frame 4 [ORF4], ORF35, -36, -37, and -38, and ORF42 and -43) were selected for PCR analysis and sequencing. Although ORF4 appeared to be the most polymorphic genome area, distinguishing several genogroups, ORF35, -36, -37, and -38 and ORF42 and -43 also showed variations useful in grouping subpopulations of this... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2012 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00083/19445/17221.pdf |
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| Francois, Cyrille; Garcia, Celine; Arzul, Isabelle; Joly, Jean-pierre; Miossec, Laurence; Chollet, Bruno; Ferrand, Sylvie; Robert, Maeva; Tourbiez, Delphine; Omnes, Emmanuelle; Cobret, Laetitia; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Saulnier, Denis; Pepin, Jean-francois; Renault, Tristan; Antajan, Elvire; Rauflet, Fabienne; Ropert, Michel; Mouillard, Gilbert; Gerla, Daniel; Annezo, Jean-pierre; Le Gal, Dominique; Langlade, Aime; Bedier, Edouard; Nourry, Max; Chabirand, Jean-michel; Fillon, Alain; Robert, Stephane; Courtois, Olivier. |
| Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s'inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l'introduction et la propagation d'organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l'évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l'IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Bonamia ostreae chez l'huître plate Ostrea edulis et la marteiliose à Marteilia refringens chez... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Réseau; Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Etat de santé. |
| Ano: 2009 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00086/19709/17351.pdf |
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| Francois, Cyrille; Joly, Jean-pierre; Garcia, Celine; Miossec, Laurence; Saulnier, Denis; Pepin, Jean-francois; Arzul, Isabelle; Omnes, Emmanuelle; Tourbiez, Delphine; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Chollet, Bruno; Robert, Maeva; Cobret, Laetitia; Renault, Tristan; Rauflet, Fabienne; Le Gagneur, Eric; Ropert, Michel; Mouillard, Gilbert; Gerla, Daniel; Annezo, Jean-pierre; Le Gal, Dominique; Langlade, Aime; Bedier, Edouard; Breerette, Stephane; Chabirand, Jean-michel; Grizon, James; Robert, Stephane; Courtois, Olivier; Rumebe, Myriam. |
| Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s'inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l'introduction et la propagation d'organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l'évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l'IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Banamia ostreae chez l'huître plate Ostrea edulis et la marteiliose à Marteilia refringens chez... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Réseau; Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Etat de santé. |
| Ano: 2010 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00086/19711/17352.pdf |
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| Guichard, Benjamin; Francois, Cyrille; Joly, Jean-pierre; Garcia, Celine; Saulnier, Denis; Pepin, Jean-francois; Arzul, Isabelle; Omnes, Emmanuelle; Tourbiez, Delphine; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Chollet, Bruno; Robert, Maeva; Renault, Tristan; Rauflet, Fabienne; Le Gagneur, Eric; Ropert, Michel; Mouillard, Gilbert; Gerla, Daniel; Annezo, Jean-pierre; Le Gal, Dominique; Langlade, Aime; Bedier, Edouard; Brerette, Stéphane; Chabirand, Jean-michel; Grizon, James; Robert, Stephane; Courtois, Olivier; Rumebe, Myriam; Cantin, Christian. |
| Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s’inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l’introduction et la propagation d’organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l’évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l’IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Bonamia ostreae chez l’huître plate Ostrea edulis et la marteiliose à Marteilia refringens chez... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Réseau; Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Santé; Surveillance. |
| Ano: 2011 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00059/17050/14599.pdf |
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| Francois, Cyrille; Joly, Jean-pierre; Garcia, Celine; Lupo, Coralie; Travers, Marie-agnes; Pepin, Jean-francois; Hatt, Philippe-jacques; Arzul, Isabelle; Omnes, Emmanuelle; Tourbiez, Delphine; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Huchet, Eve; Dubreuil, Christine; Chollet, Bruno; Renault, Tristan; Cordier, Remy; Hebert, Pascale; Le Gagneur, Eric; Parrad, Sophie; Gerla, Daniel; Annezo, Jean-pierre; Terre-terrillon, Aouregan; Le Gal, Dominique; Langlade, Aime; Bedier, Edouard; Hittier, Benoist; Grizon, James; Chabirand, Jean-michel; Robert, Stephane; Seugnet, Jean-luc; Rumebe, Myriam; Le Gall, Patrik; Bouchoucha, Marc; Baldi, Yoann; Masson, Jean-claude. |
| Créé en 1992, le réseau Repamo (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s’inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l’introduction et la propagation d’organismes pathogènes, en particulier ceux à réglementés et de surveiller l’évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font partie des missions institutionnelles de l’IFREMER. L’étude des hausses de mortalités (protocole II) a été poursuivie avec 52 interventions complètes ayant conduit au recueil de commémoratifs et à la réalisation d’échantillons de mollusques marins pour analyses en pathologie. Des hausses de mortalités... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Réseau; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Santé; Surveillance. |
| Ano: 2013 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25470/23625.pdf |
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| Lupo, Coralie; Osta Amigo, Axel; Fleury, Elodie; Robert, Stephane; Garcia, Celine; Arzul, Isabelle; Baillon, Laury; Bechemin, Christian; Canier, Lydie; Chollet, Bruno; Dechamps, Lucie; Dubreuil, Christine; Faury, Nicole; Francois, Cyrille; Godfrin, Yoann; Lapegue, Sylvie; Morga, Benjamin; Travers, Marie-agnes; Tourbiez, Delphine; Masson, Jean-claude; Verin, Francoise; Cordier, Remy; Gangnery, Aline; Louis, Wilfried; Mary, Charlotte; Normand, Julien; Penot, Julia; Cheve, Julien; Dagault, Francoise; Le Jolivet, Aurore; Le Gal, Dominique; Lebrun, Luc; Bellec, Gwenael; Bouget, Jean-francois; Cochennec-laureau, Nathalie; Palvadeau, Hubert; Grizon, James; Chabirand, Jean-michel; Pepin, Jean-francois; Seugnet, Jean-luc; D'Amico, Florence; Maurer, Daniele; Le Gall, Patrik; Mortreux, Serge; Baldi, Yoann; Orsoni, Valerie; Bouchoucha, Marc; Le Roy, Valerian; Pouvreau, Stephane; Queau, Isabelle; Lamoureux, Alice. |
| Depuis 1992, la surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français est assurée par le réseau de Pathologie des Mollusques (Repamo). Ses activités s’inscrivent dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Depuis son évaluation par la plateforme nationale d’épidémiosurveillance en santé animale en 2012, l’objectif de surveillance est la détection précoce des infections dues à des organismes pathogènes exotiques et émergents affectant les mollusques marins sauvages et d’élevage. L’année 2015 est la première année de transition pour laquelle un début d’évolution des modalités de surveillance de la santé des mollusques marins animées par l’Ifremer a été amorcé. Un dispositif hybride de surveillance a été mis en place, s’appuyant sur... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Réseau; Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Santé; Mortalité; Maladie. |
| Ano: 2016 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00324/43486/42945.pdf |
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| Cochennec-laureau, Nathalie; Baud, Jean-pierre; Bedier, Edouard; Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Nicolas, Jean-louis; Pepin, Jean-francois; Petton, Bruno. |
| Ce bilan comprend deux parties : la première est dédiée à une synthèse des travaux présentés lors des journées « Surmortalités des huîtres creuses, Crassostrea gigas » les 8 et 9 décembre 2009 et, la seconde partie, à une proposition d'un projet de recherche spécifique 2010-2012 en complément des propositions de « sortie de crise ». Contexte Les mortalités estivales de l'huître creuse, Crassostrea gigas, sont décrites depuis une vingtaine d'années en France mais également au Japon, en Corée, aux USA et en Australie. Ces phénomènes ou « syndrome des mortalités estivales » ont fait l'objet d'une étude pluridisciplinaire en France entre 2001 et 2006 (Défi MOREST). Toutefois, en 2008 et 2009, l'ostréiculture française a du faire face à deux épisodes de... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2010 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2010/acte-7393.pdf |
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| Suquet, Marc; Agogue, Julie; Brizard, Raphael; Haffray, Pierrick; Labbe, Catherine; Le Coz, Jean-rene; Pepin, Jean-francois; Rault, Paul; Saulnier, Denis. |
| Ce rapport fait état d'une étude réalisée au laboratoire de Génétique et Pathologie de l'IFREMER dans le cadre de l'analyse d'épisodes de mortalité anormale survenue en écloserie privée de crevettes pénéides. Plusieurs hypothèses ont été avancées. La présence de Vibrio harveyi a amené à constituer une collection de 40 souches à partir desquelles une identification bactériologique a été effectuée. Elle montre en effet une dominance de souches appartenant à un groupe homogène de Vibrio harveyi. La technique de ribotypage (digestion d'ADN génomique, transfert de Southem-blot et hybridation avec une sonde spécifique) est alors mise en place. Plusieurs difficultés techniques ont ralenti l'analyse et n'ont donc pas permis d'avoir des résultats assez avancés pour... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Tétraploïdes; Sperme; Conservation; Diagnostic zoo-sanitaire; Flore bactérienne; Herpès virus.. |
| Ano: 2007 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00304/41554/40762.pdf |
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| Nicolas, Jean-louis; Renault, Tristan; Gagnaire, Beatrice; Garcia, Celine; Le Roux, F; Miossec, Laurence; Pepin, Jean-francois; Saulnier, Denis. |
| L'un des objectifs principaux des travaux en pathologie des mollusques est d'identifier et d'étudier des agents infectieux capables d'induire des maladies et des mortalités chez les coquillages, en particulier, chez I'huître creuse, Crassostrea gigas, espèce principalement exploitée en France. Ces travaux semblent d'autant plus indispensables qu'il n'existait pas, jusqu'à ces dernières années, de maladies identifiées chez I'huître creuse en Europe excepté le virus herpès suspecté dès 1995 de provoquer des mortalités de naissain (Renault et al, 1995). Les principales maladies des espèces proches sont dues à des parasites comme Haplosporidium nelsoni (Ford et Heskin, 1987) et Perkinsus marinus Olivier et al, 1 998) pour Crassostrea virginica, Marteilia... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2006 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00304/41535/40743.pdf |
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| Batista, Frederico; Arzul, Isabelle; Pepin, Jean-francois; Ruano, Francisco; Friedman, Carolyn S.; Boudry, Pierre; Renault, Tristan. |
| Herpes-like viral infections have been reported in different bivalve mollusc species throughout the world. High mortalities among hatchery-reared larvae and juveniles of different bivalve species have been associated often with such infections. The diagnosis of herpes-like viruses in bivalve molluscs has been performed traditionally by light and transmission electron microscopy. The genome sequencing of one of these viruses, oyster herpesvirus 1 (OsHV-1), allowed the development of DNA-based diagnostic techniques. The polymerase chain reaction (PCR) has been used for the detection of OsHV-1 DNA in bivalve molluscs at different development stages. In addition, the PCR used for detection of OsHV-1 has also allowed the amplification of DNA from an OsHV-1... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Oyster; Bivalve molluscs; PCR; Detection; OsHV 1; Herpesvirus. |
| Ano: 2007 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-2322.pdf |
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| Varsamos, S.; Pepin, Jean-francois; Sauvage, Christopher; Renault, Tristan. |
| OsHV-1 was the first herpesvirus to be identified in an invertebrate host and is associated to mortalities in the Pacific oyster (Crassostrea gigas) and other economically important bivalve species. Infections due to OsHV-1 are frequently reported and cause high mortality rates in larvae and spat of C. gigas. Detection of this pathogen is usually performed by PCR and/or in situ hybridization. This presentation will focus on the development of a new molecular diagnostic tool for OsHV-1 (and OsHV-1 variant 1) detection: the mini-array. This detection system, which allows multiple pathogens detection, combines viral DNA amplification by PCR and a specific hybridisation on a nylon membrane, revealed by a colorimetric reaction (DNA chip). Multiplex PCR involves... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Diagnostic; Crassotrea gigas; Oyster; Detection; Herpesviridae; OsHV 1. |
| Ano: 2007 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/acte-3652.pdf |
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| Francois, Cyrille; Pepin, Jean-francois. |
| Increasing development of aquaculture business has thrown up new requirements in terms of prevention and control of mollusc diseases. In closed structures, one way to reduce infectious risk is to make use of anti-infectives . Specific drugs like antibiotics should be used only for therapeutic purpose against identified agents. Less specific anti-infectives like disinfectants could be employed for preventive and also for curative goals against causal pathogens and opportunist agents. A critical analysis synthesizes the bibliography available on disinfection in mollusc hatcheries and nurseries. Physical and chemical tools are reviewed then selected depending on four criteria: (1) efficiency against most important pathogens of molluscs, (2) safety for... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Antiseptics; Disinfectants; Nurseries; Hatcheries. |
| Ano: 2005 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/acte-3312.pdf |
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| Pepin, Jean-francois; Soletchnik, Patrick; Le Moine, Olivier; Polsenaere, Pierre; Genauzeau, Sylvie; Robert, Stephane; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Schmitt, Anne; Chabirand, Jean-michel; Tourbiez, Delphine; Travers, Marie-agnes; Guesdon, Stephane. |
| We report in this work data of two independent studies carried out in the Pertuis Charentais for which a link might exist? A 30-years local time series study of hydro-climatic variations in water temperature and salinity, which show a significant warming of the water masses in the Marennes Oleron bay (+ 1.5 °C) associated with a significant drop ( > -15%) of freshwater intakes by nearby rivers. In this changing local climate context several major epizootics have appeared, severely affecting farmers and the production of Pacific oysters and mussels, from the first French shellfish-producing department (catching and growing, Agreste, 2012). Following massive mortality event of blue mussels in 2014, a specific study (MORBLEU) is conducted, trying to... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2017 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00415/52697/53567.pdf |
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| Segarra, Amelie; Mauduit, Florian; Faury, Nicole; Trancart, Suzanne; Degremont, Lionel; Tourbiez, Delphine; Haffner, Philippe; Barbosa-solomieu, Valerie; Pepin, Jean-francois; Travers, Marie-agnes; Renault, Tristan. |
| Background: Massive mortality outbreaks affecting Pacific oyster (Crassostrea gigas) spat in various countries have been associated with the detection of a herpesvirus called ostreid herpesvirus type 1 (OsHV-1). However, few studies have been performed to understand and follow viral gene expression, as it has been done in vertebrate herpesviruses. In this work, experimental infection trials of C. gigas spat with OsHV-1 were conducted in order to test the susceptibility of several bi-parental oyster families to this virus and to analyze host-pathogen interactions using in vivo transcriptomic approaches. Results: The divergent response of these oyster families in terms of mortality confirmed that susceptibility to OsHV-1 infection has a significant... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Interactions; Ostreid herpesvirus 1; Gene expression; Susceptibility; Crassostrea gigas. |
| Ano: 2014 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00199/31029/29431.pdf |
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| Pepin, Jean-francois; Robert, Stephane; Soletchnik, Patrick; Seugnet, Jean-luc; Morin, Dimitri; Chabirand, Jean-michel; Costes, Louis; Geairon, Philippe; Grizon, James. |
| In France, today, more than 80% of farmed blue mussel seed collection is based on larvae fixation on collector ropes. Mussels are traditionally grown on bouchot, which are rows of wooden poles placed perpendicularly to the shore, stuck in the ground within the gently sloping intertidal strip. Mussels are transferred either as seed attached on collecting ropes or as juveniles placed in net sockings and then wound up around the poles or suspended to longlines, where they will fatten and grow (Garen et al., 2004). In order to optimize seed collection and to limit unwanted biofouling on ropes, mussel growers local organizations identify best timing of seed collector ropes deployment by monitoring the number and size of planktonic mussel larvae from water... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2018 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00455/56620/58332.pdf |
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| Schikorski, David; Renault, Tristan; Saulnier, Denis; Faury, Nicole; Moreau, Pierrick; Pepin, Jean-francois. |
| In 2008 and 2009, acute mortalities occurred in France among Pacific cupped oyster, Crassostrea gigas, spat. Different hypothesis including the implication of environmental factors, toxic algae and/or pathogens have been explored. Diagnostic tests indicated that OsHV-1 including a particular genotype, termed OsHV-1 mu Var, was detected in most of samples and especially in moribund oysters with the highlighting of virus particles looking like herpes viruses by TEM examination. In this study, an experimental protocol to reproduce OsHV-1 infection in laboratory conditions was developed. This protocol was based on the intramuscular injection of filtered (0.22 mu m) tissue homogenates prepared from naturally OsHV-1 infected spat collected on French coasts... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2011 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00037/14795/12104.pdf |
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| Segarra, Amelie; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Pepin, Jean-francois; Tourbiez, Delphine; Trancart, Suzanne; Travers, Marie-agnes; Renault, Tristan. |
| Le premier cas d'infection à virus de type herpès a été rapporté en 1972, aux Etats Unis, chez l'huître américaine, Crassostrea virginica (Farley et al, 1972). A partir de 1991, des mortalités massives associées à la détection de virus de type herpes ont été observées chez plusieurs espèces de bivalves marins, à différents stades de développement (essentiellement chez les larves et le naissain) et dans différentes régions du monde. Sur la base d’observation en microscopie électronique à transmission, ces virus présentaient des caractéristiques morphologiques identiques à celles des Herpesvirus (Roizman, 1982). Les connaissances acquises concernant la taille, la structure et le séquençage du génome d’un virus infectant les larves d’huîtres creuses en... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Herpès virus OsHV-1; Expression gènes; Huître creuse; Crassostrea gigas. |
| Ano: 2012 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00195/30627/29076.pdf |
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| Registros recuperados: 57 | |
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