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	Provedor de dados Repositório Alice (397) Infoteca-e (19) Autor REGITANO, L. C. de A. (416) ALENCAR, M. M. de (121) COUTINHO, L. L. (117) TIZIOTO, P. C. (82) IBELLI, A. M. G. (60) MUDADU, M. de A. (54) OLIVEIRA, M. C. de S. (44) SIQUEIRA, F. (40) HIGA, R. H. (39) CESAR, A. S. M. (36) MEIRELLES, S. L. (36) MOURÃO, G. B. (36) LIMA, A. O. de (34) OLIVEIRA, P. S. N. de (32) GASPARIN, G. (30) TULLIO, R. R. (30) VENERONI, G. B. (30) AFONSO, J. (28) MOKRY, F. B. (27) NICIURA, S. C. M. (27) Mais... Palavra-chave Beef cattle (42) Bos Indicus (34) Gado de Corte (32) Gado de Corte. (30) Gado Nelore (23) Expressão gênica (22) Cattle (19) Gado de corte (19) Single nucleotide polymorphism (18) Bovino (17) Nelore (17) Polimorfismo. (16) Bovinos (15) Gene expression (14) Nellore (14) SNP (13) Bos Indicus. (12) DNA (11) Espessura de gordura (10) Polimorfismo de nucleotídeo único (10) Mais... Tipo do documento Separatas (264) Artigo de periódico (71) Anais e Proceedings de eventos (40) Parte de livro (19) Documentos (INFOTECA-E) (5) Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) (4) Circular Técnica (INFOTECA-E) (3) Comunicado Técnico (INFOTECA-E) (3) Capítulo em livro técnico (INFOTECA-E) (2) Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) (1) Folhetos (1) Livros (1) Palestras Institucionais (1) Recomendação Técnica (INFOTECA-E) (1) Mais... Ano 2022 (9) 2021 (8) 2020 (7) 2019 (15) 2018 (12) 2017 (19) 2016 (24) 2015 (3) 2014 (20) 2013 (34) 2012 (26) 2011 (24) 2010 (25) 2009 (38) 2008 (18) 2007 (28) 2006 (18) 2005 (13) 2004 (18) 2003 (15) Mais... País Brazil (416) Idioma Português (293) Inglês (122) Espanhol (1)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 416 Primeira ... 1 2 3 4 5 6 7 8 9 ... Última A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J. S.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Transcription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: DNA bovino; Expressão gênica; Gene expression in cattle; Gene expression regulation. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102174 A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J. S.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Transcription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an... Tipo: Separatas Palavras-chave: DNA bovine; Gene expression in cattle; Gene expression regulation. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101203 A espessura de gordura subcutânea independe do genótipo de leptina em bovinos da raça Canchim criados a pasto. Repositório Alice SANTIAGO, A. C.; VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; OLIVEIRA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.. A criação de bovinos da raça Canchim para a produção de carne tem crescido no Brasil, porém, a carcaça de animais desta raça não apresenta boa cobertura de gordura, fator importante para a palatabilidade e para a conservação da carne após o abate. Por esse motivo, pesquisas que visam ao melhoramento dessa característica têm sido conduzidas. Uma abordagem muito utilizada para encontrar marcadores para uma característica desejada é a busca por associação com polimorfismos em genes candidatos. Entre os genes candidatos relacionados à deposição de gordura, o gene da leptina tem se destacado. Nos bovinos, o gene da leptina foi mapeado no cromossomo 4. Um polimorfismo existente no íntron 2 desse gene foi associado à deposição de gordura. O presente trabalho... Tipo: Separatas Palavras-chave: Leptina; Espessura de gordura; Canchim.; Polimorfismo.. Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/46207 A Genome-Wide Association Study of Meat Tenderness in Nelore Beef Cattle. Repositório Alice TIZIOTO, P.; DECKER, J.; TAYLOR, J.; SCHNABEL, R.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; SONSTEGARD, T.; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R.; NASSU, R. T.; FEIJO, G. L. D.; SIQUEIRA, F.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Genome map; Tagging; Characterization.; Cattle.. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/989023 A genome-wide scan for selection signatures in Nellore cattle. Repositório Alice SOMAVILLA, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; SIQUEIRA, F.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; COUTINHO, L. L.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.. Brazilian Nellore cattle (Bos indicus) have been selected for growth traits for over more than four decades. In recent years, reproductive and meat quality traits have become more important because of increasing consumption, exports and consumer demand. The identification of genome regions altered by artificial selection can potentially permit a better understanding of the biology of specific phenotypes that are useful for the development of tools designed to increase selection efficiency. Therefore, the aims of this study were to detect evidence of recent selection signatures in Nellore cattle using extended haplotype homozygosity methodology and BovineHD marker genotypes (>777 000 single nucleotide polymorphisms) as well as to identify corresponding... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Single nucleotid; Relative extended haplotype homozygosity; Single nucleotide polymorphisms; Bos Indicus; Beef cattle; Genotyping; Linkage disequilibrium. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/998406 A genômica na bovinocultura de corte. Repositório Alice COUTINHO, L. L.; JORGE, E. C.; ROSÁRIO, M. F. do; REGITANO, L. C. de A.. Genômica: definição e conceito; Aplicações da genômica; Perspectivas das aplicações da genômica. Tipo: Separatas Palavras-chave: Genômica; Melhoramento genético.; DNA.. Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/862890 A single nucleotide polymorphism in NEUROD1 is associated with production traits in nelore beef cattle. Repositório Alice OLIVEIRA, P. P. A.; TIZIOTO, P. C.; MALAGO JUNIOR, W.; NASCIMENTO, M. L. do; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. da S.; SOUZA, M. M. de; LANNA, D. P. D.; TULLIO, R. R.; MOURAO, G. B.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Feed efficiency and carcass characteristics are late-measured traits. The detection of molecular markers associated with them can help breeding programs to select animals early in life, and to predict breeding values with high accuracy. The objective of this study was to identify polymorphisms in the functional and positional candidate gene NEUROD1 (neurogenic differentiation 1), and investigate their associations with production traits in reference families of Nelore cattle. A total of 585 steers were used, from 34 sires chosen to represent the variability of this breed. By sequencing 14 animals with extreme residual feed intake (RFI) values, seven single nucleotide polymorphisms (SNPs) in NEUROD1 were identified. The investigation of marker effects on... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Candidate gene; Feed efficiency; Bos Indicus; Body composition. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1053741 A SNP in NEUROD1 is associated with production traits in Nelore beef cattle. Repositório Alice OLIVEIRA, P. S. N. de; TIZIOTO, P. C.; NORONHA, C. T.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Candidate gene; Feed consuption.; Bos Indicus.. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/992509 Accuracy of genotype imputation in a Nellore Cattle population in Brazil. Repositório Alice SILVA, F. de L.; ROSA, A. do N.; SIQUEIRA, F.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; MOURÃO, G. B.; ROSA, G. J. M.. Genome wide-association studies (GWAS) generally require large numbers of individuals that are both phenotyped and desenly genotyped for markers across the genome. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Nelore; Gado Nelore; Gado de corte; Cattle; Beef cattle. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1028849 Accuracy of genotype imputation in Canchim cattle using FImpute and Beagle software., Repositório Alice CHUD, T. C. S.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL. F. S.; URBINATI, I.; CARVALHEIRO, R.; REGITANO, L. C. de A.; MARCONDES, C. R.; MINARI, D. P.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Genotype imputation; Canchim; FImpute; Beagle software. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/988841 Ações de gestão ambiental: o caso da Embrapa Pecuária Sudeste. Repositório Alice PRIMAVESI, O.; VINHOLIS, M. de M. B.; NICODEMO, M. L. F.; CORDEIRO, C. A.; ESCRIVANI, L. P.; ANTONIO, F. de J. A.; SOUZA, G. B. de; NOGUEIRA, A. R. de A.; REGITANO, L. C. de A.; BERNARDI, A. C. de C.. Fatores de degradação ambiental como desmatamentos, queimadas, eliminação de áreas verdes permanentes que atuam como umidificadores do ar e estabilizadores térmicos, práticas agrícolas não conservacionistas com perda da capacidade produtiva dos solos e impedimento na recarga adequada de lençóis freáticos, aumento da produção de dejetos e rejeitos, consumismo e ruptura no conhecimento da sociedade urbana sobre sua dependência do meio natural resultam na redução da biodiversidade, no aumento de pragas e patógenos e nas mudanças climáticas regionais e global. Várias são as ações de gestão ambiental que podem minimizar estes efeitos. O presente trabalho tem por objetivo relatar e descrever as experiências relacionadas à gestão ambiental realizadas pela Embrapa... Tipo: Separatas Palavras-chave: Sistema de produção integrado.; Conservação; Educação Ambiental; Meio Ambiente.. Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/40204 Acurácia de imputação de genótipos para estudos de associação genômica em bovinos da raça Canchim. Repositório Alice SANTIAGO, G. G.; SIQUEIRA, F.; BOISON, S. A.; CARDOSO, F. F.; REGITANO, L. C. de A.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.. Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Marcadores; Single Nucleotide Polimorphism. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1016060 Ajuste de modelos não lineares no estudo de associação entre polimorfismos genéticos e o crescimento em bovinos de corte. Repositório Alice PAZ, C. C. P. de; FREITAS, A. R.; PACKER, I. U.; TAMBASCO TALHARI, D.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de. Foram utilizados dados de peso ao nascimento, ao desmame e mensais dos 8 aos 19 meses de idade de 11 classes de genótipos formadas pela concatenação dos polimorfismos genéticos da kappa-caseína-HinfI (CSN3): AA e AB, do hormônio do crescimento-AluI (GH): LL e LV e da b-lactoglobulina-HaeIII (LGB): AA, AB e BB. As informações foram obtidas de animais de três grupos genéticos: ½Canchim-Nelore (CN), ½Angus-Nelore (AN) e ½Simental-Nelore (SN), nascidos em 1998 e 1999 e pertencentes à Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos, SP. Dos cinco modelos estudados: Brody, Von Bertalanffy, Richards, Gompertz e Logístico, o último apresentou melhor qualidade do ajuste. As estimativas dos parâmetros A (valor assintótico), k (taxa de maturação) e m (ponto de inflexão) obtidas... Tipo: Separatas Palavras-chave: Desenvolvimento ponderal; Modelo logístico; Marcadores genéticos.; Bos Indicus; Bos Taurus; Curva de Crescimento.. Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/46471 Ajuste de modelos não lineares para dados de associação de genes candidatos com peso corporal de bovinos de corte. Repositório Alice PAZ, C. C. P. de; FREITAS, A. R. de; PACKER, I. U.; TAMBASCO, D. D.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Peso corporal; Gado de Corte; Genes. Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/46108 Ajuste de modelos não-lineares em estudos de associação entre polimorfismos genéticos e crescimento em bovino de corte. Repositório Alice PAZ, C. C. P. de; PACKER, I. U; FREITAS, A. R. de; TAMBASCO-TALHARI, D.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; CRUZ, G. M. da. Tipo: Separatas Palavras-chave: Curvas de crescimento; Desenvolvimento ponderal; Marcadores genéticos; Modelo logistico.; Bos Indicus; Bos Taurus.. Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/46994 Allele- and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: a candidate for meat tenderness in cattle. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; ROCHA, M. I. P.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Nelore; Expressão alélica diferencial; Maciez da carne; Gado Nelore; Alleles. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1052240 Allele-specific expression is widespread in Bos indicus muscle and affects meat quality candidate genes. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; ROCHA, M. I. P.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; CARDOSO, T. F.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; ANDRADE, B. G. N.; MUDADU, M. de A.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Differences between the expression of the two alleles of a gene are known as allele-specific expression (ASE), a common event in the transcriptome of mammals. Despite ASE being a source of phenotypic variation, its occurrence and effects on genetic prediction of economically relevant traits are still unexplored in bovines. Furthermore, as ASE events are likely driven by cis-regulatory mutations, scanning them throughout the bovine genome represents a significant step to elucidate the mechanisms underlying gene expression regulation. To address this question in a Bos indicus population, we built the ASE profile of the skeletal muscle tissue of 190 Nelore steers, using RNA sequencing data and SNPs genotypes from the Illumina BovineHD BeadChip (770 K bp).... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Expressão gênica; Regulação da expressão gênica; Allelic expression; Allele-specific expression; Bos Indicus; Gene expression regulation. Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125395 Allele-specific gene expression in liver of Nelore cattle extremes for feed efficiency. Repositório Alice ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Allele-specific expression; Genome regulation.; Genetic improvement.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1073455 An insight into the linkage disequilibrium map of the Canchim beef cattle breed. Repositório Alice MOKRY, F. B.; LIMA, A. O. de; MUDADU, M. A.; HIGA, R. H.; MEIRELLES, S. L. C.; REGITANO, L. C. de A.. The development of linkage disequilibrium (LD) maps is very important for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes, as LD can be defined as the non-random segregation of a pair of alleles at polymorphic sites. Canchim is a composite beef cattle breed which was developed in the 1960's by the crossing of Bos indicus (3/8) x Charolais (5/8) animals. The objective in this study was to analyze the extension of LD maps from a Canchim beef cattle population. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Desequilíbrio de ligação.; Gado.; Linkage disequilibrium; Cattle; Zebu; Haplotypes. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/946432 An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. Repositório Alice OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A.. Residual Feed Intake (RFI) is an economically relevant trait in beef cattle. Among the molecular regulatory mechanisms, microRNAs (miRNAs) are an important dimension in post-transcriptional regulation and have been associated with different biological pathways. Here, we performed differential miRNAs expression and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) to better understand the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in bovine skeletal muscle and liver. MiRNA and mRNA expression data were obtained from Nelore steers that were genetically divergent for RFI (N = 10 [low RFI or feed efficient]; N = 10 [high RFI or feed inefficient]). Differentially expressed and hub miRNAs such as bta-miR-486, bta-miR-7, bta-miR15a, bta-miR-21,... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: RFI; MiRNA; Gado Nelore; Beef cattle; Nellore; Skeletal muscle. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099755 Registros recuperados: 416 Primeira ... 1 2 3 4 5 6 7 8 9 ... Última

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