SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

RABELO, F. R.; CARAZZOLLE, M. F.; MARTINS, N. F.; CAMPOS, M. A.; SILVA, M. S.; SILVA, A. C.; SOUZA, A. A. de; AMARAL, A. M. do; REIS, A. M. dos.

No Brasil, um dos importantes problemas enfrentados por produtores de café e citros envolve os danos causados pela bactéria Xylella fastidiosa. Esta bactéria causa o entupimento dos vasos do xilema e impede a passagem de água e nutrientes, o que causa uma condição biológica de estresse hídrico. Os genomas de citros e café têm sido investigados funcionalmente e várias seqüências expressas (ESTs) foram identificadas a partir de diversas condições biológicas. Bibliotecas de EST utilizando folhas e ramos infectados com X. fastidiosa foram construídas em citros e café, respectivamente. A análise in silico das ESTs nesses tecidos revelou genes comuns expressos em ambas as culturas. Alguns destes genes codificam para proteínas relacionados com a resposta de...

Análise in silico de genes de Caseíno-quinases tipo I e II de Coffea arabica.

Palavras-chave: EST; Filogenia; Aguaporina; Drought-induced protein Di19-like protein DIP; Fiber protein Fb2.

Ano: 2007

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906023

SILVA, A. C. da; REIS, A. M. dos; MARTINS, N. F..

As proteínas quinases são enzimas fundamentais na transmissão de sinais intra e extracelulares de organismos eucariotos, incluindo organismos unicelulares, animais e plantas. Esta classe de enzimas é responsável pela regulação de inúmeros processos celulares, incluindo divisão celular, expressão gênica, desenvolvimento de tecidos, entre outros. No gênero Coffea, há pouca informação sobre as proteínas quinases e o papel que desempenham. Este trabalho tem como objetivo identificar genes semelhantes a caseíno-quinase tipo I e caseíno-quinase tipo II, através da análise in silico utilizando a base de dados do CafEST.

Análise in silico de genes de defesa do café expressos em ramos infectados por Xylella fastidiosa.

Palavras-chave: Coffea arabica; Café; Coffee; Quinases; Kinases; CKI; CKII; Análise; Analysis..

Ano: 2007

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906035

RABELLO, F. R.; CARAZZOLLE, M. F.; MARTINS, N. F.; CAMPOS, M. A.; SILVA, M. S.; SILVA, A. C.; REIS, A. M. dos.

Um dos problemas que afetam a cultura do café é o depauperamento da folha do cafeeiro (?Coffee Leaf Scorch? - CLS), causado pela bactéria Xylella fastidiosa. Esta bactéria forma agregados no xilema da planta, impossibilitando a passagem de água e nutrientes. Em virtude da importância econômica da cultura do café para o Brasil e das perdas causadas por X. fastidiosa, uma biblioteca de cDNA (RX1) foi construída utilizando ramos de cafeeiro infectados com esta bactéria e os ESTs (?Expressed sequence tags?) foram incluídos no banco de dados do CafEST (Genoma Funcional de Café). Com o objetivo de identificar genes potencialmente envolvidos nos processos de defesa de cafeeiro infectado com X. fastidiosa, foi realizada uma análise in silico dos ESTs de RX1. Foi...

Análise proteômica de embriões zigóticos e endosperma em sementes de Coffea arabica.

Palavras-chave: Café; Análise; Bactéria..

Ano: 2007

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906039

KOSHINO, L. L.; ANDRADE, A. E.; SILVA, L. P. da; BLOCH JUNIOR, C.; FRANCO, O. L.; EIRA, M. T. S. da; TEIXEIRA, J. B.; REIS, A. M. dos.

Durante o desenvolvimento da semente de café, proteínas vão sendo depositadas, predominantemente nos cotilédones e no endosperma. As proteínas de reserva 11S são as globulinas mais abundantes na semente de café agindo como fonte de nitrogênio nas reações de torra e garantindo o sabor e aroma característicos. Este estudo teve como objetivo analisar o perfil de proteínas expressas em endosperma e embrião zigótico de sementes de café. Proteínas foram extraídas da semente inteira, e também do endosperma e embrião de café, isoladamente. Em seguida, as proteínas foram analisadas por eletroforese bidimensional (2-DE) e posteriormente por espectrometria de massa. Os spots mais abundantes observados no gel de proteínas de semente inteira foram excisados,...

Comparative proteomic analyses of Anticarsia gemmatalis and Spodoptera frugiperda guts.

Palavras-chave: Coffea arabica; Café; Coffee; Análise proteômica; Proteomic Analysis; Espectrometria de massa; Mass spectronetry..

Ano: 2007

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906056

MEHRKHOU, F.; TALEBI, A. A.; KOCHAMESHGI, M. G.; HOSSEININAVEH, V.; CÂNDIDO, E. de S.; PETRIZ, B.; DIAS, S. C.; CASTRO, M. E. B. de; REIS, A. M. dos; FRANCO, O. L..

bitstream/item/156252/1/2A80BE239026.pdf

Comparative proteomical and metalloproteomical analyses of human plasma from patients with laryngeal cancer.

Palavras-chave: Mass spectrometry (MS); Anticarsia Gemmatalis; Spodoptera Frugiperda; Proteomics.

Ano: 2012

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/950085

GOMES, C. P. C.; FREIRE, M. S.; PIRES, B. R. B.; VASCONCELOS, E. A. R.; ROCHA, T. L.; SA, M. F. G. de; REZENDE, T. M. B.; REIS, A. M. dos; PEREIRA, R. W.; PETRIZ, B. A.; CRUZ, A. D. da; PESCARA, I. C.; FRANCO, O. L..

bitstream/item/181794/1/Gomes2009-Article-ComparativeProteomicalAndMetal.pdf

Comparative proteomics and gene expression analysis in Arachis duranensis reveal stress response proteins associated to drought tolerance.

Palavras-chave: Laryngeal cancer; Human plasma; Immunology; Proteomics; Trace elements.

Ano: 2010

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/869747

CARMO, L. S. T.; MARTINS, A. C. Q.; MARTINS, C. C. C.; PASSOS, M. A. S.; SILVA, L. P. da; ARAUJO, A. C. G. de; BRASILEIRO, A. C. M.; MILLER, R. N. G.; GUIMARAES, P. M.; REIS, A. M. dos.

bitstream/item/192427/1/1-s2.0-S187439191830352X-main.pdf

Comparative proteomics between natural Microcystis isolates with a focus on microcystin synthesis.

Palavras-chave: Arachis duranensis; Proteomic profile; Transcript expression; QRT-PCR; Drought tolerance.

Ano: 2019

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105765

TONIETTO, A.; PETRIZ, B. A.; ARAÚJO, W. C.; REIS, A. M. dos; MAGALHÃES, B. S.; FRANCO, O. L..

bitstream/item/156255/1/art3A10.11862F1477-5956-10-38.pdf

Comparison of different staining methods for coffee proteomic analysis.

Palavras-chave: Cyanotoxin; Cyanobacteria; Microcystis aeruginosa; Proteome.

Ano: 2012

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/950118

FRANCO, O. L.; ANDRADE, A. E.; BARROS, E. V. S. A.; SA, M. F. G. de; CARNEIRO, R. M. D. G.; CARNEIRO, R.; EIRA, M. T. S. da; ROCHA, T. L.; REIS, A. M. dos.

Proteomic methods, such as bidimensional electrophoresis (2-DE) and mass spectrometry, have been extensively used for the study of protein differential expression in several plants including Arabidopsis thaliana, rice and wheat. Specifically in the 2-DE method, deep attention must be given to the protein staining technique, which often involves silver nitrate or Coomassie Brilliant Blue (CBB). Silver staining is usually preferred over CBB due to the higher sensitivity obtained. Nevertheless, silver-staining resolution could significantly vary according to the studied organism and more specifically to the researched tissue. In Coffea spp., 2-DE analysis has been rarely employed. Some studies of protein expression have been reported in this culture mainly...

Corrigendum: proteomic analysis and functional validation of a Brassica oleracea Endochitinase involved in resistance to Xanthomonas campestris.

Palavras-chave: Proteomic method; Bidimensional electrophoresis.

Ano: 2007

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/885752

SANTOS, C.; NOGUEIRA, F. C. S.; DOMONT, G. B.; FONTES, W.; PRADO, G. S.; HABIBI, P.; SANTOS, V. O.; OLIVEIRA-NETO, O. B.; SA, M. F. G. de; JORRÍN-NOVO, J. V.; FRANCO, O. L.; REIS, A. M. dos.

bitstream/item/213362/1/fpls-11-00201.pdf

Effects of acute exercise over heart proteome from monogenic obese (ob/ob) mice.

Palavras-chave: LC-MS/MS; Differential protein abundance; QRT-PCR; Plant–pathogen interaction.; Gene overexpression.

Ano: 2019

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110405

PETRIZ, B. A.; CUNHA, V. N.; VILLETH, G. R. C.; REIS, A. M. dos; ROCHA, L. A. O.; SILVA, O. N.; ALMEIDA, J. A.; MORAIS, P. K.; SIMÕES, H. G.; FRANCO, O. L..

bitstream/item/156240/1/Petriz-et-al-2013-Journal-of-Cellular-Physiology.pdf

Expressão de genes em ramos de café depauperado com a presença de Xylella fastidiosa.

Palavras-chave: Cardiovascular disorders; Heart proteome; Obesity.

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/964132

Genotype-dependent changes of gene expression during somatic embryogenesis in oil palm hybrids (Elaeis oleifera x E. guineensis).

REIS, A. M. dos; OLIVEIRA, A. C. de; EIRA, M. T. S. da; LEITE JUNIOR, R. P.; CARVALHO, A. C.; SILVA, F. R..

2003

Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE)

Palavras-chave: Xylella fastidiosa; Biblioteca genômica; Detecção.

Ano: 2003

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/909042

SANTOS, I. R.; MAXIMIANO, M. R.; ALMEIDA, R. F.; CUNHA, R. N. V. da; LOPES, R.; PEREIRA, J. E. S.; REIS, A. M. dos.

bitstream/item/189725/1/journal.pone.0209445.pdf

Mechanism of the drought tolerance of a transgenic soybean overexpressing the molecular chaperone BiP.

Palavras-chave: Oil palm; Elaeis Oleifera; Elaeis Guineensis.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102970

COUTINHO, F. S.; SANTOS, D. S. dos; LIMA, L. L.; VITAL, C. E.; SANTOS, L. A.; PIMENTA, M. R.; SILVA, J. C. da; RAMOS, J. R. L. S.; REIS, A. M. dos; FONTES, E. P. B.; RAMOS, H. J. de O..

bitstream/item/195710/1/Coutinho2019-Article-MechanismOfTheDroughtTolerance.pdf

Methodological evaluzation of 2-DE to study root proteomics during nematode infection in cotton and coffee plants.

Palavras-chave: Stress abiotic; Amino acid metabolism; Proteomics; Metabolomics.

Ano: 2019

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1108129

FRANCO, O. L.; PEREIRA, J. L.; COSTA, P. H. A. "; ROCHA, T. L.; FR, E. V. S. A.; SA, M. F. G. de; CARNEIRO, R. M. D. G.; CARNEIRO, R. G.; REIS, A. M. dos.

bitstream/item/183190/1/METHODOLOGICAL-EVALUATION-OF-2-DE-TO-STUDY-ROOT-PROTEOMICS-DURING-NEMATODE-INFECTION-IN-COTTON-AND-COFFEE-PLANTS.pdf

Proteomic analysis of developing somatic embryos of Coffea Arabica.

Palavras-chave: Differential expression; Meloydogine; Staining methods; Two-dimensional gels; Proteins.

Ano: 2010

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/882810

TONIETTO, A.; SATO, J. H.; TEIXEIRA, J. B.; SOUZA, E. M. de; PEDROSA, F. O.; FRANCO, O. L.; REIS, A. M. dos.

bitstream/item/156256/1/art3A10.10072Fs11105-012-0425-7.pdf

Quantitative expression of microRNAs in Brassica oleracea infected with Xanthomonas campestris pv. campestris.

Palavras-chave: 2-DE; Protein profile; Molecular markers; Mass spectrometry; Somatic embryogenesis.

Ano: 2012

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/950104

SANTOS, L. S.; MAXIMIANO, M. R.; MEGIAS, E.; PAPPAS, M. de C. R.; RIBEIRO, S. da G.; REIS, A. M. dos.

bitstream/item/198505/1/Santos2019-Article-QuantitativeExpressionOfMicroR.pdf