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A novel divergent geminivirus identified in Asymptomatic new world Cactaceae plants. Repositório Alice
FONTENELE, R. S.; SALYWON, A. M.; MAJURE, L. C.; COBB, I. N.; BHASKARA, A.; AVALOS-CALLEROS, J. A.; ARGÜLLO-ASTORGA, G. R.; SCHMIDLIN, K.; KHALIFEH, A.; SMITH, K.; SCHRECK, J.; LUND, M. C.; KÖHLER, M.; WOJCIECHOWSKI, M. F.; HODGSON, W. C.; PUENT-MARTINEZ, R.; VAN DOORSLAER, K.; KUMARI, S.; VERNIÈRE, C.; FILLOUX, D.; ROUMAGNAC, P.; LEFEUVRE, P.; RIBEIRO, S. G.; KRABERGER, S.; MARTIN, D. P.; VARSANI, A..
bitstream/item/213975/1/viruses-12-00398.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Geminivirus; Cactoideae; Opuntioideae; SsDNA virus; Cochineal insects.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1123276
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An isolate of sweet potato chlorotic stunt virus from Brazil with a distinct genome organization. Repositório Alice
ROSSATO, M.; SOUZA, C. A.; MELO, F. L.; ORILIO, A. F.; RESENDE, R. O.; RIBEIRO, S. G.; NAITO, F. Y. B.; RIBEIRO, G. P.; ANDRADE, G. P.; PEREIRA?CARVALHO, R. C..
bitstream/item/202669/1/Rossato2019-Article-AnIsolateOfSweetPotatoChloroti.pdf
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Genetic research; Genomes; DNA sequencing; Phylogeny; Genomics.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1112895
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Avaliação de genótipos de tomateiro visando resistência a geminivírus de genoma bipartido do Distrito Federal e de Pernambuco. Repositório Alice
SANTANA, F. M.; RIBEIRO, S. G.; BEZERRA, I. C.; MOREIRA JUNIOR, D. J. F.; GIORDANO, L. B..
1999
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular.
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189003
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Bean transformation for resistance to bean golden mosaic virus. Repositório Alice
ARAGÃO, F. J. L.; RIBEIRO, S. G.; BARROS, L. M. G.; BRASILEIRO, A. C. M.; RECH, E. L.; FARIA, J. C..
bitstream/item/164416/1/CNPAF-19930001.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Mosca branca; Mosaico dourado; Engenharia genética.
Ano: 1993 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/215345
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Characterization of a new whitefly-transmitted (Bemisia tabaci Meam 1) cytorhabdovirus infecting common bean. Repositório Alice
LIMA, B. P. de; ALVES-FREITAS, D. M. T.; MELO, F. L. de; CARVALHO, R. de C. P.; FARIA, J. C. de; RIBEIRO, S. G..
Common bean (Phaseolus vulgaris) is an important crop in Latin America and Africa. The bean yield may be affected by the incidence of different viruses. As part of a virus survey in beans, we have used high-throughput sequencing approach to identify viruses with RNA genome in bean plants collected in Goiás (GO) state. Bioinformatic analysis of the de novoassembled contigs identified a putative cytorhabdovirus (family Rhabdoviridae) with low similarities with Northern cereal mosaic virus (NCMV). This new cytorhabdovirus was denominated Bean associated cytorhabdovirus (BaC). Cytorhabdoviruses have enveloped particles, negative ssRNA of 11-14 kb genome and are usually transmitted by aphids or leafhoppers.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Bemisia tabaci; Mosca branca; Cytorhabdovirus.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078777
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Characterization of Aspergillus flavus strains from Brazilian Brazil nuts and cashew by RAPD and ribosomal DNA anlysis. Repositório Alice
MIDORIKAWA, G. E. O.; PINHEIRO, M. R. R.; VIDIGAL, B. S.; ARRUDA, M. C.; COSTA, F. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; RIBEIRO, S. G.; FREIRE, F.; MILLER, R. N. G..
bitstream/item/177841/1/SP-19618-ID-30903.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Controle; Micotoxins; Aspergillus Flavus.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/190632
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Clonagem e expressão da capa protéica de geminivírus de tomateiro em Escherichia coli para estudos sorológicos. Repositório Alice
ORLANDINI, D. R. S.; MIRANDA, J. D. R.; INOUE-NAGATA, A. K.; NAGATA, T.; BEZERRA, I. C.; ÁVILA, A. C. de; RIBEIRO, S. G..
1999
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular.
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189011
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Complete genome sequence of a genomovirus associated with common bean plant leaves in Brazil. Repositório Alice
LAMAS, N. S.; FONTENELE, R. S.; MELO, F. L.; COSTA, A. F.; VARSANI, A.; RIBEIRO, S. G..
2016
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Circular genome; Tongan fruit bat guano; Bean.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1061592
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Detecção via PCR deCandidatus Portiera aleyrodidarum e Wolbachia em populações de bemisia tabaci colonizando tomateiro. Repositório Alice
VIEIRA, B. G.; MENDONÇA, L.; FARIAS, P. C.; RESENDE, R. O.; FONSECA-BOITEUX, M. E. de N.; BOITEUX, L. S.; RIBEIRO, S. G.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..
O objetivo deste trabalho foi detectar a presença de endossimbiotes em populações de B. tabaci associadas com tomateiros (Solanum lycopersicum L) no Distrito Federal.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Doença de planta; Virus; Praga; Bemisia tabaci.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/911011
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Detection of two endornavirus in common bean genotypes in Brazil. Repositório Alice
ALVES-FREITAS, D. M. T.; RIBEIRO, G. C.; MATOS, V. O. R. L.; MELO, L. C.; FARIA, J. C.; RIBEIRO, S. G..
Endornaviruses (Endornaviridae) are persistent viruses that infect important crops such as pepper, rice, broad bean, and beans. However, these viruses are poorly studied and have not yet been reported in Brazil. In this study, we investigated the occurrence of two endornaviruses, Phaseolus vulgaris endornavirus-1 (PvEV-1) and Phaseolus vulgaris endornavirus-2 (PvEV-2) in bean genotypes.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Doença de planta; Genótipo; Endornavirus; Phaseolus vulgaris endornavirus.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032667
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Discovery of potnetial entomopathogenic rna viruses in the whitefly (Bemisia Tabaci) using nest generation sequencing. Repositório Alice
NAKASU, E. Y. T.; MELO, F. L.; NAGATA, T.; MICHEREFF FILHO, M.; SOUZA, J. O.; RIBEIRO, B. M.; RIBEIRO, S. G.; LACORTE, C.; PEREIRA, J. L.; INOUE-NAGATA, A. K..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mosca branca; Controle biológico; RNA; Virus.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1031015
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Discovery of the first maize-infecting mastrevirus in the Americas using a vector-enabled metagenomics approach. Repositório Alice
FONTENELE, R. S.; ALVES-FREITAS, D. M. T.; SILVA, P. I. T.; FORESTI, J.; SILVA, P. R.; GODINHO, M. T.; VARSANI, A.; RIBEIRO, S. G..
bitstream/item/174581/1/10.1007-s00705-017-3571-21.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Maize-infecting mastrevirus.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1089749
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Distribuicao de geminivirus na culturas do tomate e pimentao em doze municipios do submedio do Vale Sao Francisco. Repositório Alice
LIMA, M. F.; BEZERRA, I. C.; RIBEIRO, S. G.; AVILA, A. C. de.
bitstream/item/193361/1/a14v26n1.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Geminivirus; Deteccao; Ocorrencia; Vale do Sao Francisco; Brasil; Sweet pepper; Diseases; Capsicum Annuum; Doença; Lycopersicon Esculentum; Pimentão; Tomate; Vírus; Begomovirus; Brazil; Detection; Occurrence; Tomatoes.
Ano: 2001 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/769759
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Distribution and genetic diversity of tomato-infecting begomoviruses in Brazil. Repositório Alice
RIBEIRO, S. G.; AMBROZEVÍCIUS, L. P.; ÁVILA, A. C.; BEZERRA, I. C.; CALEGARIO, R. F.; FERNANDES, J. J.; LIMA, M. F.; MLLO, R. N. de; ROCHA, H.; ZERBINI, F. M..
Tomato-infecting begomoviruses have been reported throughout Brazil since the introduction of the B biotype of Bemisia tabaci. Here, we report a large scale survey on the distribution and genetic diversity of tomato-infecting begomoviruses. Tomato samples withtypical begomovirus symptoms were collected in seven different states, comprising the major tomato growing areas of the country. Viruses were detected by polymerase chain reaction (PCR) using universal primers for the genus Begomovirus. PCR-amplified fragments were cloned and sequenced. Based on sequence comparisons and phylogenetic analyses, at least seven previously undescribed species of begomoviruses were found. Four of the new viruses were found exclusively in the Southeastern states, two...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Geminivirus; Tomato; Tomate; Doença; Vírus; Begomovirus.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/155962
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Diversidade genética de begomovirus infectando feijoeiro no Brasil. Repositório Alice
SILVA, T. A L.; FONTENELE, R. S.; FARIA, J. C.; ARAGAO, F. J. L.; RIBEIRO, S. G..
2010
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Begomovirus; Feijão; Phaseolus vulgaris; Mosaico dourado; Bemisia tabaci.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/866018
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Diversity of begomoviruses in the whitefly (Bemisia tabasi). Repositório Alice
NAKASU, E. Y. T.; MELO, F. L.; NAGATA, T.; MICHEREFF FILHO, M.; SOUZA, J. O.; RIBEIRO, B. M.; RIBEIRO, S. G.; LACORTE, C.; PEREIRA, J. L.; NAGATA, A. K. I..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Praga; Inseto; Mosca branca; Bemisia tabaci.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1030982
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Double-stranded RNA high-throughput sequencing reveals a new Cytorhabdovirus in a bean golden mosaic virus-resistant common bean transgenic line. Repositório Alice
ALVES-FREITAS, D. M. T.; PINHEIRO-LIMA, B.; FARIA, J. C.; LACORTE, C.; RIBEIRO, S. G.; MELO, F. L..
Using double-strand RNA (dsRNA) high-throughput sequencing, we identified five RNA viruses in a bean golden mosaic virus (BGMV)-resistant common bean transgenic line with symptoms of viral infection. Four of the identified viruses had already been described as infecting common bean (cowpea mild mottle virus, bean rugose mosaic virus, Phaseolus vulgaris alphaendornavirus 1, and Phaseolus vulgaris alphaendornavirus 2) and one is a putative new plant rhabdovirus (genus Cytorhabdovirus), tentatively named bean-associated cytorhabdovirus (BaCV). The BaCV genome presented all five open reading frames (ORFs) found in most rhabdoviruses: nucleoprotein (N) (ORF1) (451 amino acids, aa), phosphoprotein (P) (ORF2) (445 aa), matrix (M) (ORF4) (287 aa), glycoprotein (G)...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Rhabdovirus; Feijão; Phaseolus Vulgaris; Organismo Transgênico; Vírus; Mosaico Dourado; Beans; Cytorhabdovirus; DsRNA viruses; Transgenic plants; Bean golden mosaic virus.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1104582
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DSRNA deep sequencing reveals five viral species in common beans. Repositório Alice
ALVES-FREITAS, D. M. T.; MELO, F. L.; FARIA, J. C.; RIBEIRO, S. G..
To investigate which viruses were present in these plants, we performed highthroughput sequencing from preparations enriched for viral dsRNA. Leaves from transgenic BGMV resistant common bean breeding line CNFCT16207 showing severe crinkling were collected in Goiás, Brazil.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Carlavirus; Feijão; Phaseolus vulgaris; Doença de planta; Virus; Endornavirus; Beans.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1065314
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Erratum to: discovery of two small circular ssDNA viruses associated with the whitefly Bemisia tabaci. Repositório Alice
NAKASU, E. Y. T.; MELO, F. L.; MICHEREFF FILHO, M.; NAGATA, T.; RIBEIRO, B. M.; RIBEIRO, S. G.; LACORTE, C.; INOUE-NAGATA, A. K..
The complete genome sequences of two novel small circular DNA viruses isolated from sweet-potato whiteflies collected in Central-West (AdDF) and Southeast (AdO) regions of Brazil were determined by Next Generation Sequencing (NGS), and confirmed by cloning and Sanger sequencing.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Sweet-potato whitefly.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1081624
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Erratum to: discovery of two small circular ssDNA viruses associated with the whitefly Bemisia tabaci. Repositório Alice
NAKASU, E. Y. T.; MELO, F. L.; MICHEREFF FILHO, M.; NAGATA, T.; RIBEIRO, B. M.; RIBEIRO, S. G.; LACORTE, C.; INOUE-NAGATA, A. K..
bitstream/item/180965/1/Nakasu2017-Article-ErratumToDiscoveryOfTwoSmallCi.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Sweet-potato whitefly.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078482
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