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Accuracy of genotype imputation in a Nellore Cattle population in Brazil. Repositório Alice
SILVA, F. de L.; ROSA, A. do N.; SIQUEIRA, F.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; MOURÃO, G. B.; ROSA, G. J. M..
Genome wide-association studies (GWAS) generally require large numbers of individuals that are both phenotyped and desenly genotyped for markers across the genome.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Nelore; Gado Nelore; Gado de corte; Cattle; Beef cattle.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1028849
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Efeitos recursivos estimados em avaliação genética de bovinos de corte. Repositório Alice
COSTA, J. R. P. V.; CARDOSO, F. F.; CAMPOS, G. de los; ROSA, G. J. M.; YOKOO, M. J. -I..
O objetivo do trabalho foi estimar efeitos recursivos genéticos e residuais entre seis características em bovinos de corte, com o intuito de diminuir a dimensão dessas matrizes.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Melhoramento genético animal; Parâmetro genético; Genética animal.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1027896
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Genetic analysis of growth traits considering genetic group, average numerator relationship matrix and a hierarchical Bayes model for Nellore cattle with uncertain paternity. Repositório Alice
SHIOTSUKI, L.; CARDOSO, F. F.; ROSA, G. J. M.; SILVA, J. A. II V.; ALBUQUERQUE, L. G..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Bovino.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/880561
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Genome-enabled prediction of breeding values for feedlot average daily weight gain in nelore cattle. Repositório Alice
SOMAVILLA, A. L.; REGITANO, L. C. de A.; ROSA, G. J. M.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M. de; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P..
Nelore is the most economically important cattle breed in Brazil, and the use of genetically improved animals has contributed to increase beef production efficiency. The Brazilian beef feedlot industry has grown considerably in the last decade, so the selection of animals with higher growth rates on feedlot has become quite important. Genomic selection could be used to reduce generation intervals and improve the rate of genetic gains. The aim of this study was to evaluate the prediction of genomic estimated breeding values for average daily gain in 718 feedlot-finished Nelore steers. Analyses of three Bayesian model specifications (Bayesian GBLUP, BayesA, and BayesCπ) were performed with four genotype panels (Illumina BovineHD BeadChip, TagSNPs,...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Genomic selection; Bos taurus indicus; Growth.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1070097
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Genome-wide linkage analysis of gene expression of loin muscle tissue identifies candidate genes in pigs. Repositório Alice
STEIBEL, J. P.; BATES, R. O.; ROSA, G. J. M.; TEMPELMAN, R. J.; RILINGTON, V. D.; RAGAVENDRAM, A.; RANEY, N. E.; RAMOS, A. M.; CARDOSO, F. F.; EDWARDS, D. B.; ERNST, C. W..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Suíno.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/880578
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Genome-wide linkage analysis of global gene expression in loin muscle tissue identifies candidate genes in pigs. Repositório Alice
STEIBEL, J. P.; BATES, R. O.; ROSA, G. J. M.; TEMPELMAN, R. J.; RILINGTON, V. D.; RAGAVENDRAN, A.; RANEY, NANCY E.; RAMOS, A. M.; CARDOSO, F. F.; EDWARDS, D. B.; ERNST, C. W..
Background: Nearly 6,000 QTL have been reported for 588 different traits in pigs, more than in any other livestock species. However, this effort has translated into only a few confirmed causative variants. A powerful strategy for revealing candidate genes involves expression QTL (eQTL) mapping, where the mRNA abundance of a set of transcripts is used as the response variable for a QTL scan. Methodology/Principal Findings: We utilized a whole genome expression microarray and an F2 pig resource population to conduct a global eQTL analysis in loin muscle tissue, and compared results to previously inferred phenotypic QTL (pQTL) from the same experimental cross. We found 62 unique eQTL (FDR ,10%) and identified 3 gene networks enriched with genes subject to...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Suíno; Genética.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/888216
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Improving genomic prediction accuracy for meat tenderness in Nellore cattle using artificial neural networks. Repositório Alice
LOPES, F. B.; MAGNABOSCO, C. de U.; PASSAFARO, T. L.; BRUNES, L. C.; COSTA, M. F. O. e; EIFERT, E. da C.; NARCISO, M. G.; ROSA, G. J. M.; LOBO, R. B.; BALDI, F..
The goal of this study was to compare the predictive performance of artificial neural networks (ANNs) with Bayesian ridge regression, Bayesian Lasso, Bayes A, Bayes B and Bayes C&#960; in estimating genomic breeding values for meat tenderness in Nellore cattle. The animals were genotyped with the Illumina Bovine HD Bead Chip (HD, 777K from 90 samples) and the GeneSeek Genomic Profiler (GGP Indicus HD, 77K from 485 samples). The quality control for the genotypes was applied on each Chip and comprised removal of SNPs located on non&#8208;autosomal chromosomes, with minor allele frequency <5%, deviation from HWE (p < 10?6), and with linkage disequilibrium >0.8. The FImpute program was used for genotype imputation. Pedigree&#8208;based...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Maciez da carne; Carne macia; Carne; Gado de Corte.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1131678
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Produção de novilho precoce no estado de Mato Grosso do Sul: análise exploratória de dados do Programa PROAPE-Precoce MS. Infoteca-e
AMARAL, T. B.; GOMES, R. da C.; ROSA, G. J. M..
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Idade de abate; Qualidade da carne; Pecuária; Abate.
Ano: 2021 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1138385
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Using factor analysis modeling multiple traits in genetic improvement of Nelore beef cattle. Repositório Alice
YOKOO, M. J. I.; CAMPOS, G. de los; ROSA, G. J. M.; CARDOSO, F. F.; SOLLERO, B. P.; CARDOSO, L. L.; LOBO, R. B.; ALBUQUERQUE, L. G..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Gado de corte.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/993951
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