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Artificial neural networks compared with Bayesian generalized linear regression for leaf rust resistance prediction in Arabica coffee. Repositório Alice
SILVA, G. N.; NASCIMENTO, M.; SANT'ANNA, I. de C.; CRUZ, C. D.; CAIXETA, E. T.; CARNEIRO, P. C. S.; ROSADO, R. D. S.; PESTANA, K. N.; ALMEIDA, D. P. de; OLIVEIRA, M. da S..
The objective of this work was to evaluate the use of artificial neural networks in comparison with Bayesian generalized linear regression to predict leaf rust resistance in Arabica coffee (Coffea arabica). This study used 245 individuals of a F2 population derived from the self-fertilization of the F1 H511-1 hybrid, resulting from a crossing between the susceptible cultivar Catuaí Amarelo IAC 64 (UFV 2148-57) and the resistant parent Híbrido de Timor (UFV 443-03). The 245 individuals were genotyped with 137 markers. Artificial neural networks and Bayesian generalized linear regression analyses were performed. The artificial neural networks were able to identify four important markers belonging to linkage groups that have been recently mapped, while the...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Inteligência artificial; Predição.; Marcador molecular; Coffea Arábica; Hemileia Vastatrix.; Artificial intelligence; Genetic markers; Prediction..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1069618
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Factor analysis and GGE biplot for environmental andgenotypic evaluation in sunflower trials. Repositório Alice
SANTOS, I. G. dos; CARNEIRO, V. Q.; SANT'ANNA, I. de C.; CRUZ, C. D.; CARVALHO, C. G. P.; BORBA FILHO, A. L.; ALVES, A. D..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Sunflower; Girassol; Helianthus Annuus; Genótipo.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1120438
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Quantile regression in genomic selection for oligogenic traits in autogamous plants: a simulation study. Repositório Alice
OLIVEIRA, G. F.; NASCIMENTO, A. C. C.; NASCIMENTO, M.; SANT'ANNA, I. de C.; ROMERO, J. V.; AZEVEDO, C. F.; BHERING, L. L.; CAIXETA, E. T..
This study assessed the efficiency of Genomic selection (GS) or genome‐wide selection (GWS), based on Regularized Quantile Regression (RQR), in the selection of genotypes to breed autogamous plant populations with oligogenic traits. To this end, simulated data of an F2 population were used, with traits with different heritability levels (0.10, 0.20 and 0.40), controlled by four genes. The generations were advanced (up to F6) at two selection intensities (10% and 20%). The genomic genetic value was computed by RQR for different quantiles (0.10, 0.50 and 0.90), and by the traditional GWS methods, specifically RR-BLUP and BLASSO. A second objective was to find the statistical methodology that allows the fastest fixation of favorable alleles. In...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Regressão Linear; Seleção Genótipa; Genomics; Plant selection guides; Plant breeding.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1139325
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