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Abundance, distribution and potential impact of transposable elements in the genome of Mycosphaerella fijiensis. Repositório Alice
SANTANA, M. F.; SILVA, J. C. F.; BATISTA, A. D.; RIBEIRO, L. E.; SILVA, G. F. da; ARAÚJO, E. F. de; QUEIROZ, M. V. de.
Mycosphaerella fijiensis is a ascomycete that causes Black Sigatoka in bananas. Recently, the M. fijiensis genome was sequenced. Repetitive sequences are ubiquitous components of fungal genomes. In most genomic analyses, repetitive sequences are associated withtransposable elements (TEs). TEs are dispersed repetitive DNA sequences found in a host genome. These elements have the ability to move from one location to another within the genome, and their insertion can cause a wide spectrum of mutations in their hosts. Some of the deleterious effects of TEs may be due to ectopic recombination among TEs of the same family. In addition, some transposons are physically linked to genes and can control their expression. To prevent possible damage caused by the...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Mycosphaerella fijiensis; Transposable elements; RIP; Genome.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/946093
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Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of Lasiodiplodia theobromae, the causal agent of gummosis in cashew nut plants. Repositório Alice
MUNIZ, C. R.; SILVA, G. F. da; SOUZA JUNIOR, M. T.; FREIRE, F. das C. O.; KEMA, G. H. J.; GUEDES, M. I. F..
Lasiodiplodia theobromae is a major pathogen of many different crop cultures, including cashew nut plants. This paper describes an efficient Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation (ATMT) system for the successful delivery of T-DNA, transferring the genes of green fluorescent protein (gfp) and hygromycin B phosphotransferase (hph) to L. theobromae. When the fungal pycnidiospores were co-cultured with A. tumefaciens harboring the binary vector with hph-gfp gene, hygromycin-resistant fungus only developed with acetosyringone supplementation.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Lasiodiplodia theobromae; Cashew plants; Gummosis; Agrobacterium tumefaciens; Mediated transformation.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/985915
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Allocation of storage yards in management plans in the Amazon by means of mathematical programming. Repositório Alice
SILVA, E. F. da; SILVA, G. F. da; FIGUEIREDO, E. O.; BINOTI, D. H. B.; MENDONÇA, A. R. de; TORRES, C. M. M. E.; PEZZOPANE, J. E. M..
The present study aimed to optimize the location of wood storage yards in forest management for the production of wood in the Brazilian Amazon. The area of forest management studied was 638.17 ha, with 1478 trees selected for harvest with a diameter at breast height of at least 50 cm in accordance with Brazilian legislation. Taking the topography into account-permanent preservation areas, restricted areas, and remaining trees-and using GIS tools, 7896 sites were identified that could be used as wood storage yards. By using mathematical programming techniques, more specifically binary integer linear programming, and based on the classical p-median model, optimal locations for the opening of yards were defined. Four scenarios were proposed combining distance...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Estaleiro; Manejo florestal; Administração florestal; Planejamento florestal; Extração da madeira; Madeira; Armazenamento; Método de otimização; Programação linear; Forest management; Logging; Sort yards; Manejo forestal; Linear programming; System optimization; Explotación forestal; Patios de clasificación; Programación lineal; Optimización de los sistemas.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088822
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Amplificação e clonagem do gene sox9 em tambaqui (Colossoma macropomum). Repositório Alice
GUALBERTO, G. F.; SILVA, G. F. da; CRUZ, J. C. da; ALMEIDA, F. L. de.
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Família sox; Determinação sexual; Bacia Amazônica.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/979507
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Análise da cadeia produtiva da nogueira-pecã no Rio Grande do Sul. Repositório Alice
SILVA, G. F. da; HELLWIG, C. G.; MARCO, R. de; FARIAS, P. C. de M.; CONTE, A.; FARIAS, R. M. de; FILIPPINI ALBA, J. M.; MARTINS, C. R..
Este trabalho tem como objetivo mostrar o panorama atual da cultura da nogueira-pecã no estado Rio Grande do Sul.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Noz Peca.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1123190
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Analise da diversidade genética entre acessos de cupuaçuzeiro. Repositório Alice
SOUSA, N. R.; SOUZA, A. das G. C. de; SOUZA, M. G. de; SILVA, G. F. da.
O objetivo do trabalho foi estimar a diversidade genética de 84 acessos pertencentes a coleção de germoplasma da Embrapa Amazônia Ocidental visando fornecer informações úteis para a estruturação dos programas de conservação e melhoramento genético do cupuaçuzeiro.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biotecnologia; Cupuaçu; Theobroma Grandiflorum.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/873455
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Análise da eficiência dos genes npl4, gpdhN e ef1-alfa para normalização de RT-qPCR em Fusarium decemcellulare. Repositório Alice
OLIVEIRA, C. V. S. de; NASCIMENTO, A. R. do; SILVA, G. F. da.
O objetivo deste trabalho foi analisar a eficiência dos genes npl4, gpdhN e ef1-alfa em F. decemcellulare visando à utilização deste em RT-qPCR.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genes normalizadores; Fusarium decemcellulare; Eficiência; PCR quantitativa; Fungo.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074746
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Análise da população de Mycosphaerella fijiensis por meio do marcador M13 fingerprinting. Repositório Alice
QUEIROZ, C. B. de; MIRANDA, E. C.; GASPAROTTO, L.; HANADA, R. E.; SOUSA, N. R.; SILVA, G. F. da.
Este trabalho teve como objetivo analisar diversidade de 40 isolados de M. fijiensis de diferentes regiões geográficas do Brasil baseados no fago M13.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Doença de planta; Marcadores moleculares; Diversidade genética; Fitopatógeno; Sigatoka-negra.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/876036
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Análise de Mycosphaerella fijiensis do Estado do Amazonas por meio da inserção de transposon entre os genes que codificam PACC e superóxido desmutase. Repositório Alice
MIRANDA, E. C.; SOUZA, R. F.; HANADA, R. E.; SOUSA, N. R.; GASPAROTTO, L.; SILVA, G. F. da.
O objetivo deste trabalho foi realizar uma triagem em isolados de M. fijiensis baseada no polimorfismo de inserção de transposon.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mycosphaerella fijiensis; Sigatoka-negra; Doença de planta.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/932814
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Análise de polimorfismo de inserção de transposon em Mycosphaerella fijiensis isolado do Estado do Amazonas. Repositório Alice
MIRANDA, E. C.; PAIXÃO, R. V.; HANADA, R. E.; SOUSA, N. R.; SILVA, G. F. da.
O objetivo deste trabalho foi realizar uma triagem em isolados de M. fijiensis provenientes do estado do Amazonas baseada em TIP.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mycosphaerella fijiensis; Sigatoka-negra; Doença de planta; Biotecnologia.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/932818
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Análise do fator de transcrição PacC e condições de pH ambiente em Mycosphaerella fijiensis. Repositório Alice
QUEIROZ, C. B. de; SILVA, G. F. da; SOUSA, N. R.; GASPAROTTO, L.; HANADA, R. E..
Este trabalho teve como objetivo caracterizar o fator de transcrição PacC e a influência do pH no crescimento de Mycosphaerella fijiensis agente causal da sigatoka-negra em bananeira.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sigatoka-negra; Virulência.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/884985
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Arcopilus amazonicus, chemical and biological study of a new species of endophytic fungus. Repositório Alice
SANTOS, A. dos; SOUSA, T.; SILVA, F.; ANGOLINI, C. F. F.; LIMA, R.; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H..
bitstream/item/212449/1/galoa-proceedings-BCNP-2019-117489.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arcopilus.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1121788
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Aspectos morfológicos dos sintomas de superbrotamento em plantas de guaranazeiro. Repositório Alice
MATOS, K.S.; ANGELO, P. C. S.; MUNIZ, C. R.; HANADA, R.E.; SOUSA, N. R.; SILVA, G. F. da.
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: FUSARIUM DECEMCELLULARE; Hiperplasia; Hipertrofia; Anatomia; Histologia; FUSARIUM DECEMCELLULARE; Hiperplasia; Hipertrofia; Anatomia; Histologia.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1030202
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Atividade antifúngica do isolado Arcopilus tupanensis (2412) no controle de fitopatógenos do guaranazeiro. Repositório Alice
SOUZA, T. M. de; YUYAMA, K. T.; SILVA, G. F. da.
O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial antifúngico de A. tupanensis (2412) contra fitopatógenos do guaranazeiro.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arcopilus tupanensis; Controle Biológico.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1117674
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Avaliação da produção de metabólitos secundários pelo basidiomiceto, Quambalaria cyanescens, endofítico do açaí-da-Amazônia (Euterpe precatoria). Repositório Alice
RAPOSO, D. de S.; RODRIGUES, A. de M.; GUIMARÃES, D. R.; ALBUQUERQUE, J. M. da R.; MACIEL, J. B. de S.; SOUSA, T. F.; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. H. F..
O objetivo geral desta pesquisa foi avaliar a produção de metábolitos secundários do fungo endófitico, Q. cyanescens, através da técnica de OSMAC (onestrainmanycompounds).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Metabólitos secundários; Açaí-da-amazônia; Fungos endofíticos; Euterpe precatoria.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1117659
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Baseline sensitivity of Brazilian Mycosphaerella fijiensis isolates to protectant and systemic fungicides. Repositório Alice
GOMES, L. I. S.; BIBIANO, L. B. J.; SILVA, G. F. da; HANADA, R. E.; MIZUBUTI, E. S. G..
Black Sigatoka caused by Mycosphaerella fijiensis is a foliar disease that affects banana plants and large amounts of fungicides are required to prevent crop losses. Intensive applications of single-site fungicides can select for fungicide-resistant isolates. The objective of this study was to assess the sensitivity of 60 isolates of M. fijiensis to commonly used fungicides.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Black leaf streak disease; Fungicide resistance; Sigatoka-negra; Protectant fungicides; Strobilurin; Tebuconazole; Thiophanate-methyl; Mycosphaerella fijiensis.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1007698
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Biofábricas integradas à agricultura familiar. Repositório Alice
QUISEN, R. C.; ÂNGELO, P. C. da S.; LOPES, R.; CUNHA, R. N.; BITTENCOURT, D.; SILVA, G. F. da; LIMA, W. A. A. de..
Este trabalho teve como objetivo propor processo de produção massal de dendê utilizando técnicas de biotecnologia vegetal de forma a se obter um aumento expressivo da taxa de produção de mudas de Elaeis sp. visando o aumento dos rendimentos e produtividade das culturas voltadas à produção de óleo vegetal no contexto da agricultura familiar, que terão como destino final a produção de biodiesel.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biotecnologia vegetal; Dendê; Agricultura familiar; Biodiesel.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/685040
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Boto, a class II transposon in Moniliophthora perniciosa, is the first representative of the PIF/Harbinger superfamily in a phytopathogenic fungus. Repositório Alice
PEREIRA, J. F.; ALMEIDA, A. P. M. M.; COTA, J.; PAMPHILE, J. A.; SILVA, G. F. da; ARAUJO, E. F. de; GRAMACHO, K. P.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PEREIRA, G. A. G.; QUEIROZ, M. V. de.
2013
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genética; Fungo; Planta; Doença.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/976811
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Boto, a class II transposon in Moniliophthora perniciosa, is the first representative of the PIF/Harbinger superfamily in a phytopathogenic fungus. Repositório Alice
PEREIRA, J. F.; ALMEIDA, A. P. M. M.; COTA, J.; PAMPHILE, J. A.; SILVA, G. F. da; ARAÚJO, E. F. de; GRAMACHO, K. P.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PEREIRA, G. A. G.; QUEIROZ, M. V. de.
Boto, a class II transposable element, was characterized in the Moniliophthora perniciosa genome. The Boto transposase is highly similar to plant PIF-like transposases that belong to the newest class II superfamily known as PIF/Harbinger. Although Boto shares characteristics with PIF-like elements, other characteristics, such as the transposase intron position, the position and direction of the second ORF, and the footprint, indicate that Boto belongs to a novel family of the PIF/Harbinger superfamily. Southern blot analyses detected 6?12 copies of Boto in C-biotype isolates and a ubiquitous presence among the C- and S-biotypes, as well as a separation in the C-biotype isolates from Bahia State in Brazil in at least two genotypic groups, and a new...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Moniliophthora perniciosa.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946075
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Caracterização da diversidade genética e produção de esporos e de isolados de Moniliophtora perniciosa oriundos de tecidos infectados de Theobroma spp. Repositório Alice
SANTOS, D. M. dos; SOUZA, M. G. de; SOUSA, N. R.; GUALBERTO, G. F.; SOUZA, A. DA C. G. DE; CORRÊA, E. M.; SILVA, G. F. da.
Este trabalho teve como objetivo avaliar a diversidade genética de isolados de Moniliophthora perniciosa coletados de tecido infectado de Theobroma sp oriundos de diferentes regiões da Amazônia por meio do marcador ISSR.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Cupuaçu.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/885077
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