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	Provedor de dados Repositório Alice (131) Infoteca-e (75) Autor SILVA, M. V. G. B. (206) MACHADO, M. A. (88) MARTINS, M. F. (86) PANETTO, J. C. do C. (86) REIS, D. R. de L. (50) ARBEX, W. A. (39) PAIVA, L. DE C. (37) VERNEQUE, R. da S. (29) GONÇALVES, G. S. (24) FERNANDES, A. R. (22) REGITANO, L. C. de A. (22) CEMBRANELLI, M. DE A. R. (20) PEIXOTO, M. G. C. D. (19) MUNARI, D. P. (17) CEMBRANELLI, M. de A. R. (16) ALVES, B. R. C. (15) COBUCI, J. A. (14) MACHADO, C. H. C. (14) BRUNELI, F. A. T. (13) CARVALHO, B. C. de (13) Mais... Palavra-chave Bovinos de leite (31) Bovino (22) Gado Leiteiro (18) Raça girolando. (18) Gado de leite (17) Girolando (16) Raça girolando (15) Melhoramento genetico (14) Melhoramento genético (14) Breeding and Genetic Improvement (13) Dairy cattle (11) Genômica (11) Melhoramento. (11) Dairy cattle. (10) Melhoramento Genético Animal (10) Melhoramento genético animal (10) Beef cattle (8) Cattle (8) Gir leiteiro (8) SNP (8) Mais... Tipo do documento Documentos (INFOTECA-E) (65) Separatas (58) Artigo de periódico (34) Anais e Proceedings de eventos (31) Parte de livro (5) Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) (3) Artigo em anais e proceedings (2) Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) (2) Folhetos (2) Livro técnico (INFOTECA-E) (2) Circular Técnica (INFOTECA-E) (1) Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) (1) Mais... Ano 2023 (7) 2022 (6) 2021 (17) 2020 (12) 2019 (11) 2018 (12) 2017 (28) 2016 (13) 2015 (25) 2014 (27) 2013 (13) 2012 (9) 2011 (9) 2010 (4) 2009 (3) 2008 (1) 2007 (4) 2006 (2) 2005 (2) 2003 (1) Mais... País Brazil (206) Idioma Português (119) Inglês (81) Espanhol (6)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 206 Primeira ... 1 2 3 4 5 6 7 8 9 ... Última A gene-transcription factor network associated with residual feed intake based on SNVs/InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds. Repositório Alice VERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.. The aim of this study was to analyze whole-genome re-sequencing data focusing on SNVs and InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds related to RFI. Thus, genes showing SNVs/InDels in TF binding sites (5' UTR variants) were used to search for TF related to feed intake and to generate a gene-TF network for RFI across two purebred and one admixed dairy cattle breeds. Moreover, we were able to perform a comparative analysis accessing similarities and dissimilarities at the genomic level across these breeds. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Sequência de dados; Single Nucleotide Variations (SNVs); Insertions/deletions (InDels); Whole-genome; Whole-genome re-sequencing data; Gado de Corte; Bos Indicus; Variação Genética; Cattle breeds. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105518 A Low-cost Infrastructure for Massive Storage of Phenotype Data for Dairy Cattle Genetic Improvement Program. Repositório Alice ARBEX, W. A.; CARVALHO, C. dos S. B. de; SANTOS, K. C. L. dos; BRUM, V. C; SILVA, M. V. G. B.. ICOMP'14 Tipo: Separatas Palavras-chave: Scientific computing environment; Storage system; Utility computing; Phenotype data.; Genetic improvement.. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1014636 Accuracy of genomic predictions in Bos indicus (Nellore) cattle. Repositório Alice NEVES, H. H.; CARVALHEIRO, R.; O'BRIEN, A. M.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARMO, A. S. do; SCHENKEL, F. S.; SÖLKNER, J.; MCEWAN, J. C.; VAN TASSELL, C. P.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B.; QUEIROZ, S. A.; SONSTEGARD, T. S.; GARCIA, J. F.. Article n. 17. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Nellore cattle; Genomic selection. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/987574 Acurácia em diferentes modelos para predição de valores genéticos em bovinos da raça Senepol. Repositório Alice SUNIGA, P. A. P.; SANTIAGO, G. G.; MENEZES, G. R. de O.; MILANESI, M.; GONDO, A.; SILVA, M. V. G. B.; GARCIA, J. F.; SILVA, L. O. C. da; NOBRE, P. R. C.; SIQUEIRA, F.; EGITO, A. A. do. A predição de valores genéticos é uma ferramenta fundamental para classificar animais candidatos à seleção. O desenvolvimento de tecnologias moleculares e computacionais viabiliza a utilização de informações genômicas nas predições, proporcionando incremento na acurácia. Neste contexto, objetivou-se averiguar o impacto na acurácia ao empregar dados genômicos em avaliações genéticas para características de crescimento e carcaça em bovinos da raça Senepol. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Predição de valor genético; Área de olho de lombo; Espessura de gordura subcutânea; Peso ao sobreano; Bovino. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099590 Ajuste da curva de lactação de três grupos genéticos de Girolando. Repositório Alice MACHADO, J. D.; DALTRO, D. dos S.; PADILHA, A. H.; BRACCINI NETO, J.; SILVA, M. V. G. B.; COBUCI, J. A.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Modelos matemáticos; Produção de leite; Projeção de lactação.; Curva de Lactação.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1072289 An approach to genomic analysis of longitudinal data using random regression Repositório Alice SANTOS, D. J.; BOISON, S. A.; UTSUNOMIYA, Y. T.; PEIXOTO, M. G. C. D.; TONHATI, H.; SÖLKNER, J.; SILVA, M. V. G. B.. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Genomic evaluation; SNP; Lactation curve. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1009528 Análise de associação genômica para o fenótipo mocho em bovinos da raça Nelore. Infoteca-e ROSA, A. J. de M.; YOKOO, M. J. I.; ROSA, A. do N.; MAGNABOSCO, C. de U.; SILVA, M. V. G. B.; TULLIO, R. R.; REGITANO, L. C. de A.. Resumo ? Uma das principais características raciais da raça Nelore tradicional é a presença e o formato de chifres. O aparecimento de animais mochos, por introgressão ou mutação ?de novo?, despertou nos produtores o interesse em selecionar linhagens sem chifres por razões econômicas, bem-estar animal e segurança do tratador, evitando-se assim o uso da descorna. Essa característica apresenta herança Mendeliana autossômica, com dominância do alelo Mocho sobre o padrão, como foi demonstrado em diversos estudos em raças variadas. Neste trabalho, efetuamos Estudo de Associação Genômica (GWAS) para presença de chifres e foi identificado um pico de alta significância, associado à herança dos chifres, localizado no BTA1. Os Polimorfismos de Nucleotídeo Único... Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Gado; Gado Mocho; Nelore Mocho. Ano: 2020 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1131616 Análise de diversidade genética do gene da osteopontina em bovinos da raça girolando. Repositório Alice MELLO, F. de; MARTINS, M. F.; COBUCI, J. A.; SILVA, M. V. G. B.; BRACCINI NETO, J.; PAIVA, D. de S.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Bovinos leiteiros; Produção de leite; SNP; SPP1; Polimorfismo. Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/911632 Análise de genes diferencialmente expressos em resposta à infecção por Streptococcus agalactiae. Repositório Alice CARVALHO, B. de O.; PEREIRA, H. P.; SEIBERLICK, O. S. G.; REIS, D. R. de L.; CARVALHO, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.. Resumo: As doenças infectocontagiosas estão entre os problemas que mais acarretam prejuízos econômicos na pecuária brasileira e mundial, sendo a mastite a principal enfermidade acometida aos bovinos. A mastite pode ser definida como uma inflamação da glândula mamária que é causada, mais frequentemente, por micro-organismos patogênicos ambientais ou contagiosos. Podendo culminar na redução da quantidade e no comprometimento da qualidade do leite, podendo levar até a perda total da potencialidade secretora da glândula mamaria do animal infectado ou mesmo a sua morte. Estudos relacionados aos mecanismos de resposta e resistência de animais à mastite foram realizados a fim de contribuir para a compreensão dos mecanismos genéticos de resistência e resposta a... Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: CD 14; NFKBIA; PCR em tempo real; Resposta inflamatória; STAT3. Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1111976 Analysis of copy number variation regions in a Nellore population evaluated for feed efficiency. Repositório Alice OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; REY, F. S. B.; SILVA, M. V. G. B.; SANTANA, M. H. A.; ALEXANDRE, P. A.; ELER, J. P.; FERRAZ, J. B. S.. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Genomic; Residual feed intake; SNP; Beef cattle. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1009538 Aplicação de análises multivariadas para determinação da casta de abelhas Apis mellifera L. (Africanizadas), obtidas em laboratório. Repositório Alice SILVA, I. C. da; MESSAGE, D.; CRUZ, C. D.; SILVA, M. V. G. B.. A técnica de criação de larvas de abelhas Apis mellifera em laboratório tem sido utilizada freqüentemente em estudos de desenvolvimento larval, determinação de castas e, mais recentemente, em testes de patogênese. A quantidade e a qualidade do alimento fornecido às larvas em laboratório podem levar à formação de castas diferentes (rainha, operárias ou intercastas). Neste trabalho, crias de abelhas africanizadas foram desenvolvidas a partir de larvas de 18-24 horas de idade até atingir a fase adulta, utilizando-se durante a alimentação, 4, 15, 25, 50 e 70 µl de dieta por larva, respectivamente, do primeiro ao quinto dia de alimentação. Para determinar se as abelhas adultas obtidas em laboratório eram pertencentes à casta de operárias, de rainhas ou se eram... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Abelha. Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/594888 Aplicações da genômica na produção animal. Repositório Alice OTTO, P. I.; GOBO, D. O. R.; OLIVEIRA, D.; BÖCK, M. J.; GARCIA, A. O.; SANTOS, M. G. dos; OTTO, T. M.; ROCHA, R. de F. B.; SILVA, M. V. G. B.; DALTRO, D. dos S.; NEGRI, R.; KLUSKA, S.; COSTA, K. A.. A genômica revolucionou a produção animal, desempenhando papel crucial na seleção e criação de animais mais saudáveis, produtivos e sustentáveis. Essa ciência se concentra no estudo do genoma de organismos, fornecendo informações valiosas sobre os genes e suas interações. Uma das suas aplicações mais notáveis, dentro do melhoramento genético animal, é a seleção genômica, que têm permitido a predição dos valores genômicos dos animais de forma mais precisa, permitindo a seleção mais precisa dos animais com alto mérito genético, especialmente quando aplicada a animais jovens e até mesmo embriões. Essa abordagem não apenas aumenta a acurácia da seleção, mas também acelera o progresso genético, resultando em ganhos maiores para a produção animal e a... Tipo: Artigo em anais e proceedings Palavras-chave: Bovino; Genoma; Melhoramento Genético Animal. Ano: 2023 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1157632 Assessing signatures of selection through variation in linkage disequilibrium between taurine and indicine cattle. Repositório Alice O'BRIEN, A. M. P.; UTSUNOMIYA, Y. T.; MÉSZÁROS, G.; BICKHART, D. M.; LIU, G. E.; TASSEL, C. P. V.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, M. V. G. B.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J.. Signatures of selection are regions in the genome that have been preferentially increased in frequency and fixed in a population because of their functional importance in specific processes. These regions can be detected because of their lower genetic variability and specific regional linkage disequilibrium (LD) patterns. By comparing the differences in regional LD variation between dairy and beef cattle types, and between indicine and taurine subspecies, we aim at finding signatures of selection for production and adaptation in cattle breeds. The VarLD method was applied to compare the LD variation in the autosomal genome between breeds, including Angus and Brown Swiss, representing taurine breeds, and Nelore and Gir, representing indicine breeds. The... Tipo: Separatas Palavras-chave: Cattle - genetic improvement; Indicine; Minor allele frequency.; Linkage disequilibrium; Taurine.. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1006605 Assessment of autozygosity in Nellore cows (Bos indicus) through high-density SNP genotypes. Repositório Alice ZAVAREZ, L. B.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARMO, A. S.; NEVES, H. H.; CARVALHEIRO, R.; FERENCAKOVIC, M.; O'BRIEN, A. M. P.; CURIK, I.; COLE, J. B.; TASSELL, C. P. V.; SILVA, M. V. G. B.; SONSTEGARD, T. S.; SÖLKNER, J.; GARCIA, J. F.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Fertility; Runs of homozygosity; Selection.; Bos Indicus.; Cattle; Disease resistance.. Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1036982 Assessment of copy number variants in three Brazilian locally adapted cattle breeds using whole-genome re-sequencing data. Repositório Alice PERIPOLLI, E.; STAFUZZA, N. B.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; EGITO, A. A. do; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B.. Further characterization of genetic structural variations should strongly focus on small and endangered local breeds given their role in unraveling genes and structural variants underlying selective pressures and phenotype variation. A comprehensive genome-wide assessment of copy number variations (CNVs) based on whole-genome re-sequencing data was performed on three Brazilian locally adapted cattle breeds (Caracu Caldeano, Crioulo Lageano, and Pantaneiro) using the ARS-UCD1.2 genome assembly. Data from 36 individuals with an average coverage depth of 14.07× per individual was used. A total of 24?945 CNVs were identified distributed among the breeds (Caracu Caldeano = 7285, Crioulo Lageano = 7297, and Pantaneiro = 10 363). Deletion events were... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Variação fenotípica; Bovino; Raça; Gado Crioulo; Genoma. Ano: 2023 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1151656 Assessment of runs of homozygosity islands and estimates of genomic inbreeding in Gyr (Bos indicus) dairy cattle. Repositório Alice PERIPOLLI, E.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; LIMA, A. L. F.; IRGANG, R.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; VENTURA, R. V.; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B.. Abstract BACKGROUND: Runs of homozygosity (ROH) are continuous homozygous segments of the DNA sequence. They have been applied to quantify individual autozygosity and used as a potential inbreeding measure in livestock species. The aim of the present study was (i) to investigate genome-wide autozygosity to identify and characterize ROH patterns in Gyr dairy cattle genome; (ii) identify ROH islands for gene content and enrichment in segments shared by more than 50% of the samples, and (iii) compare estimates of molecular inbreeding calculated from ROH (FROH), genomic relationship matrix approach (FGRM) and based on the observed versus expected number of homozygous genotypes (FHOM), and from pedigree-based coefficient (FPED). RESULTS: ROH were identified in... Tipo: Separatas Palavras-chave: Dairy traits; Inbreeding coefficients; ROH islands; Bos Indicus. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1100275 Avaliação de abordagens estatísticas para análise da expressão gênica diferencial em dados reais de RNA-seq Repositório Alice SBARDELLA, A. P; FONSECA, I.; WELLER, M. A. DEL C. A.; STAFUZZA, N. B.; OLIVEIRA, J. R.; WATANABE, R. N.; COSTA, R, M. da; CARVAJAL, A. B.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MUNARI, D. P.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Expressão diferencial; Bovinos de leite; Sequenciamento. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1072447 Avaliação dos coeficientes de endogamia em bovinos da raça Gir (Bos primigenius indicus) Repositório Alice PERIPOLLI, E.; OLIVIERI. B. F.; FEITOSA, F. L. B.; LEMOS, M. V. A. de; TONUSSI, R. L.; MUNARI, D. P.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; VENTURA, R. V.; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Autozigosidade; Corridas de Homozigose.; Pedigree.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1072487 Avaliação genética multirracial via regressão aleatória com polinômios lineares do tipo spline. Repositório Alice RIBEIRO, V. M. P.; RAIDAN, F. S. S.; BARBOSA, A. R.; WINKELSTROTER, L. K.; SILVA, M. V. G. B.; TORAL, F. L. B.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Gir; Holandês; Multirracial.; Girolando.. Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1041039 Banco de DNA de Bovinos: avaliação de metodologias alternativas para extração de DNA. Repositório Alice BRION, C. T.; SANTOS, L. B.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Genética molecular bovinos; Métodos de extração.; DNA.. Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1034534 Registros recuperados: 206 Primeira ... 1 2 3 4 5 6 7 8 9 ... Última

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