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Draft genome sequence of Paraburkholderia tropica Ppe8 strain, a sugarcane endophytic diazotrophic bacterium. Repositório Alice
SILVA, P. R. A.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; CRUZ, L. M.; SOUZA, E. M. de; BALDANI, J. I..
Paraburkholderia tropica (syn Burkholderia tropica) are nitrogen-fixing bacteria commonly found in sugarcane. The Paraburkholderia tropica strain Ppe8 is part of the sugarcane inoculant consortium that has a beneficial effect on yield. Here, we report a draft genome sequence of this strain elucidating the mechanisms involved in its interaction mainly with Poaceae. A genome size of approximately 8.75 Mb containing 7844 protein coding genes distributed in 526 subsystems was de novo assembled with ABySS and annotated by RAST. Genes related to the nitrogen fixation process, the secretion systems (I, II, III, IV, and VI), and related to a variety of metabolic traits, such as metabolism of carbohydrates, amino acids, vitamins, and proteins, were detected,...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Diazotrophic; Next generation sequencing; Nitrogen fixing; Secretion system.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079611
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Transcriptional profile of Herbaspirillum rubrisubalbicans in response of sugarcane apoplastic fluid. Repositório Alice
POLESE, V.; SILVA, P. R. A.; PESSOA, D. D. V.; TADRA-SFEIR, M. Z.; SOUZA, E. M.; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I.; VIDAL, M. S..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Diazotrophic bacteria; Plant bacteria interaction; RNA Seq.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105472
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