SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

SILVEIRA, R. D. D.; SANTOS, K. F. E. N.; CRUZEIRO, G. A. V.; BORBA, T. C. O.; DIDONET, C. G. M.; BRONDANI, C..

Este trabalho teve como objetivo quantificar as proteínas totais dos 550 acessos da CNAE, a fim de conhecer a influência do tipo de cultivo e da origem de cada acesso nos seus teores de proteínas.

Análise de genes diferencialmente expressos em Phaseolus vulgaris sob condições de déficit hídrico.

Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Rice; Recurso genético; Proteína; Qualidade do grão; Proteômica; Coleção nuclear; Banco de germoplasma; Conpeex.

Ano: 2008

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/217547

MÜLLER, B. S. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PEREIRA, M.; GUIMARÃES, C. M.; ZAMBUZZI-CARVALHO, P. F.; SILVEIRA, R. D. D.; BRONDANI, C.; BRONDANI, R. P. V..

Com o intuito de ampliar o conhecimento dos mecanismos genéticos envolvidos na tolerância à seca, esse estudo prevê a criação de um banco de sequencias gênicas e a identificação de genes-candidatos envolvidos na resposta ao déficit-hídrico, utilizando as cultivares BAT-477, como genitor tolerante, e Pérola, como susceptível.

Análise do transcriptoma de arroz (Oryza sativa) cultivado sob déficit hídrico.

Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Resistência a seca; Genoma; Deficiência hídrica.

Ano: 2010

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/866756

SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; LANNA, A. C.; BRONDANI, C.; CARNEIRO, N. P..

2013

Análise do transcriptoma de arroz (Oryza sativa) cultivado sob déficit hídrico.

Palavras-chave: Gene; Genética vegetal; Plant genetics; Plant-water relations; Transcriptome.

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/974343

SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; LANNA, A. C.; BRONDANI, C.; CARNEIRO, N. P..

Neste trabalho analisamos a expressão dos genes relacionados à resposta ao déficit hídrido em tecido foliar de duas cultivares brasileiras de arroz de terras altas, a cultivar tolerante Douradão e a cultivar sensível BRS Primavera. Pela análise de RNA-seq foram identificados em Douradão 27.618 transcritos, sendo 24.090 (87,2%) homólogos ao banco de dados de arroz, enquanto que para BRS Primavera dos 27.221 transcritos 23.663 (86,9%) apresentaram homologia no banco de dados.

Análise do transcriptoma de Phaseolus vulgaris em resposta ao déficit hídrico.

Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Deficiência hídrica.

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/964157

MÜLLER, B. S. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; COSTA, M. M. C.; PEREIRA, M.; GUIMARÃES, C. M.; ZAMBUZZI-CARVALHO, P. F.; SILVEIRA, R. D. D.; BRONDANI, C.; BRONDANI, R. P. V..

Com o intuito de avançar no conhecimento dos mecanismos genéticos envolvidos na tolerância à seca, esse estudo prevê identificação de genes candidatos envolvidos na resposta ao déficit hídrico, bem como contribuir para o estabelecimento de um banco de sequências-alvo expressas (ESTs) que sejam públicas e enriquecidas para genes diferencialmente expressos nos genótipos BAT 477 (tolerante) e Pérola (suscetível) quando submetidos às condições de presença e ausência do déficit hídrico.

Análise quantitativa da proteína total de reserva do grão em acessos de arroz irrigado da coleção nuclear da Embrapa (CNAE).

Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Deficiência hídrica.

Ano: 2010

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/886014

SILVEIRA, R. D. D.; SANTOS, K. F. E. N.; DIDONET, C. C. G. M.; BRONDANI, C..

Este trabalho objetivou quantificar a proteína total de reserva de 186 acessos com sistema de cultivo irrigado da CNAE e observar se estes acessos apresentam variabilidade em relação ao teor protéico.

Anotação de genes relacionados à tolerância a seca em arroz (Oryza sativa) de terras altas.

Palavras-chave: Arroz irrigado; Oryza sativa; Banco de germoplasma; Recurso genético; Proteína.

Ano: 2009

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/658682

SILVEIRA, R. D. D.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..

O objetivo deste trabalho foi identificar e anotar os genes expressos em resposta ao déficit hídrico em tecido foliar de duas cultivares brasileiras de arroz de terras altas, a cultivar tolerante à seca Douradão e a cultivar sensível Primavera.

Avaliação de genótipos de arroz de sequeiro para tolerância à deficiência hídrica.

Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Resistência a seca.

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/984357

SILVEIRA, R. D. D.; LANNA, A. C.; HEINEMANN, A. B.; BRONDANI, C..

O objetivo deste trabalho foi comparar a produtividade de três genótipos de arroz de sequeiro, submetidos a três condições de deficiência hídrica: 30 %, 50 % e 70 % do fornecimento de água dado ao tratamento controle (tratamento sem restrição de água).

De Arabidopsis a Oryza: identificação de genes ortólogos, transformação e obtenção de plantas de arroz mais tolerantes à seca.

Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Deficiência hídrica.

Ano: 2011

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/923214

ABREU, F. R. M.; OLIVEIRA, J. A. V. de; MENDONÇA, J. A.; SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..

Com o objetivo de verificar a expressão dos genes ortólogos PLDα1 e CPK5 em arroz, previamente relacionados com a tolerância à seca em Arabidopsis, o presente estudo, em uma primeira etapa, analisou em um experimento de tolerância à seca dois genótipos contrastantes de arroz, Douradão, tolerante à seca, e Primavera, susceptível.

Desenvolvimento de banco ESTs para feijão comum enriquecido para genes de resposta ao estresse hídrico.

Palavras-chave: Arabidopsis; Arroz; Oryza sativa; Resistência a seca; Gene.

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039506

MÜLLER, B. S. F.; GUIMARÃES, C. M.; SILVEIRA, R. D. D.; ABREU, E. M.; SANCHES, B. A.; ZAMBUZZI-CARVALHO, P. F.; BRONDANI, C.; BRONDANI, R. P. V..

Com o intuito de ampliar o conhecimento dos mecanismos genéticos envolvidos na tolerância a seca esse estudo prevê a criação de um banco de seqüências gênicas e a identificação de genes-candidatos envolvidos na resposta a seca utilizando as cultivares BAT 477, como genótipo tolerante, e Pérola, como susceptível.

Differentially expressed genes during flowering and grain filling in common bean (Phaseolus vulgaris) grown under drought stress conditions.

Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Resistência a seca.

Ano: 2010

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/883148

MÜLLER, B. S. de F.; SAKAMOTO, T.; SILVEIRA, R. D. D.; ZAMBUSSI-CARVALHO, P. F.; PEREIRA, M.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; COSTA, M. M. do C.; GUIMARÃES, C. M.; PEREIRA, W. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO-BRONDANI, R. P..

Drought stress, particularly during the flowering and grain-filling stages of growth, contributes to serious yield loss in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The aim of this study was to identify genes induced in response to drought stress using transcriptome analysis of contrasting genotypes. Using leaf tissues of tolerant (BAT 477) and susceptible common bean genotypes (Pérola), collected at the flowering and grain-filling stages, four complementary deoxyribonucleic acid representational difference analysis subtractive libraries were constructed and then sequenced. A total of 7,203 (77.6 %) sequences with an average sequence size of 570 bp were considered valid, for a combined 4 Mbp sequence. According to a differential display analysis, 802 expressed...

Expressão de genes homólogos de Arabidopsis em arroz relacionados ao aumento do potencial produtivo.

Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Deficiência hídrica; Beans; Abiotic stress; Water stress.

Ano: 2014

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/994817

OLIVEIRA, J. A. V. de; ABREU, F. R. M.; PEREIRA, W. J.; SILVEIRA, R. D. D.; MENDONÇA, J. A.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..

O objetivo desse trabalho foi quantificar a expressão de genes de arroz homólogos de Arabidopsis previamente relacionados ao aumento do potencial produtivo (RUBIRICE, RUBICORN, AVP1, DA1 e TOR) por meio da análise de PCR quantitativo (qPCR). Os genótipos estudados nesse estudo foram BRSMG Curinga, Primavera e Douradão, os quais foram avaliados em um ensaio em casa de vegetação, cultivados sob dois níveis de fertilidade do solo (alta e baixa), em esquema fatorial, no delineamento inteiramente casualizado e com duas repetições.

Expression of rice genes homologous of Arabidopsis genes previously related to drought tolerance.

Palavras-chave: Arabidopsis; Arroz; Oryza sativa; Gene.

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039417

ABREU, F. R. M.; DEUS, K. E. de; PEREIRA, W. .J.; SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..

The identification and validation of candidate genes related to traits of interest is a time consuming and expensive process and the homology among genes from different species can facilitate the identification of genes of the target species from the genomic information of a model species. This study aimed to quantify the expression of homologous rice genes previously related to drought tolerance in Arabidopsis. Five genes (CPK6, PLDa, GluR2, CesA8, and EIN2) were identified in rice by the homology of the amino acid sequence between rice and Arabidopsis. The genotypes Douradão (drought tolerant) and Primavera (drought susceptible) were subjected to a water deficit experiment, and subsequently evaluated for gene expression by qPCR for the five homologous...

Genômica funcional: mutagênese insercional como fonte de descoberta de novos genes para o melhoramento de arroz (Oryza sativa (L.).

Palavras-chave: Gene homology; Arroz; Oryza sativa; Acido abscisico; Rendimento; Rice; Abscisic acid; Quantitative polymerase chain reaction; Yields; Arabidopsis.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1054691

BEVITORI, R.; MARGIS, M. M. P.; SILVEIRA, R. D. D.; ABREU, J.; SILVA, A. B.; ORTEGA, J. M..

MALDI-TOF analysis of storage proteins from two brazilian rice (Oryza sativa) cultivars.

Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Mutagênese; Melhoramento.

Ano: 2006

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/192104

SILVEIRA, R. D. D.; SANTOS, K. F. E. N.; DIDONET, C. C. G. M.; BRONDANI, C..

Objectives: a) obtain reference grain proteome for two Brazilian cultivars, representatives of the indica and japonica subspecies; b) compare the protein profile of the two cultivars; c) determine the difference of the amino acid sequences of some peptides from the two genotypes.

Molecular and biochemical characterization of superoxide dismutase (SOD) in upland rice under drought.

Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Variedade; Proteína; Aminoacido.

Ano: 2010

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/866732

DEUS, K. E. de; LANNA, A. C.; ABREU, F. R. M.; SILVEIRA, R. D. D.; PEREIRA, W. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..

Drought is a major cause of reduced yield in upland rice farming in many regions of the world and cause an increased production of reactive oxygen species (ROS), followed by activation of a complex antioxidant system. In this study, the superoxide dismutase (SOD) enzymatic activity and the gene expression levels of eight isoforms of SOD were evaluated in drought-tolerant and drought-sensitive varieties of upland rice, Oryza sativa japonica (the Primavera and Douradão cultivars), including shoot and root tissues in two stages of plant development, grown under normal and restricted irrigation. The SOD activity was determined by spectrophotometric method and the gene expression by qPCR experiments. In the tolerant cultivar, SOD enzymatic activity increased...

Proteínas de reserva de acessos de coleção nuclear de arroz.

Palavras-chave: Enzymatic activity; Arroz; Oryza sativa; Resistencia a seca; Rice; Water stress; Oxidative stress; Gene expression; Superoxide dismutase.

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1037521

SILVEIRA, R. D. D.; SANTOS, K. F. D'E. N.; DIDONET, C. C. G. M.; DIDONET, A. D.; BRONDANI, C..

O objetivo deste trabalho foi quantificar o conteúdo de proteína total de reserva dos 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa (CNAE), e avaliar o perfil proteico dos 20 acessos com maior teor de proteína em SDS‑PAGE. Foi encontrado alto teor de proteína total de reserva (≥12,0%) em 103 acessos da CNAE, teor médio (11,9 a 9,0%) em 309 acessos e teor baixo (≤8,9%) em 138 acessos. Seis dos 20 acessos com maior teor de proteína de reserva apresentaram um padrão qualitativo diferencial de glutelina, que é a fração proteica de reserva mais abundante do grão de arroz. Há ampla variabilidade para o teor de proteína total de reserva do grão de arroz nos acessos da CNAE, a qual pode ser explorada por programas de melhoramento...

Quantificação das proteínas de reserva total e frações protéicas de linhagens interespecíficas de arroz.

Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Proteína; Valor nutritivo.

Ano: 2010

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/876964

SANTOS, K. F. D. N.; SILVEIRA, R. D. D.; DIDONET, C. C. G. M.; BRONDANI, C..

Este trabalho objetivou quantificar as proteínas de reserva total e as frações proteícas albumina, globulina, prolamina e glutelina presentes no grão de 34 linhagens interespecíficas do cruzamento entre a espécie silvestre de arroz Oryza glumaepatula RS016 e a cultivar Oryza sativa BG 90-2 pelo método de Bradford.

Storage protein profile and amino acid content in wild rice Oryza glumaepatula.

Palavras-chave: Oryza glumaepatula; Proteína de reserva; Albumina; Globulina; Glutelina; Prolamina; Arroz; Oryza sativa.

Ano: 2009

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/661243

SANTOS, K. F. D'. N.; SILVEIRA, R. D. D.; MARTIN-DIDONET, C. C. G.; BRONDANI, C..

The objective of this work was to determine the total protein profile and the contents of the four major protein fractions (albumin, globulin, prolamin and glutelin) and of the amino acids in the endosperm of the rice wild species Oryza glumaepatula. The experiment was performed with 29 accessions of this species, collected from 13 Brazilian locations, and two commercial cultivars. Protein samples were prepared using dried, polished, and ground grains to obtain homogeneous, dry flour used in the preparation of extracts. Oryza glumaepatula accessions were identified with the highest levels of total protein, albumin and glutelin protein fractions, and amino acids (with the exception of tryptophan) in comparison to the two analized rice cultivars. The albumin...