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In silico phylogenetic and virulence gene profile analyses of avian pathogenic Escherichia coli genome sequences. Repositório Alice
ROJAS, T. C. G.; MALUTA, R. P.; KOENIGKAN, L. V.; SILVEIRA, W. D. da.
Avian pathogenic Escherichia coli (APEC) infections are responsible for significant losses in the poultry industry worldwide. A zoonotic risk has been attributed to APEC strains because they present similarities to extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) associated with illness in humans, mainly urinary tract infections and neonatal meningitis. Here, we present in silico analyses with pathogenic E. coli genome sequences, including recently available APEC genomes. The phylogenetic tree, based on multi-locus sequence typing (MLST) of seven housekeeping genes, revealed high diversity in the allelic composition. Nevertheless, despite this diversity, the phylogenetic tree was able to cluster the different pathotypes together. An in silico virulence gene...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Árvore filogenética; Avian pathogenic Escherichia coli; Tipagem de sequência multilocus; Análise in silico; Genes associados à virulência; Multi-locus Sequence Typing; Phylogenetic tree; Virulence genes.; Escherichia Coli..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077504
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