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A genome-wide association study identified loci for yield component traits in sugarcane (Saccharum spp.). Repositório Alice
BARRETO, F. Z.; ROSA, J. R. B. F.; BALSALOBRE, T. W. A.; PASTINA, M. M.; SILVA, R. R.; HOFFMANN, H. P.; SOUZA, A. P. de; GARCIA, A. A. F.; CARNEIRO, M. S..
Sugarcane (Saccharum spp.) has a complex genome with variable ploidy and frequent aneuploidy, which hampers the understanding of phenotype and genotype relations. Despite this complexity, genome-wide association studies (GWAS) may be used to identify favorable alleles for target traits in core collections and then assist breeders in better managing crosses and selecting superior genotypes in breeding populations. Therefore, in the present study, we used a diversity panel of sugarcane, called the Brazilian Panel of Sugarcane Genotypes (BPSG), with the following objectives: (i) estimate, through a mixed model, the adjusted means and genetic parameters of the five yield traits evaluated over two harvest years; (ii) detect population structure, linkage...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Associação ampla do genoma; GWAS; Painel Brasileiro de Genótipos de Cana-de-Açúcar; BPSG; Cana de Açúcar; Genoma.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1113513
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A joint learning approach for genomic prediction in polyploid grasses. Repositório Alice
AONO, A. H.; FERREIRA, R. C. U.; MORAES, A. da C. L.; LARA, L. A. de C.; PIMENTA, R. J. G.; COSTA, E. A.; PINTO, L. R.; LANDELL, M. G. de A.; SANTOS, M. F.; JANK, L.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B.; CHIARI, L.; GARCIA, A. A. F.; KUROSHU, R. M.; LORENA, A. C.; GORJANC, G.; SOUZA, A. P. de.
Poaceae, among the most abundant plant families, includes many economically important polyploid species, such as forage grasses and sugarcane (Saccharum spp.). These species have elevated genomic complexities and limited genetic resources, hindering the application of marker-assisted selection strategies. Currently, the most promising approach for increasing genetic gains in plant breeding is genomic selection. However, due to the polyploidy nature of these polyploid species, more accurate models for incorporating genomic selection into breeding schemes are needed. This study aims to develop a machine learning method by using a joint learning approach to predict complex traits from genotypic data. Biparental populations of sugarcane and two species of...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Cana de Açúcar; Gramínea Forrageira; Recurso Genético; Forage grasses; Genetic resources; Plant breeding; Poaceae; Polyploidy; Saccharum; Sugarcane.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1150365
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A Modified protocol for total RNA isolation from forage peanuts. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; CAMPOS, T. de.
The development of specific protocols for extraction of high-quality RNA are key advances in molecular techniques for elucidating biological processes and mechanisms. The forage peanut has significant economic value for use in mixed pastures. However, it is difficult to extract high-quality RNA from forage peanuts due to high contents of tannins, polysaccharides, and other secondary metabolites. Here, it is described an efficient method for obtaining high-quality, high-yield total RNA that is usable in downstream transcriptome analysis. This modifications helped eliminate the problems associated with the presence of high concentrations of secondary metabolites in forage peanut leaves, and lacked signs of degradation. O desenvolvimento de protocolos...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Amendoim forrageiro; Forage peanut; Cacahuetes forrajeros; Ácido ribonucleico; Metabólico secundário; Secondary metabolic; High quality; Alta calidad; RNA extraction; Extracción de ARN; Leguminosa Forrageira; Melhoramento Genético Vegetal; RNA; Extração; Rendimento; Qualidade; Forage legumes; Arachis pintoi; Plant breeding.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125058
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An overview of the genetics and genomics of the Urochloa Species Most Commonly used in pastures. Repositório Alice
FERREIRA, R. C. U.; MOERAES, A. da C. l.; CHIARI, L.; SIMEÃO, R. M.; VIGNA, B. B. Z.; SOUZA, A. P. de.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Genetic studies; Genomic tools; Molecular breeding; Tropical forage grasses; Brachiaria.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1138006
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Análise de componentes principais aplicada ao crescimento da berinjela cultivada com esterco bovino e termofosfato magnesiano. Repositório Alice
CARDOSO, M. O.; PEREIRA, W. E.; OLIVEIRA, A. P. de; SOUZA, A. P. de.
Objetivou-se estudar o crescimento da berinjela, cultivada com doses de esterco bovino e termofosfato magnesiano, utilizando-se a técnica multivariada de componentes principais.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Esterco bovino; Urina de vaca; Berinjela; Fósforo; Solanum Melongena.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/681563
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Análise de componentes principais aplicada ao crescimento da berinjela cultivada com esterco bovino e termofosfato magnesiano. Repositório Alice
CARDOSO, M. O.; PEREIRA, W. E.; OLIVEIRA, A. P. de; SOUZA, A. P. de.
Objetivou-se estudar o crescimento da berinjela, cultivada com doses de esterco bovino e termofosfato magnesiano, utilizando-se a técnica multivariada de componentes principais.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Esterco bovino; Urina de vaca; Berinjela; Fósforo; Solanum Melongena.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/681553
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Análise de componentes principais aplicada aos teores de macronutrientes e nitrato em frutos de berinjela cultivada com esterco bovino e termofosfato magnesiano. Repositório Alice
CARDOSO, M. O.; OLIVEIRA, A. P. de; PEREIRA, W. E.; SOUZA, A. P. de.
Objetivou-se estudar o crescimento da berinjela, cultivada com doses de esterco bovino e termofosfato magnesiano, utilizando-se a técnica multivariada de componentes principais.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Esterco bovino; Urina de vaca; Berinjela; Fósforo; Solanum Melongena.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/681573
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Análise de componentes principais aplicada aos teores de macronutrientes e nitrato em frutos de berinjela cultivada com esterco bovino e termofosfato magnesiano. Repositório Alice
CARDOSO, M. O.; OLIVEIRA, A. P. de; PEREIRA, W. E.; SOUZA, A. P. de.
A berinjela, em função da grande divulgação de que seu fruto possui propriedades nutracêuticas, tem crescido em demanda. No seu cultivo, a fertilização é fundamental. Na produção orgânica, entretanto, os fertilizantes minerais solúveis sofrem restrições, ao contrário dos adubos orgânicos e dos adubos de baixa solubilidade. A urina de vaca é também utilizada na produção orgânica de alimentos. Devido à necessidade de estudos com essas fontes, os terores macronutrientes de frutos de berinjela, cultivada com doses de esterco bovino e de termofosfato magnesiano, associadas à urina de vaca, foram submetidos à análise de componentes principais.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Adubação orgânica; Fosfato natural; Urina de vaca; Berinjela; Solanum Melongena.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/681556
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Avaliação biomecânica das atividades de corte de madeira semimecanizado na Amazônia. Repositório Alice
RÊGO, L. J. S.; MARZANO, F. L. da C.; REIS, L. P.; FREITAS, L. J. M. de; REIS, P. C. M. dos R.; SILVA, M. L. da; SOUZA, A. P. de.
O objetivo deste trabalho é realizar uma análise biomecânica das posturas adotadas pelos trabalhadores nas atividades de corte arbóreo em florestas naturais, no Estado do Pará. Para avaliar as posturas dos trabalhadores nas atividades de derrubada, traçamento e destocamento utilizaram-se os métodos OWAS, REBA e de Michigan. Pelo OWAS todas as posturas adotadas exigem medidas corretivas em um futuro próximo. Pelo REBA a atividade de derrubada apresentou situação mais crítica. Pelo modelo biomecânico as articulações dos cotovelos e dos ombros não apresentaram risco de lesão. A força de compressão do disco L5-S1 ultrapassou o valor recomendado na atividade de destocar.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Trabalhador; Ergonomia; Postura; Corte; Madeira.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1091402
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Bactérias resistentes à antibióticos em nódulos de Vigna spp. cultivados em solos de Caatinga. Repositório Alice
SILVAM V. B. da; SILVA, A. F. da; SOUZA, A. P. de; FERNANDES JUNIOR, P. I..
O objetivo deste trabalho foi isolar e determinar a resistência intrínseca a antibióticos (RIA) de bactérias de nódulos de Vigna spp. em solos de Caatinga. Foi realizado um experimento utilizando-se amostras de solos de áreas de Caatinga dos municípios de Teresina, PI, Paulistana, PI; Uauá, BA; Juazeiro, BA e Petrolina, PE com três espécies de Vigna spp. A identifi cação fi logenética de todos os isolados foi realizada pela análise das sequências parciais do gene 16S rRNA. Foi selecionado um isolado de cada gênero para os testes de resistência a nove tipos de antibióticos. Foram identifi cadas 17 bactérias, pertencentes aos gêneros Pseudomonas, Rhizobium, Bacillus e Sphingomonas isoladas de diferentes cultivares e locais de coleta, consideradas resistentes...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Fixação biológica de nitrogênio; Semiárido; Vigna Unguiculata; Bactéria; Solo; Caatinga; Inoculação; Soil.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102399
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Caminhos da Biotecnologia da Reprodução em Suínos. Infoteca-e
SOUZA, A. P. de; SILVA, Z.; SUPERTI, B. F. V.; MARQUES, M. G..
Artigo descreve algumas das biotecnologias que estão aprimoradas e podem abrir novas possibilidades para a reprodução na espécie suína.
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Suinocultura; Biotecnologia; Reprodução animal; Animal reproduction; Swine; Biotechnology.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1061837
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Caracterização de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro para o desenvolvimento de novos microssatélites. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAMPOS, T. de.
O uso do amendoim forrageiro (Arachis pintoi) em pastagens consorciadas com gramíneas tem importância econômica e ambiental. Avanços no programa de melhoramento da espécie podem ser obtidos com a ampla informação gerada pelo sequenciamento de segunda geração. A tecnologia de RNA-Seq permite obter extensa cobertura dos genes existentes no genoma com custo consideravelmente baixo. Os dados gerados possibilitam identificar novos marcadores, validar genes e rotas metabólicas. Atualmente existem poucos microssatélites disponíveis para o amendoim forrageiro. Assim, o objetivo deste trabalho foi desenvolver novos marcadores microssatélites a partir de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro. O RNA de duas cultivares (Belomonte e Amarillo MG-100) foi...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Pastos forrajeros; Forage peanut; Cacahuetes forrajeros; RNA-Seq; RNA sequencing; Belomonte; Amarillo MG-100; Genoma funcional; Cultivo mixto; Leguminosas forrajeras; Repeticiones de microsatélite; Análisis de secuencia; Embrapa Acre; Rio Branco (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental.; Amendoim forrageiro; Pastagem Consorciada; Marcador Genético; Banco de Germoplasma.; Leguminosa Forrageira; Gramínea Forrageira; Sequence analysis; Germplasm conservation.; Forage legumes; Arachis pintoi; Microsatellite repeats; Mixed cropping; Forage grasses.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125415
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Caracterização de novos microssatélites desenvolvidos a partir do transcriptoma de amendoim forrageiro. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, L. M. da; FORMIGHIERI, E. F.; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; CAMPOS, T. de.
O amendoim forrageiro tem ganhado cada vez mais importância devido às vantagens associadas ao seu uso. Entretanto, a quantidade de microssatélites disponíveis para a espécie ainda é restrita, o que tem sido um gargalo no avanço do programa de melhoramento. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho foi desenvolver e caracterizar novos microssatélites a partir do transcriptoma de folhas de Arachis pintoi. Foram testados 186 locos em 19 acessos. Os locos com os melhores perfis de amplificação (64) foram selecionados para avaliação de polimorfismo, dos quais 63 (98,4%) apresentaram perfis polimórficos, com média de 7,37 alelos por loco. Os valores médios de heterozigosidade esperada (HE) e observada (HO) foram 0,72 e 0,31, respectivamente. Os marcadores...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Amendoim forrageiro; Forage peanut; Cacahuetes forrajeros; Transcriptoma da folha; Fitomejoramiento; Leguminosas forrajeras; Repeticiones de microsatélite; Hojas; Variación genética; Conservación del germoplasma; Embrapa Acre; Rio Branco (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Melhoramento Genético Vegetal; Leguminosa Forrageira; Marcador Genético; Variação Genética; Banco de Germoplasma; Plant breeding; Forage legumes; Arachis pintoi; Genetic markers; Microsatellite repeats; Transcriptome; Leaves; Genetic variation; Germplasm conservation.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1145988
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Caracterização morfológica e molecular de 20 acessos de Paspalum notatum com potencial de uso como gramados. Repositório Alice
VIGNA, B. B. Z.; MATTA, F. de P.; OLIVEIRA, F. A. de; SOUZA, A. P. de; FAVERO, A. P.; GUSMAO, M. R.; SOUZA, F. H. D. de.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Diversidade genética; SSR; Descritores morfológicos.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1065029
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Characterization of microsatellite loci in Himatanthus drasticus (Apocynaceae), a medicinal plant from the Brazilian savanna. Repositório Alice
BALDAUF, C.; CIAMPI, M. B.; VIGNA, B. B. Z.; MORI, G. M.; GUEDES, J. P. P.; SOUZA, A. P. de; SANTOS, F. A. M. dos.
? Premise of the study: We developed a new set of microsatellite markers for studying the genome of the janaguba tree, Himatanthus drasticus (Mart.) Plumel, which is used in folk medicine in northeastern Brazil. These novel markers are being used to evaluate the effect of harvesting on the genetic structure and diversity of natural populations of this species. ? Methods and Results: Microsatellite loci were isolated from an enriched H. drasticus genomic library. Nine primer pairs successfully amplified polymorphic microsatellite regions, with an average of 8.5 alleles per locus. The average values of observed and expected heterozygosity were 0.456 and 0.601, respectively. ? Conclusions: The microsatellite markers described here are valuable tools for...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Conservation; Molecular markers; Sustainable management; Harvesting; Medicinal plants.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/911321
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Coeficientes de angström-prescott e a evapotranspiração de referência na transição Cerrado-Amazônia do Mato Grosso. Repositório Alice
MARTIM, C. C.; ZAMADEI, T.; SOUZA, A. P. de; ALMEIDA, F. T. de; ZOLIN, C. A..
PT-BR: A radiação global (H) e a duração do brilho solar (n) são elementos meteorológicos que contribuem expressivamente para estudos agronômicos, ecológicos e hidrológicos. Na obtenção de H podem ser aplicados diferentes modelos de estimativas baseados em variáveis meteorológicas, todavia, a maneira mais simplificada baseia-se na correlação linear entre a transmissividade atmosférica e a razão de insolação. Objetivou-se obter os coeficientes lineares (a) e angulares (b) da equação de Angström-Prescott e avaliar a sua aplicação nas estimativas de H e da evapotranspiração de referência (ETo), na região de Sinop, MT (transição Cerrado-Amazônia; -11,86°; -55,48° e 371m de altitude), entre 2011 e 2016. Os dados diários foram agrupados em bases mensais,...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Transmissividade atmosférica; Razão de insolação; Radiação global; Indicativos estatísticos; Atmospheric transmissivity; Sunshine duration; Global radiation; Statistical indicators; Transmisividad atmosférica; Razón de insolación; Radiación global; Indicativos estadísticos; Radiação; Meteorologia; Irradiação; Evapotranspiração; Cerrado.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1130560
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Coexpression and transcriptome analyses identify active apomixis-related genes in Paspalum notatum leaves. Repositório Alice
OLIVEIRA, F. A. de; VIGNA, B. B. Z.; SILVA, C. C. da; FAVERO, A. P.; MATTA, F. de P.; AZEVEDO, A. L. S.; SOUZA, A. P. de.
RNA sequencing (RNA-seq) is the most effective method for simultaneously predicting new transcripts and identifying differentially expressed genes among distinct tissues, genotypes, abiotic conditions and developmental stages [1]. Conversely, considering the large amount of data generated from RNA-seq, new approaches that efficiently extract meaningful associations from highly multivariate datasets are needed [2]. Transcriptome coexpression studies can show how complex phenotypes depend on the activity of coordinated batteries of genes [3]. Therefore, the construction of coexpression networks based on gene expression data using correlation metrics provides valuable information regarding alterations in biological systems in response to differential gene...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Differential expression; Gene coexpression network; RNA sequencing; Apomixis; Paspalum.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1121557
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Comparison of different surgical procedures to prepare teaser boars. Repositório Alice
SUPERTI, B. F. V.; SOUZA, A. P. de; MÜLLER, B. C.; SILVA, Z. da; ZANELLA, R.; ZANELLA, E. L.; MARQUES, M. G..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Métodos cirúrgicos.; Reprodução animal; Suíno; Rufião; Castração..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088135
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Conservação de água e solo em sistemas integrados de produção. Repositório Alice
ZOLIN, C. A.; MAGALHÃES, C. A. de S.; MATOS, E. da S.; SOUZA, A. P. de; PAULINO, J.; ALMEIDA, F. T. de; VIANA, J. L..
O crescimento populacional e consequentemente da demanda por alimentos, fibra e energia tem provocado mudanças significativas no uso e cobertura dos solos, em especial nas regiões de clima tropical (Foley et al., 2005), o que, por sua vez, tem resultado no processo erosivo acelerado dos solos. A erosão hídrica acelerada é um dos principais fatores que atuam na redução da produtividade dos solos agrícolas (Carvalho et al., 2007). Esta, por sua vez, depende da precipitação, topografia, cobertura vegetal e das práticas conservacionistas utilizadas nos sistemas de produção. Entre esses fatores, os dois últimos são determinantes na redução da erosão hídrica em sistemas agrícolas, pois atuam tanto na redução do impacto das gotas da chuva quanto no aumento da...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Sistemas integrados; Sistema agrossilvipastoril; Integracao lavoura-pecuaria-floresta; Ilpf; Mato Grosso; Sinop-MT; Conservação da Água; Conservação do Solo; Sistema de Produção.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1103837
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Correlações canônicas entre características do crescimento com características químicas do substrato em berinjela. Repositório Alice
CARDOSO, M. O.; PEREIRA, W. E.; OLIVEIRA, A. P. de; SOUZA, A. P. de.
Nesse trabalho, foi estudado o crescimento da berinjela, cultivada com doses de esterco bovino e termofosfato magnesiano, associadas à urina de vaca, utilizando-se a técnica multivariada de correlações canônicas.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Esterco bovino; Urina de vaca; Berinjela; Fósforo; Solanum Melongena.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/681551
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