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	Provedor de dados Repositório Alice (38) Infoteca-e (3) Autor SOUZA, M. M. de (41) REGITANO, L. C. de A. (23) TIZIOTO, P. C. (19) COUTINHO, L. L. (18) ROCHA, M. I. P. (15) AFONSO, J. (13) OLIVEIRA, P. S. N. de (12) DINIZ, W. J. da S. (11) ZERLOTINI NETO, A. (10) NICIURA, S. C. M. (9) SILVA, A. F. da (8) LIMA, A. O. de (7) SILVA, C. da (7) TARDIN, F. D. (7) FILIMBERTI, E. L. (6) MUDADU, M. de A. (6) BRUSCADIN, J. J. (5) BUSS, C. E. (5) DINIZ, W. J. S. (5) JOANELLA, G. K. (5) Mais... Palavra-chave Bos Indicus (6) Allele-specific expression (5) Gado Nelore (5) Gene expression (5) Cattle (4) Expressão gênica (4) Gene expression regulation (4) Sorghum Bicolor. (4) Bioenergia (3) Single nucleotide polymorphism (3) ASE (2) Algodão (2) Allelic expression (2) BRS 506 (2) BRS 506. (2) Beef cattle (2) Caprino (2) Casting (2) Extrusão. (2) Feed efficiency (2) Mais... Tipo do documento Separatas (14) Artigo de periódico (11) Parte de livro (8) Anais e Proceedings de eventos (5) Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) (3) Ano 2022 (2) 2021 (2) 2020 (2) 2019 (2) 2018 (4) 2017 (5) 2016 (5) 2015 (2) 2014 (5) 2013 (7) 2012 (1) 2011 (1) 2007 (1) 1980 (2) Mais... País Brazil (41) Idioma Português (21) Inglês (20)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 41 Primeira ... 1 2 3 ... Última A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J. S.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Transcription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: DNA bovino; Expressão gênica; Gene expression in cattle; Gene expression regulation. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102174 A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J. S.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Transcription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an... Tipo: Separatas Palavras-chave: DNA bovine; Gene expression in cattle; Gene expression regulation. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101203 A single nucleotide polymorphism in NEUROD1 is associated with production traits in nelore beef cattle. Repositório Alice OLIVEIRA, P. P. A.; TIZIOTO, P. C.; MALAGO JUNIOR, W.; NASCIMENTO, M. L. do; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. da S.; SOUZA, M. M. de; LANNA, D. P. D.; TULLIO, R. R.; MOURAO, G. B.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Feed efficiency and carcass characteristics are late-measured traits. The detection of molecular markers associated with them can help breeding programs to select animals early in life, and to predict breeding values with high accuracy. The objective of this study was to identify polymorphisms in the functional and positional candidate gene NEUROD1 (neurogenic differentiation 1), and investigate their associations with production traits in reference families of Nelore cattle. A total of 585 steers were used, from 34 sires chosen to represent the variability of this breed. By sequencing 14 animals with extreme residual feed intake (RFI) values, seven single nucleotide polymorphisms (SNPs) in NEUROD1 were identified. The investigation of marker effects on... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Candidate gene; Feed efficiency; Bos Indicus; Body composition. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1053741 Adequação de épocas de semeadura de sorgo sacarino no município de Sinop- MT. Repositório Alice JOANELLA, G. K.; SOUZA, M. M. de; SILVA, C. da; FILIMBERTI, E. L.; SPAZIANI, C.; TARDIN, F. D.; MAY, A.; SILVA, A. F. da. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: BRS 506; CMSXS 647.; Biocombustível; Sistema de Produção.. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/972693 Adequação de populações de braquiária em consórcio com milho safrinha em espaçamento reduzido. Repositório Alice SILVA, A. F. da; BEHLING, M.; SILVA, C. da; FILIMBERTI, E. L.; SOUZA, M. M. de; JOANELLA, G. K.; SILVA, A. J. M. da; GONTIJO NETO, M. M.. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Milho safrinha. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/972496 Adubação foliar do algodoeiro com nitrato de potássio. Repositório Alice BOGIANI, J. C.; SILVA, F. I. S. da; PERINA, F. J.; SOUZA, M. M. de. O potássio (K) e o nitrogênio (N) são os nutrientes mais exigidos pelo algodoeiro. Para altas produtividades, é necessário que a planta acumule quantidade suficiente destes nutrientes nas folhas. Contudo, as características das novas cultivares co mo ciclo mais precoce, maturação concentrada e alto potencial produtivo, atrelado ao problema de ocorrência de veranicos prolongados em regiões como no oeste da Bahia que ocasionam menor potencial de absorção de N e K pelas raízes, estão proporcionando situações de perda do potencial produtivo por causa do pouco acúmulo de N e K nas folhas. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Fertilizante foliar; Algodão; Nitrogênio. Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1042554 Allele- and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: a candidate for meat tenderness in cattle. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; ROCHA, M. I. P.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Nelore; Expressão alélica diferencial; Maciez da carne; Gado Nelore; Alleles. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1052240 Allele-specific expression is widespread in Bos indicus muscle and affects meat quality candidate genes. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; ROCHA, M. I. P.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; CARDOSO, T. F.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; ANDRADE, B. G. N.; MUDADU, M. de A.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Differences between the expression of the two alleles of a gene are known as allele-specific expression (ASE), a common event in the transcriptome of mammals. Despite ASE being a source of phenotypic variation, its occurrence and effects on genetic prediction of economically relevant traits are still unexplored in bovines. Furthermore, as ASE events are likely driven by cis-regulatory mutations, scanning them throughout the bovine genome represents a significant step to elucidate the mechanisms underlying gene expression regulation. To address this question in a Bos indicus population, we built the ASE profile of the skeletal muscle tissue of 190 Nelore steers, using RNA sequencing data and SNPs genotypes from the Illumina BovineHD BeadChip (770 K bp).... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Expressão gênica; Regulação da expressão gênica; Allelic expression; Allele-specific expression; Bos Indicus; Gene expression regulation. Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125395 Allele-specific gene expression in liver of Nelore cattle extremes for feed efficiency. Repositório Alice ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Allele-specific expression; Genome regulation.; Genetic improvement.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1073455 Análise de haplótipos em QTL associado ao conteúdo de ferro no músculo de bovinos Nelore. Repositório Alice DINIZ, W. J. da S.; TIZIOTO, P. C.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; SOUZA, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Caue Ribeiro, Maria Alice Martins, Elaine Cristina Paris, Paulino Ribeiro Villas Boas, Ladislau Marcelino Rabello. Tipo: Separatas Palavras-chave: ABC; Blocos de haplótipos; Minerais; QTL; Nelore.; Bos Indicus; Bovino.. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1002861 Association of KCNJ11 gene variants with tenderness in Nelore breed. Repositório Alice TIZIOTO, P. C.; SOUZA, M. M. de; MUDADU, M. de A.; THOLON, P.; MEIRELLES, S. L. C.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; ROSA, A. do N.; MEDEIROS, S. R. de; SIQUEIRA, F.; FEIJO, G. L. D.; REGITANO, L. C. de A.. The KCNJ11 (potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 11) gene is located in BTA15, near a quantitative trait loci for meat tenderness. In this study, single nucleotide polymorphisms (SNPs) were described in KCNJ11 and associated with Warner ? Bratzler shear force (WBSF) at different aging times: 1 d after slaughter (WBSF0), after 7 d (WBSF7) and 14 d (WBSF14) of aging. Fourteen steers of Nelore breed, characterized as extreme for the distribution of WBSF0 in a half-sib population of 500 progenies from 32 sires, were selected for sequencing. Tipo: Separatas Palavras-chave: KCNJ11; Gene variants; Nelore breed; SNP.; Cattle; Meat.. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/951696 Avaliação de desempenho de cultivares de milho em função da densidade de semeadura, no munícipio de Sinop-MT. Repositório Alice SILVA, A. F. da; GONTIJO NETO, M. M.; SOUZA, M. M. de; FILIMBERTI, E. L.; JOANELLA, G. K.; SILVA, C. da; TARDIN, F. D.. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Milho safrinha; Variedades.; Zea Mays.. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/972509 Avaliação de desempenho de cultivares de milho safrinha no município de Sinop-MT. Repositório Alice SILVA, A. F. da; GONTIJO NETO, M. M.; TARDIN, F. D.; FILIMBERTI, E. L.; SOUZA, M. M. de; JOANELLA, G. K.; CESAR DA SILVA. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Variedades.; Milho; Zea Mays.. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/972517 Comportamento produtivo de sorgo sacarino em função do arranjo de plantas. Repositório Alice FILIMBERTI, E. L.; SOUZA, M. M. de; SILVA, C. da; JOANELLA, G. K.; PETTER, F. A.; TARDIN, F. D.; MAY, A.; SILVA, A. F. da. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: BRS 506; Sistemas de produção.; Bioenergia; Sorghum Bicolor.. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/972698 Comportamento produtivo de sorgo sacarino em função do arranjo de plantas, no município de Sinop-MT. Repositório Alice SILVA, A. F. da; SILVA, C. da; SOUZA, M. M. de; TARDIN, F. D.; BEHLING, M.; MAY, A.. A cultura do sorgo sacarino se destaca no cenário nacional como uma interessante alternativa para a produção de etanol. Porém, para que a cultura possa expressar todo o seu potencial produtivo é necessário que o arranjo de plantas seja realizado de maneira adequada. Objetivou-se com esse trabalho avaliar o comportamento do sorgo sacarino, cultivar BRS 506, em diferentes espaçamentos e densidade de semeadura, durante duas safras agrícolas, no município de Sinop-MT. O delineamento experimental adotado foi o de blocos ao acaso, em esquema fatorial 5x4x2, sendo cinco espaçamentos de entre linhas (0,5; 0,6; 0,7; 0,8; e1 x0,5 metros), quatro populações de planta (80.000; 100.000; 120.000; 140.000 plantas ha -1 ) e duas safras agrícolas (2011/2012 e 2012/2013),... Tipo: Parte de livro Palavras-chave: BRS 506.; Bioenergia; Sorghum Bicolor.. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1006481 Comportamento produtivo de sorgo sacarino em função do arranjo de plantas, no município de Sinop-MT. Repositório Alice SILVA, A. F. da; SILVA, C. da; SOUZA, M. M. de; TARDIN, F. D.; BEHLING, M.; MAY, A.. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: BRS 506.; Bioenergia; Sorghum Bicolor.. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/992649 Differential allele-specific expression revealed functional variants and candidate genes related to meat quality traits in B. indicus muscle. Repositório Alice BRUSCADIN, J. J.; CARDOSO, T. F.; DINIZ, W. J. da S.; SOUZA, M. M. de; AFONSO, J.; VIEIRA, D.; MALHEIROS, J. M.; ANDRADE, B. G. N.; PETRINI, J.; FERRAZ, J. B. S.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Abstract: Traditional transcriptomics approaches have been used to identify candidate genes affecting economically important livestock traits. Regulatory variants affecting these traits, however, remain under covered. Genomic regions showing allele-specific expression (ASE) are under the effect of cis-regulatory variants, being useful for improving the accuracy of genomic selection models. Taking advantage of the better of these two methods, we investigated single nucleotide polymorphisms (SNPs) in regions showing differential ASE (DASE SNPs) between contrasting groups for beef quality traits. For these analyses, we used RNA sequencing data, imputed genotypes and genomic estimated breeding values of muscle-related traits from 190 Nelore (Bos indicus)... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Polimorfismos de nucleotídeo único; Expressão gênica; Expressão alelo específica; Cis-regulation; ASE; Allele-specific expression; Fenótipo; Single nucleotide polymorphism; Gene expression; Phenotype; Beef. Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1151168 Differentially expressed genes in Longissimus dorsi muscle of Nelore steers divergent for average daily gain. Repositório Alice SILVA, J. V. da; TIZIOTO, P. C.; NEUBERN, P. S. N. de; AFONSO, J.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: RNA-seq; ADG; Gado Zebu; Zebu. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1056895 DNA methylation may affect beef tenderness through signal transduction in Bos indicus. Repositório Alice SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; ROCHA, M. I. P.; PAN, Z.; ZHOU, H.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; AFONSO, J.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; KOLTES, J. E.; REGITANO, L. C. de A.. Abstract. Background:Beef tenderness is a complex trait of economic importance for the beef industry. Understanding the epigenetic mechanisms underlying this trait may help improve the accuracy of breeding programs. However, little is known about epigenetic effects on Bos taurus muscle and their implications in tenderness, and no studies have been conducted in Bos indicus.Results:Comparing methylation profile of Bos indicus skeletal muscle with contrasting beef tenderness at 14 days after slaughter, we identified differentially methylated cytosines and regions associated with this trait. Interestingly, muscle that became tender beef had higher levels of hypermethylation compared to the tough group. Enrichment analysis of predicted target genes suggested... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Nelore; Epigenoma; Músculo de nelore; RRBS; GNAS; EBF3; Força de cisalhamento; Shear force; Epigenome; Muscle; Metilação; Bos Taurus; Bos Indicus; Músculo; Cattle; Methylation; DNA methylation. Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1144144 Efeito do processamento e das condições ambientais na sorção de umidade dos materiais biodegradáveis de amido de aveia. Repositório Alice GALDEANO, M. C.; WILHELM, A. E.; GROSSMANN, M. V. E.; MALI, S.; CARVALHO, C. W. P. de; SOUZA, M. M. de. Tipo: Separatas Palavras-chave: Casting; Plastificante.; Extrusão.. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/996569 Registros recuperados: 41 Primeira ... 1 2 3 ... Última

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