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Aflatoxins: contamination, analysis and control. 119
DORS, G. C.; CALDAS, S. S.; FEDDERN, V.; BEMVENUTI, R. H.; HACKBART, H. C. S.; SOUZA, M. M.; OLIVEIRA, M. S.; BUFFON, J. G.; PRIMEL, E, G.; FURLONG, E. B..
Projeto: 11.11.11.111.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Aflatoxinas; Controle.; Alimento; Análise; Contaminação..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/907418
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Allele specific expression analysis in bovine muscle tissue. 119
SOUZA, M. M.; MOKRY, F. C.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A.; CESAR, A. S. M.; MORÉ, D.; MOURÃO, G.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C..
Imprinted genes have been target of many studies, mainly in human and mouse, and lately in bovines due to the interest of understanding the epigenetic mechanisms underlying important meat quality phenotypes and the possibility of applying it in animal breeding programs in the future. Genomic DNA from 146 steers was genotyped using the Illumina BovineHD BeadChip in order to identify heterozygous individuals with known allele origin.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Bioinformática; Expressão gênica; Genoma; Bioinformatics; Gene expression; Genome.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1035220
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Allele specific expression analysis in bovine muscle tissue. 119
SOUZA, M. M.; MOKRY, F. C.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A.; CESAR, A. S. M.; MORÉ, D.; MOURÃO, G.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; ZERLOTINI, A.; REGITANO, L. C..
Imprinted genes have been target of many studies, mainly in human and mouse, and lately in bovines due to the interest of understanding the epigenetic mechanisms underlying important meat quality phenotypes and the possibility of applying it in animal breeding programs in the future. Genomic DNA from 146 steers was genotyped using the Illumina BovineHD BeadChip in order to identify heterozygous individuals with known allele origin.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Bioinformática; Expressão gênica; Genoma; Bioinformatics; Genome; Gene expression.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1035029
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Allele specific expression analysis in bovine muscle tissue. 119
SOUZA, M. M.; MOKRY, F. C.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A.; CESAR, A. S. M.; MORÉ, D.; MOURÃO, G.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; ZERLOTINI, A.; REGITANO, L. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Allele; Specific expression analysis; Bovine muscle tissue.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1029313
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Analysis of transferability of microsatellite primers (SSR) in wild Passiflora species and intraspecific genetic diversity in Passiflora alata. 119
SILVA, M. A. A.; SOUZA, M. M.; SILVA, G. S.; MELO, C. A. F.; CORRÊA, R. X.; ARAÚJO, I. S.; CONCEIÇÃO, L. D. H. C. S. da.
ABSTRACT. The genus Passiflora L. is the most representative of Passifloraceae, with over 500 known species, among which 150-200 originated from Brazil. In addition to the great commercial importance of this genus for the fruit market, many of the species have exotic flowers with a huge diversity of colors and can thereby be exploited as ornamental plants. This study was aimed at investigating the transferability of microsatellite primers in wild Passiflora species (P. cacao, P. cincinnata, P. glandulosa, P. gibertii, and P. mucronata) and characterizing 29 P. alata accessions using microsatellite primers that were previously developed in a library enriched with microsatellites from P. edulis f. flavicarpa for P. alata. The interspecies cross-amplification...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Diversidade genética; Marcador microsatelite; Transferabilidade de primers; Marcador genético; Maracujá; Flor; Melhoramento genético vegetal; Passiflora alata; Genetic variation; Microsatellite repeats; DNA primers.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1008509
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Association study of a cast gene snp with meat tenderness in bos indicus cattle. 119
SOUZA, M. M.; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MEDEIROS, S. R. de; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Cast gene snp; Bos indicus cattle.; Meat tenderness..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/904844
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Complex pattern of CAST allelic expression in bovine muscle tissue. 119
SOUZA, M. M.; ZERLOTINI, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A. L.; MOKRY, F. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. A..
ISMB 2014. Pôster E13.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Bioinformática; Polimorfismo de nucleotídeo único; Bioinformatics; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1007540
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Detection of quantitative trait loci for mineral content of Nelore longissimus dorsi muscle 119
TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; DECKER, J. E.; GROMBONI, C. F.; MUDADU, M. de A.; SCHNABEL, R. D.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOUZA, M. M.; REECY, J. M.; NASSU, R. T.; BRESSANI, F. A.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; NOGUEIRA, A. R. de A.; REGITANO, L. C. de A..
Genome-wide association studies (GWAS) can be used to identify quantitative trait loci (QTL) associated with complex traits and to better understand which genes and biological mechanisms underlie phenotypic variation.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Trait loci; Race Nellore; Longissimus dorsi; Mineral.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1017292
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Estabilidade de produção do algodoeiro cultivado sob diferentes palhadas para cobertura do solo. 119
BOGIANI, J. C.; FERREIRA, A. C. de B.; BORIN, A. L. D. C.; PERINA, F. J.; SIVA, F. I. S. da; SOUZA, M. M..
Nos últimos anos, a região oeste da Bahia vem enfrentando problemas sérios de veranicos prolongados com quedas de produtividade do algodoeiro. Quando e stes veranicos ocorrem em estádios de alta demanda de agua pela planta, os prejuízos são ainda maiores. Alternativas como o uso de cobertura do solo com biomassa podem minimizar estes problemas, pois podem diminuir as perdas de água por evaporação, e consequentemente aumentar a eficiência do uso da água do solo pelas culturas. Frente a esta realidade, o objetivo deste trabalho foi de avaliar a estabilidade de produção do algodoeiro cultivado sob diferentes condições de cobertura do solo com biomassa seca.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Biomassa seca; Semeadura direta; Planta de cobertura; Plantio direto.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1042658
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Evolução da produção agrícola nas microrregiões do Bioma Cerrado. 119
SOUZA, M. M.; VILELA, M. de F.; CHAIB FILHO, H..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Mapeamento.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/662455
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First record of Eucoilinae (Hymenoptera: Figitidae), parasitoids of African fig fly Zaprionus indianus Gupta (Diptera: Drosophilidae), in the Caatinga biome. 119
SANTOS, W. G. N.; FERNANDES, E. C.; SOUZA, M. M.; GUIMARAES, J. A.; ARAUJO, E. L..
Este trabalho relata a ocorrência de eucoilineos (Hymenoptera: Figitidae), parasitoides da Mosca-africana-do-figo Zapriomis indianus Gupta (Diptera: Drosophilidae). no bioma Caatinga semiárido Brasileiro.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Eucoilinae; Mosca frugívora; Inimigo natural; Praga; Inseto; Biodiversity.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1060095
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Global liver gene expression differences in Nelore steers with divergent residual feed intake phenotypes. 119
TIZIOTO, P.; COUTINHO, L. L.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; ROSA, K. O.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOUZA, M. M.; MOURÃO, G. B.; TULLIO, R. R.; CHAVES, A. S.; LANNA, D. P. D.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. de A.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. de A..
Feed efficiency-related traits are increasingly being studied because of their importance to the overall profitability of animal production.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: RFI; Feed efficiency; Bos Indicus; Transcriptomics.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1029683
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Global liver gene expression differences in Nelore steers with divergent residual feed intake phenotypes. 119
TIZIOTO, P.; COUTINHO, L. L.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; ROSA, C. O.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOUZA, M. M.; MOURÃO, G. B.; TULLIO, R. R.; CHAVES, A. S.; LANNA, D. P. D.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. A.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. A..
Background: Efficiency of feed utilization is important for animal production because it can reduce greenhouse gas emissions and improve industry profitability. However, the genetic basis of feed utilization in livestock remains poorly understood. Recent developments in molecular genetics, such as platforms for genome-wide genotyping and sequencing, provide an opportunity to identify genes and pathways that influence production traits. It is known that transcriptional networks influence feed efficiency-related traits such as growth and energy balance. This study sought to identify differentially expressed genes in animals genetically divergent for Residual Feed Intake (RFI), using RNA sequencing methodology (RNA-seq) to obtain information from genome-wide...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Transcriptoma; Sequenciamento genético; Bioinformática; RFI; Feed efficiency.; Bos Indicus.; Zebu; Feed conversion; Transcriptomics; Bioinformatics.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1034697
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Identification of KCNJ11 as a functional candidate gene for bovine meat tenderness. 119
TIZIOTO, P.; GASPARINI, G.; SOUZA, M. M.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; THOLON, P.; MEIRELLES, S. L. C.; TULLIO, R. R.; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; MEDEIROS, S. R.; SIQUEIRA, F.; FEIJO, G. L. D.; NASSU, R. T.; REGITANO, L. C. de A..
The potassium inwardly rectifying channel, subfamily J, member 11 (KCNJ11) gene was investigated as a candidate for meat tenderness based on the effects reported on muscle for KCNJ11 gene knockout in rat models and its position in a quantitative trait locus (QTL) for meat tenderness in the bovine genome. Sequence variations in the KCNJ11 gene were described by sequencing six amplified fragments, covering almost the entire gene. We identified single nucleotide polymorphisms (SNP) and validated them by different approaches, taking advantage of simultaneous projects that are being developed with the same Nelore population. By sequencing the KCNJ11 in Nelore steers representing extreme phenotypes for Warner-Bratzler shear force (WBSF), it was possible to...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Candidate gene; Bovine; Differential expression; Molecular markers; Warner Bratzler; Shear force; Beef; Meat.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/982035
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Influência do espaçamento entre linhas e da relação entre espaçamento-altura na podridão de maçãs do algodoeiro. 119
PERINA, F. J.; BOGIANI, J. C.; SILVA, F. I. S.; SOUZA, M. M.; FERREIRA, A. C. de B.; BORIN, A. L. D. C..
A podridão de maçãs é um dos problemas fitossanitários mais importantes para a cultura do algodoeiro no Brasil. Sob condições de elevada umidade e precipitação pluviométrica no período de abertura ou formação das maçãs, essa enfermidade provoca prejuízos expressivos. A podridão de maçãs pode ocorrer tanto antes como após sua abertura, e é caracterizada pela ação de um complexo de agentes patogênicos primários e secundários, sendo registra dos mais de uma centena de microrganismos associados.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Apodrecimento de maçã; Altura de planta; Adensamento.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1042710
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Monoallelic expression of NNAT gene in Nelore steers skeletal muscle. 119
SOUZA, M. M.; ZERLOTINI, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A. L.; MOKRY, F. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. A..
ABSTRACT: The NNAT gene plays a role on adipogenesis, brain development and insulin secretion. NNAT is described as paternal imprinted in bovine fetal tissue, but it is still underexplored in adult tissues. In order to improve the understanding of NNAT expression, muscle from Nellore was used to assess its allelic expression. Genomic DNA from 38 steers was genotyped for identification of heterozygous individuals with known allele origin. Total mRNA from muscle was extracted and sequenced by HiScanSQ, and afterwards the reads of each allele were counted for each animal. A total of 8 reciprocal heterozygous had more than 10 reads for the chosen SNP. All animals showed monoallelic expression, being 5 with paternal allele expressed, while 7 had the G allele...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Neuronatin; Zebu; Genomic imprinting.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1006155
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Monoallelic expression of NNAT gene in Nelore steers skeletal muscle. 119
SOUZA, M. M.; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A. L.; MOKRY, F. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. de A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Imprint; Neuronatin.; Bos Indicus..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/997977
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MyoD1 expression levels affect meat tenderness in Nellore beef cattle. 119
TIZIOTO, P. C.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; MUDADU, M. de A.; SOUZA, M. M.; MALAGO JUNIOR, W.; DONATONI, F. A. B.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Separatas Palavras-chave: QPCR; Shear force; Gene expres.; Bos Indicus..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/998063
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Positional candidate genes for residual intake and gain in Nelore beef cattle. 119
OLIVEIRA, P. S. N.; CESAR, A. S. M.; NASCIMENTO, M. L. do; SOUZA, M. M.; TULLIO, R. R.; LANNA, D. P.; SONSTEGARD, T.; MOURÃO, G. B.; REECY, J. M.; GARRICK, D. J.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Feed efficiency; SNPs.; Bos Indicus..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/998065
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