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Bilan des observations hydrologiques du secteur côtier au large de la Loire et de la Vilaine en 2016 5
Retho, Michael; Bizzozero, Lucie; Le Merrer, Yoann; Manach, Soazig; Collin, Karine; Fortune, Mireille; Schmitt, Anne; Gabellec, Raoul; Souchu, Philippe; Cochennec-laureau, Nathalie.
Ce rapport décrit le contexte hydrologique du littoral côtier du Morbihan, de la Loire Atlantique et de la Vendée Nord, sous l'influence des deux fleuves la Loire et la Vilaine, durant l'année 2016. Il s'appuie sur les suivis environnementaux réalisés dans le cadre des réseaux REPHY et DCE, complétés par les données acquises en haute fréquence sur la bouée MOLIT (réseau COAST HF-HOSEA).
Tipo: Text Palavras-chave: Hydrologie; DCE; Nutriment; Loire Bretagne; REPHY; Phytoplancton.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00416/52720/53593.pdf
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Demande de deuxième prolongation de l’ouverture du gisement naturel d’huîtres creuses à éclipse au sein de la zone 44.09 Estuaire Loire 5
Piquet, Jean-come; Schmitt, Anne; Cochennec-laureau, Nathalie.
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00467/57845/79477.pdf
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Demande de prolongation de l'arrêté d'exploitation du gisement naturel d'huîtres creuses au sein de la zone 44.09 Estuaire Loire 5
Piquet, Jean-come; Schmitt, Anne; Cochennec-laureau, Nathalie.
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00436/54737/79479.pdf
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Demande d'exploitation d'un gisement naturel à éclipse "44.09 Estuaire de la Loire" 5
Piquet, Jean-come; Schmitt, Anne; Cochennec-laureau, Nathalie.
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00403/51484/79481.pdf
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Directive cadre sur l’eau Bassin Loire-Bretagne. Contrôles de surveillance et opérationnel dans les masses d’eau côtières et de transition. Actions menées par Ifremer en 2011 5
Oger-jeanneret, Helene; Allenou, Jean-pierre; Cheve, Julien; Collin, Karine; Dagault, Francoise; Derrien, Annick; Doner, Anne; Duval, Audrey; Faure, Sandra; Fortune, Mireille; Gabellec, Raoul; Genauzeau, Sylvie; Le Merrer, Yoann; Queau, Julie; Piriou, Jean-yves; Retho, Michael; Schmitt, Anne; Truquet, Isabelle.
La Directive Cadre sur l’Eau 2000/60/CE établit un nouveau cadre pour une politique communautaire dans le domaine de l’eau. Elle fixe comme objectif général l’atteinte, à l’horizon 2015, d’un bon état écologique et chimique des masses d’eau souterraines et de surface, ces dernières incluant les eaux côtières et de transition (estuaires en particulier). Les masses d’eau côtières et de transition sont des unités géographiques cohérentes, qui ont été définies sur la base de critères physiques ayant une influence avérée sur la biologie : * critères hydrodynamiques (courant, marnage, stratification, profondeur… ), * critères sédimentologiques (sable, vase, roche… ). Dans le bassin Loire-Bretagne, qui s’étend du Mont Saint-Michel à La Rochelle, le groupe de...
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00108/21940/19534.pdf
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Does global warming favour the occurrence of recent blue mussel mortality events in France? 5
Pepin, Jean-francois; Soletchnik, Patrick; Le Moine, Olivier; Polsenaere, Pierre; Genauzeau, Sylvie; Robert, Stephane; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Schmitt, Anne; Chabirand, Jean-michel; Tourbiez, Delphine; Travers, Marie-agnes; Guesdon, Stephane.
We report in this work data of two independent studies carried out in the Pertuis Charentais for which a link might exist? A 30-years local time series study of hydro-climatic variations in water temperature and salinity, which show a significant warming of the water masses in the Marennes Oleron bay (+ 1.5 °C) associated with a significant drop ( > -15%) of freshwater intakes by nearby rivers. In this changing local climate context several major epizootics have appeared, severely affecting farmers and the production of Pacific oysters and mussels, from the first French shellfish-producing department (catching and growing, Agreste, 2012). Following massive mortality event of blue mussels in 2014, a specific study (MORBLEU) is conducted, trying to...
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00415/52697/53567.pdf
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Etat de la situation sanitaire des zones de production conchylicole dans les Pertuis Charentais. Volet 2 : Phytoplancton 5
Ryckaert, Mireille; Margat, Sylvie; Derrien, Annick; Schmitt, Anne; Thomas, Gerard.
Après un rappel de la réglementation concernant la qualité sanitaire des coquillages d’élevage, ainsi qu’une présentation du (REPHY*), un bilan sur les risques sanitaires liés au phytoplancton toxique est réalisé en 2008. Trois familles de toxines sont passées en revue, ainsi que les espèces phytoplanctoniques potentiellement émettrices de ces toxines. Il s’agit des toxines diarrhéiques (DSP) associées aux dinoflagellés du genre Dinophysis, paralysantes (PSP) émises par le dinoflagellé Alexandrium et amnésiantes (ASP) sécrétées par des diatomées du genre Pseudo-nitzschia. Le bilan fait la synthèse des données issues du REPHY depuis 1984 avec une analyse plus précise de 1998 à 2008. La hiérarchisation des risques montre une prépondérance des évènements liés...
Tipo: Text Palavras-chave: Zones conchylicoles; Pertuis Charentais; Phytoplancton; Phycotoxine.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00123/23419/21246.pdf
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Etude sanitaire du traict de Pen Bé. Zone N° 44.03. Département de Loire-Atlantique 5
Treguier, Cathy; Schmitt, Anne; Cochennec-laureau, Nathalie; Piquet, Jean-come.
L’étude de zone sanitaire du traict de Pen Bé (44.03) a été menée afin d’envisager un découpage en deux sous-secteurs Nord et Sud de l’actuelle zone classée pour les coquillages fouisseurs, et de déterminer les points de suivis REMI associés pour la surveillance ultérieure. Cette étude sanitaire a été réalisée par l’Ifremer dans le cadre de ses missions d’appui à l’Etat pour la définition d’une stratégie de surveillance pertinente, conforme aux exigences du règlement (CE) n°854/2004. L’étude comprend une étude de dossier identifiant les sources de contamination microbiologiques et une évaluation de leurs impacts sur les zones de pêche ou d’élevage des coquillages fouisseurs, puis une analyse des résultats des suivis réalisés à la fois dans le cadre du...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. Coli; Contamination bactériologique des coquillages; Contaminants chimiques; Milieu marin; Étude sanitaire; Traict de Pen Bé; Département de Loire-Atlantique.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00425/53629/54464.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de Loire-Atlantique. Edition 2019 5
Piquet, Jean-come; Schmitt, Anne; Rocq, Sophie; Cochennec-laureau, Nathalie.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats, ce rapport décrit les résultats obtenus en 2018 pour le réseau de surveillance de la contamination microbiologique REMI et du réseau d’observation de la contamination chimique ROCCH du département de Loire–Atlantique. Il présente l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées.
Tipo: Text Palavras-chave: Ifremer; REMI; Escherichia coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Estimation de la qualité sanitaire des zones de production; Département de Loire-Atlantique.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00495/60625/64117.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de Loire-Atlantique. Edition 2020 5
Schmitt, Anne; Piquet, Jean-come; Cochennec-laureau, Nathalie.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et la méthode d’interprétation desrésultats, ce rapport décrit les résultats obtenus en 2019 pour le réseau de surveillance de la contamination microbiologique REMI et du réseau d’observation de la contamination chimique ROCCH du département de Loire-Atlantique. Il présente l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées. En 2019, il y a eu 29 alertes déclenchées : 26 de niveau 0, 2 de niveau 1 et 1 de niveau 2. Sur 27 zones classées, 4 zones présentes des discordances de classement et une zone n’a pas suffisamment de données pour être classée. Sur les 4 zones dont le classement sanitaire ne concorde pas avec l’estimation de la qualité, 2 sont classées...
Tipo: Text Palavras-chave: Ifremer; REMI; Escherichia coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Estimation de la qualité sanitaire des zones de production; Département de Loire-Atlantique.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00624/73621/73059.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de Loire-Atlantique. Edition 2021 5
Schmitt, Anne; Piquet, Jean-come.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et la méthode d’interprétation des résultats, ce rapport décrit les résultats obtenus en 2020 pour le réseau de surveillance de la contamination microbiologique REMI et du réseau d’observation de la contamination chimique ROCCH du département de Loire-Atlantique. Il présente l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées. En 2020, il y a eu 32 alertes déclenchées : 24 de niveau 0, 7 de niveau 1 et 1 de niveau 2. Sur 29 zones classées, deux zones présentes des discordances de classement et quatre zones n’ont pas suffisamment de données pour être classées. Sur les deux zones dont le classement sanitaire ne concorde pas avec l’estimation de la qualité, les...
Tipo: Text Palavras-chave: Ifremer; REMI; Escherichia coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Estimation de la qualité sanitaire des zones de production; Département de Loire-Atlantique.
Ano: 2021 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00691/80289/83402.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département : Loire-Atlantique. Edition 2018 5
Schmitt, Anne; Cochennec-laureau, Nathalie; Piquet, Jean-come.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats, ce rapport décrit les résultats obtenus en 2017 pour le réseau de surveillance de la contamination microbiologique REMI et du réseau d’observation de la contamination chimique ROCCH du département de Loire–Atlantique. Il présente l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées.
Tipo: Text Palavras-chave: Ifremer; REMI; Escherichia coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Estimation de la qualité sanitaire des zones de production; Département de Loire-Atlantique.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00440/55198/56809.pdf
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Expertise sur le contexte hydro-climatologique de la Baie de Pénestin pour décrire les conditions physico-chimiques environnementales et l'impact possible sur les mortalités de moules 5
Cochennec-laureau, Nathalie; Schapira, Mathilde; Bouget, Jean-francois; Manach, Soazig; Retho, Michael; Le Merrer, Yoann; Schmitt, Anne; Pierre-duplessix, Olivier; Gabellec, Raoul; Normand, Julien; Combette, Agnes.
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00457/56879/79184.pdf
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Microbial balance, and triggering of recent mussel mortality events in France: Is there a link? 5
Guesdon, Stephane; Travers, Marie-agnes; Hervio Heath, Dominique; Derrien, Annick; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Quintric, Laure; Leroi, Laura; Pepin, Jean-francois.
Since the spring of 2014, the mussel farming of Charente-Maritime and Vendée (French Atlantic coast) has experienced an unprecedented crisis. Mass mortality events of blue mussel (M. edulis) have affected livestock areas, decimating up to 100% of production in some farming areas. Investigation for infectious agents in moribund mussels revealed presence of bacteria capable of inducing mortalities. In this context, the MORBLEU research project (DPMA-Ifremer agreement) was initiated to explore potentially aggravating factors, associated or correlated with mortality of mussels. The aim of the present study is to support the hypothesis that these mortality episodes can be linked to an evolution of microbial communities. Based on historical data from Ifremer...
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00415/52696/53566.pdf
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Note sur les eaux colorées observées au large de la Loire et de la Vilaine en avril 2017 5
Souchu, Philippe; Retho, Michael; Schapira, Mathilde; Fortune, Mireille; Manach, Soazig; Schmitt, Anne; Cochennec-laureau, Nathalie.
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00385/49642/81466.pdf
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Optimisation of growth conditions for continuous culture of the hyperthermophilic archaeon Thermococcus hydrothermalis and development of sulphur-free defined and minimal media 5
Postec, Anne; Pignet, Patricia; Cueff-gauchard, Valerie; Schmitt, Anne; Querellou, Joel; Godfroy, Anne.
The hyperthermophilic archaeon Thermococcus hydrothermalis was cultivated in continuous culture in a gas-lift bioreactor in the absence of elemental sulphur on both proteinaceous and maltose-containing media. Optimal conditions (pH, temperature and gas flow rate), determined on complex media that yielded maximal growth rate and maximal steady state cell density, were obtained at 80degreesC, pH 6 and gas sparging at 0.2 v v(-1) min(-1). Higher steady state cell densities were obtained on a medium containing maltose and yeast extract. In order to design a defined and minimal media, the nutritional requirements of T hydrothermalis were then investigated using continuous culture in the absence of elemental sulphur in the gas-lift bioreactor. First, the complex...
Tipo: Text Palavras-chave: Bioreactor; Defined and minimal media; Culture optimisation; Gas lift bioreactor; Thermococcus hydrothermalis.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/publication-365.pdf
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Première évaluation de la diversité des communautés microbiennes planctoniques au cours d'épisodes de mortalité des moules bleues en France : utilisation de l'approche de métabarcoding pour l'analyse de l'ADN environnemental 5
Pepin, Jean-francois; Bouget, Jean-francois; Chabirand, Jean-michel; Chasselin, Leo; Costes, Louis; Grizon, James; Lejolivet, Aurore; Le Noc, Sandrine; Palvadeau, Hubert; Schmitt, Anne; Seugnet, Jean-luc; Soletchnik, Patrick; Travers, Marie-agnes; Tourbiez, Delphine; Guesdon, Stephane.
Since 2014 in France, in Charente maritime and Vendée, farmed and stocks of blue mussels experienced strong mortality events. In this context, the « MORBLEU » research project (DPMA-Ifremer agreement) was initiated to explore potentially aggravating factors, associated or correlated with mortality of mussels. Here, the work is to study biotic factors in mussels environment, looking for describe diversity and evolution of microbial communities (water column) before, during and after mortality events using NGS technology (metabarcoding) for environmental DNA analysis. We present, sampling strategy used from 2015 to 2018, Material & Methods and some preliminary results.  
Tipo: Text Palavras-chave: MORBLEU; Moules; Mortalité; ADN environnemental; EDNA; Metabarcoding; Communautés microbiennes.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00505/61664/65579.pdf
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Qualité du Milieu Marin Littoral 2017. Bulletin de la surveillance 2017. Laboratoire Environnement Ressources du Morbihan/Pays de Loire. Départements de la Loire-Atlantique et de Vendée nord 5
Cochennec-laureau, Nathalie; Bizzozero, Lucie; Bonneau, Francoise; Collin, Karine; Fortune, Mireille; Le Merrer, Yoann; Pierre-duplessix, Olivier; Schapira, Mathilde; Schmitt, Anne; Souchu, Philippe.
Suivi hydrologique L’année 2017 s’est caractérisée par des températures élevées et un déficit en précipitation sur le bassin versant de la Loire, ce qui la classe parmi les années sèches exceptionnelles avec les années 2003, 2011 et 2015. Les débits de la Loire ont été largement déficitaires. L’ensoleillement soutenu en début d’année et en automne a été toutefois plus faible sur les mois de juillet et septembre. Suivi microbiologique Parmi les 41 stations de surveillance, 9 ont présenté une bonne qualité microbiologique, 31 une qualité moyenne, et une seule station est de mauvaise qualité. Comparativement à l'année 2016, le nombre de stations présentant une tendance à l'amélioration est en augmentation : 4 stations présentent une tendance à l'amélioration...
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00461/57312/59406.pdf
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Rapport d'activités 2017 du Laboratoire Environnement Ressources du Morbihan Pays de Loire 5
Cochennec-laureau, Nathalie; Bizzozero, Lucie; Blouin, Antoine; Bonneau, Francoise; Bouget, Jean-francois; Collin, Karine; Fortune, Mireille; Gabellec, Raoul; Le Merrer, Yoann; Manach, Soazig; Mellor, Alice; Pierre-duplessix, Olivier; Reboul, Sebastien; Retho, Michael; Schapira, Mathilde; Schmitt, Anne; Souchu, Philippe; Stanisiere, Jean-yves; Treguier, Cathy.
Ce rapport présente les activités d'observation et de surveillance de la qualité des eaux littorales du Morbihan, de la Loire Atlantique et du Nord Vendée et les résultats des projets de recherche.
Tipo: Text Palavras-chave: Réseaux de surveillance et d’observation; Qualité des écosystèmes marins littoraux du Morbihan; Pays de Loire; Microbiologie; Phytoplancton; Eutrophisation; Ressources exploitées; Huîtres; Moules.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00439/55061/56484.pdf
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Rapport d'activités 2018 du Laboratoire Environnement Ressources Conchylicoles du Morbihan-Pays de Loire 5
Cochennec-laureau, Nathalie; Bellec, Gwenael; Bizzozero, Lucie; Bonneau, Francoise; Bouget, Jean-francois; Bouvier, Calypso; Collin, Karine; Fortune, Mireille; Gabellec, Raoul; Le Merrer, Yoann; Manach, Soazig; Mellor, Alice; Pierre-duplessix, Olivier; Reboul, Sebastien; Retho, Michael; Roux, Pauline; Schapira, Mathilde; Schmitt, Anne; Souchu, Philippe; Stanisiere, Jean-yves.
Activités d’observation, de surveillance de la qualité des eaux littorales du Morbihan, Pays de Loire et Nord Vendée et résultats des projets de recherche 2018
Tipo: Text Palavras-chave: Réseaux de surveillance et d’observation; Qualité des écosystèmes marins littoraux du Morbihan; Pays de Loire; Microbiologie; Phytoplancton; Eutrophisation; Ressources exploitées; Huîtres; Moules.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00481/59245/61969.pdf
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