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	Provedor de dados Repositório Alice (82) Infoteca-e (8) Autor TOGAWA, R. C. (90) GRYNBERG, P. (33) COSTA, M. M. do C. (19) MARTINS, N. F. (18) MILLER, R. N. G. (12) SILVA, M. C. M. da (10) SILVA JUNIOR, O. B. da (9) ARRAES, F. B. M. (8) BRASILEIRO, A. C. M. (8) MARTINS, E. (8) QUEIROZ, P. (8) GUIMARAES, P. M. (7) MONNERAT, R. (7) MORGANTE, C. V. (7) SA, M. F. G. de (7) SANTOS, C. M. R. (7) BERTIOLI, D. J. (6) GROSSI-DE-SA, M. F. (6) MACEDO, L. L. P. de (6) NESHICH, G. (6) Mais... Palavra-chave Transcriptome (9) Musa Acuminata. (7) Banana (6) Meloidogyne Incognita (6) Bioinformatics (4) Biotic stress (4) Cupuaçu (4) Fungo (4) Arroz (3) Bioinformática (3) Doença (3) Genoma (3) Glycine Max (3) Musa Acuminata (3) Ngs (3) Praga (3) Protein structure (3) RNA-Seq (3) Soja (3) Amendoim (2) Mais... Tipo do documento Artigo de periódico (35) Separatas (31) Anais e Proceedings de eventos (9) Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) (6) Parte de livro (6) Comunicado Técnico (INFOTECA-E) (2) Teses (1) Mais... Ano 2022 (16) 2021 (4) 2020 (6) 2019 (4) 2018 (4) 2017 (6) 2016 (8) 2015 (9) 2014 (1) 2013 (3) 2012 (3) 2011 (2) 2010 (2) 2009 (2) 2008 (4) 2007 (1) 2006 (7) 2005 (5) 2004 (1) 2003 (1) Mais... País Brazil (90) Idioma Inglês (70) Português (20)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 90 Primeira ... 1 2 3 4 5 ... Última A large-scale analysis of resistance gene analogs (RGAs) encoding NBS domains in the genus Elaeis. Repositório Alice SANTOS, M. de L.; COTTA, M. G.; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; ALVES, A. A.; MILLER, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T.. Poster 637. Tipo: Separatas Palavras-chave: NBS-LRR; Elaeis guineenses.; Elaeis Oleifera.; Biotic stress.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088997 A large-scale analysis of resistance gene analogs (RGAs) encoding NBS domains in the genus Elaeis. Repositório Alice SANTOS, M. de L.; ALVES, G. S. C.; COTTA, M. G.; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; ALVES, A. A.; MILLER, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T.. Tipo: Separatas Palavras-chave: E guineensis; E oleifera; NBS-LRRs; Biotic stress. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085646 Análise de ESTs de raízes de genótipos de algodão contrastantes com resistência e susceptibilidade ao nematóide Meloidogyne incognita. Repositório Alice BARBOSA, A. E. A. D.; LIMA, L. M.; FRAGOSO, R. R.; GUIMARÃES, L. M.; SOUZA, D. S. L.; OLIVEIRA NETO, O. B.; PAES, N. CARNEIRO, R.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; GROSSI DE SÁ, M. F.. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Praga de Planta; Variedade Resistente.. Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/189517 Análise e caracterização do gene de osmotina em cupuaçuzeiro. Repositório Alice FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; SANTANA, R. J.; ALVES, R. M.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M.; MARCELLINO, L. H.. O cupuaçuzeiro, Theobroma grandiflorum (Willd. ex Spreng.) Schum., pertence à família Malvaceae e é nativo da região Amazônica. A cultura do cupuaçuzeiro é afetada pela doença vassoura-de-bruxa, causada pelo fungo Moniliophthora perniciosa, provocando uma grande redução na produção de frutos. O conhecimento molecular da interação planta-patógeno é essencial para o desenvolvimento de ferramentas para o controle da doença, como por exemplo, a identificação de genótipos resistentes. Genes expressos em resposta ao ataque de patógenos são alvos de estudos desta interação. O objetivo do presente trabalho foi caracterizar um deles, o gene de osmotina, em cupuaçuzeiro. Sequências anotadas do transcriptoma de frutos de cupuaçuzeiro foram avaliadas quanto à presença... Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Osmotina; Proteínas PR; Vassoura-de-bruxa.; Cupuaçu; Theobroma Grandiflorum.. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/950306 Analyses of cupuassu (Theobroma grandiflorum) transcriptome during interaction with Moniliophthora perniciosa, the causal agent of Witches' Broom disease. Repositório Alice FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; ALVES, R. M.; ALBUQUERQUE, P. S. B.; MARCELLINO, L. H.. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Cupuaçu; Theobroma Grandiflorum; Doença; Doença de Planta; Vassoura de Bruxa. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101187 Analysis of binding properties and specificity through identification of the interface forming residues (IFR) for serine proteases in silico docked to different inhibitors. Repositório Alice RIBEIRO, C.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MINARDI, R. C. de M.; SILVEIRA, C. H. da; JARDINE, J. G.; SANTORO, M. M.; NESHICH, G.. Background: Enzymes belonging to the same super family of proteins in general operate on variety of substrates and are inhibited by wide selection of inhibitors. In this work our main objective was to expand the scope of studies that consider only the catalytic and binding pocket amino acids while analyzing enzyme specificity and instead, include a wider category which we have named the Interface Forming Residues (IFR). We were motivated to identify those amino acids with decreased accessibility to solvent after docking of different types of inhibitors to sub classes of serine proteases and then create a table (matrix) of all amino acid positions at the interface as well as their respective occupancies. Our goal is to establish a platform for analysis of... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Enzimas; Propriedades ligantes; Proteases; Interface Forming Residues.; Binding properties; Enzymes.. Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/867859 Analysis of non-TIR NBS-LRR resistance gene analogs in Musa acuminata Colla: isolation, RFLP marker development, and physical mapping. Repositório Alice MILLER, R. N. G.; BERTIOLI, D. J.; BAURENS, F. C.; SANTOS, C. M. R.; ALVES, P. C.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Musa acuminata Colla; Banana; Doença; Praga; Resistência. Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/190719 Analysis of the leaf transcriptome of Musa acuminata during interaction with Mycosphaerella musicola: gene assembly, annotation and marker development. Repositório Alice PASSOS, M. A. N.; CRUZ, V. O. de; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C. de; AZEVEDO, V. C. R.; BRASILEIRO, A. C. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MILLER, R. T N. G.. Background: Although banana (Musa sp.) is an important edible crop, contributing towards poverty alleviation and food security, limited transcriptome datasets are available for use in accelerated molecular-based breeding in this genus. 454 GS-FLX Titanium technology was employed to determine the sequence of gene transcripts in genotypes of Musa acuminata ssp. burmannicoides Calcutta 4 and M. acuminata subgroup Cavendish cv. Grande Naine, contrasting in resistance to the fungal pathogen Mycosphaerella musicola, causal organism of Sigatoka leaf spot disease. To enrich for transcripts under biotic stress responses, full length-enriched cDNA libraries were prepared from whole plant leaf materials, both uninfected and artificially challenged with pathogen... Tipo: Separatas Palavras-chave: Banana; Fungo; Musa Acuminata; Mycosphaerella Musicola; Transcriptome; Microsatellite repeats. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/964212 Analysis of the transcriptome in Aspergillus tamarii during enzymatic degradation of sugarcane bagasse. Repositório Alice MIDORIKAWA, G. E. O.; CORREA, C. L.; NORONHA, E. F.; FERREIRA FILHO, E. X.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G.. Na publicação: Orzenil Bonfim Silva-Junior. Tipo: Separatas Palavras-chave: Carbohydrate-active enzymes; XlnR; Sugar transporters; ClrA; Aspergillus tamarii; Transcriptome; Lignocellulose; Bioethanol. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096563 Banco de dados de proteínas alvo da broca do cafeeiro- Hypothenemus hampei. Repositório Alice MARTINS, N. F.; MILHOME, Y. A.; TOGAWA, R. C.; SILVA, M. C. M. da; VIANA, M. J. A.. Na publicação: Natália Martins; Maria Cristina Mattar. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Target protein; Genomic analysis; New insecticides. Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1149596 Caracterização e otimização de Primers SSR para B.brizantha, B.humidicola e B.decumbens. Repositório Alice CARVALHO, N.; LEITE, P. H. dos S.; CANELA, F. M.; DUSI, D. M. de A.; TOGAWA, R. C.; AMARAL, Z. P. de S.; CHIARI, L.; CARNEIRO, V. T. de C.; BUSO, G. S. C.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Microssatélite; Brachiaria; Polimorfismo. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1067941 Combinação de abordagens de análises de novo e guiadas pelo genoma para explorar dados de RNA-Seq de sementes oleaginosas para anotação de vias de ácidos graxos. Infoteca-e LEMOS, V. N. S.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; RECH FILHO, E. L.; GRYNBERG, P.. Elaeis guineensis (dendê), Jatropha curcas (pinhão-manso) e Ricinus communis (mamona) produzem ácidos graxos que podem ser utilizados como fonte renovável na matriz energética, apresentando um grande potencial biotecnológico para as indústrias da área. O objetivo deste trabalho foi identificar transcritos relacionados com a síntese de ácidos graxos e inferir a sua presença em vias metabólicas. Para isso, o RNA total de sementes destas três espécies foi extraído e sequenciado. Os transcritomas foram montados utilizando abordagens de novo e guiados pelo genoma e filtrados com o programa Evidential Gene para a obtenção de resultados robustos. Uma base de dados contendo 527 sequências de 170 códigos de enzimas únicos de 12 vias de metabolismo de ácidos graxos... Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Pinhão-manso; RNA-Seq; Vias metabólicas; Dendê; Mamona; Elaeis Guineensis; Jatropha Curcas; Ricinus Communis. Ano: 2021 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1131672 Comparative gut transcriptome analysis of Diatraea saccharalis in response to the dietary source. Repositório Alice NORIEGA, D. D.; ARRAES, F. B. M.; ANTONINO, J. D.; MACEDO, L. L. P.; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; SILVA, M. C. M.; NEGRISOLI JUNIOR, A. S.; MORGANTE, C. V.; GROSSI-DE-SA, M. F.. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Physiological Aspects; Genetic Aspects; Diatraea Saccharalis; Transcription factors. Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1124729 Comparative root transcriptome of wild Arachis reveals NBS-LRR genes related to nematode resistance. Repositório Alice MOTA, A. P. Z.; VIDIGAL, B.; DANCHIN, E. G. J.; TOGAWA, R. C.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; BERTIOLI, D. J.; ARAUJO, A. C. G. de; BRASILEIRO, A. C. M.; GUIMARAES, P. M.. Na publicação: Soraya C. M. Leal-Bertioli; Ana Claudia Guerra Araujo e Patricia Messenberg Guimaraes. Tipo: Separatas Palavras-chave: X. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1094204 Comparative transcriptomics of cupuassu (Theobroma grandiflorum) offers insights into the early defense mechanism to Moniliophthora perniciosa, the causal agent of witches' broom disease. Repositório Alice FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; ALBUQUERQUE, P. S. B.; ALVES, R. M.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; BRIGIDO, M. M.; MARCELLINO, L. H.. Na publicação; Joseilde Oliveira Silva-Werneck. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Differential gene expression; Functional genomics; Plant-pathogen interaction; RNA-Seq; Transcriptome. Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1148790 Complete genome sequences of seven new Chrysodeixis includens nucleopolyhedrovirus isolates from Minas Gerais and Mato Grosso States in Brazil. Repositório Alice CRAVEIRO, S. R.; INGLIS, P. W.; MONTEIRO, L. L. S.; SANTOS, L. A. V. M.; TOGAWA, R. C.; RIBEIRO, Z. M. A.; RIBEIRO, B. M.; CASTRO, M. E. B.. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Geneme sequences. Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125051 Complete genome sequences of six Chrysodeixis includens Nucleopolyhedrovirus isolates from Brazil and Guatemala. Repositório Alice CRAVEIRO, S. R.; SANTOS, L. A. V. M.; TOGAWA, R. C.; INGLIS, P. W.; GRYNBERG, P.; RIBEIRO, Z. M. A.; RIBEIRO, B. M.; CASTRO, M. E. B.. Tipo: Separatas Palavras-chave: ChinNPV; Alphabaculovirus. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1060366 Comprehensive profiling and characterization of Arachis stenosperma (peanut) and Meloidogyne arenaria (plantroot nematode) smallRNAs identified during the course of the infection. Repositório Alice GRYNBERG, P.; GUIMARÃES, L. A.; COSTA, M. M. C.; TOGAWA, R. C.; BRASILEIRO, A. C. M.; GUIMARAES, P. M.. X-meeting 2016. Tipo: Separatas Palavras-chave: Meloidogyne.. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1062094 Construção de bibliotecas de ests de raízes de algodão (Gossypium hirsutum) infectadas com o nematóide de galha de raiz (Meloidogyne incognita). Repositório Alice PAES, N. S.; VIANA, A. A. B.; LIMA, L. M.; BATISTA, J. A. N.; GUIMARÃES, L. M.; BARBOSA, A. E. A. D.; SOUZA, D. S. L.; OLIVEIRA NETO, O. B.; CARNEIRO, R. M. D. G.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; GROSSI-de-SÁ, M. F.. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/187067 DATAMusa - a database for ortholog genes from Musa. Repositório Alice TOGAWA, R. C.; SANTOS, C. M. R.; MILLER, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T.; MARTINS, N. F.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Armazenamento de dados; Anotação de genes; Resposta ao stress; EST; Montagem; Genes transcritos.; Musa Acuminata.. Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/884025 Registros recuperados: 90 Primeira ... 1 2 3 4 5 ... 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