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Application of single step genomic BLUP under different uncertain paternity scenarios using simulated data. Repositório Alice
TONUSSI, R. L.; SILVA, R. M. de O.; MAGALHAES, A. F. B.; ESPIGOLAN, R.; PERIPOLLI, E.; OLIVIERI, B. F.; FEITOSA, F. L. B.; LEMOS, M. V. A.; BERTON, M. P.; CHIAIA, H. L. J.; PEREIRA, A. S. C.; LOBO, R. B.; BEZERRA, L. A. F.; MAGNABOSCO, C. de U.; LOURENÇO, D. A. L.; AGUILAR, I.; BALDI REY, F. S..
The objective of this study was to investigate the application of BLUP and single step genomic BLUP (ssGBLUP) models in different scenarios of paternity uncertainty with different strategies of scaling the G matrix to match the A22 matrix, using simulated data for beef cattle. Genotypes, pedigree, and phenotypes for age at first calving (AFC) and weight at 550 days (W550) were simulated using heritabilities based on real data (0.12 for AFC and 0.34 for W550). Paternity uncertainty scenarios using 0, 25, 50, 75, and 100% of multiple sires (MS) were studied. The simulated genome had a total length of 2,333 cM, containing 735,293 biallelic markers and 7,000 QTLs randomly distributed over the 29 BTA. It was assumed that QTLs explained 100% of the genetic...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Best Linear Unbiased Prediction; Seleção Fenótipa; Citogenética Animal; Hereditariedade; Gado de Corte.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083177
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Avaliação dos coeficientes de endogamia em bovinos da raça Gir (Bos primigenius indicus) Repositório Alice
PERIPOLLI, E.; OLIVIERI. B. F.; FEITOSA, F. L. B.; LEMOS, M. V. A. de; TONUSSI, R. L.; MUNARI, D. P.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; VENTURA, R. V.; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Autozigosidade; Corridas de Homozigose.; Pedigree..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1072487
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Caracterização do desequilíbrio de ligação em uma população de bovinos da raça Nelore. Repositório Alice
KLUSKA, S.; TONUSSI, R. L.; SILVA, R. M. de O.; OLIVERI, B. F.; FEITOSA, F. L. B.; PERIPOLLI, E.; LEMOS, M. V. A.; BERTON, M. P.; CHIAIA, H. L. J.; PEREIRA, A. S. C.; LOBO, R. B.; BEZERRA, L. A.; MAGNABOSCO, C. de U.; AGUILAR, I.; DI CROCE, F.; OSTERSTOCK, J.; BALDI REY, F. S..
Resumo: Tendo em vista a importância da estimação do desequilíbrio de ligação para a seleção genômica, o objetivo deste estudo foi estimar o desequilíbrio de ligação de uma população de bovinos da raça Nelore participantes do programa de melhoramento da ANCP. Foram utilizadas informações de 9.459 animais genotipados com um painel de alta densidade, totalizando 735.044 SNP?s, antes do controle de qualidade. A estimação do desequilíbrio de ligação foi realizada através do programa SNP1101. Os valores de LD observados para os cromossomos autossômicos variaram de 0,18 a 0,25. Para marcadores distanciados até 1 Kb a média de r² foi de 0,53 e para marcadores distanciados entre 90 e 100 Kb 0,14. Para MAF a média variou de 0,23 a 0,25, considerando MAF mínimo de...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Densidade de Marcadores; Marcador Genético; Seleção Genótipa; Cromossoma.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083353
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Estimativas de parâmetros genéticos para as características consideradas no índice bioeconômico (MGTe) do programa de melhoramento Nelore Brasil. Repositório Alice
OLIVERI, B. F.; KLUSKA, S.; FEITOSA, F. B.; BERTON, M. P.; TONUSSI, R. L.; LEMOS, M.; COLUCCI, N.; CHIAIA, H. L.; LOBO, R. B.; DI CROCE, F.; OSTERKTO, J.; MAGNABOSCO, C. de U.; SILVA, R. M. da; BALDI REY, F. S..
Resumo: O objetivo do presente estudo foi estimar parâmetros genéticos para características de carcaça, crescimento e reprodutivas de bovinos da raça Nelore. Foram analisadas as características de peso aos 120, 210 e 450 dias (P120, P210, P450), área do olho de lombo (AOL), perímetros escrotais aos 365 e 450 dias (PE365, PE450), idade ao primeiro parto (IPP), stayability (STAY) e probabilidade de prenhez precoce (3P). Para as características STAY e 3P foi utilizado o modelo de limiar, e para as demais características o modelo animal linear. Para a estimação dos componentes de variância e herdabildaide soi utilizado o modelo ssGBLUP. As estimativas de herdabilidade para as características P120, P210, P450, AOL, PE365, PE450, IPP, STAY e 3P foram 0,20; 0,21;...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Perímetro escrotal; Área de olho de lombo; Idade ao primeiro parto; Stayability; Parâmetro Genético; Carcaça; Taxa de Crescimento; Reprodução Animal; Gado Nelore.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083362
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Impacto nas acurácias dos valores genéticos para idade ao primeiro parto em diferentes cenários com paternidade incerta. Repositório Alice
TONUSSI, R. L.; SILVA, R. M. de O.; OLIVERI, B. F.; FEITOSA, F. L. B.; PERIPOLLI, E.; LEMOS, M. V. A.; BERTON, M. P.; PEREIRA, A. S. C.; LOBO, R. B.; BEZERRA, L. A. F.; MAGNABOSCO, C. de U.; AGUILAR, I.; DI CROCE, F. A.; BALDI REY, F. S..
Resumo: O objetivo deste estudo foi investigar o impacto nas acurácias de predição utilizando os métodos BLUP e ssGBLUP em diferentes cenários considerando paternidade incerta utilizando dados de uma população de bovinos Nelore. Foram estudados dados de 18.526 registros de idade ao primeiro parto (IPP). Os componentes de variância foram estimados usando os métodos BLUP e ssGBLUP. A matriz de parentesco (A) foi criada com diferentes proporções de animais com pais desconhecidos (0, 25, 50, 75 e 100%). Todos os modelos incluíram grupos contemporâneos como efeitos fixos. Os valores genéticos e genômicos (EBV / GEBV) foram avaliados em cada cenário para quatro grupos: ALL = todos os animais da população, BULL = somente touros com dez ou mais progênies; GEN =...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Best Linear Unbiased Prediction; Paternidade incerta; Avaliação genética; Parâmetro Genético; Gado Nelore.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083359
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Parâmetros genéticos e análises de componentes principais para peso corporal e características morfológicas em bovinos de corte da raça Nelore. Repositório Alice
TRAMONTE, N. C.; TONUSSI, R. L.; OLIVERI, B. F.; BALDI REY, F. S.; MAGNABOSCO, C. de U.; LOBO, R. B.; KOURY FILHO, W..
Resumo: O objetivo do presente trabalho foi estudar as associações entre características de escores visuais de estrutura corporal ao sobreano (ES), precocidade ao sobreano (PS) e musculosidade ao sobreano (MS), e peso ajustado aos 455 dias de idade, por meio de análises de componentes principais, de forma a obter variáveis indicadoras de biotipo animal e estimar os parâmetros genéticos. Foram analisados 10.888 registros de bovinos de corte da raça Nelore, provenientes de um rebanho participante do Programa Nelore Brasil. As análises de componentes principais (PCA) foram realizadas por meio do software STATISTICA. Utilizando como autovetor o primeiro componente principal das análises, foram calculados valores para os animais com informações de escores...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Gado Nelore.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083499
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