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| Registros recuperados: 51 | |
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| CHAPAVAL, L.; MOON, D. H.; GOMES, J. E.; DUARTE, F. R.; TSAI, S. M.. |
| Metodologia alternativa para extração de DNA genômico de Staphylococcus aureus. Abstract: This study describes a rapid procedure for the isolation of genomic DNA from Staphylococcus aureus that yielded a good amount of high quality DNA for the amplification of staphylococcal enterotoxins genes ( A, B, C, D, and E) and the TSST-1 gene as well as enzymatic restriction ( HaeIII) from environmental isolates. With this method, it was possible to detect these genes in a sample containing as little as 105 cells with positive PCR reactions obtained from approximately 10pg of DNA in a final reaction volume of 25 mu l. Metodologia alternativa para extração de DNA genômico de Staphylococcus aureus. Resumo: Descreve-se um procedimento rápido para extração de DNA... |
| Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: DNA genômico; Extração de DNA; DNA isolation; Genomic DNA.; Staphylococcus Aureus.. |
| Ano: 2008 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/534206 |
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| MENDES, L. W.; MENDES, R.; TSAI, S. M.. |
| The rhizosphere is the narrow zone of soil around the living plant roots that is influenced by the activity of the plants. Many beneficial microorganisms in the rhizosphere provide plants with mineral nutrients, phytohormones, and also help to protect the plant against soil-borne pathogens. Microbiological studies are addressed to understand how rhizosphere microorganisms are recruited from soil and either benefit or harm plant growth, nutrition and health. Here, we aimed to identify potential microbial groups and functional traits correlated to the suppression of the soil borne pathogen Fusarium oxysporum, the causal agent of Fusarium wilt on common beans. We used shotgun metagenomics to investigate the rhizosphere microbiome of two common bean cultivars... |
| Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Shotgun metagenomics; Soil born pathogen.; Feijão; Fusarium Oxysporum.; Microbiome.; Microbial ecology. |
| Ano: 2015 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1036665 |
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| CHAPAVAL, L.; MOON, D. H.; GOMES, J. E.; DUARTE, F. R.; TSAI, S. M.. |
| A identificação e classificação bacteriana são de suma importância no ambiente, na indústria, na medicina veterinária, na microbiologia e na ecologia microbiana. Um número de diferentes métodos genotípicos e fenotípicos estão sendo empregados para identificação e classificação microbiana. A técnica de REP-PCR é baseada no uso de primers sintetizados a partir de sequências repetidas de DNA, chamadas de palindrômicas extragênicas repetidas (REP), e têm sido descrita como um método o qual gera impressões digitais (fingerprints) de DNA que podem diferenciar bactérias entre gêneros e espécies. Neste estudo, o método de fingerprint foi usado para Staphylococcus aureus com o objetivo de avaliar a higiene de ordenha em duas fazendas leiteiras. Foram obtidos vários... |
| Tipo: -- |
Palavras-chave: Fingerprint; Higiene de ordenha; Staphylococus aureus.; Epidemiologia molecular. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/912958 |
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| VIEIRA, L. G. E.; ANDRADE, A. C.; COLOMBO, C. A.; MORAES, A. H. de A.; METHA, A.; OLIVEIRA, A. C. de; LABATE, C. A.; MARINO, C. L.; MONTEIRO-VITORELLO, C. de B.; MONTE, D. C.; GIGLIOTI, E.; KIMURA, E. T.; ROMANO, E.; KURAMAE, E. E.; LEMOS, E. G. M.; ALMEIDA, E. R. P. de; JORGE, E. C.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; SILVA, F. R. da; VINECKY, F.; SAWAZAKI, H. E.; DORRY, H. F. A.; CARRER, H.; ABREU, I. N.; BATISTA, J. A. N.; TEIXEIRA, J. B.; KITAJIMA, J. P.; XAVIER, K. G.; LIMA, L. M. de; CAMARGO, L. E. A. de; PEREIRA, L. F. P.; COUTINHO, L. L.; LEMOS, M. V. F.; ROMANO, M. R.; MACHADO, M. A.; COSTA, M. M. do C.; SÁ, M. F. G. de; GOLDMAN, M. H. S.; FERRO, M. I. T.; TINOCO, M. L. P.; OLIVEIRA, M. C.; VAN SLUYS, M-A.; SHIMIZU, M. M.; MALUF, M. P.; EIRA, M. T. S. da; GUERREIRO FILHO, O.; ARRUDA, P.; MAZZAFERA, P.; MARIANI, P. D. S. C.; OLIVEIRA, R. L. B. C. de; HARAKAVA, R.; BALBAO, S. F.; TSAI, S. M.; MAURO, S. M. Z. di; SANTOS, S. N.; SIQUEIRA, W. J.; COSTA, G. G. L.; FORMIGHIERI, E. F.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.. |
| Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Projeto genoma; Brasil; Café. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/187149 |
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| PYLRO, V. S.; ROESCH, L. F. W.; ORTEGA, J. M.; AMARAL, A. M. do; TÓTOLA, M. R.; HIRSCH, P. R.; ROSADO, A. S.; GÓES-NETO, A.; SILVA, A. L. da C.; ROSA, C. A.; MORAIS, D. K.; ANDREOTE, F. D.; DUARTE, G. F.; MELO, I. S. de; SELDIN, L.; LAMBAIS, M. R.; HUNGRIA, M.; PEIXOTO, R. S.; KRUGER, R. H.; TSAI, S. M.; AZEVEDO, V.. |
| The Brazilian Microbiome Project (BMP) aims to assemble a Brazilian Metagenomic Consortium/Database. At present, many metagenomic projects underway in Brazil are widely known. Our goal in this initiative is to co-ordinate and standardize these together with new projects to come. It is estimated that Brazil hosts approximately 20 % of the entire world's macroorganism biological diversity. It is 1 of the 17 countries that share nearly 70 % of the world's catalogued animal and plant species, and is recognized as one of the most megadiverse countries. At the end of 2012, Brazil has joined GBIF (Global Biodiversity Information Facility), as associated member, to improve the access to the Brazilian biodiversity data in a free and open way. This was an important... |
| Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Diversidade microbiana; Biodiversidade; Microrganismo; Biodiversity. |
| Ano: 2014 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1000621 |
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| MENDES, L. W.; MENDES, R.; RAAIJMAKERS, J. M.; TSAI, S. M.. |
| Over the past century, plant breeding programs have substantially improved plant growth and health, but have not yet considered the potential effects on the plant microbiome. Here, we conducted a metatranscriptome analysis to determine if and how breeding for resistance of common bean against the root pathogen Fusarium oxysporum (Fox) affected gene expression in the rhizobacterial community. Our data revealed that rhizobacterial community assembly of Fox-resistant and susceptible bean cultivars follows niche-based mechanisms, presenting lower diversity and distinct community structure compared to the bulk soil. The microbiome of the Fox-resistant bean cultivar presented a significantly higher expression of bacterial genes associated with nutrient... |
| Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Rizosfera; Feijão; Microbiome; Rhizosphere; Beans; Breeding. |
| Ano: 2018 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1103238 |
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| BRAGA, L. P. P.; YOSHIURA, C. A.; BORGES, C. D.; HORN, M. A.; BROWN, G. G.; DRAKE, H. L.; TSAI, S. M.. |
| For the last 150 years many studies have shown the importance of earthworms for plant growth, but the exact mechanisms involved in the process are still poorly understood. Many important functions required for plant growth can be performed by soil microbes in the rhizosphere. To investigate earthworm influence on the rhizosphere microbial community, we performed a macrocosm experiment with and without Pontoscolex corethrurus (EW+ and EW?, respectively) and followed various soil and rhizosphere processes for 217 days with sugarcane. In EW+ treatments, N2O concentrations belowground (15 cm depth) and relative abundances of nitrous oxide genes (nosZ) were higher in bulk soil and rhizosphere, suggesting that soil microbes were able to consume earthworm-induced... |
| Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Crescimento de plantas; Minhoca; Solo; Rizosfera; Biologia do solo; Earthworms; Rhizosphere. |
| Ano: 2016 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1067637 |
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| VIEIRA, R. F.; TANAKA, R. T.; TSAI, S. M.; PEREZ, D. V.; SILVA, C. M. M. de S.. |
| O objetivo deste trabalho foi verificar o efeito direto e residual da adubação com Iodo de esgoto, como fonte de P, na produtividade de soja, na qualidade dos grãos para consumo humano e no potencial de lixiviação de nitrato. O experimento foi realizado no campo e constituiu-se dos seguintes tratamentos: ausência de adubação química e de Iodo; adubação química e de Iodo; adubação química completa; soja com inoculação mais dose zero de Iodo; soja com inoculação de 1,5t ha-¹ de Iodo; soja com inoculação mais 3t ha-¹ de Iodo; soja com inoculação mais 6t ha-¹ de Iodo; e soja com inoculação mais adubação química, exceto a nitrogenada. As maiores produtividades de soja, tanto no primeiro como no segundo ano agrícola, foram obtidas nas duas maiores doses de Iodo.... |
| Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Biossólido; Mineralização de nitrogênio.; Fósforo; Metal Pesado.. |
| Ano: 2005 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/334991 |
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| VIEIRA, R. F.; TANAKA, R.; TSAI, S. M.; PEREZ, D. V.; SILVA, C. M. M. de S.. |
| O objetivo deste trabalho foi verificar o efeito direto e residual da adubação com lodo de esgoto, como fonte de P, na produtividade da soja, na qualidade dos grãos para consumo humano e no potencial de lixiviação do nitrato. O experimento foi realizado no campo e constituiu-se dos seguintes tratamentos: ausência de adubação química e de lodo; adubação química completa; soja com inoculação mais dose zero de lodo; soja com inoculação mais 1,5 t ha-1 de lodo; soja com inoculação mais 3 t ha-1 de lodo; soja com inoculação mais 6 t ha-1 de lodo; e soja com inoculação mais adubação química, exceto a nitrogenada. As maiores produtividades de soja, tanto no primeiro como no segundo ano agrícola, foram obtidas nas duas maiores doses de lodo. Os teores de vários... |
| Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Lodo de esgoto; Efeito; Mineralização de nitrogênio; Adubo de esgoto; Fertilizante; Fósforo; Metal pesado; Fertilidade do solo; Mineralização. |
| Ano: 2005 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/15439 |
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| BRAGA, L. P.; TANENTZAP, A. J.; LEE, B.; TSAI, S. M.; RAAIJMAKERS, J. M.; MENDES, R.; MENDES, L. W.. |
| Abstract: The rhizosphere microbiome plays a key role in plant protection against soil-borne pathogens. Plant breeding for resistance against soil-borne pathogens can alter the rhizosphere microbiome. However, most studies have focused on bacterial and fungal communities, leaving the role of the virus and viroids unassessed. Here, we tested the influence of resistance breeding on the composition of rhizosphere viruses and viroids. By analyzing metatranscriptomes from the rhizosphere of common bean (Phaseolus vulgaris) cultivars with varying resistance to the soil-borne pathogen Fusarium oxysporum, we recovered sequences representing 78 and 23 novel populations of viruses and viroids, respectively. We compared the abundances of these infectious agents... |
| Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Plant-microbe interactions; Infectome; Rizosfera; Feijão; Doença de Planta; Resistência; Vírus; Soil-plant interactions; Microbiome; Viruses; Beans; Food security. |
| Ano: 2023 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1156276 |
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| Registros recuperados: 51 | |
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